CMakeLists.txt

   1 cmake_minimum_required(VERSION 2.6.2)
   2
   3 project(Gromacs)
   4 set(PROJECT_VERSION "4.0.99-dev-20100305"
   5     CACHE STRING "Gromacs version string")
   6
   7 # Cmake modules/macros are in a subdirectory to keep this file cleaner
   8 set(CMAKE_MODULE_PATH ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cmake)
   9
  10 ########################################################################
  11 # User input options                                                   #
  12 ########################################################################
  13 option(GMX_DOUBLE "Use double precision" OFF)
  14 option(GMX_MPI    "Build a parallel (message-passing) version of GROMACS" OFF)
  15 option(GMX_THREADS    "Build a parallel (threaded-based) version of GROMACS: (doesn't work yet!)" ON)
  16 option(GMX_SOFTWARE_INVSQRT "Use GROMACS software 1/sqrt" ON)
  17 option(GMX_FAHCORE "Build a library with mdrun functionality" OFF)
  18 option(GMX_OPENMM "Accelerated execution on GPUs through the OpenMM library" OFF)
  19 set(GMX_ACCELERATION "none"
  20     CACHE STRING "Accelerated kernels. Pick one of: SSE, BlueGene, Power6, ia64, altivec")
  21
  22 set(GMX_FFT_LIBRARY "fftw3"
  23     CACHE STRING "FFT library choices: fftw3,fftw2,mkl,fftpack[built-in]")
  24 option(GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
  25        "Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE)" OFF)
  26 set(GMX_QMMM_PROGRAM "none"
  27     CACHE STRING "QM package choices: none,gaussian,mopac,gamess")
  28 option(GMX_BROKEN_CALLOC "Work around broken calloc()" OFF)
  29 option(BUILD_SHARED_LIBS "Enable shared libraries (can be problematic with MPI)" OFF)
  30 option(GMX_MPI_IN_PLACE "Enable MPI_IN_PLACE for MPIs that have it defined" ON)
  31 option(GMX_DLOPEN "Compile with dlopen, needed to read VMD supported file formats" ON)
  32 mark_as_advanced(GMX_MPI_IN_PLACE)
  33
  34 enable_language(C)
  35
  36 option(GMX_IA32_ASM "Add SSE assembly files for IA32" OFF)
  37 option(GMX_X86_64_ASM "Add SSE assembly files for X86_64" OFF)
  38
  39 #######################################################################
  40 # Check for options incompatible with OpenMM build                    #
  41 #######################################################################
  42 if(GMX_OPENMM)
  43     # we'll use the built-in fft to avoid unnecessary dependencies
  44     set (GMX_FFT_LIBRARY "fftpack")
  45     if(GMX_MPI)
  46         message(FATAL_ERROR "The OpenMM build is not compatible with MPI!")
  47     endif(GMX_MPI)
  48     if(GMX_THREADS)
  49         message(FATAL_ERROR "The OpenMM build is not compatible with threads!")
  50     endif(GMX_THREADS)
  51     if(GMX_SOFTWARE_INVSQRT)
  52         set(GMX_SOFTWARE_INVSQRT OFF)
  53     endif(GMX_SOFTWARE_INVSQRT)
  54     if(NOT GMX_ACCELERATION MATCHES "none")
  55         message(WARNING "The OpenMM build does not support other acceleration modes!")
  56         set(GMX_ACCELERATION "none")
  57     endif()
  58     if(GMX_FAHCORE)
  59         message(FATAL_ERROR "The OpenMM build does not support the FAH option!")
