src/gromacs/trajectoryanalysis/tests/refdata/SelectModuleTest_HandlesPDBOutputWithNonPDBInput.xml

   1 <?xml version="1.0"?>
   2 <?xml-stylesheet type="text/xsl" href="referencedata.xsl"?>
   3 <ReferenceData>
   4   <String Name="CommandLine">select -select 'resname RA RD and y &lt; 2.5'</String>
   5   <OutputData Name="Data">
   6     <AnalysisData Name="occupancy">
   7       <DataFrame Name="Frame0">
   8         <Real Name="X">1.000000</Real>
   9         <DataValues>
  10           <Int Name="Count">2</Int>
  11           <DataValue>
  12             <Real Name="Value">1.000000</Real>
  13           </DataValue>
  14           <DataValue>
  15             <Real Name="Value">0.000000</Real>
  16           </DataValue>
  17         </DataValues>
  18       </DataFrame>
  19       <DataFrame Name="Frame1">
  20         <Real Name="X">2.000000</Real>
  21         <DataValues>
  22           <Int Name="Count">2</Int>
  23           <DataValue>
  24             <Real Name="Value">0.500000</Real>
  25           </DataValue>
  26           <DataValue>
  27             <Real Name="Value">0.707107</Real>
  28           </DataValue>
  29         </DataValues>
  30       </DataFrame>
  31       <DataFrame Name="Frame2">
  32         <Real Name="X">3.000000</Real>
  33         <DataValues>
  34           <Int Name="Count">2</Int>
  35           <DataValue>
  36             <Real Name="Value">0.500000</Real>
  37           </DataValue>
  38           <DataValue>
  39             <Real Name="Value">0.707107</Real>
  40           </DataValue>
  41         </DataValues>
  42       </DataFrame>
  43       <DataFrame Name="Frame3">
  44         <Real Name="X">4.000000</Real>
  45         <DataValues>
  46           <Int Name="Count">2</Int>
  47           <DataValue>
  48             <Real Name="Value">0.500000</Real>
  49           </DataValue>
  50           <DataValue>
  51             <Real Name="Value">0.707107</Real>
  52           </DataValue>
  53         </DataValues>
  54       </DataFrame>
  55       <DataFrame Name="Frame4">
  56         <Real Name="X">5.000000</Real>
  57         <DataValues>
  58           <Int Name="Count">2</Int>
  59           <DataValue>
  60             <Real Name="Value">0.500000</Real>
  61           </DataValue>
  62           <DataValue>
  63             <Real Name="Value">0.707107</Real>
  64           </DataValue>
  65         </DataValues>
  66       </DataFrame>
  67       <DataFrame Name="Frame5">
  68         <Real Name="X">6.000000</Real>
  69         <DataValues>
  70           <Int Name="Count">2</Int>
  71           <DataValue>
  72             <Real Name="Value">1.000000</Real>
  73           </DataValue>
  74           <DataValue>
  75             <Real Name="Value">0.000000</Real>
  76           </DataValue>
  77         </DataValues>
  78       </DataFrame>
  79       <DataFrame Name="Frame6">
  80         <Real Name="X">7.000000</Real>
  81         <DataValues>
  82           <Int Name="Count">2</Int>
  83           <DataValue>
  84             <Real Name="Value">1.000000</Real>
  85           </DataValue>
  86           <DataValue>
  87             <Real Name="Value">0.000000</Real>
  88           </DataValue>
  89         </DataValues>
  90       </DataFrame>
  91       <DataFrame Name="Frame7">
  92         <Real Name="X">8.000000</Real>
  93         <DataValues>
  94           <Int Name="Count">2</Int>
  95           <DataValue>
  96             <Real Name="Value">0.500000</Real>
  97           </DataValue>
  98           <DataValue>
  99             <Real Name="Value">0.707107</Real>
 100           </DataValue>
 101         </DataValues>
 102       </DataFrame>
 103       <DataFrame Name="Frame8">
 104         <Real Name="X">9.000000</Real>
 105         <DataValues>
 106           <Int Name="Count">2</Int>
 107           <DataValue>
 108             <Real Name="Value">0.000000</Real>
 109           </DataValue>
 110           <DataValue>
 111             <Real Name="Value">0.000000</Real>
 112           </DataValue>
 113         </DataValues>
 114       </DataFrame>
 115     </AnalysisData>
 116   </OutputData>
 117   <OutputFiles Name="Files">
 118     <String Name="-ofpdb"><![CDATA[
 119 TITLE     frame t= 0.000
 120 REMARK    THIS IS A SIMULATION BOX
 121 CRYST1  100.000  100.000  100.000  90.00  90.00  90.00 P 1           1
 122 MODEL        1
 123 ATOM      1  CB   RA     2      10.000  10.000   0.000  1.00  0.00
 124 ATOM      2  S1   RA     2      10.000  20.000   0.000  0.50  0.00
 125 ATOM      3  S2   RA     2      10.000  30.000   0.000  0.50  0.00
 126 ATOM      4  CB   RB     3      10.000  40.000   0.000  0.00  0.00
 127 ATOM      5  S1   RB     3      20.000  10.000   0.000  0.00  0.00
 128 ATOM      6  S2   RB     3      20.000  20.000   0.000  0.00  0.00
 129 ATOM      7  CB   RA     4      20.000  30.000   0.000  0.50  0.00
 130 ATOM      8  S1   RA     4      20.000  40.000   0.000  0.50  0.00
 131 ATOM      9  S2   RA     4      30.000  10.000   0.000  1.00  0.00
 132 ATOM     10  CB   RC     5      30.000  20.000   0.000  0.00  0.00
 133 ATOM     11  S1   RC     5      30.000  30.000   0.000  0.00  0.00
 134 ATOM     12  S2   RC     5      30.000  40.000   0.000  0.00  0.00
 135 ATOM     13  CB   RD     1      40.000  10.000   0.000  1.00  0.00
 136 ATOM     14  S1   RD     1      40.000  20.000   0.000  0.50  0.00
 137 ATOM     15  S2   RD     1      40.000  30.000   0.000  0.00  0.00
 138 TER
 139 ENDMDL
 140 ]]></String>
 141   </OutputFiles>
 142 </ReferenceData>