docs/release-notes/2018/2018.4.rst

   1 GROMACS 2018.4 release notes
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   3
   4 This version was released on TODO, 2018. These release notes document
   5 the changes that have taken place in GROMACS since version 2018.3, to fix known
   6 issues. It also incorporates all fixes made in version TODO and
   7 earlier, which you can find described in the :ref:`release-notes`.
   8
   9 Fixes where mdrun could behave incorrectly
  10 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  11
  12 Correct PME forces with free energy without perturbed charges/LJ
  13 """"""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  14
  15 With free-energies calculations with lambda not set to zero and no
  16 actual perturbed charges or atom types for Lennard-Jones, the Coulomb
  17 or LJ PME mesh forces would be scaled with lambda. Note that this bug
  18 did not affect the, usual, setup where charges or atom types are actually
  19 perturbed.
  20
  21 :issue: `2640`
  22
  23 Fixes for ``gmx`` tools
  24 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  25
  26 Fix mindist output file checks
  27 """"""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  28
  29 mindist would not check if the output file needed to print residue names and
  30 residue contacts over time was actually defined, leading to errors with
  31 empty file name strings.
  32
  33 :issue:`2653`
  34
  35
  36 Fixes to improve portability
  37 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  38
  39 Miscellaneous
  40 ^^^^^^^^^^^^^
  41
  42 Fixed an issue where the log file could sometimes report an incorrect
  43 initial dynamic load balancing state
  44
  45 :issue:`2631`