Added a docker-compose.yml (#1613)
[openemr.git] / library / sql-ccr.inc
blob3e319e2a4b70af5fd230a295465fab811be00e68
1 <?php
2 /**
3  * Functions for CCR.
4  *
5  * Copyright (C) 2010 Garden State Health Systems <http://www.gshsys.com/>
6  *
7  * LICENSE: This program is free software; you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
9  * as published by the Free Software Foundation; either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
12  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
14  * GNU General Public License for more details.
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program. If not, see <http://opensource.org/licenses/gpl-license.php>;.
17  *
18  * @package OpenEMR
19  * @author  Garden State Health Systems <http://www.gshsys.com/>
20  * @link    http://www.open-emr.org
21  */
24 if ($_POST['ccrAction'] == 'generate') {
25     if (isset($_POST['show_date'])) {
26         $set = "on";
27         $start = $_POST['Start'];
28         $start = $start." 00:00:00";
29         $end = $_POST['End'];
30         $end = $end." 23:59:59";
31     }
34 function getHeaderData()
37 // Reserved for future use
40 function getMedicationData()
42     global $pid,$set,$start,$end;
43     if ($set == "on") {
44         $sql = " 
45       SELECT prescriptions.date_added ,
46         prescriptions.patient_id,
47         prescriptions.start_date,
48         prescriptions.quantity,
49         prescriptions.interval,
50         prescriptions.note,
51         prescriptions.drug,
52         prescriptions.medication,
53         IF(prescriptions.active=1,'Active','Prior History No Longer Active') AS active,
54         prescriptions.provider_id,
55         prescriptions.size,
56         prescriptions.rxnorm_drugcode,
57         IFNULL(prescriptions.refills,0) AS refills,
58         lo2.title AS form,
59         lo.title
60       FROM prescriptions 
61       LEFT JOIN list_options AS lo
62       ON lo.list_id = 'drug_units' AND prescriptions.unit = lo.option_id AND lo.activity = 1
63       LEFT JOIN list_options AS lo2
64       ON lo2.list_id = 'drug_form' AND prescriptions.form = lo2.option_id AND lo2.activity = 1
65       WHERE prescriptions.patient_id = ?
66       AND prescriptions.date_added BETWEEN ? AND ?
67       UNION
68       SELECT 
69         DATE(DATE) AS date_added,
70         pid AS patient_id,
71         begdate AS start_date,
72         '' AS quantity,
73         '' AS `interval`,
74         comments AS note,
75         title AS drug,
76         '' AS medication,
77         IF((isnull(enddate) OR enddate = '0000-00-00' OR enddate >= CURDATE()),'Active','Prior History No Longer Active') AS active,
78         '' AS provider_id,
79         '' AS size,
80 '' AS rxnorm_drugcode,
81         0 AS refills,
82         '' AS form,
83         '' AS title 
84       FROM
85         lists 
86       WHERE `type` = 'medication' 
87         AND pid = ?
88         AND `date` BETWEEN ? AND ?";
89         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$start,$end,$pid,$start,$end));
90     } else {
91         $sql = " 
