share/top/gromos54a7.ff/aminoacids.n.tdb

   1 [ None ]
   2
   3 [ NH3+ ]
   4 [ replace ]
   5 N               NL      14.0067 0.129
   6 CA              CH1     13.019  0.127   0
   7 [ add ]
   8 3       4       H       N       CA      C
   9         H       1.008   0.248
  10 [ delete ]
  11 H
  12 [ bonds ]
  13 N       H1      gb_2
  14 N       H2      gb_2
  15 N       H3      gb_2
  16 [ angles ]
  17 H1      N       H2      ga_10
  18 H2      N       H3      ga_10
  19 H3      N       H1      ga_10
  20 CA      N       H1      ga_11
  21 CA      N       H2      ga_11
  22 CA      N       H3      ga_11
  23 [ dihedrals ]
  24 H1      N       CA      C       gd_39
  25
  26 [ NH2 ]
  27 [ replace ]
  28 N               NL      14.0067 -0.66
  29 CA              CH1     13.019  -0.22   0
  30 [ add ]
  31 2       4       H       N       CA      C
  32         H       1.008   0.44
  33 [ delete ]
  34 H
  35 [ bonds ]
  36 N       H1      gb_2
  37 N       H2      gb_2
  38 [ angles ]
  39 H1      N       H2      ga_10
  40 CA      N       H1      ga_11
  41 CA      N       H2      ga_11
  42 [ dihedrals ]
  43 H1      N       CA      C       gd_39
  44
  45 [ PRO-NH2+ ]
  46 [ replace ]
  47 N               NT      14.0067 0.128
  48 CA              CH1     13.019  0.188
  49 CD              CH2r    14.027  0.188
  50 [ add ]
  51 2       4       H       N       CA      C
  52         H       1.008   0.248
  53 [ bonds ]
  54 N       H1      gb_2
  55 N       H2      gb_2
  56 [ angles ]
  57 H1      N       H2      ga_10
  58 CA      N       H1      ga_11
  59 CA      N       H2      ga_11
  60 CD      N       H1      ga_11
  61 CD      N       H2      ga_11
  62 [ dihedrals ]
  63 CD      N       CA      C       gd_39
  64
  65 [ PRO-NH ]
  66 [ replace ]
  67 N               N       14.0067 -0.31
  68 [ add ]
  69 1       4       H       N       CA      C
  70         H       1.008   0.31
  71 [ bonds ]
  72 N       H       gb_2
  73 [ angles ]
  74 CA      N       H       ga_11
  75 CD      N       H       ga_11
  76 [ dihedrals ]
  77 CD      N       CA      C       gd_39
  78
  79 [ GLY-NH3+ ]
  80 [ replace ]
  81 N               NL      14.0067 0.129
  82 CA              CH2     14.027  0.127   0
  83 [ add ]
  84 3       4       H       N       CA      C
  85         H       1.008   0.248
  86 [ delete ]
  87 H
  88 [ bonds ]
  89 N       H1      gb_2
  90 N       H2      gb_2
  91 N       H3      gb_2
  92 [ angles ]
  93 H1      N       H2      ga_10
  94 H2      N       H3      ga_10
  95 H3      N       H1      ga_10
  96 CA      N       H1      ga_11
  97 CA      N       H2      ga_11
  98 CA      N       H3      ga_11
  99 [ dihedrals ]
 100 H1      N       CA      C       gd_39
 101