share/top/ions.itp

   1 ; This file is for backward compatibility only.
   2 ; Please directly include the ions.itp file from your force field directory.
   3
   4 #ifdef _FF_GROMACS
   5
   6 #include "gmx.ff/ions.itp"
   7
   8 #endif
   9
  10 #ifdef _FF_GROMOS96
  11 ; The definitions for GROMOS are included here,
  12 ; because newer versions of the force fields
  13 ; do not have the signs of the ions in the molecule name.
  14
  15 [ moleculetype ]
  16 ; molname   nrexcl
  17 CU1+        1
  18
  19 [ atoms ]
  20 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  21 1       CU1+    1       CU1+        CU1+     1      1        63.54600
  22
  23 [ moleculetype ]
  24 ; molname   nrexcl
  25 CU2+        1
  26
  27 [ atoms ]
  28 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  29 1       CU2+    1       CU2+        CU       1      2        63.54600
  30
  31 [ moleculetype ]
  32 ; molname   nrexcl
  33 ZN2+        1
  34
  35 [ atoms ]
  36 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  37 1       ZN2+    1       ZN2+        ZN       1      2        65.37000
  38
  39 [ moleculetype ]
  40 ; molname   nrexcl
  41 MG2+        1
  42
  43 [ atoms ]
  44 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  45 1       MG2+    1       MG2+        MG       1      2        24.30500
  46
  47 [ moleculetype ]
  48 ; molname   nrexcl
  49 CA2+        1
  50
  51 [ atoms ]
  52 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  53 1       CA2+    1       CA2+        CA       1      2        40.08000
  54
  55 [ moleculetype ]
  56 ; molname   nrexcl
  57 NA+         1
  58
  59 [ atoms ]
  60 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  61 1       NA+     1       NA+         NA       1      1        22.9898
  62
  63 [ moleculetype ]
  64 ; molname   nrexcl
  65 CL-         1
  66
  67 [ atoms ]
  68 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  69 1       CL-     1       CL-         CL       1      -1       35.45300
  70
  71
  72 #include "gromos43a1.ff/ions.itp"
  73
  74 #endif
  75
  76 #ifdef _FF_OPLS
  77 ; The definitions for OPLS-aa are included here,
  78 ; because newer versions of the force fields
  79 ; do not have the signs of the ions in the molecule name.
  80
  81 [ moleculetype ]
  82 ; molname   nrexcl
  83 CU2+        1
  84
  85 [ atoms ]
  86 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  87 1       Cu2+    1       CU2+        CU       1      2        63.54600
  88
  89 [ moleculetype ]
  90 ; molname   nrexcl
  91 ZN2+        1
  92
  93 [ atoms ]
  94 ; id    at type res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
  95 1       Zn2+    1       ZN2+        ZN       1      2        65.37000
  96
  97 [ moleculetype ]
  98 ; molname   nrexcl
  99 MG2+        1
 100
 101 [ atoms ]
 102 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 103 1       opls_411    1       MG2+        MG       1      2        24.30500
 104
 105 [ moleculetype ]
 106 ; molname   nrexcl
 107 CA2+        1
 108
 109 [ atoms ]
 110 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 111 1       opls_412    1       CA2+        CA       1      2        40.08000
 112
 113 [ moleculetype ]
 114 ; molname   nrexcl
 115 LI+         1
 116
 117 [ atoms ]
 118 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 119 1       opls_406    1       LI+         LI       1      1        6.941
 120
 121 [ moleculetype ]
 122 ; molname   nrexcl
 123 NA+         1
 124
 125 [ atoms ]
 126 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 127 1       opls_407    1       NA+         NA       1      1        22.98977
 128
 129 [ moleculetype ]
 130 ; molname   nrexcl
 131 K+          1
 132
 133 [ atoms ]
 134 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 135 1       opls_408    1       K+          K        1      1        39.0983
 136
 137 [ moleculetype ]
 138 ; molname   nrexcl
 139 Rb+         1
 140
 141 [ atoms ]
 142 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 143 1       opls_409    1       Rb+         Rb       1      1        85.4678
 144
 145 [ moleculetype ]
 146 ; molname   nrexcl
 147 Cs+         1
 148
 149 [ atoms ]
 150 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 151 1       opls_410    1       Cs+         Cs       1      1        132.9054
 152
 153 [ moleculetype ]
 154 ; molname   nrexcl
 155 F-          1
 156
 157 [ atoms ]
 158 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 159 1       opls_400    1       F-          F        1      -1       18.9984
 160
 161 [ moleculetype ]
 162 ; molname   nrexcl
 163 CL-         1
 164
 165 [ atoms ]
 166 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 167 1       opls_401    1       CL-         CL       1      -1       35.45300
 168
 169 [ moleculetype ]
 170 ; molname   nrexcl
 171 BR-         1
 172
 173 [ atoms ]
 174 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 175 1       opls_402    1       BR-         BR       1      -1       79.904
 176
 177 [ moleculetype ]
 178 ; molname   nrexcl
 179 I-          1
 180
 181 [ atoms ]
 182 ; id    at type     res nr  residu name at name  cg nr  charge   mass
 183 1       opls_403    1       I-          I        1      -1       126.9045
 184
 185 #endif