library/report_database.inc

   1 <?php
   2 /**
   3  * Report tracking, storing and viewing functions using the report_results sql table.
   4  *
   5  * Supports generic tracking, storing and viewing of reports by utilizing a vertical
   6  * table entitled report_results. This allows flexible placement of tokens for report
   7  * setting etc. Also supports itemization of results (per patient tracking).
   8  * <pre>Tokens that are reserved include:
   9  *   'bookmark'          - Allows bookmarking of a new report id (used to allow tracking
  10  *                         progress via ajax calls). If exist, value is always set to '1'.
  11  *   'progress'          - Either set to 'pending' or 'complete'.
  12  *   'type'              - Set to type of report
  13  *   'total_items'       - Set to total number of items that will be processed (ie. such as patients)
  14  *   'progress_items'    - Set to number of items (ie. such as patients)
  15  *   'data'              - Contains the data of the report
  16  *   'date_report'       - Set to date of the report (date and time)
  17  *   'date_report_complete'       - Set to date of the report completion (date and time)
  18  * </pre>
  19  *
  20  * These functions should not ever attempt to write to
  21  * session variables, because the session_write_close() function
  22  * is typically called before utilizing these functions.
  23  *
  24  * Copyright (C) 2012 Brady Miller <brady.g.miller@gmail.com>
  25  *
  26  * LICENSE: This program is free software; you can redistribute it and/or
  27  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  28  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  29  * of the License, or (at your option) any later version.
  30  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  31  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  32  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
  33  * GNU General Public License for more details.
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  35  * along with this program. If not, see <http://opensource.org/licenses/gpl-license.php>;.
  36  *
  37  * @package OpenEMR
  38  * @author  Brady Miller <brady.g.miller@gmail.com>
  39  * @link    http://www.open-emr.org
  40  */
  41
  42 /**
  43  * Return listing of report results.
  44  *
  45  * @param   timestamp  $start  Start of date range
  46  * @param   timestamp  $end    End of date range
  47  * @return  sql-query          Listing of report results
  48  */
  49 function listingReportDatabase($start_date='',$end_date='') {
  50
  51   // set $end_date to today's date if empty
  52   $end_date = ($end_date) ? $end_date : date('Y-m-d H:i:s');
  53
  54   // Collect pertinent information as a pivot table (ie. converting vertical to horizontal row)
  55   if (empty($start_date)) {
  56     $res = sqlStatement("SELECT *, TIMESTAMPDIFF(MINUTE,pt.date_report,pt.date_report_complete) as `report_time_processing`
  57                          FROM (
  58                            SELECT `report_id`,
  59                            MAX(if( `field_id` = 'date_report', `field_value`, 0 )) as `date_report`,
  60                            MAX(if( `field_id` = 'date_report_complete', `field_value`, 0 )) as `date_report_complete`,
  61                            MAX(if( `field_id` = 'progress', `field_value`, 0 )) as `progress`,
  62                            MAX(if( `field_id` = 'total_items', `field_value`, 0 )) as `total_items`,
  63                            MAX(if( `field_id` = 'progress_items', `field_value`, 0 )) as `progress_items`,
  64                            MAX(if( `field_id` = 'type', `field_value`, 0 )) as `type`
  65                            FROM `report_results`
  66                            GROUP BY `report_id`
  67                          ) AS pt
  68                          WHERE pt.date_report < ?
  69                          ORDER BY pt.report_id", array($end_date));
  70   }
  71   else {
  72     $res = sqlStatement("SELECT *, TIMESTAMPDIFF(MINUTE,pt.date_report,pt.date_report_complete) as `report_time_processing`
  73                          FROM (
  74                            SELECT `report_id`,
  75                            MAX(if( `field_id` = 'date_report', `field_value`, 0 )) as `date_report`,
  76                            MAX(if( `field_id` = 'date_report_complete', `field_value`, 0 )) as `date_report_complete`,
