Public Git Hosting - gromacs.git/tree

drwxr-xr-x		..
-rw-r--r--	2075	CMakeLists.txt	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	23027	broadcaststructs.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3334	broadcaststructs.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	42702	calc_verletbuf.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5863	calc_verletbuf.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3657	calcmu.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2275	calcmu.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	7544	calcvir.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	80855	clincs.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5391	compute_io.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2183	compute_io.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	44027	constr.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	13740	constr.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	55987	coupling.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	31633	csettle.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	8578	ebin.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3735	ebin.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	47045	expanded.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2697	expanded.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	30540	force.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	8405	force.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2828	force_flags.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2043	forcerec-threading.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	107821	forcerec.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5966	forcerec.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	49504	genborn.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	7422	genborn.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	34199	genborn_allvsall.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3434	genborn_allvsall.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	18932	gmx_omp_nthreads.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	4713	gmx_omp_nthreads.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	13749	groupcoord.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	10373	groupcoord.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5111	integrator.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	10510	main.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3096	main.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	21026	md_support.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5456	md_support.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	16169	mdatoms.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3878	mdatoms.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	50791	mdebin.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6614	mdebin.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	23661	mdebin_bar.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	8894	mdebin_bar.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	15249	mdoutf.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	4587	mdoutf.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6955	mdrun.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5380	mdsetup.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3431	mdsetup.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	104980	minimize.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2294	minimize.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	8579	nb_verlet.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	52898	nbnxn_atomdata.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5220	nbnxn_atomdata.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3371	nbnxn_consts.h	blob \| blame \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	nbnxn_cuda	tree \| history
-rw-r--r--	7008	nbnxn_gpu.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	12807	nbnxn_gpu_common.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2646	nbnxn_gpu_common_utils.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5550	nbnxn_gpu_data_mgmt.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2283	nbnxn_gpu_jit_support.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2162	nbnxn_gpu_types.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3535	nbnxn_gpu_types_common.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	51546	nbnxn_grid.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	4022	nbnxn_grid.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	13009	nbnxn_internal.h	blob \| blame \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	nbnxn_kernels	tree \| history
drwxr-xr-x	-	nbnxn_ocl	tree \| history
-rw-r--r--	15981	nbnxn_pairlist.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	154093	nbnxn_search.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	4075	nbnxn_search.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	10437	nbnxn_search_simd_2xnn.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	13238	nbnxn_search_simd_4xn.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2491	nbnxn_simd.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	20843	nbnxn_tuning.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3960	nbnxn_tuning.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	4013	nbnxn_util.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	75382	ns.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3781	ns.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	27114	nsgrid.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6175	nsgrid.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	21427	perf_est.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2713	perf_est.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	9327	qm_gamess.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	28772	qm_gaussian.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	7702	qm_mopac.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	10982	qm_orca.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	1912	qm_orca.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	32644	qmmm.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6456	qmmm.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5192	rbin.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2602	rbin.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	10530	rf_util.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	21291	shakef.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	44593	shellfc.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3910	shellfc.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5221	sighandler.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3343	sighandler.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	100274	sim_util.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6300	sim_util.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5005	simulationsignal.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6584	simulationsignal.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	11019	splitter.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2276	splitter.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	12266	stat.cpp	blob \| blame \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	tests	tree \| history
-rw-r--r--	10182	tgroup.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3036	tgroup.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	31347	tpi.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	2028	tpi.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	7279	trajectory_writing.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	3772	trajectory_writing.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	74426	update.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	10697	update.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	18648	vcm.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	4234	vcm.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	86463	vsite.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	6446	vsite.h	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	12734	wall.cpp	blob \| blame \| history \| raw
-rw-r--r--	5610	wnblist.cpp	blob \| blame \| history \| raw