Simplify compiling GPU code for tests
[gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / tests / peptide-and-water.pdb
blob77555a6e493641415c4922cf57479a32f30cb85a
1 TITLE     Fragments of peptides and water
2 REMARK    THIS IS A SIMULATION BOX
3 CRYST1   80.562   56.371   74.450  90.00  90.00  90.00 P 1           1
4 MODEL        1
5 ATOM      1  N   ALA A   2      43.810  17.900  -0.540  1.00  0.00            
6 ATOM      2  H1  ALA A   2      44.800  17.785  -0.622  1.00  0.00            
7 ATOM      3  H2  ALA A   2      43.377  17.004  -0.438  1.00  0.00            
8 ATOM      4  H3  ALA A   2      43.458  18.349  -1.362  1.00  0.00            
9 ATOM      5  CA  ALA A   2      43.500  18.750   0.670  1.00  0.00            
10 ATOM      6  HA  ALA A   2      43.728  18.142   1.430  1.00  0.00            
11 ATOM      7  CB  ALA A   2      44.390  20.060   0.730  1.00  0.00            
12 ATOM      8  HB1 ALA A   2      44.150  20.589   1.544  1.00  0.00            
13 ATOM      9  HB2 ALA A   2      45.356  19.805   0.770  1.00  0.00            
14 ATOM     10  HB3 ALA A   2      44.225  20.613  -0.087  1.00  0.00            
15 ATOM     11  C   ALA A   2      42.030  19.010   0.920  1.00  0.00            
16 ATOM     12  O   ALA A   2      41.550  18.760   2.010  1.00  0.00            
17 ATOM     13  N   CYS A   3      41.410  19.640  -0.130  1.00  0.00            
18 ATOM     14  H   CYS A   3      41.928  19.877  -0.952  1.00  0.00            
19 ATOM     15  CA  CYS A   3      40.000  19.960  -0.040  1.00  0.00            
20 ATOM     16  HA  CYS A   3      39.726  19.549   0.830  1.00  0.00            
21 ATOM     17  CB  CYS A   3      39.690  21.510  -0.040  1.00  0.00            
22 ATOM     18  HB1 CYS A   3      40.088  21.896  -0.872  1.00  0.00            
23 ATOM     19  HB2 CYS A   3      38.696  21.618  -0.065  1.00  0.00            
24 ATOM     20  SG  CYS A   3      40.430  22.190   1.470  1.00  0.00            
25 ATOM     21  HG  CYS A   3      40.257  23.174   1.512  1.00  0.00            
26 ATOM     22  C   CYS A   3      39.300  19.330  -1.220  1.00  0.00            
27 ATOM     23  O   CYS A   3      38.170  19.680  -1.550  1.00  0.00            
28 ATOM     24  N   ASP A   4      40.000  18.460  -1.980  1.00  0.00            
29 ATOM     25  H   ASP A   4      40.969  18.366  -1.751  1.00  0.00            
30 ATOM     26  CA  ASP A   4      39.530  17.640  -3.090  1.00  0.00            
31 ATOM     27  HA  ASP A   4      39.109  18.223  -3.785  1.00  0.00            
32 ATOM     28  CB  ASP A   4      40.780  16.940  -3.740  1.00  0.00            
33 ATOM     29  HB1 ASP A   4      40.501  16.361  -4.506  1.00  0.00            
34 ATOM     30  HB2 ASP A   4      41.439  17.621  -4.059  1.00  0.00            
35 ATOM     31  CG  ASP A   4      41.430  16.080  -2.680  1.00  0.00            
36 ATOM     32  OD1 ASP A   4      41.220  14.850  -2.810  1.00  0.00            
37 ATOM     33  OD2 ASP A   4      41.940  16.580  -1.630  1.00  0.00            
38 ATOM     34  C   ASP A   4      38.410  16.690  -2.560  1.00  0.00            
39 ATOM     35  O   ASP A   4      37.470  17.010  -1.820  1.00  0.00            
40 TER
41 ATOM      1  OW  SOL     1       5.690  12.750  11.650  1.00  0.00            
42 ATOM      2  HW1 SOL     1       4.760  12.680  11.280  1.00  0.00            
43 ATOM      3  HW2 SOL     1       5.800  13.640  12.090  1.00  0.00            
44 ATOM      4  OW  SOL     2      15.550  15.110   7.030  1.00  0.00            
45 ATOM      5  HW1 SOL     2      14.980  14.950   7.840  1.00  0.00            
46 ATOM      6  HW2 SOL     2      14.960  15.210   6.230  1.00  0.00            
47 TER
48 ATOM      1  N   THR B  18      47.530  15.820   0.820  1.00  0.00            
49 ATOM      2  H1  THR B  18      47.507  16.562   1.490  1.00  0.00            
50 ATOM      3  H2  THR B  18      46.700  15.269   0.904  1.00  0.00            
51 ATOM      4  H3  THR B  18      48.330  15.244   0.987  1.00  0.00            
52 ATOM      5  CA  THR B  18      47.610  16.400  -0.570  1.00  0.00            