  77                            MAX(if( `field_id` = 'progress', `field_value`, 0 )) as `progress`,
  78                            MAX(if( `field_id` = 'total_items', `field_value`, 0 )) as `total_items`,
  79                            MAX(if( `field_id` = 'progress_items', `field_value`, 0 )) as `progress_items`,
  80                            MAX(if( `field_id` = 'type', `field_value`, 0 )) as `type`
  81                            FROM `report_results`
  82                            GROUP BY `report_id`
  83                          ) AS pt
  84                          WHERE pt.date_report > ? AND pt.date_report < ?
  85                          ORDER BY pt.report_id", array($start_date,$end_date));
  86   }
  87
  88   return $res;
  89 }
  90
  91 /**
  92  * Simply reserves a report id for use in the report results tracking/storing/viewing item in database..
  93  *
  94  * @return  integer           Report id that was assigned in database
  95  */
  96 function bookmarkReportDatabase() {
  97
  98   // Retrieve a new report id
  99   $query = sqlQuery("SELECT max(`report_id`) as max_report_id FROM `report_results`");
 100   if (empty($query)) {
 101     $new_report_id = 1;
 102   }
 103   else {
 104    $new_report_id = $query['max_report_id'] + 1;
 105   }
 106
 107   // Set the bookmark token
 108   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,"bookmark",1));
 109
 110   return $new_report_id;
 111 }
 112
 113 /**
 114  * Initiate a report results tracking/storing/viewing item in database.
 115  *
 116  * @param   string   $type       Report type identifier
 117  * @param   array    $fields     Array containing pertinent report details (Do NOT use 'bookmark', 'progress','type','progress_patients', 'data', 'date_report' or 'no_json_support' as keys in array; they will be ignored)
 118  * @param   integer  $report_id  Report id (if have already bookmarked a report id)
 119  * @return  integer              Report id that is assigned to the report
 120  */
 121 function beginReportDatabase($type,$fields,$report_id=NULL) {
 122
 123   // Retrieve a new report id, if needed.
 124   if (empty($report_id)) {
 125     $query = sqlQuery("SELECT max(`report_id`) as max_report_id FROM `report_results`");
 126     if (empty($query)) {
 127       $new_report_id = 1;
 128     }
 129     else {
 130      $new_report_id = $query['max_report_id'] + 1;
 131     }
 132   }
 133   else {
 134     $new_report_id = $report_id;
 135   }
 136
 137   // Set the required tokens
 138   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,"progress","pending"));
 139   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,"type",$type));
 140   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,"progress_items","0"));
 141   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,"data",""));
 142   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,"date_report",date("Y-m-d H:i:s")));
 143
 144   // Set the fields tokens
 145   if (!empty($fields)) {
 146    foreach ($fields as $key=>$value) {
 147
 148     // skip the special tokens
 149     if (($key == "type") ||
 150         ($key == "data") ||
 151         ($key == "progress") ||
 152         ($key == "progress_items") ||
 153         ($key == "total_items") ||
 154         ($key == "date_report") ||
 155         ($key == "date_report_complete") ||
 156         ($key == "bookmark") ) continue;
 157
 158     // place the token
 159     sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($new_report_id,$key,$value));
 160    }
 161   }
 162
 163   // Return the report id
 164   return $new_report_id;
 165 }
 166
 167 /**
 168  * Insert total items to process in database.
 169  * For performance reasons, it is assumed that the total_items does not already exists in current database entry.
 170  *
 171  * @param   integer  $report_id    Report id
 172  * @param   integer  $total_items  Total number of items that will be processed
 173  */
 174 function setTotalItemsReportDatabase($report_id,$total_items) {
 175   // Insert the total items that are to be processed
 176   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($report_id,"total_items",$total_items));
 177 }
 178
 179 /**
 180  * Update report results in database(basically update number of items (patients) that has been processed in pending reports).
 181  * For performance reasons, it is assumed that the progress_items token already exists in current database entry.
