Simplify compiling GPU code for tests
[gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / tests / fragment1.g96
blob536f8dc67734886b79e797914fd4a9ce2166ef21
1 TITLE
2 Protein (first fragment of regressiontests/complex/aminoacids.gro)
3 END
4 POSITION
5     2 ALA   N          1    4.381000042    1.789999962   -0.054000001
6     2 ALA   H1         2    4.480000019    1.777999997   -0.061999999
7     2 ALA   H2         3    4.337999821    1.700000048   -0.044000000
8     2 ALA   H3         4    4.346000195    1.835000038   -0.136000007
9     2 ALA   CA         5    4.349999905    1.875000000    0.067000002
10     2 ALA   HA         6    4.373000145    1.814000010    0.143000007
11     2 ALA   CB         7    4.439000130    2.006000042    0.072999999
12     2 ALA   HB1        8    4.414999962    2.059000015    0.153999999
13     2 ALA   HB2        9    4.535999775    1.980000019    0.077000000
14     2 ALA   HB3       10    4.422999859    2.061000109   -0.009000000
15     2 ALA   C         11    4.203000069    1.901000023    0.092000000
16     2 ALA   O         12    4.155000210    1.876000047    0.201000005
17     3 CYS   N         13    4.140999794    1.963999987   -0.013000000
18     3 CYS   H         14    4.192999840    1.988000035   -0.094999999
19     3 CYS   CA        15    4.000000000    1.996000051   -0.004000000
20     3 CYS   HA        16    3.973000050    1.955000043    0.082999997
21     3 CYS   CB        17    3.969000101    2.151000023   -0.004000000
22     3 CYS   HB1       18    4.008999825    2.190000057   -0.086999997
23     3 CYS   HB2       19    3.869999886    2.161999941   -0.007000000
24     3 CYS   SG        20    4.043000221    2.219000101    0.147000000
25     3 CYS   HG        21    4.026000023    2.316999912    0.150999993
26     3 CYS   C         22    3.930000067    1.932999969   -0.122000001
27     3 CYS   O         23    3.816999912    1.968000054   -0.155000001
28     4 ASP   N         24    4.000000000    1.845999956   -0.197999999
29     4 ASP   H         25    4.097000122    1.837000012   -0.174999997
30     4 ASP   CA        26    3.953000069    1.764000058   -0.308999985
31     4 ASP   HA        27    3.911000013    1.822000027   -0.379000008
32     4 ASP   CB        28    4.078000069    1.694000006   -0.374000013
33     4 ASP   HB1       29    4.050000191    1.636000037   -0.451000005
34     4 ASP   HB2       30    4.144000053    1.761999965   -0.405999988
35     4 ASP   CG        31    4.143000126    1.608000040   -0.268000007
36     4 ASP   OD1       32    4.122000217    1.485000014   -0.280999988
37     4 ASP   OD2       33    4.193999767    1.657999992   -0.163000003
38     4 ASP   C         34    3.841000080    1.669000030   -0.256000012
39     4 ASP   O         35    3.746999979    1.700999975   -0.181999996
40     5 GLU   N         36    3.841000080    1.542000055   -0.305999994
41     5 GLU   H         37    3.917999983    1.514000058   -0.363999993
42     5 GLU   CA        38    3.736999989    1.445000052   -0.280999988
43     5 GLU   HA        39    3.660000086    1.498000026   -0.246000007
44     5 GLU   CB        40    3.706000090    1.371000051   -0.416999996
45     5 GLU   HB1       41    3.785000086    1.314000010   -0.437999994
46     5 GLU   HB2       42    3.625999928    1.312999964   -0.400999993
47     5 GLU   CG        43    3.676000118    1.463999987   -0.545000017
48     5 GLU   HG1       44    3.762000084    1.501000047   -0.580999970
49     5 GLU   HG2       45    3.630000114    1.411000013   -0.615999997
50     5 GLU   CD        46    3.585000038    1.582000017   -0.509000003
51     5 GLU   OE1       47    3.634000063    1.695999980   -0.529999971
52     5 GLU   OE2       48    3.476000071    1.565000057   -0.451000005