  60     endif(GMX_FAHCORE)
  61 endif(GMX_OPENMM)
  62
  63
  64 ########################################################################
  65 # Fix stupid flags on MSVC
  66 ########################################################################
  67 IF(CMAKE_GENERATOR MATCHES "Visual Studio")
  68     STRING(REPLACE /MD /MT CMAKE_C_FLAGS_RELEASE ${CMAKE_C_FLAGS_RELEASE})
  69     SET(CMAKE_C_FLAGS_RELEASE ${CMAKE_C_FLAGS_RELEASE} CACHE STRING "" FORCE)
  70     STRING(REPLACE /MD /MT CMAKE_C_FLAGS_DEBUG ${CMAKE_C_FLAGS_DEBUG})
  71     SET(CMAKE_C_FLAGS_DEBUG ${CMAKE_C_FLAGS_DEBUG} CACHE STRING "" FORCE)
  72 ENDIF(CMAKE_GENERATOR MATCHES "Visual Studio")
  73
  74 set(GMX_EXTRA_LIBRARIES)
  75
  76 ########################################################################
  77 #Process MPI settings
  78 ########################################################################
  79 if(GMX_MPI)
  80     if(GMX_THREADS)
  81         #message(FATAL_ERROR "Thread-based parallelization conflicts with MPI.")
  82         set(GMX_THREADS OFF CACHE BOOL
  83             "Thread-based parallelization conflicts with MPI." FORCE)
  84     endif(GMX_THREADS)
  85     find_package(MPI)
  86     if(MPI_FOUND)
  87         set(GROMACS_C_FLAGS ${GROMACS_FLAGS} ${MPI_COMPILE_FLAGS})
  88         set(GROMACS_LINKER_FLAGS ${GROMACS_LINKER_FLAGS} ${MPI_LINK_FLAGS})
  89
  90         include_directories(${MPI_INCLUDE_PATH})
  91         list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES ${MPI_LIBRARIES})
  92         add_definitions( -DMPI ) #for FAHCORE
  93         include(gmxTestMPI_IN_PLACE)
  94         if (GMX_MPI_IN_PLACE)
  95             gmx_test_mpi_in_place(MPI_IN_PLACE_EXISTS)
  96         endif (GMX_MPI_IN_PLACE)
  97     else(MPI_FOUND)
  98         message(FATAL_ERROR "MPI support requested, but no MPI compiler found.")
  99     endif(MPI_FOUND)
 100     include(gmxTestCatamount)
 101     gmx_test_catamount(GMX_CRAY_XT3)
 102     if(GMX_CRAY_XT3)
 103         set(GMX_NO_SYSTEM 1)
 104         set(GMX_NO_NICE 1)
 105     endif(GMX_CRAY_XT3)
 106     set(GMX_LIB_MPI 1)
 107 endif(GMX_MPI)
 108
 109 ########################################################################
 110 # Basic system tests (standard libraries, headers, functions, types)   #
 111 ########################################################################
 112 include(CheckIncludeFiles)
 113 check_include_files(string.h     HAVE_STRING_H)
 114 check_include_files(limits.h     HAVE_LIMITS_H)
 115 check_include_files(memory.h     HAVE_MEMORY_H)
 116 check_include_files(unistd.h     HAVE_UNISTD_H)
 117 check_include_files(pwd.h        HAVE_PWD_H)
 118 check_include_files(stdint.h     HAVE_STDINT_H)
 119 check_include_files(stdlib.h     HAVE_STDLIB_H)
 120 check_include_files(pthread.h    HAVE_PTHREAD_H)
 121 check_include_files(dirent.h     HAVE_DIRENT_H)
 122 check_include_files(inttypes.h   HAVE_INTTYPES_H)
 123 check_include_files(regex.h      HAVE_REGEX_H)
 124 check_include_files(sys/types.h  HAVE_SYS_TYPES_H)
 125 check_include_files(sys/stat.h   HAVE_SYS_STAT_H)
 126 check_include_files(sys/time.h   HAVE_SYS_TIME_H)
 127 check_include_files(rpc/rpc.h    HAVE_RPC_RPC_H)
 128 check_include_files("rpc/rpc.h;rpc/xdr.h"    HAVE_RPC_XDR_H)
 129 # SSE support
