configure.ac

   1 #######################################################################
   2 # Process this file wth autoconf to produce a configure script.
   3 #######################################################################
   4
   5 AC_PREREQ(2.50)
   6 AC_INIT(xdrfile, 1.0, [gmx-users@gromacs.org])
   7 AC_CONFIG_SRCDIR(src/xdrfile.c)
   8 AC_CONFIG_AUX_DIR(config)
   9 AC_CANONICAL_HOST
  10
  11 AM_INIT_AUTOMAKE(tar-ustar)
  12 AC_PREFIX_DEFAULT(/usr/local/gentop)
  13
  14 AM_CONFIG_HEADER(config.h)
  15 dnl This is the version info according to the libtool versioning system.
  16 dnl It does *not* correspond to the release number.
  17 SHARED_VERSION_INFO="4:0:0"
  18 AC_SUBST(SHARED_VERSION_INFO)
  19
  20 # MPI builds on aix break with shared libs, so they are disabled by default.
  21 AC_DISABLE_SHARED
  22
  23 #######################################################################
  24 # Simple options and makefile variables
  25 #######################################################################
  26
  27 ### Fortran or not
  28 AC_ARG_ENABLE(fortran,
  29  [  --Enable-fortran              use fortran (default on sgi,ibm,sun,axp)],,
  30 [case "${host_cpu}-${host_os}" in
  31   sparc*-solaris* | alpha*-* | rs6000*-aix* | powerpc*-aix* | mips*-irix*) enable_fortran=yes ;;
  32   *) enable_fortran=no ;;
  33  esac])
  34 AM_CONDITIONAL([GMX_FORTRAN],[test "$enable_fortran" = "yes"])
  35 if test "$enable_fortran" = "yes"; then
  36   AC_DEFINE(GMX_FORTRAN,,[Use Fortran innerloops])
  37 fi
  38 # always use CC for linking:
  39 AC_SUBST(F77LINK,"\$(LINK)")
  40
  41
  42 AC_ARG_ENABLE(all-static,
  43  [  --enable-all-static           make completely static binaries],, enable_all_static=no)
  44 # Dont add the -all-static flag until after the compiler test.
  45
  46
  47
  48 ############################################################
  49 # Add some debug info: Who is building, and on what machine?
  50 ############################################################
  51 AC_DEFINE_UNQUOTED([BUILD_TIME],["`date`"],[Date and time for build])
  52 AC_DEFINE_UNQUOTED([BUILD_USER],["`whoami`@`hostname`"],[User doing build])
  53 AC_DEFINE_UNQUOTED([BUILD_MACHINE],["`uname -srm`"],[Hardware and OS version for build host])
  54
  55
  56
  57 ############################################################
  58 # Checks for programs
  59 ############################################################
  60
  61 # normally we use the default compiler, but on alpha/linux we try the compaq ones first
  62 case "${host_cpu}-${host_os}" in
  63   alpha*-linux*)
  64     cc_names="ccc cc gcc"
  65     f77_names="fort f77 g77"
  66     ;;
  67   *)
  68     cc_names="cc icc xlc gcc"
  69     f77_names="f77 ifort xlf xlf77 cf77 fl32 g77 fort77 f90 xlf90 pgf77 cf77 fort fort77 pgf90"
  70     ;;
  71 esac
  72 # the (non-mpi) c compiler, which is also used for programs executed during build stage
  73 AC_PROG_CC( $cc_names )
  74 # Check for environment variable CC_FOR_BUILD before overwriting it
  75 if test -z "$CC_FOR_BUILD"; then
  76   CC_FOR_BUILD=$CC
  77 fi
  78 AC_SUBST(CC_FOR_BUILD)
  79
  80 if test "$enable_fortran" = "yes"; then
  81   AC_PROG_F77( $f77_names )
  82   if test -z "$F77"; then
  83     AC_MSG_ERROR([No fortran compiler found])
  84   fi
  85 fi
  86
  87 AM_PROG_AS( $CC )
  88
  89 # if we are using mpi, also get an MPICC. We cannot set that in the PROG_CC macro
  90 # above, since autoconf checks that the created file can be executed. This would
  91 # fail on platforms where MPI executables can only be run through a batchqueue.
  92
  93 if test "$enable_mpi" = "yes"; then
  94   AC_CHECK_PROGS(MPICC, mpxlc mpicc mpcc hcc, $CC)
  95 # now change the normal cc to the MPI one - see the comment above.