53     5 GLU   C         49    3.785000086    1.338999987   -0.174999997
54     5 GLU   O         50    3.707999945    1.273000002   -0.104999997
55     6 PHE   N         51    3.921000004    1.320000052   -0.172000006
56     6 PHE   H         52    3.977999926    1.373999953   -0.233999997
57     6 PHE   CA        53    3.984999895    1.223999977   -0.082000002
58     6 PHE   HA        54    3.928999901    1.143000007   -0.066000000
59     6 PHE   CB        55    4.119999886    1.187999964   -0.144999996
60     6 PHE   HB1       56    4.171999931    1.271000028   -0.165000007
61     6 PHE   HB2       57    4.172999859    1.128999949   -0.082999997
62     6 PHE   CG        58    4.094999790    1.115000010   -0.272000015
63     6 PHE   CD1       59    4.122000217    1.169000030   -0.398999989
64     6 PHE   HD1       60    4.171000004    1.256000042   -0.405999988
65     6 PHE   CD2       61    4.030000210    0.986000001   -0.261000007
66     6 PHE   HD2       62    4.020999908    0.939999998   -0.172999993
67     6 PHE   CE1       63    4.081999779    1.105000019   -0.513999999
68     6 PHE   HE1       64    4.103000164    1.144999981   -0.602999985
69     6 PHE   CE2       65    3.980000019    0.926999986   -0.379999995
70     6 PHE   HE2       66    3.923000097    0.845000029   -0.375000000
71     6 PHE   CZ        67    4.012000084    0.985000014   -0.507000029
72     6 PHE   HZ        68    3.983999968    0.939000010   -0.591000021
73     6 PHE   C         69    4.006000042    1.297000051    0.045000002
74     6 PHE   O         70    3.966000080    1.259999990    0.156000003
75     7 GLY   N         71    4.063000202    1.414999962    0.028000001
76     7 GLY   H         72    4.113999844    1.432999969   -0.056000002
77     7 GLY   CA        73    4.052000046    1.521999955    0.131999999
78     7 GLY   HA1       74    4.060999870    1.480000019    0.222000003
79     7 GLY   HA2       75    4.125999928    1.587000012    0.118000001
80     7 GLY   C         76    3.921000004    1.595999956    0.127000004
81     7 GLY   O         77    3.921000004    1.715999961    0.152999997
82     8 HIS   N         78    3.802000046    1.536000013    0.108999997
83     8 HIS   H         79    3.806999922    1.437000036    0.093999997
84     8 HIS   CA        80    3.667999983    1.590000033    0.108000003
85     8 HIS   HA        81    3.665999889    1.636999965    0.020000000
86     8 HIS   CB        82    3.562999964    1.480000019    0.104000002
87     8 HIS   HB1       83    3.608999968    1.391999960    0.093000002
88     8 HIS   HB2       84    3.512000084    1.480000019    0.189999998
89     8 HIS   CG        85    3.466000080    1.498000026   -0.009000000
90     8 HIS   ND1       86    3.397000074    1.618999958   -0.015000000
91     8 HIS   CD2       87    3.443000078    1.425999999   -0.125000000
92     8 HIS   HD2       88    3.483999968    1.338999987   -0.150999993
93     8 HIS   CE1       89    3.329999924    1.611999989   -0.127000004
94     8 HIS   HE1       90    3.267999887    1.684000015   -0.158999994
95     8 HIS   NE2       91    3.354000092    1.496999979   -0.195999995
96     8 HIS   HE2       92    3.312999964    1.470000029   -0.282999992
97     8 HIS   C         93    3.641999960    1.695999980    0.221000001
98     8 HIS   O         94    3.651999950    1.677000046    0.347000003
99     9 ILE   N         95    3.596999884    1.817999959    0.174999997
100     9 ILE   H         96    3.604000092    1.835999966    0.077000000
101     9 ILE   CA        97    3.542000055    1.919999957    0.256000012
102     9 ILE   HA        98    3.548000097    1.868000031    0.340999991
103     9 ILE   CB        99    3.618999958    2.056999922    0.256999999
104     9 ILE   HB       100    3.578999996    2.122999907    0.319999993