 130 check_include_files(xmmintrin.h  HAVE_XMMINTRIN_H)
 131 check_include_files(emmintrin.h  HAVE_EMMINTRIN_H)
 132 check_include_files(pmmintrin.h  HAVE_PMMINTRIN_H)
 133 check_include_files(smmintrin.h  HAVE_SMMINTRIN_H)
 134
 135 include(CheckFunctionExists)
 136 check_function_exists(strcasecmp        HAVE_STRCASECMP)
 137 check_function_exists(strdup            HAVE_STRDUP)
 138 check_function_exists(vprintf           HAVE_VPRINTF)
 139 check_function_exists(memcmp            HAVE_MEMCMP)
 140 check_function_exists(gettimeofday      HAVE_GETTIMEOFDAY)
 141 check_function_exists(isnan             HAVE_ISNAN)
 142 check_function_exists(_isnan            HAVE__ISNAN)
 143 check_function_exists(isfinite          HAVE_ISFINITE)
 144 check_function_exists(_isfinite         HAVE__ISFINITE)
 145 # After large files? check_function_exists(fseeko     HAVE_FSEEKO)
 146
 147 include(CheckLibraryExists)
 148 check_library_exists(m sqrt "" HAVE_LIBM)
 149
 150 include(CheckTypeSize)
 151 check_type_size("bool"          SIZEOF_BOOL) # will also set HAVE_BOOL
 152 check_type_size("int"           SIZEOF_INT)
 153 check_type_size("long int"      SIZEOF_LONG_INT)
 154 check_type_size("long long int" SIZEOF_LONG_LONG_INT)
 155 check_type_size("off_t"         SIZEOF_OFF_T)
 156 check_type_size("void *"        SIZEOF_VOIDP)
 157
 158 # Check for some basic types that we *need*, so set these to int if they are not present
 159 check_type_size(uid_t uid_t)
 160 if(NOT uid_t)
 161   set(uid_t int)
 162 else(NOT uid_t)
 163   set(uid_t 0)
 164 endif(NOT uid_t)
 165
 166 check_type_size(gid_t gid_t)
 167 if(NOT gid_t)
 168   set(gid_t 1)
 169 else(NOT gid_t)
 170   set(gid_t 0)
 171 endif(NOT gid_t)
 172
 173 check_type_size(size_t size_t)
 174 if(NOT size_t)
 175   set(size_t int)
 176 else(NOT size_t)
 177   set(size_t 0)
 178 endif(NOT size_t)
 179
 180 check_type_size(off_t off_t)
 181 if(NOT off_t)
 182   set(off_t int)
 183 else(NOT off_t)
 184   set(off_t 0)
 185 endif(NOT off_t)
 186
 187 include(TestBigEndian)
 188 test_big_endian(GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN)
 189
 190
 191
 192 ########################################################################
 193 # Find external packages                                               #
 194 ########################################################################
 195
 196 find_package(LibXml2)
 197 if(LIBXML2_FOUND)
 198     include_directories(${LIBXML2_INCLUDE_DIR})
 199     list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES ${LIBXML2_LIBRARIES})
 200     set(HAVE_LIBXML2 1)
 201 endif(LIBXML2_FOUND)
 202
 203 find_package(X11)
 204 # X11 includes/libraries are only set in the ngmx subdirectory!
 205 if(X11_FOUND)
 206     set(HAVE_X11 1)
 207 endif(X11_FOUND)
 208
 209 if(GMX_THREADS)
 210     include(ThreadMPI)
 211     set(THREAD_MPI_LIB thread_mpi)
 212     set(GMX_MPI 1)
 213     string(TOUPPER ${GMX_FFT_LIBRARY} ${GMX_FFT_LIBRARY})
 214     if(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "FFTW2")
 215         message(FATAL_ERROR "FFTW2 can't be used with threads. Try fftw3 or mkl.")
 216     endif()
 217 endif(GMX_THREADS)
 218
 219 if(GMX_OPENMM)
 220     set(CUDA_BUILD_EMULATION OFF)
 221     find_package(CUDA 2.3 EXACT REQUIRED)   # TODO what are we compatible with?