92       SELECT prescriptions.date_added ,
93         prescriptions.patient_id,
94         prescriptions.start_date,
95         prescriptions.quantity,
96         prescriptions.interval,
97         prescriptions.note,
98         prescriptions.drug,
99         prescriptions.medication,
100         IF(prescriptions.active=1,'Active','Prior History No Longer Active') AS active,
101         prescriptions.provider_id,
102         prescriptions.size,
103         prescriptions.rxnorm_drugcode,
104         IFNULL(prescriptions.refills,0) AS refills,
105         lo2.title AS form,
106         lo.title
107       FROM prescriptions 
108       LEFT JOIN list_options AS lo
109       ON lo.list_id = 'drug_units' AND prescriptions.unit = lo.option_id AND lo.activity = 1
110       LEFT JOIN list_options AS lo2
111       ON lo2.list_id = 'drug_form' AND prescriptions.form = lo2.option_id AND lo2.activity = 1
112       WHERE prescriptions.patient_id = ?
113       UNION
114       SELECT 
115         DATE(DATE) AS date_added,
116         pid AS patient_id,
117         begdate AS start_date,
118         '' AS quantity,
119         '' AS `interval`,
120         comments AS note,
121         title AS drug,
122         '' AS medication,
123         IF((isnull(enddate) OR enddate = '0000-00-00' OR enddate >= CURDATE()),'Active','Prior History No Longer Active') AS active,
124         '' AS provider_id,
125         '' AS size,
126         '' AS rxnorm_drugcode,
127         0 AS refills,
128         '' AS form,
129         '' AS title 
130       FROM
131         lists 
132       WHERE `type` = 'medication' 
133         AND pid = ?";
134         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$pid));
135     }
137     return $result;
140 function getImmunizationData()
142     global $pid,$set,$start,$end;
143     if ($set == "on") {
144         $sql = "SELECT
145       immunizations.administered_date,
146       immunizations.patient_id,
147       immunizations.vis_date,
148       immunizations.note,
149       immunizations.immunization_id,
150       immunizations.manufacturer,
151       codes.code_text AS title
152     FROM immunizations 
153     LEFT JOIN codes ON immunizations.cvx_code = codes.code
154     LEFT JOIN code_types ON codes.code_type = code_types.ct_id
155     WHERE immunizations.patient_id = ? AND code_types.ct_key = 'CVX' AND immunizations.added_erroneously = 0
156     AND create_date BETWEEN ? AND ?" ;
157         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$start,$end));
158     } else {
159         $sql = "SELECT
160       immunizations.administered_date,
161       immunizations.patient_id,
162       immunizations.vis_date,
163       immunizations.note,
164       immunizations.immunization_id,
165       immunizations.manufacturer,
166       codes.code_text AS title
167     FROM immunizations 
168     LEFT JOIN codes ON immunizations.cvx_code = codes.code
169     LEFT JOIN code_types ON codes.code_type = code_types.ct_id
170     WHERE immunizations.patient_id = ? AND immunizations.added_erroneously = 0 AND code_types.ct_key = 'CVX'";
171         $result = sqlStatement($sql, array($pid));
172     }
174     return $result;
178 function getProcedureData()
181     global $pid,$set,$start,$end;
182     if ($set == "on") {
183         $sql = " 
184     SELECT 
185       lists.title as proc_title,
186       lists.date as `date`,
187       list_options.title as outcome,
188       '' as laterality,
189       '' as body_site,
190       lists.type as `type`,
191       lists.diagnosis as `code`,
192       IF(SUBSTRING(lists.diagnosis,1,LOCATE(':',lists.diagnosis)-1) = 'ICD9','ICD9-CM',SUBSTRING(lists.diagnosis,1,LOCATE(':',lists.diagnosis)-1)) AS coding
193     FROM
194       lists 
195       LEFT JOIN issue_encounter 
196         ON issue_encounter.list_id = lists.id 
197       LEFT JOIN form_encounter 
198         ON form_encounter.encounter = issue_encounter.encounter 
199       LEFT JOIN facility 
200         ON form_encounter.facility_id = facility.id 
201       LEFT JOIN users 
202         ON form_encounter.provider_id = users.id 
203       LEFT JOIN list_options
204         ON lists.outcome = list_options.option_id
205         AND list_options.list_id = 'outcome' AND list_options.activity = 1
206     WHERE lists.type = 'surgery' 
207       AND lists.pid = ?
208       AND lists.date BETWEEN ? AND ?
209     UNION
210     SELECT 
211       pt.name as proc_title,
212       prs.date as `date`,
213       '' as outcome,
214       ptt.laterality as laterality,
215       ptt.body_site as body_site,
216       'Lab Order' as `type`,
217       ptt.standard_code as `code`,
218       IF(SUBSTRING(ptt.standard_code,1,LOCATE(':',ptt.standard_code)-1) = 'ICD9','ICD9-CM',SUBSTRING(ptt.standard_code,1,LOCATE(':',ptt.standard_code)-1)) AS coding