 182  *
 183  * @param   integer  $report_id           Report id
 184  * @param   integer  $items_processed  Number of items that have been processed
 185  */
 186 function updateReportDatabase($report_id,$items_processed) {
 187   // Update the items that have been processed
 188   sqlStatement("UPDATE `report_results` SET `field_value`=? WHERE `report_id`=? AND `field_id`='progress_items'", array($items_processed,$report_id) );
 189 }
 190
 191 /**
 192  * Store (finished) report results (in json format) in database.
 193  * For performance reasons, it is assumed that the data and progress tokens already exists in current database entry.
 194  * For performance reasons, it is assumed that the date_report_complete does not already exists in current database entry.
 195  *
 196  * @param   integer  $report_id  Report id
 197  * @param   string   $data       Report results/data
 198  */
 199 function finishReportDatabase($report_id,$data) {
 200
 201   // Record the data
 202   sqlStatement("UPDATE `report_results` SET `field_value`=? WHERE `report_id`=? AND `field_id`='data'", array($data,$report_id) );
 203
 204   // Record the finish date/time
 205   sqlStatement("INSERT INTO `report_results` (`report_id`,`field_id`,`field_value`) VALUES (?,?,?)", array ($report_id,"date_report_complete",date("Y-m-d H:i:s")));
 206
 207   // Set progress to complete
 208   sqlStatement("UPDATE `report_results` SET `field_value`='complete' WHERE `report_id`=? AND `field_id`='progress'", array($report_id) );
 209 }
 210
 211 /**
 212  * Collect report results from database.
 213  *
 214  * @param   integer  $report_id  Report id
 215  * @return  array                Array of id/values for a report
 216  */
 217 function collectReportDatabase($report_id) {
 218
 219   // Collect the rows of data
 220   $res = sqlStatement("SELECT * FROM `report_results` WHERE `report_id`=?", array($report_id));
 221
 222   // Convert data into an array
 223   $final_array = array();
 224   while ($row = sqlFetchArray($res)) {
 225     $final_array = array_merge($final_array,array($row['field_id']=>$row['field_value']));
 226   }
 227
 228   return $final_array;
 229 }
 230
 231 /**
 232  * Get status of report from database.
 233  *
 234  * @param   integer  $report_id  Report id
 235  * @return  string               Status report (PENDING, COMPLETE, or return a string with progress)
 236  */
 237 function getStatusReportDatabase($report_id) {
 238
 239   // Collect the pertinent rows of data
 240   $res = sqlStatement("SELECT `field_id`, `field_value` FROM `report_results` WHERE `report_id`=? AND (`field_id`='progress' OR `field_id`='total_items' OR `field_id`='progress_items')", array($report_id));
 241
 242   // If empty, then just return Pending, since stil haven't likely created the entries yet
 243   if (sqlNumRows($res) < 1) {
 244     return "PENDING";
 245   }
 246
 247   // Place into an array for quick processing
 248   $final_array = array();
 249   while ($row = sqlFetchArray($res)) {
 250     $final_array = array_merge($final_array,array($row['field_id']=>$row['field_value']));
 251   }
 252
 253   if ($final_array['progress'] == "complete") {
 254     // return COMPLETE
 255     return "COMPLETE";
 256   }
 257   else {
 258     $final_array['progress_items'] = ($final_array['progress_items']) ? $final_array['progress_items'] : 0;
 259     return $final_array['progress_items'] . " / " . $final_array['total_items'] . " " . xl("Patients");
 260   }
 261 }
 262
 263 /**
 264  * Insert itemization item into database.
 265  *
 266  * @param   integer  $report_id         Report id
 267  * @param   integer  $itemized_test_id  Itemized test id
 268  * @param   integer  $pass              0 is fail, 1 is pass, 2 is exclude
 269  * @param   integer  $patient_id        Patient pid
 270  * @param   integer  $$numerator_label  Numerator label (if applicable)
 271  */
 272 function insertItemReportTracker($report_id, $itemized_test_id, $pass, $patient_id, $numerator_label='') {
 273   $sqlParameters = array($report_id,$itemized_test_id,$numerator_label,$pass,$patient_id);
 274   sqlStatementCdrEngine("INSERT INTO `report_itemized` (`report_id`,`itemized_test_id`,`numerator_label`,`pass`,`pid`) VALUES (?,?,?,?,?)", $sqlParameters);
 275 }
 276
 277 /**
 278  * Collect a rules display title for itemized report.