 222     add_definitions(-DGMX_OPENMM)
 223     if(CMAKE_BUILD_TYPE STREQUAL "DEBUG")
 224         set(CUDA_VERBOSE_BUILD ON)
 225     endif()
 226     find_package(OpenMM)
 227 endif(GMX_OPENMM)
 228
 229 if(APPLE)
 230    find_library(ACCELERATE_FRAMEWORK Accelerate)
 231    list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES ${ACCELERATE_FRAMEWORK})
 232 endif(APPLE)
 233
 234 ########################################################################
 235 # Our own GROMACS tests
 236 ########################################################################
 237
 238 include(gmxCFlags)
 239 gmx_c_flags()
 240
 241 add_definitions( -DHAVE_CONFIG_H )
 242 include_directories(${CMAKE_BINARY_DIR}/src)
 243 include_directories(${CMAKE_SOURCE_DIR}/include)
 244
 245 include(gmxCheckBuildUserTime)
 246 gmx_check_build_user_time(BUILD_TIME BUILD_USER BUILD_MACHINE)
 247
 248 include(gmxTestFloatFormat)
 249 gmx_test_float_format(GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
 250                       GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
 251                       GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER)
 252
 253 include(gmxTestLargeFiles)
 254 gmx_test_large_files(GMX_LARGEFILES)
 255
 256 include(gmxTestSignal)
 257 gmx_test_retsigtype(RETSIGTYPE)
 258
 259 include(gmxTestInline)
 260 gmx_test_inline(INLINE_KEYWORD)
 261
 262 include(gmxTestPipes)
 263 gmx_test_pipes(HAVE_PIPES)
 264
 265 include(gmxTestInlineASM)
 266 gmx_test_inline_asm_gcc_x86(GMX_X86_GCC_INLINE_ASM)
 267 gmx_test_inline_asm_msvc_x86(GMX_X86_MSVC_INLINE_ASM)
 268
 269 include(gmxTestXDR)
 270 gmx_test_xdr(GMX_SYSTEM_XDR)
 271 if(NOT GMX_SYSTEM_XDR)
 272     set(GMX_INTERNAL_XDR 1)
 273 endif(NOT GMX_SYSTEM_XDR)
 274
 275 if(GMX_FORTRAN OR GMX_POWER6)
 276     enable_language(Fortran)
 277     include(FortranCInterface)
 278     discover_fortran_mangling(prefix isupper suffix extra_under_score found)
 279     if(extra_under_score)
 280         set(extrasuffix "_")
 281     endif(extra_under_score)
 282
 283     if(isupper)
 284         set(F77_FUNCDEF   "${prefix} ## NAME ## ${suffix}")
 285         set(F77_FUNCDEF_  "${prefix} ## NAME ## ${suffix}${extrasuffix}")
 286     else(isupper)
 287         set(F77_FUNCDEF   "${prefix} ## name ## ${suffix}")
 288         set(F77_FUNCDEF_  "${prefix} ## name ## ${suffix}${extrasuffix}")
 289     endif(isupper)
 290 else(GMX_FORTRAN OR GMX_POWER6)
 291         set(F77_FUNCDEF   "name ## _")
 292         set(F77_FUNCDEF_  "name ## _")
 293 endif(GMX_FORTRAN OR GMX_POWER6)
 294
 295
 296 # Process nonbonded accelerated kernels settings
 297 option(GMX_ASM_USECCOMPILER "Use C compiler for assembly" ON)
 298 string(TOUPPER ${GMX_ACCELERATION} ${GMX_ACCELERATION})
 299 if(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "NONE")
 300   # nothing to do
 301 elseif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "SSE")
 302     if(HAVE_XMMINTRIN_H)
 303         set(GMX_SSE 1)
 304         if(GMX_IA32_ASM)
 305           option(GMX_ASM_USEASM-ATT "Use ATT-style assembly" ON)
 306           set(GMX_IA32_SSE 1)
 307         endif(GMX_IA32_ASM)
 308     endif(HAVE_XMMINTRIN_H)
 309     if(HAVE_EMMINTRIN_H)
 310         if(GMX_X86_64_ASM)
 311           option(GMX_ASM_USEASM-ATT "Use ATT-style assembly" ON)
 312           set(GMX_X86_64_SSE 1)
