sql/7_0_0-to-7_0_1_upgrade.sql

   1 --
   2 --  Comment Meta Language Constructs:
   3 --
   4 --  #IfNotTable
   5 --    argument: table_name
   6 --    behavior: if the table_name does not exist,  the block will be executed
   7
   8 --  #IfTable
   9 --    argument: table_name
  10 --    behavior: if the table_name does exist, the block will be executed
  11
  12 --  #IfColumn
  13 --    arguments: table_name colname
  14 --    behavior:  if the table and column exist,  the block will be executed
  15
  16 --  #IfMissingColumn
  17 --    arguments: table_name colname
  18 --    behavior:  if the table exists but the column does not,  the block will be executed
  19
  20 --  #IfNotColumnType
  21 --    arguments: table_name colname value
  22 --    behavior:  If the table table_name does not have a column colname with a data type equal to value, then the block will be executed
  23
  24 --  #IfNotColumnTypeDefault
  25 --    arguments: table_name colname value value2
  26 --    behavior:  If the table table_name does not have a column colname with a data type equal to value and a default equal to value2, then the block will be executed
  27
  28 --  #IfNotRow
  29 --    arguments: table_name colname value
  30 --    behavior:  If the table table_name does not have a row where colname = value, the block will be executed.
  31
  32 --  #IfNotRow2D
  33 --    arguments: table_name colname value colname2 value2
  34 --    behavior:  If the table table_name does not have a row where colname = value AND colname2 = value2, the block will be executed.
  35
  36 --  #IfNotRow3D
  37 --    arguments: table_name colname value colname2 value2 colname3 value3
  38 --    behavior:  If the table table_name does not have a row where colname = value AND colname2 = value2 AND colname3 = value3, the block will be executed.
  39
  40 --  #IfNotRow4D
  41 --    arguments: table_name colname value colname2 value2 colname3 value3 colname4 value4
  42 --    behavior:  If the table table_name does not have a row where colname = value AND colname2 = value2 AND colname3 = value3 AND colname4 = value4, the block will be executed.
  43
  44 --  #IfNotRow2Dx2
  45 --    desc:      This is a very specialized function to allow adding items to the list_options table to avoid both redundant option_id and title in each element.
  46 --    arguments: table_name colname value colname2 value2 colname3 value3
  47 --    behavior:  The block will be executed if both statements below are true:
  48 --               1) The table table_name does not have a row where colname = value AND colname2 = value2.
  49 --               2) The table table_name does not have a row where colname = value AND colname3 = value3.
  50
  51 --  #IfRow
  52 --    arguments: table_name colname value
  53 --    behavior:  If the table table_name does have a row where colname = value, the block will be executed.
  54
  55 --  #IfRow2D
  56 --    arguments: table_name colname value colname2 value2
  57 --    behavior:  If the table table_name does have a row where colname = value AND colname2 = value2, the block will be executed.
  58
  59 --  #IfRow3D
  60 --        arguments: table_name colname value colname2 value2 colname3 value3
  61 --        behavior:  If the table table_name does have a row where colname = value AND colname2 = value2 AND colname3 = value3, the block will be executed.
  62
  63 --  #IfRowIsNull
  64 --    arguments: table_name colname
  65 --    behavior:  If the table table_name does have a row where colname is null, the block will be executed.
  66
  67 --  #IfIndex
  68 --    desc:      This function is most often used for dropping of indexes/keys.
  69 --    arguments: table_name colname
  70 --    behavior:  If the table and index exist the relevant statements are executed, otherwise not.
  71
  72 --  #IfNotIndex
  73 --    desc:      This function will allow adding of indexes/keys.
  74 --    arguments: table_name colname
  75 --    behavior:  If the index does not exist, it will be created
  76
  77 --  #EndIf
  78 --    all blocks are terminated with a #EndIf statement.
  79
  80 --  #IfNotListReaction
  81 --    Custom function for creating Reaction List
  82
  83 --  #IfNotListOccupation
  84 --    Custom function for creating Occupation List
  85
  86 --  #IfTextNullFixNeeded
  87 --    desc: convert all text fields without default null to have default null.
  88 --    arguments: none
  89
  90 --  #IfTableEngine
  91 --    desc:      Execute SQL if the table has been created with given engine specified.
  92 --    arguments: table_name engine
  93 --    behavior:  Use when engine conversion requires more than one ALTER TABLE
  94
  95 --  #IfInnoDBMigrationNeeded
  96 --    desc: find all MyISAM tables and convert them to InnoDB.
  97 --    arguments: none
  98 --    behavior: can take a long time.
  99
 100 --  #IfDocumentNamingNeeded
 101 --    desc: populate name field with document names.