 279  *
 280  * @param   integer  $report_id         Report id
 281  * @param   integer  $itemized_test_id  Itemized test id
 282  * @param   integer  $numerator_label   Numerator label (if applicable)
 283  * @return  string/boolean              Rule title for itemization display (false if nothing found)
 284  */
 285 function collectItemizedRuleDisplayTitle($report_id, $itemized_test_id, $numerator_label='') {
 286   $dispTitle = "";
 287   $report_view = collectReportDatabase($report_id);
 288   $type_report = $report_view['type'];
 289   $dataSheet = json_decode($report_view['data'],TRUE);
 290   foreach ($dataSheet as $row) {
 291     if (isset($row['is_main']) || isset($row['is_sub'])) {
 292       if (isset($row['is_main'])) {
 293         // Store this
 294         $dispTitle = generate_display_field(array('data_type'=>'1','list_id'=>'clinical_rules'),$row['id']);
 295       }
 296       if ( ($row['itemized_test_id'] == $itemized_test_id) && ($row['numerator_label'] == $numerator_label) ) {
 297         // We have a hit, build on the $dispTitle created above
 298         if (isset($row['is_main'])) {
 299           $tempCqmAmcString = "";
 300           if (($type_report == "cqm") || ($type_report == "cqm_2011") || ($type_report == "cqm_2014")) {
 301             if (!empty($row['cqm_pqri_code'])) {
 302               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('PQRI') . ":" . text($row['cqm_pqri_code']) . " ";
 303             }
 304             if (!empty($row['cqm_nqf_code'])) {
 305               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('NQF') . ":" . text($row['cqm_nqf_code']) . " ";
 306             }
 307           }
 308           if ($type_report == "amc") {
 309             if (!empty($row['amc_code'])) {
 310               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('AMC-2011') . ":" . text($row['amc_code']) . " ";
 311             }
 312             if (!empty($row['amc_code_2014'])) {
 313               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('AMC-2014') . ":" . text($row['amc_code_2014']) . " ";
 314             }
 315           }
 316           if ($type_report == "amc_2011") {
 317             if (!empty($row['amc_code'])) {
 318               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('AMC-2011') . ":" . text($row['amc_code']) . " ";
 319             }
 320           }
 321           if ($type_report == "amc_2014_stage1") {
 322             if (!empty($row['amc_code_2014'])) {
 323               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('AMC-2014 Stage I'). ":" . text($row['amc_code_2014']) . " ";
 324             }
 325           }
 326           if ($type_report == "amc_2014_stage2") {
 327             if (!empty($row['amc_code_2014'])) {
 328               $tempCqmAmcString .= " " . xlt('AMC-2014 Stage II'). ":" . text($row['amc_code_2014']) . " ";
 329             }
 330           }
 331
 332           if (!empty($tempCqmAmcString)) {
 333             $dispTitle .=  "(".$tempCqmAmcString.")";
 334           }
 335           if ( !(empty($row['concatenated_label'])) ) {
 336             $dispTitle .= ", " . xlt($row['concatenated_label']) . " ";
 337           }
 338         }
 339         else { // isset($row['is_sub']
 340           $dispTitle .= " - " .  generate_display_field(array('data_type'=>'1','list_id'=>'rule_action_category'),$row['action_category']);
 341           $dispTitle .= ": " . generate_display_field(array('data_type'=>'1','list_id'=>'rule_action'),$row['action_item']);
 342         }
 343         return $dispTitle;
 344       }
 345     }
 346   }
 347   return false;
 348 }
 349
 350 /**
 351  * Collect patient listing from CDR reports itemization.
