A freeze group can now be allowed to move rigidly in some dimension by using "freezed...
[gromacs/rigid-bodies.git] / share / top / gromos45a3.ff / aminoacids.hdb
blob44628fb6a45ee0cae73f05f5fe05ccad5bb27d13
1 ABU     1       
2 1       1       H       N       -C      CA
3 ACEH    1       
4 3       4       HA      CA      C       O
5 AIB     1       
6 1       1       H       N       -C      CA
7 ALA     1       
8 1       1       H       N       -C      CA
9 ARG     4       
10 1       1       H       N       -C      CA
11 1       1       HE      NE      CD      CZ
12 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
13 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
14 ARGN    4       
15 1       1       H       N       -C      CA
16 1       1       HE      NE      CD      CZ
17 1       2       HH1     NH1     CZ      NE
18 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
19 ASN     2       
20 1       1       H       N       -C      CA
21 2       3       HD2     ND2     CG      CB
22 ASP     1       
23 1       1       H       N       -C      CA
24 ASP1    2       
25 1       1       H       N       -C      CA
26 1       2       HD1     OD1     CG      CB
27 ASPH    2       
28 1       1       H       N       -C      CA
29 1       2       HD2     OD2     CG      CB
30 BEN     7       
31 1       1       H2      C2      C1      C3
32 1       1       H3      C3      C2      C4
33 1       1       H4      C4      C3      C5
34 1       1       H5      C5      C4      C6
35 1       1       H6      C6      C5      C1
36 2       3       H1      N1      C7      C1
37 2       3       H2      N2      C7      C1
38 CYS2    1       
39 1       1       H       N       -C      CA
40 CYSH    2       
41 1       1       H       N       -C      CA
42 1       2       HG      SG      CB      CA
43 FAD     7       
44 2       3       HN6     AN6     AC6     AC5
45 1       2       HO2*    AO2*    AC2*    AC1*
46 1       2       HO3*    AO3*    AC3*    AC2*
47 1       2       H4*     O4*     C4*     C5*
48 1       2       H3*     O3*     C3*     C4*
49 1       2       H2*     O2*     C2*     C3*
50 1       2       H3      N3      C4      C4A
51 GLN     2       
52 1       1       H       N       -C      CA
53 2       3       HE2     NE2     CD      CG
54 GLU     1       
55 1       1       H       N       -C      CA
56 GLUH    2       
57 1       1       H       N       -C      CA
58 1       2       HE2     OE2     CD      CG
59 GLY     1       
60 1       1       H       N       -C      CA
61 HEME    4       
62 1       1       HHA     CHA     C1A     C4D
63 1       1       HHB     CHB     C1B     C4A
64 1       1       HHC     CHC     C1C     C4B
65 1       1       HHD     CHD     C1D     C4C
66 HIS1    2       
67 1       1       H       N       -C      CA
68 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
69 HISA    2       
70 1       1       H       N       -C      CA
71 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
72 HISB    2       
73 1       1       H       N       -C      CA
74 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
75 HISH    3       
76 1       1       H       N       -C      CA
77 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
78 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
79 HOH     1       
80 2       7       HW      OW
81 HYP     1       
82 1       2       HD1     OD1     CG      CB
83 ILE     1       
84 1       1       H       N       -C      CA
85 LEU     1       
86 1       1       H       N       -C      CA
87 LYS     2       
88 1       1       H       N       -C      CA
89 2       4       HZ      NZ      CE      CD
90 LYSH    2       
91 1       1       H       N       -C      CA
92 3       4       HZ      NZ      CE      CD
93 MET     1       
94 1       1       H       N       -C      CA
95 NAC     1       
96 1       1       H       N       -C      CA
97 NACH    2       
98 1       1       H       N       -C      CA
99 3       4       HA      CA      N       NH
100 NH2     1       
101 2       3       H       N       -C      -CA
102 PHE     6       
103 1       1       H       N       -C      CA
104 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
105 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
106 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
107 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
108 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
109 PHEU    1       
110 1       1       H       N       -C      CA
111 PHL     7       
112 1       1       H       N       -C      CA
113 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
114 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
115 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
116 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
117 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
118 1       2       HY      OY      CX      CA
119 SER     2       
120 1       1       H       N       -C      CA
121 1       2       HG      OG      CB      CA
122 TFE     1       
123 1       2       H       O       CH2     C
124 THR     2       
125 1       1       H       N       -C      CA
126 1       2       HG1     OG1     CB      CA
127 TRP     7       
128 1       1       H       N       -C      CA
129 1       1       HD1     CD1     CG      NE1
130 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
131 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
132 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
133 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
134 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
135 TRPU    2       
136 1       1       H       N       -C      CA
137 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
138 TYR     6       
139 1       1       H       N       -C      CA
140 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
141 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
142 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
143 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
144 1       2       HH      OH      CZ      CE1
145 TYRU    2       
146 1       1       H       N       -C      CA
147 1       2       HH      OH      CZ      CE1
148 VAL     1       
149 1       1       H       N       -C      CA