 102 --    arguments: none
 103
 104 --  #IfUpdateEditOptionsNeeded
 105 --    desc: Change Layout edit options.
 106 --    arguments: mode(add or remove) layout_form_id the_edit_option comma_separated_list_of_field_ids
 107
 108 --  #IfVitalsDatesNeeded
 109 --    desc: Change date from zeroes to date of vitals form creation.
 110 --    arguments: none
 111
 112 #IfNotTable questionnaire_repository
 113 CREATE TABLE `questionnaire_repository` (
 114     `id` bigint(21) UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT,
 115     `uuid` binary(16) DEFAULT NULL,
 116     `questionnaire_id` varchar(255) DEFAULT NULL,
 117     `provider` int(11) UNSIGNED DEFAULT NULL,
 118     `version` int(11) NOT NULL DEFAULT 1,
 119     `created_date` datetime DEFAULT current_timestamp(),
 120     `modified_date` datetime DEFAULT current_timestamp(),
 121     `name` varchar(255) DEFAULT NULL,
 122     `type` varchar(63) NOT NULL DEFAULT 'Questionnaire',
 123     `profile` varchar(255) DEFAULT NULL,
 124     `active` tinyint(2) NOT NULL DEFAULT 1,
 125     `status` varchar(31) DEFAULT NULL,
 126     `source_url` text,
 127     `code` varchar(255) DEFAULT NULL,
 128     `code_display` text,
 129     `questionnaire` longtext,
 130     PRIMARY KEY (`id`),
 131     UNIQUE KEY `uuid` (`uuid`),
 132     KEY `search` (`name`,`questionnaire_id`)
 133 ) ENGINE=InnoDB;
 134 #EndIf
 135
 136 -- At this point below table was never used. Simply recreating with additions
 137 #IfMissingColumn questionnaire_response response_id
 138 DROP TABLE `questionnaire_response`;
 139 #EndIf
 140
 141 #IfMissingColumn questionnaire_repository lform
 142 ALTER TABLE `questionnaire_repository` ADD `lform` LONGTEXT;
 143 #EndIf
 144
 145 #IfMissingColumn registry form_foreign_id
 146 ALTER TABLE `registry` ADD `form_foreign_id` BIGINT(21) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'An id to a form repository. Primarily questionnaire_repository.';
 147 #EndIf
 148
 149 #IfNotTable form_questionnaire_assessments
 150 CREATE TABLE `form_questionnaire_assessments` (
 151   `id` bigint(21) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
 152   `date` datetime DEFAULT current_timestamp(),
 153   `last_date` datetime DEFAULT NULL,
 154   `pid` bigint(21) NOT NULL DEFAULT 0,
 155   `user` bigint(21) DEFAULT NULL,
 156   `groupname` varchar(255) DEFAULT NULL,
 157   `authorized` tinyint(4) NOT NULL DEFAULT 0,
 158   `activity` tinyint(4) NOT NULL DEFAULT 1,
 159   `copyright` text,
 160   `form_name` varchar(255) DEFAULT NULL,
 161   `code` varchar(31) DEFAULT NULL,
 162   `code_type` varchar(31) DEFAULT "LOINC",
 163   `questionnaire` longtext,
 164   `questionnaire_response` longtext,
 165   `lform` longtext,
 166   `lform_response` longtext,
 167   PRIMARY KEY (`id`)
 168 ) ENGINE=InnoDB;
 169 INSERT INTO `registry` (`name`, `state`, `directory`, `sql_run`, `unpackaged`, `date`, `priority`, `category`, `nickname`, `patient_encounter`, `therapy_group_encounter`, `aco_spec`, `form_foreign_id`) VALUES ('New Questionnaire', 1, 'questionnaire_assessments', 1, 1, '2022-08-04 14:45:15', 0, 'Questionnaires', '', 1, 0, 'admin|forms', NULL);
 170 #EndIf
 171
 172 #IfMissingColumn openemr_postcalendar_events uuid
 173 ALTER TABLE `openemr_postcalendar_events` ADD `uuid` binary(16) DEFAULT NULL;
 174 #EndIf
 175
 176 #IfNotIndex openemr_postcalendar_events uuid
 177 CREATE UNIQUE INDEX `uuid` ON `openemr_postcalendar_events` (`uuid`);
 178 #EndIf
 179
 180 #IfNotRow2D list_options list_id drug_route option_id bymouth
 181 INSERT INTO `list_options` (`list_id`, `option_id`, `title`, `seq`, `is_default`, `notes`, `codes`) VALUES ('drug_route', 'bymouth', 'By Mouth', 1, 0, 'PO', 'NCI-CONCEPT-ID:C38288');
 182 #EndIf
 183
 184 #IfNotColumnType prescriptions route VARCHAR(100)