219     FROM
220       procedure_result AS prs 
221       LEFT JOIN procedure_report AS prp 
222         ON prs.procedure_report_id = prp.procedure_report_id 
223       LEFT JOIN procedure_order AS po 
224         ON prp.procedure_order_id = po.procedure_order_id 
225       LEFT JOIN procedure_order_code AS poc
226         ON poc.procedure_order_id = po.procedure_order_id
227         AND poc.procedure_order_seq = prp.procedure_order_seq
228       LEFT JOIN procedure_type AS pt 
229         ON pt.lab_id = po.lab_id
230         AND pt.procedure_code = prs.result_code
231         AND pt.procedure_type = 'res'
232       LEFT JOIN procedure_type AS ptt 
233         ON pt.parent = ptt.procedure_type_id 
234         AND ptt.procedure_type = 'ord' 
235       LEFT JOIN list_options AS lo 
236         ON lo.list_id = 'proc_unit' 
237         AND pt.units = lo.option_id AND lo.activity = 1
238     WHERE po.patient_id = ?
239     AND prs.date BETWEEN ? AND ?";
240   
241         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$start,$end,$pid,$start,$end));
242     } else {
243         $sql = " 
244     SELECT 
245       lists.title as proc_title,
246       lists.date as `date`,
247       list_options.title as outcome,
248       '' as laterality,
249       '' as body_site,
250       lists.type as `type`,
251       lists.diagnosis as `code`,
252       IF(SUBSTRING(lists.diagnosis,1,LOCATE(':',lists.diagnosis)-1) = 'ICD9','ICD9-CM',SUBSTRING(lists.diagnosis,1,LOCATE(':',lists.diagnosis)-1)) AS coding
253     FROM
254       lists 
255       LEFT JOIN issue_encounter 
256         ON issue_encounter.list_id = lists.id 
257       LEFT JOIN form_encounter 
258         ON form_encounter.encounter = issue_encounter.encounter 
259       LEFT JOIN facility 
260         ON form_encounter.facility_id = facility.id 
261       LEFT JOIN users 
262         ON form_encounter.provider_id = users.id 
263       LEFT JOIN list_options
264         ON lists.outcome = list_options.option_id
265         AND list_options.list_id = 'outcome' AND list_options.activity = 1
266     WHERE lists.type = 'surgery' 
267       AND lists.pid = ? 
268     UNION
269     SELECT 
270       pt.name as proc_title,
271       prs.date as `date`,
272       '' as outcome,
273       ptt.laterality as laterality,
274       ptt.body_site as body_site,
275       'Lab Order' as `type`,
276       ptt.standard_code as `code`,
277       IF(SUBSTRING(ptt.standard_code,1,LOCATE(':',ptt.standard_code)-1) = 'ICD9','ICD9-CM',SUBSTRING(ptt.standard_code,1,LOCATE(':',ptt.standard_code)-1)) AS coding
278     FROM
279       procedure_result AS prs 
280       LEFT JOIN procedure_report AS prp 
281         ON prs.procedure_report_id = prp.procedure_report_id 
282       LEFT JOIN procedure_order AS po 
283         ON prp.procedure_order_id = po.procedure_order_id
284       LEFT JOIN procedure_order_code AS poc
285         ON poc.procedure_order_id = po.procedure_order_id
286         AND poc.procedure_order_seq = prp.procedure_order_seq
287       LEFT JOIN procedure_type AS pt 
288         ON pt.lab_id = po.lab_id
289         AND pt.procedure_code = prs.result_code
290         AND pt.procedure_type = 'res'
291       LEFT JOIN procedure_type AS ptt 
292         ON pt.parent = ptt.procedure_type_id 
293         AND ptt.procedure_type = 'ord' 
294       LEFT JOIN list_options AS lo 
295         ON lo.list_id = 'proc_unit' 
296         AND pt.units = lo.option_id AND lo.activity = 1
297     WHERE po.patient_id = ? ";
298   
299         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$pid));
300     }
302     return $result;
306 function getProblemData()
309   # Note we are hard-coding (only allowing) problems that have been coded to ICD9. Would
310   #  be easy to upgrade this to other codesets in future (ICD10,SNOMED) by using already
311   #  existant flags in the code_types table.
312   # Additionally, only using problems that have one diagnosis code set in diagnosis field.
313   #  Note OpenEMR allows multiple codes set per problem, but will limit to showing only
314   #  problems with one diagnostic code set in order to maintain previous behavior
315   #  (this will likely need to be dealt with at some point; ie. support multiple dx codes per problem).
