scripts/GMXRC.bash.cmakein

   1 # sh/bash/zsh configuration file for Gromacs
   2 # First we remove old gromacs stuff from the paths
   3 # by selecting everything else.
   4 # This is not 100% necessary, but very useful when we
   5 # repeatedly switch between gmx versions in a shell.
   6
   7 #we make use of IFS, which needs shwordsplit in zsh
   8 test -n "${ZSH_VERSION+set}" && setopt shwordsplit
   9 old_IFS="$IFS"
  10 IFS=":"
  11
  12 # First remove gromacs part of ld_library_path
  13 tmppath=""
  14 for i in $LD_LIBRARY_PATH; do
  15   if test "$i" != "$GMXLDLIB"; then
  16     tmppath="${tmppath}${tmppath:+:}${i}"
  17   fi
  18 done
  19 LD_LIBRARY_PATH=$tmppath
  20
  21 # remove gromacs part of PKG_CONFIG_PATH
  22 tmppath=""
  23 for i in $PKG_CONFIG_PATH; do
  24   if test "$i" != "$GMXLDLIB/pkgconfig"; then
  25     tmppath="${tmppath}${tmppath:+:}${i}"
  26   fi
  27 done
  28 PKG_CONFIG_PATH=$tmppath
  29
  30 # remove gromacs part of path
  31 tmppath=""
  32 for i in $PATH; do
  33   if test "$i" != "$GMXBIN"; then
  34     tmppath="${tmppath}${tmppath:+:}${i}"
  35   fi
  36 done
  37 PATH=$tmppath
  38
  39 # and remove the gmx part of manpath
  40 tmppath=""
  41 for i in $MANPATH; do
  42   if test "$i" != "$GMXMAN"; then
  43     tmppath="${tmppath}${tmppath:+:}${i}"
  44   fi
  45 done
  46 MANPATH=$tmppath
  47
  48 ##########################################################
  49 # This is the real configuration part. We save the Gromacs
  50 # things in separate vars, so we can remove them later.
  51 # If you move gromacs, change the first line.
  52 ##########################################################
  53 GMXPREFIX=@CMAKE_INSTALL_PREFIX@
  54 GMXBIN=${GMXPREFIX}/@BIN_INSTALL_DIR@
  55 GMXLDLIB=${GMXPREFIX}/@LIB_INSTALL_DIR@
  56 GMXMAN=${GMXPREFIX}/@MAN_INSTALL_DIR@
  57 GMXDATA=${GMXPREFIX}/@DATA_INSTALL_DIR@
  58 GROMACS_DIR=${GMXPREFIX}
  59
  60 LD_LIBRARY_PATH=${GMXLDLIB}${LD_LIBRARY_PATH:+:}${LD_LIBRARY_PATH}
  61 PKG_CONFIG_PATH=${GMXLDLIB}/pkgconfig${PKG_CONFIG_PATH:+:}${PKG_CONFIG_PATH}
  62 PATH=${GMXBIN}${PATH:+:}${PATH}
  63 #debian/ubuntu needs a : at the end
  64 MANPATH=${GMXMAN}:${MANPATH}
  65
  66 # export should be separate, so /bin/sh understands it
  67 export GMXBIN GMXLDLIB GMXMAN GMXDATA LD_LIBRARY_PATH PATH MANPATH
  68 export PKG_CONFIG_PATH GROMACS_DIR
  69
  70 IFS="$old_IFS"
  71 unset old_IFS
  72
  73 # read bash completions if understand how to use them
  74 # and this shell supports extended globbing
  75 if test -n "${BASH_VERSION+set}" && (complete) > /dev/null 2>&1; then
  76   if (shopt -s extglob) > /dev/null 2>&1; then
  77     shopt -s extglob
  78     if [ -f $GMXBIN/gmx-completion.bash ]; then
  79       source $GMXBIN/gmx-completion.bash
  80       for cfile in $GMXBIN/gmx-completion-*.bash ; do
  81         source $cfile
  82       done
  83     fi
  84   fi
  85 elif test -n "${ZSH_VERSION+set}" > /dev/null 2>&1 ; then
  86   autoload bashcompinit
  87   if (bashcompinit) > /dev/null 2>&1; then
  88     bashcompinit
  89     if [ -f $GMXBIN/gmx-completion.bash ]; then
  90       source $GMXBIN/gmx-completion.bash
  91       for cfile in $GMXBIN/gmx-completion-*.bash ; do
  92         source $cfile
  93       done
  94     fi
  95   fi
  96 fi