105     9 ILE   CG1      101    3.609999895    2.125999928    0.115000002
106     9 ILE   HG11     102    3.683000088    2.091000080    0.057000000
107     9 ILE   HG12     103    3.522000074    2.105000019    0.074000001
108     9 ILE   CG2      104    3.766000032    2.023999929    0.303000003
109     9 ILE   HG21     105    3.819999933    2.108000040    0.305000007
110     9 ILE   HG22     106    3.763999939    1.983000040    0.393999994
111     9 ILE   HG23     107    3.806999922    1.960000038    0.238000005
112     9 ILE   CD       108    3.622999907    2.276000023    0.116999999
113     9 ILE   HD1      109    3.615999937    2.311000109    0.024000000
114     9 ILE   HD2      110    3.549999952    2.315000057    0.172999993
115     9 ILE   HD3      111    3.711999893    2.301000118    0.156000003
116     9 ILE   C        112    3.403000116    1.942999959    0.241999999
117     9 ILE   O        113    3.342000008    2.012000084    0.326000005
118    10 LYS   N        114    3.342999935    1.894000053    0.131999999
119    10 LYS   H        115    3.395999908    1.837000012    0.068999998
120    10 LYS   CA       116    3.206000090    1.921000004    0.104000002
121    10 LYS   HA       117    3.193000078    2.003000021    0.159999996
122    10 LYS   CB       118    3.181999922    1.950999975   -0.046000000
123    10 LYS   HB1      119    3.184000015    1.863999963   -0.094999999
124    10 LYS   HB2      120    3.091000080    1.991000056   -0.054000001
125    10 LYS   CG       121    3.279000044    2.045000076   -0.118000001
126    10 LYS   HG1      122    3.230000019    2.081000090   -0.197999999
127    10 LYS   HG2      123    3.299000025    2.119999886   -0.054000001
128    10 LYS   CD       124    3.414999962    1.986999989   -0.167999998
129    10 LYS   HD1      125    3.473999977    2.065000057   -0.188999996
130    10 LYS   HD2      126    3.453999996    1.934999943   -0.092000000
131    10 LYS   CE       127    3.414000034    1.893000007   -0.294000000
132    10 LYS   HE1      128    3.345000029    1.822000027   -0.282000005
133    10 LYS   HE2      129    3.392999887    1.947000027   -0.375999987
134    10 LYS   NZ       130    3.543999910    1.824000001   -0.319000006
135    10 LYS   HZ1      131    3.536000013    1.766000032   -0.400000006
136    10 LYS   HZ2      132    3.615999937    1.891999960   -0.333000004
137    10 LYS   HZ3      133    3.566999912    1.766999960   -0.239999995
138    10 LYS   C        134    3.109999895    1.809000015    0.150999993
139    10 LYS   O        135    2.989000082    1.820999980    0.172000006
140    11 LEU   N        136    3.171999931    1.690999985    0.175999999
141    11 LEU   H        137    3.250000000    1.664999962    0.119000003
142    11 LEU   CA       138    3.130000114    1.598999977    0.282999992
143    11 LEU   HA       139    3.048000097    1.628999949    0.331999987
144    11 LEU   CB       140    3.092999935    1.462000012    0.224999994
145    11 LEU   HB1      141    3.177000046    1.427000046    0.182999998
146    11 LEU   HB2      142    3.069000006    1.404999971    0.303000003
147    11 LEU   CG       143    2.979000092    1.445000052    0.119999997
148    11 LEU   HG       144    2.996000051    1.503000021    0.041000001
149    11 LEU   CD1      145    2.967999935    1.294000030    0.083999999
150    11 LEU   HD11     146    2.894999981    1.281000018    0.017000001
151    11 LEU   HD12     147    3.055000067    1.261999965    0.046000000
152    11 LEU   HD13     148    2.947000027    1.241999984    0.166999996
153    11 LEU   CD2      149    2.846999884    1.481999993    0.182999998
154    11 LEU   HD21     150    2.773999929    1.470999956    0.115999997
155    11 LEU   HD22     151    2.828999996    1.422000051    0.261000007