 185 ALTER TABLE `prescriptions` CHANGE `route` `route` VARCHAR(100) NULL DEFAULT NULL Comment 'Max size 100 characters is same max as immunizations';
 186 #EndIf
 187
 188 #IfNotRow4D supported_external_dataloads load_type ICD10 load_source CMS load_release_date 2022-10-01 load_filename 2023 Code Descriptions in Tabular Order.zip
 189 INSERT INTO `supported_external_dataloads` (`load_type`, `load_source`, `load_release_date`, `load_filename`, `load_checksum`) VALUES
 190     ('ICD10', 'CMS', '2022-10-01', '2023 Code Descriptions in Tabular Order.zip', 'a2bd2e87d6fac3f861b03dba9ca87cbc');
 191 #EndIf
 192
 193 #IfNotRow4D supported_external_dataloads load_type ICD10 load_source CMS load_release_date 2022-10-01 load_filename Zip File 3 2023 ICD-10-PCS Codes File.zip
 194 INSERT INTO `supported_external_dataloads` (`load_type`, `load_source`, `load_release_date`, `load_filename`, `load_checksum`) VALUES
 195     ('ICD10', 'CMS', '2022-10-01', 'Zip File 3 2023 ICD-10-PCS Codes File.zip', 'a4c0e6026557d770dc3d994718acaa21');
 196
 197 #IfNotTable questionnaire_response
 198 CREATE TABLE `questionnaire_response` (
 199  `id` bigint(21) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
 200  `uuid` binary(16) DEFAULT NULL,
 201  `response_id` varchar(255) DEFAULT NULL COMMENT 'A globally unique id for answer set. String version of UUID',
 202  `questionnaire_foreign_id` bigint(21) DEFAULT NULL COMMENT 'questionnaire_repository id for subject questionnaire',
 203  `questionnaire_id` varchar(255) DEFAULT NULL COMMENT 'Id for questionnaire content. String version of UUID',
 204  `questionnaire_name` varchar(255) DEFAULT NULL,
 205  `patient_id` int(11) DEFAULT NULL,
 206  `encounter` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'May or may not be associated with an encounter',
 207  `audit_user_id` int(11) DEFAULT NULL,
 208  `creator_user_id` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'user id if answers are provider',
 209  `create_time` datetime DEFAULT current_timestamp(),
 210  `last_updated` datetime DEFAULT NULL,
 211  `version` int(11) NOT NULL DEFAULT 1,
 212  `status` varchar(63) DEFAULT NULL COMMENT 'form current status. completed,active,incomplete',
 213  `questionnaire` longtext COMMENT 'the subject questionnaire json',
 214  `questionnaire_response` longtext COMMENT 'questionnaire response json',
 215  `form_response` longtext COMMENT 'lform answers array json',
 216  `form_score` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'Arithmetic scoring of questionnaires',
 217  `tscore` double DEFAULT NULL COMMENT 'T-Score',
 218  `error` double DEFAULT NULL COMMENT 'Standard error for the T-Score',
 219  PRIMARY KEY (`id`),
 220  UNIQUE KEY `uuid` (`uuid`),
 221  KEY `response_index` (`response_id`, `patient_id`, `questionnaire_id`, `questionnaire_name`)
 222 ) ENGINE=InnoDB;
 223 #EndIf
 224
 225 #IfMissingColumn form_questionnaire_assessments response_id
 226 ALTER TABLE `form_questionnaire_assessments` CHANGE `last_date` `response_id` TEXT COMMENT 'The foreign id to the questionnaire_response repository';
 227 ALTER TABLE `form_questionnaire_assessments` CHANGE `code` `response_meta` TEXT COMMENT 'json meta data for the response resource';
 228 ALTER TABLE `form_questionnaire_assessments` CHANGE `code_type` `questionnaire_id` TEXT COMMENT 'The foreign id to the questionnaire_repository';
 229 #EndIf
 230
 231 #IfNotRow2D list_options list_id Document_Template_Categories option_id questionnaire
 232 INSERT INTO `list_options` (`list_id`, `option_id`, `title`, `seq`, `is_default`, `option_value`, `mapping`, `notes`, `codes`, `toggle_setting_1`, `toggle_setting_2`, `activity`) VALUES ('Document_Template_Categories','questionnaire','Questionnaires',10,0,0,'','','',0,0,1);
 233 #EndIf
 234
 235 #IfMissingColumn layout_group_properties grp_unchecked
 236 ALTER TABLE `layout_group_properties` ADD `grp_unchecked` tinyint(1) NOT NULL DEFAULT 0;