 313         else(GMX_X86_64_ASM)  #only use intrinsic if not using the ASM loops
 314           set(GMX_SSE2 1)
 315         endif(GMX_X86_64_ASM)
 316     endif(HAVE_EMMINTRIN_H)
 317 #    if(HAVE_PMMINTRIN_H)
 318 #        set(GMX_SSE3 1)
 319 #    endif(HAVE_PMMINTRIN_H)
 320 #    if(HAVE_SMMINTRIN_H)
 321 #        set(GMX_SSE4_1 1)
 322 #    endif(HAVE_SMMINTRIN_H)
 323
 324 elseif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "FORTRAN")
 325     set(GMX_FORTRAN 1)
 326 elseif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "BLUEGENE")
 327     set(GMX_BLUEGENE 1)
 328 elseif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "POWER6")
 329     set(GMX_POWER6 1)
 330 elseif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "IA64")
 331     set(GMX_IA64_ASM 1)
 332     set(DISABLE_WATERWATER_NLIST 1)
 333     set(DISABLE_WATER_NLIST 1)
 334 elseif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "ALTIVEC")
 335     check_include_files(altivec.h HAVE_ALTIVEC_H)
 336     if(HAVE_ALTIVEC_H)
 337         set(GMX_PPC_ALTIVEC 1)
 338     endif(HAVE_ALTIVEC_H)
 339 else(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "NONE")
 340     MESSAGE(FATAL_ERROR "Unrecognized option for accelerated kernels: ${GMX_ACCELERATION}. Pick one of none, SSE, Fortran, BlueGene, Power6, ia64, altivec")
 341 endif(${GMX_ACCELERATION} STREQUAL "NONE")
 342
 343
 344
 345
 346
 347
 348
 349 # Process QM/MM Settings
 350 string(TOUPPER ${GMX_QMMM_PROGRAM} ${GMX_QMMM_PROGRAM})
 351 if(${GMX_QMMM_PROGRAM} STREQUAL "GAUSSIAN")
 352     set(GMX_QMMM_GAUSSIAN 1)
 353 elseif(${GMX_QMMM_PROGRAM} STREQUAL "MOPAC")
 354     set(GMX_QMMM_MOPAC 1)
 355 elseif(${GMX_QMMM_PROGRAM} STREQUAL "GAMESS")
 356     set(GMX_QMMM_GAMESS 1)
 357 elseif(${GMX_QMMM_PROGRAM} STREQUAL "NONE")
 358     # nothing to do
 359 else(${GMX_QMMM_PROGRAM} STREQUAL "GAUSSIAN")
 360     MESSAGE(FATAL_ERROR "Invalid QM/MM program option: ${GMX_QMMM_PROGRAM}. Choose one of: Gaussian, Mopac, Gamess, None")
 361 endif(${GMX_QMMM_PROGRAM} STREQUAL "GAUSSIAN")
 362
 363 # Process FFT library settings - if not OpenMM build
 364 string(TOUPPER ${GMX_FFT_LIBRARY} ${GMX_FFT_LIBRARY})
 365 if(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "FFTW3")
 366 #    MESSAGE(STATUS "Using external FFT library - fftw3")
 367     if(GMX_DOUBLE)
 368         find_package(FFTW3 REQUIRED)
 369     else(GMX_DOUBLE)
 370         find_package(FFTW3F REQUIRED)
 371     endif(GMX_DOUBLE)
 372
 373     if(NOT FFTW3_FOUND)
 374         MESSAGE(FATAL_ERROR "Cannot find fftw3 (with correct precision). Fix it, choose another FFT library, or use the Gromacs built-in fftpack (slower)!")
 375     endif(NOT FFTW3_FOUND)
 376
 377     set(GMX_FFT_FFTW3 1)
 378     include_directories(${FFTW3_INCLUDE_DIR})
 379     list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES ${FFTW3_LIBRARIES})
 380
 381 elseif(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "FFTW2")
 382 #    MESSAGE(STATUS "Using external FFT library - fftw2")
 383     if(GMX_DOUBLE)
 384         find_package(FFTW2 REQUIRED)
 385     else(GMX_DOUBLE)
 386         find_package(FFTW2F REQUIRED)
 387     endif(GMX_DOUBLE)
 388
 389     if(NOT FFTW2_FOUND)
 390            MESSAGE(FATAL_ERROR "Cannot find fftw2 (with correct precision). Fix it, choose another FFT library, or use the Gromacs built-in fftpack (slower)!")