317     global $pid,$set,$start,$end;
318     if ($set == "on") {
319         $sql = " 
320     SELECT fe.encounter, fe.reason, fe.provider_id, u.title, u.fname, u.lname, 
321       fe.facility_id, f.street, f.city, f.state, ie.list_id, l.pid, l.title AS prob_title, l.diagnosis, 
322       l.outcome, l.groupname, l.begdate, l.enddate, l.type, l.comments , l.date
323     FROM lists AS l 
324     LEFT JOIN issue_encounter AS ie ON ie.list_id = l.id
325     LEFT JOIN form_encounter AS fe ON fe.encounter = ie.encounter
326     LEFT JOIN facility AS f ON fe.facility_id = f.id
327     LEFT JOIN users AS u ON fe.provider_id = u.id
328     WHERE l.type = 'medical_problem' AND l.pid=? AND l.diagnosis LIKE 'ICD9:%'
329     AND l.diagnosis NOT LIKE '%;%'
330     AND l.date BETWEEN ? AND ?";
331         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$start,$end));
332     } else {
333         $sql = " 
334     SELECT fe.encounter, fe.reason, fe.provider_id, u.title, u.fname, u.lname, 
335       fe.facility_id, f.street, f.city, f.state, ie.list_id, l.pid, l.title AS prob_title, l.diagnosis, 
336       l.outcome, l.groupname, l.begdate, l.enddate, l.type, l.comments , l.date
337     FROM lists AS l 
338     LEFT JOIN issue_encounter AS ie ON ie.list_id = l.id
339     LEFT JOIN form_encounter AS fe ON fe.encounter = ie.encounter
340     LEFT JOIN facility AS f ON fe.facility_id = f.id
341     LEFT JOIN users AS u ON fe.provider_id = u.id
342     WHERE l.type = 'medical_problem' AND l.pid=? AND l.diagnosis LIKE 'ICD9:%'
343     AND l.diagnosis NOT LIKE '%;%'";
344         $result = sqlStatement($sql, array($pid));
345     }
347     return $result;
351 function getAlertData()
354     global $pid,$set,$start,$end;
355     if ($set == "on") {
356         $sql = " 
357     select fe.reason, fe.provider_id, fe.facility_id, fe.encounter,
358       ie.list_id, l.pid, l.title as alert_title, l.outcome, 
359       l.groupname, l.begdate, l.enddate, l.type, l.diagnosis, l.date ,
360       l.reaction , l.comments ,
361         f.street, f.city, f.state, u.title, u.fname, u.lname, cd.code_text
362     from lists as l 
363     left join issue_encounter as ie
364     on ie.list_id = l.id
365     left join form_encounter as fe
366     on fe.encounter = ie.encounter
367     left join facility as f
368     on fe.facility_id = f.id
369     left join users as u
370     on fe.provider_id = u.id
371     left join codes as cd
372     on cd.code = SUBSTRING(l.diagnosis, LOCATE(':',l.diagnosis)+1)
373     where l.type = 'allergy' and l.pid=?
374     AND l.date BETWEEN ? AND ?";
375     
376         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$start,$end));
377     } else {
378         $sql = " 
379     select fe.reason, fe.provider_id, fe.facility_id, fe.encounter,
380       ie.list_id, l.pid, l.title as alert_title, l.outcome, 
381       l.groupname, l.begdate, l.enddate, l.type, l.diagnosis, l.date ,
382       l.reaction , l.comments ,
383         f.street, f.city, f.state, u.title, u.fname, u.lname, cd.code_text
384     from lists as l 
385     left join issue_encounter as ie
386     on ie.list_id = l.id
387     left join form_encounter as fe
388     on fe.encounter = ie.encounter
389     left join facility as f
390     on fe.facility_id = f.id
391     left join users as u
392     on fe.provider_id = u.id
393     left join codes as cd
394     on cd.code = SUBSTRING(l.diagnosis, LOCATE(':',l.diagnosis)+1)
395     where l.type = 'allergy' and l.pid=?";
396       
397         $result = sqlStatement($sql, array($pid));
398     }
400     return $result;
404 function getResultData()
407     global $pid,$set,$start,$end;
408     if ($set == "on") {
409         $sql = "