 352  *
 353  * @param   integer  $report_id         Report id
 354  * @param   integer  $itemized_test_id  Itemized test id
 355  * @param   string   $pass              options are 'fail', 'pass', 'exclude', 'init_patients', 'exception' and 'all'
 356  * @param   integer  $numerator_label   Numerator label (if applicable)
 357  * @param   integer  $sqllimit          Sql query pagination info
 358  * @param   integer  $fstart            Sql query pagination info
 359  * @return  array/integer               Array list or a count
 360  */
 361 function collectItemizedPatientsCdrReport($report_id,$itemized_test_id,$pass='all',$numerator_label='',$count=false,$sqllimit='all',$fstart=0) {
 362
 363   if ($count) {
 364     $given = " COUNT(DISTINCT `patient_data`.`pid`) AS total_listings ";
 365   }
 366   else {
 367     $given = " DISTINCT `patient_data`.*, DATE_FORMAT(`patient_data`.`DOB`,'%m/%d/%Y') as DOB_TS ";
 368   }
 369   $orderby = " `patient_data`.`lname` ASC, `patient_data`.`fname` ASC ";
 370
 371   // set $pass_sql
 372   switch ($pass) {
 373     case "fail":
 374       $pass_sql=0;
 375       break;
 376     case "pass":
 377       $pass_sql=1;
 378       break;
 379     case "exclude":
 380       $pass_sql=2;
 381       break;
 382     case "init_patients":
 383       $pass_sql=3;
 384       break;
 385     case "exception":
 386       $pass_sql=4;
 387       break;
 388   }
 389
 390   $sqlParameters = array($report_id,$itemized_test_id,$numerator_label);
 391
 392   if ($pass == "all") {
 393     $sql_where = " WHERE `report_itemized`.`pass` != 3 AND `report_itemized`.`report_id` = ? AND `report_itemized`.`itemized_test_id` = ? AND `report_itemized`.`numerator_label` = ? ";
 394   }
 395   else if ($pass == "fail") {
 396     $exlPidArr = array();
 397     $exludeResult = collectItemizedPatientsCdrReport($report_id,$itemized_test_id,'exclude',$numerator_label,false,$sqllimit,$fstart);
 398     foreach($exludeResult as $exlResArr){
 399       $exlPidArr[] = $exlResArr['pid'];
 400     }
 401
 402     $sql_where = " WHERE `report_itemized`.`report_id` = ? AND `report_itemized`.`itemized_test_id` = ? AND `report_itemized`.`numerator_label` = ? AND `report_itemized`.`pass` = ? ";
 403
 404     if(count($exlPidArr) > 0){
 405       $exlPids = implode(",", $exlPidArr);
 406       $sql_where .= " AND patient_data.pid NOT IN(" . add_escape_custom($exlPids) . ") ";
 407     }
 408     array_push($sqlParameters,$pass_sql);
 409   }
 410   else {
 411     $sql_where = " WHERE `report_itemized`.`report_id` = ? AND `report_itemized`.`itemized_test_id` = ? AND `report_itemized`.`numerator_label` = ? AND `report_itemized`.`pass` = ? ";
 412     array_push($sqlParameters,$pass_sql);
 413   }
 414
 415   $sql_query = "SELECT " . $given . " FROM `patient_data` JOIN `report_itemized` ON `patient_data`.`pid` = `report_itemized`.`pid` " . $sql_where. " ORDER BY " . $orderby;
 416
 417   if ($sqllimit != "all") $sql_query .= " limit " . escape_limit($fstart) . ", " . escape_limit($sqllimit);
 418
 419   if ($count) {
 420     $rez = sqlQueryCdrEngine($sql_query,$sqlParameters);
 421     return $rez['total_listings'];
 422   }
 423   else {
 424     $rez = sqlStatementCdrEngine($sql_query,$sqlParameters);
 425     // create array of listing for return
 426     for($iter=0; $row=sqlFetchArray($rez); $iter++) {
 427       $returnval[$iter]=$row;
 428     }
 429     return $returnval;
 430   }
 431 }
 432 ?>