 391     endif(NOT FFTW2_FOUND)
 392     include_directories(${FFTW2_INCLUDE_DIR})
 393     list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES ${FFTW2_LIBRARIES})
 394
 395     if("${FFTW2_LIBRARIES}" MATCHES "dfftw")
 396         set(FFTW2_NAME_DFFTW 1)
 397     elseif("${FFTW2_LIBRARIES}" MATCHES "sfftw")
 398         set(FFTW2_NAME_SFFTW 1)
 399     else("${FFTW2_LIBRARIES}" MATCHES "dfftw")
 400         set(FFTW2_NAME_FFTW 1)
 401     endif("${FFTW2_LIBRARIES}" MATCHES "dfftw")
 402
 403     set(GMX_FFT_FFTW2 1)
 404 elseif(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "MKL")
 405 #    MESSAGE(STATUS "Using external FFT library - Intel MKL")
 406     find_package(MKL REQUIRED)
 407     include_directories(${MKL_INCLUDE_DIR})
 408     list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES ${MKL_LIBRARIES})
 409
 410     set(GMX_FFT_MKL 1)
 411     set(HAVE_MKL 1)
 412
 413 #elseif(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "ACML")
 414 #    MESSAGE(STATUS "Using external FFT library - AMD core math library")
 415 #    set(GMX_FFT_ACML 1)
 416 elseif(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "FFTPACK")
 417     MESSAGE(STATUS "Using internal FFT library - fftpack")
 418     set(GMX_FFT_FFTPACK 1)
 419 else(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "FFTW3")
 420     MESSAGE(FATAL_ERROR "Invalid FFT library setting: ${GMX_FFT_LIBRARY}. Choose one of: fftw3, fftw2, mkl, acml, fftpack")
 421 endif(${GMX_FFT_LIBRARY} STREQUAL "FFTW3")
 422
 423 # MKL has BLAS/LAPACK routines
 424 if(HAVE_MKL OR ACCELERATE_FRAMEWORK)
 425   set(GMX_EXTERNAL_BLAS TRUE CACHE BOOL "Use external BLAS instead of built-in")
 426   set(GMX_EXTERNAL_LAPACK TRUE CACHE BOOL "Use external LAPACK instead of built-in")
 427 else(HAVE_MKL OR ACCELERATE_FRAMEWORK)
 428   set(GMX_EXTERNAL_BLAS FALSE CACHE BOOL "Use external LAPACK instead of built-in")
 429   set(GMX_EXTERNAL_LAPACK FALSE CACHE BOOL "Use external LAPACK instead of built-in")
 430 endif(HAVE_MKL OR ACCELERATE_FRAMEWORK)
 431
 432 # Math and thread libraries must often come after all others when linking...
 433 if(HAVE_LIBM)
 434     list(APPEND GMX_EXTRA_LIBRARIES m)
 435 endif(HAVE_LIBM)
 436
 437
 438
 439 if(GMX_FAHCORE)
 440   set(COREWRAP_INCLUDE_DIR "${CMAKE_SOURCE_DIR}/../corewrap" CACHE STRING
 441       "Path to swindirect.h")
 442   include_directories(${COREWRAP_INCLUDE_DIR})
 443 endif(GMX_FAHCORE)
 444
 445 # # # # # # # # # # NO MORE TESTS AFTER THIS LINE! # # # # # # # # # # #
 446 set(CMAKE_C_FLAGS ${GROMACS_C_FLAGS} CACHE STRING "Compiler flags")
 447 set(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS ${GROMACS_LINKER_FLAGS} CACHE STRING "Linker flags")
 448
 449 ########################################################################
 450 # Specify install locations and which subdirectories to process        #
 451 ########################################################################
 452 set(LIB_INSTALL_DIR  ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/lib)
 453 set(BIN_INSTALL_DIR  ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/bin)
 454 set(DATA_INSTALL_DIR ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/gromacs)
 455 set(MAN_INSTALL_DIR  ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/share/man)
 456
 457 set(GMXLIBDIR        ${DATA_INSTALL_DIR}/top)
 458
 459
 460 add_subdirectory(share)
 461 add_subdirectory(include)
 462 add_subdirectory(man)
 463
 464 add_subdirectory(src)
 465
 466