156    11 LEU   HD23     152    2.849999905    1.577000022    0.214000002
157    11 LEU   C        153    3.246000051    1.600000024    0.375999987
158    11 LEU   O        154    3.354000092    1.552999973    0.340999991
159    12 MET   N        155    3.230000019    1.657999992    0.499000013
160    12 MET   H        156    3.138999939    1.677000046    0.537000000
161    12 MET   CA       157    3.354000092    1.690999985    0.573000014
162    12 MET   HA       158    3.414000034    1.728999972    0.501999974
163    12 MET   CB       159    3.329999924    1.799999952    0.681999981
164    12 MET   HB1      160    3.296999931    1.881999969    0.634999990
165    12 MET   HB2      161    3.259000063    1.764999986    0.742999971
166    12 MET   CG       162    3.448999882    1.843999982    0.772000015
167    12 MET   HG1      163    3.411999941    1.921000004    0.824999988
168    12 MET   HG2      164    3.463000059    1.766000032    0.833000004
169    12 MET   SD       165    3.604000092    1.889999986    0.677999973
170    12 MET   CE       166    3.555000067    2.058000088    0.615999997
171    12 MET   HE1      167    3.630000114    2.096999884    0.561999977
172    12 MET   HE2      168    3.473999977    2.049999952    0.559000015
173    12 MET   HE3      169    3.535000086    2.118000031    0.694000006
174    12 MET   C        170    3.430999994    1.570000052    0.621999979
175    12 MET   O        171    3.391000032    1.493999958    0.713000000
176    13 ASN   N        172    3.548000097    1.544000030    0.568000019
177    13 ASN   H        173    3.575999975    1.600999951    0.490999997
178    13 ASN   CA       174    3.640000105    1.440000057    0.610000014
179    13 ASN   HA       175    3.595999956    1.373999953    0.671000004
180    13 ASN   CB       176    3.691999912    1.368999958    0.479999989
181    13 ASN   HB1      177    3.612999916    1.335999966    0.428999990
182    13 ASN   HB2      178    3.740999937    1.437000036    0.425000012
183    13 ASN   CG       179    3.786999941    1.248999953    0.499000013
184    13 ASN   OD1      180    3.839999914    1.223999977    0.606000006
185    13 ASN   ND2      181    3.829999924    1.179000020    0.391000003
186    13 ASN   HD21     182    3.799999952    1.205000043    0.298999995
187    13 ASN   HD22     183    3.891999960    1.100999951    0.402999997
188    13 ASN   C        184    3.749000072    1.509999990    0.685999990
189    13 ASN   O        185    3.812000036    1.600999951    0.626999974
190    14 PRO   N        186    3.789000034    1.481999993    0.805999994
191    14 PRO   CA       187    3.892999887    1.554000020    0.883000016
192    14 PRO   HA       188    3.875999928    1.651999950    0.875999987
193    14 PRO   CB       189    3.880000114    1.490000010    1.019000053
194    14 PRO   HB1      190    3.970999956    1.480000019    1.059999943
195    14 PRO   HB2      191    3.822999954    1.547999978    1.077999949
196    14 PRO   CG       192    3.815999985    1.355000019    1.006000042
197    14 PRO   HG1      193    3.884000063    1.284000039    0.986999989
198    14 PRO   HG2      194    3.763999939    1.330999970    1.088000059
199    14 PRO   CD       195    3.724999905    1.378000021    0.888000011
200    14 PRO   HD1      196    3.714999914    1.294000030    0.833999991
201    14 PRO   HD2      197    3.634999990    1.409000039    0.917999983
202    14 PRO   C        198    4.035999775    1.542999983    0.833999991
203    14 PRO   O        199    4.106999874    1.641000032    0.859000027
204    15 GLN   N        200    4.079999924    1.442000031    0.765999973
205    15 GLN   H        201    4.019000053    1.363999963    0.751999974
206    15 GLN   CA       202    4.219999790    1.435999990    0.707000017