53 ATOM      6  HA  THR B  18      46.749  16.906  -0.523  1.00  0.00            
54 ATOM      7  CB  THR B  18      48.740  17.360  -0.930  1.00  0.00            
55 ATOM      8  HB  THR B  18      48.898  17.421  -1.916  1.00  0.00            
56 ATOM      9  OG1 THR B  18      50.020  16.940  -0.390  1.00  0.00            
57 ATOM     10  HG1 THR B  18      50.725  17.599  -0.652  1.00  0.00            
58 ATOM     11  CG2 THR B  18      48.330  18.640  -0.210  1.00  0.00            
59 ATOM     12 1HG2 THR B  18      49.012  19.351  -0.380  1.00  0.00            
60 ATOM     13 2HG2 THR B  18      47.440  18.944  -0.551  1.00  0.00            
61 ATOM     14 3HG2 THR B  18      48.269  18.465   0.773  1.00  0.00            
62 ATOM     15  C   THR B  18      47.650  15.380  -1.660  1.00  0.00            
63 ATOM     16  O   THR B  18      48.350  14.370  -1.570  1.00  0.00            
64 ATOM     17  N   VAL B  19      46.990  15.650  -2.800  1.00  0.00            
65 ATOM     18  H   VAL B  19      46.589  16.555  -2.944  1.00  0.00            
66 ATOM     19  CA  VAL B  19      46.860  14.630  -3.820  1.00  0.00            
67 ATOM     20  HA  VAL B  19      46.794  13.844  -3.206  1.00  0.00            
68 ATOM     21  CB  VAL B  19      45.590  14.650  -4.650  1.00  0.00            
69 ATOM     22  HB  VAL B  19      45.844  14.046  -5.405  1.00  0.00            
70 ATOM     23  CG1 VAL B  19      44.330  14.240  -3.760  1.00  0.00            
71 ATOM     24 1HG1 VAL B  19      43.504  14.259  -4.323  1.00  0.00            
72 ATOM     25 2HG1 VAL B  19      44.465  13.318  -3.396  1.00  0.00            
73 ATOM     26 3HG1 VAL B  19      44.232  14.886  -3.003  1.00  0.00            
74 ATOM     27  CG2 VAL B  19      45.210  15.960  -5.270  1.00  0.00            
75 ATOM     28 1HG2 VAL B  19      44.362  15.850  -5.789  1.00  0.00            
76 ATOM     29 2HG2 VAL B  19      45.075  16.642  -4.551  1.00  0.00            
77 ATOM     30 3HG2 VAL B  19      45.939  16.262  -5.884  1.00  0.00            
78 ATOM     31  C   VAL B  19      48.080  14.550  -4.760  1.00  0.00            
79 ATOM     32  O   VAL B  19      48.100  13.660  -5.600  1.00  0.00            
80 ATOM     33  N   TRP B  20      49.000  15.510  -4.590  1.00  0.00            
81 ATOM     34  H   TRP B  20      48.796  16.221  -3.917  1.00  0.00            
82 ATOM     35  CA  TRP B  20      50.240  15.610  -5.280  1.00  0.00            
83 ATOM     36  HA  TRP B  20      50.610  14.686  -5.379  1.00  0.00            
84 ATOM     37  CB  TRP B  20      50.000  16.290  -6.650  1.00  0.00            
85 ATOM     38  HB1 TRP B  20      49.286  15.797  -7.147  1.00  0.00            
86 ATOM     39  HB2 TRP B  20      49.713  17.237  -6.507  1.00  0.00            
87 ATOM     40  CG  TRP B  20      51.260  16.290  -7.490  1.00  0.00            
88 ATOM     41  CD1 TRP B  20      51.940  15.180  -7.930  1.00  0.00            
89 ATOM     42  HD1 TRP B  20      51.756  14.257  -7.592  1.00  0.00            
90 ATOM     43  CD2 TRP B  20      51.790  17.380  -8.290  1.00  0.00            
91 ATOM     44  NE1 TRP B  20      52.910  15.460  -8.890  1.00  0.00            
92 ATOM     45  HE1 TRP B  20      53.500  14.803  -9.358  1.00  0.00            
93 ATOM     46  CE2 TRP B  20      52.890  16.880  -9.070  1.00  0.00            
94 ATOM     47  CE3 TRP B  20      51.560  18.780  -8.300  1.00  0.00            
95 ATOM     48  HE3 TRP B  20      50.849  19.172  -7.717  1.00  0.00            
96 ATOM     49  CZ2 TRP B  20      53.670  17.750  -9.810  1.00  0.00            
97 ATOM     50  HZ2 TRP B  20      54.463  17.404 -10.311  1.00  0.00            
98 ATOM     51  CZ3 TRP B  20      52.340  19.630  -9.140  1.00  0.00            
99 ATOM     52  HZ3 TRP B  20      52.140  20.608  -9.198  1.00  0.00            
100 ATOM     53  CH2 TRP B  20      53.360  19.090  -9.860  1.00  0.00            
101 ATOM     54  HH2 TRP B  20      53.905  19.689 -10.447  1.00  0.00            
102 ATOM     55  C   TRP B  20      51.120  16.530  -4.440  1.00  0.00            
103 ATOM     56  O   TRP B  20      50.690  16.980  -3.420  1.00  0.00            
105 ENDMDL