410       SELECT 
411         prs.procedure_result_id as `pid`,
412         pt.name as `name`,
413         pt.procedure_type_id as `type`,
414         prs.date as `date`,
415         concat_ws(' ',prs.result,lo.title) as `result`,
416         prs.range as `range`,
417         prs.abnormal as `abnormal`,
418         prs.comments as `comments`,
419         ptt.lab_id AS `lab`
420       FROM
421         procedure_result AS prs 
422         LEFT JOIN procedure_report AS prp 
423           ON prs.procedure_report_id = prp.procedure_report_id 
424         LEFT JOIN procedure_order AS po 
425           ON prp.procedure_order_id = po.procedure_order_id
426         LEFT JOIN procedure_order_code AS poc
427           ON poc.procedure_order_id = po.procedure_order_id
428           AND poc.procedure_order_seq = prp.procedure_order_seq
429         LEFT JOIN procedure_type AS pt 
430           ON pt.lab_id = po.lab_id
431           AND pt.procedure_code = prs.result_code
432           AND pt.procedure_type = 'res'
433         LEFT JOIN procedure_type AS ptt 
434           ON pt.parent = ptt.procedure_type_id
435           AND ptt.procedure_type = 'ord'
436         LEFT JOIN list_options AS lo
437           ON lo.list_id = 'proc_unit' AND pt.units = lo.option_id AND lo.activity = 1
438       WHERE po.patient_id=?
439       AND prs.date BETWEEN ? AND ?";
440         
441         $result = sqlStatement($sql, array($pid,$start,$end));
442     } else {
443         $sql = "
444       SELECT 
445         prs.procedure_result_id as `pid`,
446         pt.name as `name`,
447         pt.procedure_type_id as `type`,
448         prs.date as `date`,
449         concat_ws(' ',prs.result,lo.title) as `result`,
450         prs.range as `range`,
451         prs.abnormal as `abnormal`,
452         prs.comments as `comments`,
453         ptt.lab_id AS `lab`
454       FROM
455         procedure_result AS prs 
456         LEFT JOIN procedure_report AS prp 
457           ON prs.procedure_report_id = prp.procedure_report_id 
458         LEFT JOIN procedure_order AS po 
459           ON prp.procedure_order_id = po.procedure_order_id
460         LEFT JOIN procedure_order_code AS poc
461           ON poc.procedure_order_id = po.procedure_order_id
462           AND poc.procedure_order_seq = prp.procedure_order_seq
463         LEFT JOIN procedure_type AS pt 
464           ON pt.lab_id = po.lab_id
465           AND pt.procedure_code = prs.result_code
466           AND pt.procedure_type = 'res'
467         LEFT JOIN procedure_type AS ptt 
468           ON pt.parent = ptt.procedure_type_id
469           AND ptt.procedure_type = 'ord'
470         LEFT JOIN list_options AS lo
471           ON lo.list_id = 'proc_unit' AND pt.units = lo.option_id AND lo.activity = 1
472       WHERE po.patient_id=?";
473         
474         $result = sqlStatement($sql, array($pid));
475     }
477     return $result;
481 function getActorData()
483     global $pid;
485     $sql = " 
486         select fname, lname, DOB, sex, pid, street, city, state, postal_code, phone_contact
487         from patient_data
488         where pid=?";
489         
490     $result[0] = sqlStatement($sql, array($pid));
491   
492     $sql2 = " 
493         SELECT * FROM users AS u LEFT JOIN facility AS f ON u.facility_id = f.id WHERE u.id=?";
494         
495     $result[1] = sqlStatement($sql2, array($_SESSION['authUserID']));
496   
497     $sql3 = "
498   SELECT 
499     u.ppid AS id, u.name AS lname, '' AS fname, '' AS city, '' AS state, '' AS zip, '' AS phone
500   FROM
501     procedure_order AS po 
502     LEFT JOIN forms AS f
503       ON f.form_id = po.procedure_order_id 
504       AND f.formdir = 'procedure_order'
505     LEFT JOIN list_options AS lo 
506       ON lo.title = f.form_name AND lo.activity = 1
507     LEFT JOIN procedure_providers AS u
508       ON po.lab_id = u.ppid
509   WHERE f.pid = ? 
510     AND lo.list_id = 'proc_type' 
511     AND lo.option_id = 'ord'
512     GROUP BY u.ppid";
513         
514     $result[2] = sqlStatement($sql3, array($pid));
515   
516     return $result;
520 function getReportFilename()
522     global $pid;
524     $sql = "
525     select fname, lname, pid
526     from patient_data
527     where pid=?";
529     $result = sqlQuery($sql, array($pid));
530     $result_filename = $result['lname']."-".$result['fname']."-".$result['pid']."-".date("mdY", time());
532     return $result_filename;