share/top/amberGS.ff/gbsa.itp

   1 [ implicit_genborn_params ]
   2
   3 ; atype      sar      st     pi       gbr       hct
   4 ;amber94_0    0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
   5 amber94_2    0.172    1      1.554    0.1875    0.72 ; C
   6 amber94_3    0.18     1      1.037    0.1875    0.72 ; C
   7 amber94_4    0.172    0.012  1.554    0.1875    0.72 ; C
   8 amber94_5    0.172    1      1.554    0.1875    0.72 ; C
   9 amber94_8    0.172    0.012  1.554    0.1875    0.72 ; C
  10 amber94_10   0.18     1      1.073    0.1875    0.72 ; C
  11 amber94_11   0.18     1      1.276    0.190     0.72 ; C
  12 amber94_12   0.18     1      1.073    0.1875    0.72 ; C
  13 amber94_13   0.18     1      1.073    0.1875    0.72 ; C
  14 amber94_14   0.172    0.012  1.554    0.1875    0.72 ; C
  15 amber94_17   0.1      1      1        0.115     0.85 ; H
  16 amber94_18   0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  17 amber94_19   0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  18 amber94_22   0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  19 amber94_23   0.1      1      1        0.115     0.85 ; H
  20 amber94_24   0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  21 amber94_25   0.1      1      1        0.105     0.85 ; H
  22 amber94_26   0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  23 amber94_28   0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  24 amber94_34   0.155    1      1.028    0.17063   0.79 ; N
  25 amber94_35   0.155    1      1.028    0.17063   0.79 ; N
  26 amber94_36   0.155    1      1.215    0.17063   0.79 ; N
  27 amber94_38   0.16     1      1.215    0.17063   0.79 ; N
  28 amber94_39   0.16     1      1.215    0.1625    0.79 ; N
  29 amber94_41   0.15     1      0.926    0.148     0.85 ; O
  30 amber94_43   0.152    1      1.080    0.1535    0.85 ; O
  31 amber94_45   0.17     1      0.922    0.148     0.85 ; O
  32 amber94_47   0.18     1      1.121    0.1775    0.96 ; S
  33 amber94_48   0.18     1      1.121    0.1775    0.96 ; S
  34
  35 ; masscenters for vsites do not have gbsa parameters
  36
  37 MNH2        0        0       0       0          0
  38 MNH3        0        0       0       0          0
  39 MCH3B       0        0       0       0          0