now Nose-Hoover variables are written to mdebin only if GMX_NOSEHOOVER_CHAINS is...
[gromacs/rigid-bodies.git] / share / top / opls-methanol.itp
blob32f0272e8ac7985d5c6bc4c98f9f0dbce5e840b6
2 ; Methanol, Jorgensen et al. JACS 118 pp. 11225 (1996)
4 [ moleculetype ]
5 ; name  nrexcl
6 MET     3
8 [ atoms ]
9 ;   nr    type   resnr  residu    atom    cgnr        charge          mass
10      1       opls_157       1     MET        C       1  0.145    
11      2       opls_156       1     MET        H       1  0.04    
12      3       opls_156       1     MET        H       1  0.04    
13      4       opls_156       1     MET        H       1  0.04    
14      5       opls_154       1     MET       OA       1  -0.683 
15      6       opls_155       1     MET       HO       1  0.418
16    
17 [ bonds ]
18 ;  ai    aj funct           c0           c1
19 1       2       1
20 1       3       1
21 1       4       1 
22 1       5       1
23 5       6       1
25 [ pairs ]
26 ; i     j       funct
27 2       6
28 3       6
29 4       6
31 [ angles ]
32 ;  ai    aj    ak funct           c0        c1
33 ; H3
34  2      1       5       1
35  3      1       5       1 
36  4      1       5       1
37  4      1       3       1
38  4      1       2       1
39  3      1       2       1
40  1      5       6       1
43 [ dihedrals ]
44 2       1       5       6       3
45 3       1       5       6       3
46 4       1       5       6       3