python_packaging/docker/gromacs.dockerfile

   1 # Provide an easy-to-reproduce environment in which to test full Python functionality.
   2 # Produce an image with GROMACS installed. Use the root of the repository as the build context
   3
   4 # Optionally, set `--build-arg DOCKER_CORES=N` for a Docker engine running with access to more than 1 CPU.
   5 #    REF=`git show -s --pretty=format:"%h"`
   6 #    docker build -t gmxapi/gromacs:${REF} --build-arg DOCKER_CORES=4 -f gromacs.dockerfile ../..
   7
   8 # This image serves as a base for integration with the gmxapi Python tools and sample code.
   9
  10 ARG MPIFLAVOR=mpich
  11 ARG REF=latest
  12 FROM gmxapi/gromacs-dependencies-$MPIFLAVOR:$REF
  13
  14 ENV SRC_DIR /tmp/gromacs-source
  15 COPY . $SRC_DIR
  16
  17 ENV BUILD_DIR /tmp/gromacs-build
  18 RUN mkdir -p $BUILD_DIR
  19 WORKDIR $BUILD_DIR
  20
  21 ARG DOCKER_CORES=1
  22 # Allow the build type to be specified with `docker build --build-arg TYPE=something`
  23 ARG TYPE=Release
  24 # Note: AVX2 instructions not available in older docker engines.
  25 RUN cmake $SRC_DIR \
  26         -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/gromacs \
  27         -DGMXAPI=ON \
  28         -DGMX_THREAD_MPI=ON \
  29         -DGMX_BUILD_HELP=OFF \
  30         -DGMX_SIMD=AVX_256 \
  31         -DGMX_USE_RDTSCP=OFF \
  32         -DGMX_HWLOC=OFF \
  33         -DCMAKE_BUILD_TYPE=$TYPE
  34 RUN make -j$DOCKER_CORES
  35 RUN make -j$DOCKER_CORES tests
  36 RUN make -j$DOCKER_CORES install
  37
  38 # Default command provided for convenience since it inherits WORKDIR from above.
  39 CMD make check