  96   CC=$MPICC
  97   AC_MSG_CHECKING([whether the MPI cc command works]) # be paranoid
  98   AC_TRY_LINK([#include <mpi.h>],[int argc; char **argv; MPI_Init(&argc,&argv);],
  99 AC_MSG_RESULT([yes]),AC_MSG_ERROR([Cannot compile and link MPI code with $CC]))
 100   AC_DEFINE(GMX_MPI,,[Make a parallel version of GENTOP using MPI])
 101
 102 # on the cray xt3 we have to tell autoconf that we
 103 # are actually cross-compiling even if the architecture
 104 # of host and target are the same. so we enforce
 105 # cross-compilation if __QK_USER__ is defined
 106   AC_MSG_CHECKING([for catamount])
 107   AC_TRY_COMPILE([
 108 #if defined __QK_USER__
 109 #else
 110 #error not catamount
 111 #endif
 112 ],,[
 113   AC_MSG_RESULT([yes])
 114   cross_compiling=yes
 115   AC_DEFINE(GMX_CRAY_XT3,[],[Enable special hacks for Cray XT3])
 116   AC_DEFINE(GMX_NO_SYSTEM,[],[Ignore calls to system(3)])
 117   AC_DEFINE(GMX_NO_NICE,[],[Ignore calls to nice(3)])
 118   AC_DEFINE(GMX_BROKEN_CALLOC,[],[Don't use calloc(3)])
 119   extra_LDFLAGS="$extra_LDFLAGS -lgmalloc -lacml"
 120 ],[
 121   AC_MSG_RESULT([no])
 122 ])
 123 # end of "$enable_mpi" = "yes"
 124 fi
 125
 126 if test "$enable_threads" = "yes"; then
 127    AC_MSG_CHECKING([for pthreads])
 128    AC_MSG_RESULT([yes])
 129    AC_DEFINE([GMX_THREAD_PTHREAD],,[Use pthreads for Gromacs multithreading])
 130 #  ACX_PTHREAD([],AC_MSG_ERROR([Cannot compile with pthreads; use --disable-threads])
 131 fi
 132
 133
 134
 135 AH_TEMPLATE([F77_OR_C_FUNC],
 136             [Set to F77_FUNC(name,NAME) if Fortran used, otherwise 'name' for C.])
 137 AH_TEMPLATE([F77_OR_C_FUNC_],
 138             [Set to F77_FUNC_(name,NAME) if Fortran used, otherwise 'name' for C.])
 139
 140
 141
 142 if test "$enable_fortran" = "yes"; then
 143   AC_F77_LIBRARY_LDFLAGS
 144   AC_F77_WRAPPERS
 145   AC_DEFINE([F77_OR_C_FUNC(name,NAME)],[F77_FUNC(name,NAME)])
 146   AC_DEFINE([F77_OR_C_FUNC_(name,NAME)],[F77_FUNC_(name,NAME)])
 147 else
 148   AC_DEFINE([F77_OR_C_FUNC(name,NAME)],[name])
 149   AC_DEFINE([F77_OR_C_FUNC_(name,NAME)],[name])
 150 fi
 151
 152
 153
 154 AC_PROG_CPP
 155
 156 if test "$enable_cpu_optimization" = "yes"; then
 157   ACX_DETECT_GMXCPU
 158 else
 159   gmxcpu=""
 160 fi
 161 ACX_COMPILER_MAXOPT
 162
 163
 164
 165
 166 #############
 167 # Check integer endian
 168 #############
 169 AC_C_BIGENDIAN([AC_DEFINE([GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN],,[Integer byte order is big endian.])],[],[
 170 AC_MSG_ERROR([Cannot determine endian in compiled output])])
 171 # Little endian implied if GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN not defined in source.
 172
 173 #############
 174 # Check integer sizes, set to zero if e.g. long long is not supported.
 175 #############
 176 AC_CHECK_SIZEOF(int)
 177 AC_CHECK_SIZEOF(long int)
 178 AC_CHECK_SIZEOF(long long int)
 179
 180
 181 #############
 182 # Make sure size_t can hold pointers.
 183 # On some Nec machines, you reportedly need to specify a flag for size_t to be 64 bits wide.
 184 #############
 185 AC_MSG_CHECKING([that size_t can hold pointers])
 186 AC_TRY_COMPILE([
 187 #include <stdlib.h>
 188 #include <stddef.h>
 189 ],[int chk[sizeof(size_t)-sizeof(int *)+1];],AC_MSG_RESULT([yes]),[
 190    AC_MSG_ERROR([size_t is smaller than int*. Check if your compiler needs a flag to make it 64 bit.])])
 191
 192
 193
 194 #############
 195 # Check floating-point format and endian
 196 #############
 197 ACX_FLOAT_FORMAT
 198
 199
 200 AC_PROG_INSTALL
 201 AC_PROG_LN_S
 202 AC_PROG_MAKE_SET
 203 AC_LIBTOOL_WIN32_DLL
 204 AC_PROG_LIBTOOL
 205 AC_SYS_LARGEFILE
 206 AC_FUNC_FSEEKO
 207
 208
 209
 210
 211 ############################################################################
 212 # Checks for libraries.
