man/man1/wheel.1

   1 .TH wheel 1 "Thu 16 Oct 2008"
   2 .SH NAME
   3 wheel - plots helical wheels
   4
   5 .B VERSION 4.0
   6 .SH SYNOPSIS
   7 \f3wheel\fP
   8 .BI "-f" " nnnice.dat "
   9 .BI "-o" " plot.eps "
  10 .BI "-[no]h" ""
  11 .BI "-nice" " int "
  12 .BI "-r0" " int "
  13 .BI "-rot0" " real "
  14 .BI "-T" " string "
  15 .BI "-[no]nn" ""
  16 .SH DESCRIPTION
  17 wheel plots a helical wheel representation of your sequence.The input sequence is in the .dat file where the first line contains
  18 the number of residues and each consecutive line contains a residuename.
  19 .SH FILES
  20 .BI "-f" " nnnice.dat"
  21 .B Input
  22  Generic data file
  23
  24 .BI "-o" " plot.eps"
  25 .B Output
  26  Encapsulated PostScript (tm) file
  27
  28 .SH OTHER OPTIONS
  29 .BI "-[no]h"  "no    "
  30  Print help info and quit
  31
  32 .BI "-nice"  " int" " 19"
  33  Set the nicelevel
  34
  35 .BI "-r0"  " int" " 1"
  36  The first residue number in the sequence
  37
  38 .BI "-rot0"  " real" " 0     "
  39  Rotate around an angle initially (90 degrees makes sense)
  40
  41 .BI "-T"  " string" " "
  42  Plot a title in the center of the wheel (must be shorter than 10 characters, or it will overwrite the wheel)
  43
  44 .BI "-[no]nn"  "yes   "
  45  Toggle numbers
  46