Handle partially frozen and constrained atoms
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treea7f6b4c68b4df55375d7f94fc6323409529dccff
drwxr-xr-x   ..
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-rw-r--r-- 8768 adress.h
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-rw-r--r-- 42238 calc_verletbuf.c
-rw-r--r-- 4055 calc_verletbuf.h
-rw-r--r-- 3627 calcmu.cpp
-rw-r--r-- 8041 calcvir.cpp
-rw-r--r-- 89017 clincs.cpp
-rw-r--r-- 5278 compute_io.c
-rw-r--r-- 2187 compute_io.h
-rw-r--r-- 44781 constr.cpp
-rw-r--r-- 53168 coupling.cpp
-rw-r--r-- 20369 csettle.cpp
-rw-r--r-- 8566 ebin.c
-rw-r--r-- 47451 expanded.c
-rw-r--r-- 32866 force.cpp
-rw-r--r-- 2300 forcerec-threading.h
-rw-r--r-- 115177 forcerec.cpp
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-rw-r--r-- 3264 genborn_allvsall.h
-rw-r--r-- 115317 genborn_allvsall_sse2_double.c
-rw-r--r-- 3676 genborn_allvsall_sse2_double.h
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-rw-r--r-- 3676 genborn_allvsall_sse2_single.h
-rw-r--r-- 34417 genborn_sse2_double.c
-rw-r--r-- 2619 genborn_sse2_double.h
-rw-r--r-- 63192 genborn_sse2_single.c
-rw-r--r-- 2590 genborn_sse2_single.h
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-rw-r--r-- 10341 groupcoord.h
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-rw-r--r-- 14006 mdatom.cpp
-rw-r--r-- 53167 mdebin.c
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-rw-r--r-- 8912 mdebin_bar.h
-rw-r--r-- 4684 mdrun_signalling.cpp
-rw-r--r-- 4355 mdrun_signalling.h
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-rw-r--r-- 4383 nb_verlet.h
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-rw-r--r-- 5220 nbnxn_atomdata.h
-rw-r--r-- 4348 nbnxn_consts.h
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-rw-r--r-- 2135 nbnxn_gpu_types.h
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drwxr-xr-x - nbnxn_ocl
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-rw-r--r-- 194732 nbnxn_search.c
-rw-r--r-- 6135 nbnxn_search.h
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-rw-r--r-- 3275 nbnxn_simd.h
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-rw-r--r-- 21374 perf_est.c
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-rw-r--r-- 10233 rf_util.c
-rw-r--r-- 21414 shakef.cpp
-rw-r--r-- 40811 shellfc.cpp
-rw-r--r-- 95531 sim_util.cpp
-rw-r--r-- 12461 stat.cpp
-rw-r--r-- 53653 tables.c
drwxr-xr-x - tests
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-rw-r--r-- 60779 vsite.cpp
-rw-r--r-- 12501 wall.c
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