 213 ############################################################################
 214 #
 215 # Don't add math library for intel compilers
 216 if $CC -V 2>&1 | grep 'Intel Corporation' > /dev/null 2>&1; then
 217   AC_MSG_NOTICE([Using built-in math library with intel compiler])
 218 else
 219   AC_CHECK_LIB(m,sqrt,,AC_MSG_ERROR([No math library found]))
 220 fi
 221
 222 #####
 223 # Disable MASS support for now.
 224 #####
 225
 226
 227 ######
 228 # check for xtc headers
 229 case "${host_os}" in
 230 cygwin* | mingw*)   # use our own xdr stuff for cygwin/mingw
 231   GMXLIB_LIBOBJS="$GMXLIB_LIBOBJS gmx_system_xdr.lo"
 232   ;;
 233 *)
 234   AC_CHECK_HEADERS([rpc/rpc.h])
 235   AC_CHECK_HEADERS([rpc/xdr.h],,,
 236 [#if HAVE_RPC_RPC_H
 237 # include <rpc/rpc.h>
 238 #endif
 239 ])
 240   AC_CHECK_LIB(nsl,xdr_float)
 241   AC_TRY_LINK([
 242 #if HAVE_RPC_RPC_H
 243 #include<rpc/rpc.h>
 244 #else
 245 #error NO rpc.h header
 246 #endif
 247 #if HAVE_RPC_XDR_H
 248 #include<rpc/xdr.h>
 249 #else
 250 #error No xdr.h header
 251 #endif
 252 ],[ XDR *xd; float f; xdr_float(xd,&f);],[have_xdr="yes"])
 253
 254   if test "$have_xdr" != "yes"; then
 255     AC_DEFINE(GMX_INTERNAL_XDR,,[Use our own instead of system XDR libraries])
 256       GMXLIB_LIBOBJS="${GMXLIB_LIBOBJS} gmx_system_xdr.lo"
 257     AC_MSG_WARN([Couldn't find XDR headers and/or libraries - using our own])
 258   fi
 259   ;;
 260 esac
 261
 262 #####
 263 # Checks for additional and/or optional functions or libraries.
 264 #AC_FUNC_MALLOC
 265 AC_FUNC_MEMCMP
 266 AC_TYPE_SIGNAL
 267 AC_FUNC_VPRINTF
 268 AM_WITH_DMALLOC
 269 AC_CHECK_FUNCS(strcasecmp)
 270 AC_CHECK_FUNCS(strdup)
 271 # check for bool (must come late, since CFLAGS/includes might affect it)
 272 AC_CHECK_TYPES([bool])
 273
 274 ######
 275 ####
 276 # And collect the f77 libs to the linker - on Solaris, f77 stuff must go first,
 277 # and we need -L/usr/ucblib to find libucb... (stupid OS)
 278 # On e.g. ibm the mass libraries must come before -lm...
 279 case "${host_cpu}-${host_os}" in
 280   *-solaris*)
 281     LIBS="$FLIBS $LIBS"
 282     LDFLAGS="$LDFLAGS -L/usr/ucblib"
 283     ;;
 284   *) LIBS="$LIBS $FLIBS" ;;
 285 esac
 286
 287
 288 # add the Accelerate framework if enabled above.
 289 # LDFLAGS might have been set in the CPU optimization, so we cant assign it directly before that.
 290 LDFLAGS="$LDFLAGS $extra_LDFLAGS"
 291
 292
 293
 294
 295
 296
 297 ########################################################################
 298 # Checks for header files and types
 299 ########################################################################
 300
 301 AC_CHECK_HEADERS([limits.h strings.h unistd.h],,AC_MSG_ERROR([Include headers not found]))
 302 AC_CHECK_HEADERS(unistd.h)
 303
 304 #####
 305 # Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
 306 AC_C_CONST
 307 AC_TYPE_SIZE_T
 308 AC_STRUCT_TM
 309 AC_TYPE_UID_T
 310 AC_C_INLINE
 311
 312
 313
 314
 315
 316 # Test stuff for ia64 assembly
 317 #
 318 # Nothing to test right now.
 319
 320
 321
 322
 323
 324 #############
 325 # Check integer endian
 326 #############
 327 AC_C_BIGENDIAN([AC_DEFINE([GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN],,[Integer byte order is big endian.])],[],[
 328 AC_MSG_ERROR([Cannot determine endian in compiled output])])
 329 # Little endian implied if GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN not defined in source.
