renamed amber LYP to LYS and changed names for water models in the rtp files
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blob22ac11c6e4bbc6f20eda38a2f11c497bdd51d2b3
1 ; rtp residue to rtp building block table
2 ;GMX   Force-field
3 ALA     ALA     NALA    CALA    ALA
4 GLY     GLY     NGLY    CGLY    GLY
5 SER     SER     NSER    CSER    SER
6 THR     THR     NTHR    CTHR    THR
7 LEU     LEU     NLEU    CLEU    LEU
8 ILE     ILE     NILE    CILE    ILE
9 VAL     VAL     NVAL    CVAL    VAL
10 ASN     ASN     NASN    CASN    ASN
11 GLN     GLN     NGLN    CGLN    GLN
12 ARG     ARG     NARG    CARG    ARG
13 HISD    HID     NHID    CHID    HID
14 HISE    HIE     NHIE    CHIE    HID
15 HISH    HIP     NHIP    CHIP    HIP
16 TRP     TRP     NTRP    CTRP    TRP
17 PHE     PHE     NPHE    CPHE    PHE
18 TYR     TYR     NTYR    CTYR    TYR
19 GLU     GLU     NGLU    CGLU    GLU
20 ASP     ASP     NASP    CASP    ASP
21 LYS     LYS     NLYS    CLYS    LYS
22 ORN     ORN     NORN    CORN    ORN
23 DAB     DAB     NDAB    CDAB    DAB
24 LYSN    LYN     NLYN    CLYN    LYN
25 PRO     PRO     NPRO    CPRO    PRO
26 HYP     HYP     NHYP    CHYP    HYP
27 CYS     CYN     NCYN    CCYN    CYN
28 CYS2    CYS2    NCYS2   CCYS2   CYS2
29 MET     MET     NMET    CMET    MET
30 ASPH    ASH     NASH    CASH    ASH
31 GLUH    GLH     NGLH    CGLH    GLH