207    15 GLN   HA       203    4.280000210    1.468999982    0.779999971
208    15 GLN   CB       204    4.260000229    1.294000030    0.672999978
209    15 GLN   HB1      205    4.359000206    1.291000009    0.662999988
210    15 GLN   HB2      206    4.231999874    1.235000014    0.749000013
211    15 GLN   CG       207    4.201000214    1.238000035    0.547999978
212    15 GLN   HG1      208    4.188000202    1.139999986    0.559000015
213    15 GLN   HG2      209    4.112999916    1.281999946    0.531000018
214    15 GLN   CD       210    4.294000149    1.264000058    0.430999994
215    15 GLN   OE1      211    4.414999962    1.289000034    0.444000006
216    15 GLN   NE2      212    4.234000206    1.279999971    0.307999998
217    15 GLN   HE21     213    4.135000229    1.274000049    0.300000012
218    15 GLN   HE22     214    4.289999962    1.297000051    0.226999998
219    15 GLN   C        215    4.242000103    1.529999971    0.588000000
220    15 GLN   O        216    4.158999920    1.541000009    0.497999996
221    16 ARG   N        217    4.349999905    1.613999963    0.586000025
222    16 ARG   H        218    4.415999889    1.603000045    0.661000013
223    16 ARG   CA       219    4.381000042    1.720000029    0.485000014
224    16 ARG   HA       220    4.298999786    1.728000045    0.428000003
225    16 ARG   CB       221    4.421999931    1.853999972    0.566999972
226    16 ARG   HB1      222    4.498000145    1.832999945    0.628000021
227    16 ARG   HB2      223    4.449999809    1.924999952    0.501999974
228    16 ARG   CG       224    4.302999973    1.911999941    0.653999984
229    16 ARG   HG1      225    4.260000229    1.833999991    0.699999988
230    16 ARG   HG2      226    4.343999863    1.973000050    0.722000003
231    16 ARG   CD       227    4.186999798    1.993000031    0.583000004
232    16 ARG   HD1      228    4.120999813    2.026000023    0.649999976
233    16 ARG   HD2      229    4.223999977    2.071000099    0.532999992
234    16 ARG   NE       230    4.114999771    1.904999971    0.486000001
235    16 ARG   HE       231    4.147999763    1.899999976    0.391999990
236    16 ARG   CZ       232    4.008999825    1.833999991    0.519999981
237    16 ARG   NH1      233    3.979000092    1.807000041    0.648999989
238    16 ARG   HH11     234    4.038000107    1.840999961    0.722000003
239    16 ARG   HH12     235    3.898000002    1.753000021    0.671000004
240    16 ARG   NH2      236    3.930000067    1.771000028    0.425999999
241    16 ARG   HH21     237    3.951999903    1.777999997    0.328999996
242    16 ARG   HH22     238    3.849999905    1.718000054    0.455000013
243    16 ARG   C        239    4.499000072    1.679999948    0.391000003
244    16 ARG   O        240    4.563000202    1.768000007    0.333999991
245    17 SER   N        241    4.527999878    1.549999952    0.375999987
246    17 SER   H        242    4.473000050    1.476999998    0.416999996
247    17 SER   CA       243    4.644999981    1.524000049    0.296999991
248    17 SER   HA       244    4.703999996    1.588000059    0.347000003
249    17 SER   CB       245    4.686999798    1.371000051    0.298999995
250    17 SER   HB1      246    4.620999813    1.315000057    0.250000000
251    17 SER   HB2      247    4.777999878    1.358000040    0.259000003
252    17 SER   OG       248    4.691999912    1.322000027    0.433999985
253    17 SER   HG       249    4.718999863    1.225999951    0.432999998
254    17 SER   C        250    4.636000156    1.559999943    0.144999996
255    17 SER   O1       251    4.538000107    1.567999959    0.078000002
256    17 SER   O2       252    4.745999813    1.536000013    0.068999998
259     8.056200027    5.637100220    7.445000172