 330
 331
 332
 333 case "${host_cpu}" in
 334    i?86)
 335          # Check if inline assembly works
 336          AC_MSG_CHECKING(if the compiler supports gcc inline assembly)
 337       AC_TRY_LINK([],[float f;int i; asm("fld %1\nfistpl %0\n" : "=m" (*&i) : "f" (f));],[AC_MSG_RESULT(yes)
 338 AC_DEFINE(GMX_X86_GCC_INLINE_ASM,,[Enable x86 gcc inline assembly])],[AC_MSG_RESULT(no)])
 339          # Check for MSVC inline assembly
 340      AC_MSG_CHECKING(if the compiler supports MSVC inline assembly)
 341       AC_TRY_LINK([],[float f;int i; _asm { fld f } ; _asm { fistpl i };],[AC_MSG_RESULT(yes)
 342 AC_DEFINE(GMX_X86_MSVC_INLINE_ASM,,[Enable x86 MSVC inline assembly])],[AC_MSG_RESULT(no)])
 343         ;;
 344    *) ;;
 345 esac
 346
 347
 348
 349
 350
 351
 352 ########################################################################
 353 # Final output stage
 354 ########################################################################
 355 AS="$CC"
 356 AC_SUBST(ASFLAGS)
 357 AC_SUBST(AS)
 358 AC_SUBST(INCLUDES)          # should be automatic, but doesnt seem to be?
 359 AC_SUBST(GMXLIB_LIBOBJS)
 360 AC_SUBST(MDLIB_LIBOBJS)
 361 AC_SUBST(GMXANA_LIBOBJS)
 362
 363 # To tell libraries apart, we use four versions of the name. For instance, libgmx:
 364 # libgmx                single prec, no mpi.
 365 # libgmx_d              double prec, no mpi.
 366 # libgmx_mpi            single prec, mpi.
 367 # libgmx_mpi_d          double prec, mpi.
 368 # However, the non-suffixed names are linked to the _mpi and/or _d suffixed
 369 # ones upon installation if that is the only version available.
 370
 371 if test "$enable_mpi" = "yes"; then
 372   LIBSUFFIX="_mpi"
 373 fi
 374 if test "$enable_float" = "no"; then
 375   LIBSUFFIX="${LIBSUFFIX}_d"
 376 fi
 377 AC_SUBST(LIBSUFFIX)
 378
 379 # Unless the user has explicitly requested a prefix/suffix/transform, we
 380 # use _d on double precision files. Don't add anything for mpi, but at the
 381 # end we tell the user it is possible and smart to do in some cases!
 382 if test "$program_transform_name" = "s,x,x,"; then
 383   name_transform_provided=no;
 384   if test "$enable_float" = "no"; then
 385     program_transform_name="s,\$\$,_d,"
 386   fi
 387 else
 388   name_transform_provided=yes;
 389 fi
 390
 391
 392 # Use a variable for RPM - this way it can be
 393 # overridden with make RPM=rpm3 rpm
 394 RPM=rpm
 395 AC_SUBST(RPM)
 396
 397
 398 if test "$enable_all_static" = "yes"; then
 399   LDFLAGS="$LDFLAGS -all-static"
 400 fi
 401
 402 # we have asm source, so this is necessary for automake 1.6
 403 CCAS=$CC
 404 CCASFLAGS=$CFLAGS
 405
 406 AC_SUBST(CCAS)
 407 AC_SUBST(CCASFLAGS)
 408
 409 AC_CONFIG_FILES([ Makefile ])
 410 AC_CONFIG_FILES([ include/Makefile ])
 411 AC_CONFIG_FILES([ src/Makefile ])
 412
 413 AC_OUTPUT
 414
 415
 416
 417
 418
 419
 420
 421 #########################################################
 422 # Echo some important info, to avoid stupid mistakes
 423 #
 424
 425 if test "$enable_float" = "no" -a "$name_transform_provided" = "no"; then
 426   echo ""
 427   echo "* You are compiling a double precision version of Gromacs -"
 428   echo "  program names will be suffixed with _d to avoid overwriting single"
 429   echo "  precision files. You can override it with --program-suffix"
 430 fi
 431
 432 if test "$name_transform_provided" = "no" -a "$enable_mpi" = "yes"; then
 433   echo ""
 434   echo "* Seems you are compiling with MPI support. You can install the MPI-"
 435   echo "  enabled programs with suffixed names to have both MPI and non-MPI"
 436   echo "  versions. This is useful e.g. on supercomputers where you usually"
 437   echo "  cannot run MPI-linked programs on the login node."
 438   echo "  Set a suffix with e.g. --program-suffix=_mpi (or _mpi_d for double)."
 439   echo "  You only need MPI for mdrun, so if you already have non-MPI stuff"
 440   echo "  installed you can issue make mdrun; make install-mdrun."
 441 fi
 442
 443 echo ""
 444
 445
 446
 447
 448
 449
 450
 451
 452
 453
 454
 455
 456
 457
 458
 459
 460
 461
 462
 463
 464
 465
 466
 467
 468