 237 #EndIf
 238
 239 #IfMissingColumn form_encounter in_collection
 240 ALTER TABLE `form_encounter` ADD `in_collection` tinyint(1) DEFAULT NULL;
 241 #EndIf
 242
 243 #IfVitalsDatesNeeded
 244 #EndIf
 245
 246 #IfRow2D categories aco_spec patients|docs name Patient Information
 247 UPDATE `categories` SET `aco_spec` = 'patients|demo' WHERE `name` = 'Patient Information';
 248 #EndIf
 249
 250 #IfRow2D categories aco_spec patients|docs name Patient ID card
 251 UPDATE `categories` SET `aco_spec` = 'patients|demo' WHERE `name` = 'Patient ID card';
 252 #EndIf
 253
 254 #IfRow2D categories aco_spec patients|docs name Patient Photograph
 255 UPDATE `categories` SET `aco_spec` = 'patients|demo' WHERE `name` = 'Patient Photograph';
 256 #EndIf
 257
 258 #IfNotColumnType audit_details field_value LONGTEXT
 259 ALTER TABLE `audit_details` CHANGE `field_value` `field_value` LONGTEXT COMMENT 'openemr table field value';
 260 #EndIf
 261
 262 #IfMissingColumn audit_master is_unstructured_document
 263 ALTER TABLE `audit_master` ADD `is_unstructured_document` BOOLEAN NULL DEFAULT FALSE;
 264 #EndIf
 265
 266 #IfNotColumnType ccda ccda_data LONGTEXT
 267 ALTER TABLE `ccda` CHANGE `ccda_data` `ccda_data` LONGTEXT;
 268 #EndIf
 269
 270 #IfNotRow2D background_services name phimail require_once /library/direct_message_check.inc.php
 271 UPDATE `background_services` SET `require_once` = '/library/direct_message_check.inc.php' WHERE `name` = 'phimail';
 272 #EndIf
 273
 274 #IfRow2D registry directory procedure_order category Administrative
 275 UPDATE `registry` SET `category` = 'Orders' WHERE `directory` = 'procedure_order' AND `category` = 'Administrative';
 276 #EndIf
 277
 278 #IfMissingColumn insurance_data date_end
 279 ALTER TABLE `insurance_data` ADD `date_end` date NULL;
 280 #EndIf
 281
 282 #IfNotColumnType form_questionnaire_assessments user VARCHAR(255)
 283 ALTER TABLE `form_questionnaire_assessments` CHANGE `user` `user` VARCHAR(255) NULL DEFAULT NULL;
 284 #EndIf
 285
 286 #IfMissingColumn module_configuration date_created
 287 ALTER TABLE `module_configuration` ADD COLUMN `date_created` DATETIME DEFAULT NULL COMMENT 'Datetime the record was created';
 288 #EndIf
 289
 290 #IfRow2D globals gl_name login_page_layout gl_value center
 291 UPDATE `globals` SET `gl_value` = 'login/layouts/vertical_box.html.twig' WHERE `gl_name` = 'login_page_layout' AND `gl_value` = 'center';
 292 #EndIf
 293
 294 #IfRow2D globals gl_name login_page_layout gl_value left
 295 UPDATE `globals` SET `gl_value` = 'login/layouts/horizontal_box_left_logo.html.twig' WHERE `gl_name` = 'login_page_layout' AND `gl_value` = 'left';
 296 #EndIf
 297
 298 #IfRow2D globals gl_name login_page_layout gl_value right
 299 UPDATE `globals` SET `gl_value` = 'login/layouts/horizontal_band_right_logo.html.twig' WHERE `gl_name` = 'login_page_layout' AND `gl_value` = 'right';
 300 #EndIf
 301
 302 #IfMissingColumn ar_activity payer_claim_number
 303 ALTER TABLE `ar_activity` ADD `payer_claim_number` VARCHAR(30) DEFAULT NULL;
 304 #EndIf
 305
 306 #IfNotTable onetime_auth
 307 CREATE TABLE `onetime_auth` (
 308   `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
 309   `pid` bigint(20) DEFAULT NULL,
 310   `create_user_id` bigint(20) DEFAULT NULL,
 311   `context` varchar(64) DEFAULT NULL,
 312   `access_count` int(11) NOT NULL DEFAULT 0,
 313   `remote_ip` varchar(32) DEFAULT NULL,
 314   `onetime_pin` varchar(10) DEFAULT NULL COMMENT 'Max 10 numeric. Default 6',
 315   `onetime_token` tinytext,
 316   `redirect_url` tinytext,
 317   `expires` int(11) DEFAULT NULL,
 318   `date_created` datetime DEFAULT current_timestamp(),
 319   `last_accessed` datetime DEFAULT NULL,
 320   PRIMARY KEY (`id`),
 321   KEY `pid` (`pid`,`onetime_token`(255))
 322 ) ENGINE=InnoDB;
 323 #EndIf