python/sddekit_h.pxd

   1 # copyright 2016 Apache 2 sddekit authors
   2
   3 # This file provides the Cython declarations for the C library
   4 # defined in the C header. If you want to use the Cython types
   5 # from Cython code, see sddekit.pxd.
   6
   7 from libc.stdlib cimport malloc, free
   8 from cpython cimport PyObject, Py_INCREF, Py_DECREF
   9 from libc.stdint cimport uint32_t
  10 from libcpp cimport bool
  11
  12 cdef extern from "sddekit.h":
  13
  14     # stat enum {{{
  15     ctypedef enum sd_stat:
  16         SD_OK
  17         SD_ERR
  18         SD_CONT
  19         SD_STOP
  20     # }}}
  21
  22     # util {{{
  23     sd_stat sd_util_read_square_matrix(char *fname, uint32_t *n, double **w)
  24
  25     sd_stat sd_util_uniqi(uint32_t n,
  26                   uint32_t * ints,
  27                   uint32_t * nuniq,
  28                   uint32_t **uints)
  29     # }}}
  30
  31     # rng {{{
  32     ctypedef struct sd_rng:
  33         void *ptr
  34         void (*seed)(sd_rng*, uint32_t seed)
  35         double (*norm)(sd_rng*)
  36         void (*fill_norm)(sd_rng*, uint32_t n, double *x)
  37         uint32_t (*nbytes)(sd_rng*)
  38         void (*free)(sd_rng*)
  39
  40     sd_rng * sd_rng_new_default()
  41     # }}}
  42
  43     # hfill {{{
  44     ctypedef struct sd_hfill:
  45         void *ptr
  46         sd_stat (*apply)(sd_hfill*, uint32_t n, double * t, uint32_t *indices, double * buf)
  47         void (*free)(sd_hfill*)
  48
  49     sd_hfill * sd_hfill_new_val(double val)
  50     # }}}
  51
  52     # hist {{{
  53     ctypedef struct sd_hist:
  54         uint32_t(*get_maxvi)(sd_hist*)
  55         uint32_t(*get_vi2i)(sd_hist*, uint32_t vi)
  56         uint32_t(*get_nu)(sd_hist *h)
  57         void (*free)(sd_hist *h)
  58         sd_stat (*fill)(sd_hist *h, sd_hfill *filler)
  59         void (*get)(sd_hist *h, double t, double *aff)
  60         void (*set)(sd_hist *h, double t, double *eff)
  61         uint32_t (*nbytes)(sd_hist *h)
  62         double (*get_buf_lin)(sd_hist *h, uint32_t index)
  63         uint32_t (*get_nd)(sd_hist *h)
  64         double (*get_t)(sd_hist *h)
  65         double (*get_dt)(sd_hist *h)
  66         uint32_t (*get_lim)(sd_hist *h, uint32_t i)
  67         uint32_t (*get_len)(sd_hist *h, uint32_t i)
  68         uint32_t (*get_pos)(sd_hist *h, uint32_t i)
  69         uint32_t (*get_uvi)(sd_hist *h, uint32_t i)
  70         double (*get_maxd)(sd_hist *h, uint32_t i)
  71         uint32_t (*get_vi)(sd_hist *h, uint32_t i)
  72         double (*get_vd)(sd_hist *h, uint32_t i)
  73
  74     sd_hist * sd_hist_new_default(uint32_t nd, uint32_t *vi, double *vd, double t0, double dt)
  75     # }}}
  76
  77     # sys {{{
  78     ctypedef struct sd_sys:
  79         uint32_t (*ndim)(sd_sys*)
  80         uint32_t (*ndc)(sd_sys*)
  81         uint32_t (*nobs)(sd_sys*)
  82         uint32_t (*nrpar)(sd_sys*)
  83         uint32_t (*nipar)(sd_sys*)
  84         sd_stat (*apply)(sd_sys*, sd_sys_in*, sd_sys_out*)
  85         void (*free)(sd_sys*)
  86         void *ptr
  87     ctypedef struct sd_sys_in:
  88         uint32_t nx, nc, id
  89         double t, *x, *i
  90         sd_hist *hist
  91         sd_rng *rng
  92     ctypedef struct sd_sys_out:
  93         double *f, *g, *o
  94     # sys }}}
  95
  96     # net {{{
  97     ctypedef struct sd_net:
  98         sd_sys * ( * sys)(sd_net *d)
  99         void (*free)(sd_net *d)
 100         uint32_t (*get_n)(sd_net *net)
 101         uint32_t (*get_m)(sd_net *net)
 102         uint32_t (*get_nnz)(sd_net *net)
 103         uint32_t *(*get_or)(sd_net *net)
 104         uint32_t (*get_or_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 105         uint32_t *(*get_ic)(sd_net *net)
 106         uint32_t (*get_ic_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 107         double *(*get_w)(sd_net *net)
 108         double (*get_w_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 109         double *(*get_d)(sd_net *net)
 110         double (*get_d_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 111         uint32_t (*get_ns)(sd_net *net)
 112         uint32_t (*get_ne)(sd_net *net)
 113         bool (*cn_is_null)(sd_net *net)
 114         uint32_t (*get_Ms_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 115         uint32_t (*get_Ma_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 116         uint32_t (*get_Me_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 117         uint32_t (*get_M_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 118         sd_sys * (*get_models_i)(sd_net *net, uint32_t i)
 119         bool (*get__init1)(sd_net *net)
 120         sd_net* sd_net_new_het(uint32_t n, uint32_t m, uint32_t * M, uint32_t * Ms,
 121            uint32_t * Ma, uint32_t * Me,
 122            sd_sys **models,
 123            uint32_t nnz, uint32_t * Or, uint32_t * Ic,
 124                double * w, double * d)
 125         sd_net * sd_net_new_hom(uint32_t n, sd_sys *sys,
 126                 uint32_t ns, uint32_t na, uint32_t ne, uint32_t nnz,
 127                 uint32_t * Or,
 128                 uint32_t * Ic,
 129                 double * w,
 130                 double * d)
 131     # net }}}
 132
 133 # vim: sw=4 et foldmethod=marker