kernel/nb_kernel_ElecEwSw_VdwNone_GeomP1P1/reference.warn

   1 WARNING 1 [file grompp.mdp]:
   2   The switching range should be 5% or less (currently 29.29% using a
   3   switching range of 0.700000-0.990000) for accurate electrostatic
   4   energies, energy conservation will be good regardless, since ewald_rtol =
   5   1e-05.
   6
   7 WARNING 2 [file topol.top, line 121]:
   8   The bond in molecule-type Protein between atoms 1 N and 2 H1 has an
   9   estimated oscillational period of 1.0e-02 ps, which is less than 5 times
  10   the time step of 2.0e-03 ps.
  11   Maybe you forgot to change the constraints mdp option.
  12
  13 WARNING 3 [file grompp.mdp]:
  14   Can not exclude the lattice Coulomb energy between energy groups
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