thesis.log

   1 This is pdfTeXk, Version 3.1415926-1.40.9 (Web2C 7.5.7) (format=pdflatex 2008.12.28)  16 FEB 2010 18:26
   2 entering extended mode
   3 \write18 enabled.
   4  %&-line parsing enabled.
   5 **thesis.tex
   6 (./thesis.tex
   7 LaTeX2e <2005/12/01>
   8 Babel <v3.8l> and hyphenation patterns for english, usenglishmax, dumylang, noh
   9 yphenation, german-x-2008-06-18, ngerman-x-2008-06-18, ancientgreek, ibycus, ar
  10 abic, basque, bulgarian, catalan, pinyin, coptic, croatian, czech, danish, dutc
  11 h, esperanto, estonian, farsi, finnish, french, galician, german, ngerman, mono
  12 greek, greek, hungarian, icelandic, indonesian, interlingua, irish, italian, la
  13 tin, lithuanian, mongolian, mongolian2a, bokmal, nynorsk, polish, portuguese, r
  14 omanian, russian, sanskrit, serbian, slovak, slovenian, spanish, swedish, turki
  15 sh, ukenglish, ukrainian, uppersorbian, welsh, loaded.
  16 (./phdthesis.cls
  17 Document Class: phdthesis 2001/07/18 PhD Dissertation Style
  18 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/book.cls
  19 Document Class: book 2005/09/16 v1.4f Standard LaTeX document class
  20 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/bk10.clo
  21 File: bk10.clo 2005/09/16 v1.4f Standard LaTeX file (size option)
  22 )
  23 \c@part=\count79
  24 \c@chapter=\count80
  25 \c@section=\count81
  26 \c@subsection=\count82
  27 \c@subsubsection=\count83
  28 \c@paragraph=\count84
  29 \c@subparagraph=\count85
  30 \c@figure=\count86
  31 \c@table=\count87
  32 \abovecaptionskip=\skip41
  33 \belowcaptionskip=\skip42
  34 \bibindent=\dimen102
  35 )
  36 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/epsfig.sty
  37 Package: epsfig 1999/02/16 v1.7a (e)psfig emulation (SPQR)
  38
  39 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/graphicx.sty
  40 Package: graphicx 1999/02/16 v1.0f Enhanced LaTeX Graphics (DPC,SPQR)
  41
  42 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/keyval.sty
  43 Package: keyval 1999/03/16 v1.13 key=value parser (DPC)
  44 \KV@toks@=\toks14
  45 )
  46 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/graphics.sty
  47 Package: graphics 2006/02/20 v1.0o Standard LaTeX Graphics (DPC,SPQR)
  48
  49 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/trig.sty
  50 Package: trig 1999/03/16 v1.09 sin cos tan (DPC)
  51 )
  52 (/usr/local/texlive/2008/texmf/tex/latex/config/graphics.cfg
  53 File: graphics.cfg 2007/01/18 v1.5 graphics configuration of teTeX/TeXLive
  54 )
  55 Package graphics Info: Driver file: pdftex.def on input line 90.
  56
  57 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/pdftex-def/pdftex.def
  58 File: pdftex.def 2008/09/08 v0.04l Graphics/color for pdfTeX
  59 \Gread@gobject=\count88
  60 ))
  61 \Gin@req@height=\dimen103
  62 \Gin@req@width=\dimen104
  63 )
  64 \epsfxsize=\dimen105
  65 \epsfysize=\dimen106
  66 )
  67 \@spacebeforechapterhead=\skip43
  68 \@spaceinchapterhead=\skip44
  69 \@spaceafterchapterhead=\skip45
  70 )
  71 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/psnfss/palatino.sty
  72 Package: palatino 2005/04/12 PSNFSS-v9.2a (SPQR)
  73 )
  74 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/makeidx.sty
  75 Package: makeidx 2000/03/29 v1.0m Standard LaTeX package
  76 )
  77 \@indexfile=\write3
  78 \openout3 = `thesis.idx'.
  79
  80
  81 Writing index file thesis.idx
  82 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fancyhdr/fancyheadings.sty
  83 Package: fancyheadings 2008/02/04 1.99 Dummy package to call fancyhdr
  84
  85
  86 Package fancyheadings Warning: Please stop using fancyheadings!
  87 (fancyheadings)                Use fancyhdr instead.
  88 (fancyheadings)                We will call fancyhdr with the very same
  89 (fancyheadings)                options you passed to fancyheadings.
  90 (fancyheadings)
  91 (fancyheadings)                fancyhdr is 99 percent compatible with
  92 (fancyheadings)                fancyheadings. The only incompatibility is
  93 (fancyheadings)                that \headrulewidth and \footrulewidth and
  94 (fancyheadings)                their \plain... versions are no longer length
  95 (fancyheadings)                parameters, but normal macros (to be changed
  96 (fancyheadings)                with \renewcommand rather than \setlength)..
  97
  98 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fancyhdr/fancyhdr.sty
  99 \fancy@headwidth=\skip46
 100 \f@ncyO@elh=\skip47
 101 \f@ncyO@erh=\skip48
 102 \f@ncyO@olh=\skip49
 103 \f@ncyO@orh=\skip50
 104 \f@ncyO@elf=\skip51
 105 \f@ncyO@erf=\skip52
 106 \f@ncyO@olf=\skip53
 107 \f@ncyO@orf=\skip54
 108 ))
 109 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsmath.sty
 110 Package: amsmath 2000/07/18 v2.13 AMS math features
 111 \@mathmargin=\skip55
 112
 113 For additional information on amsmath, use the `?' option.
 114 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amstext.sty
 115 Package: amstext 2000/06/29 v2.01
 116
 117 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsgen.sty
 118 File: amsgen.sty 1999/11/30 v2.0
 119 \@emptytoks=\toks15
 120 \ex@=\dimen107
 121 ))
 122 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsbsy.sty
 123 Package: amsbsy 1999/11/29 v1.2d
 124 \pmbraise@=\dimen108
 125 )
 126 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsopn.sty
 127 Package: amsopn 1999/12/14 v2.01 operator names
 128 )
 129 \inf@bad=\count89
 130 LaTeX Info: Redefining \frac on input line 211.
 131 \uproot@=\count90
 132 \leftroot@=\count91
 133 LaTeX Info: Redefining \overline on input line 307.
 134 \classnum@=\count92
 135 \DOTSCASE@=\count93
 136 LaTeX Info: Redefining \ldots on input line 379.
 137 LaTeX Info: Redefining \dots on input line 382.
 138 LaTeX Info: Redefining \cdots on input line 467.
 139 \Mathstrutbox@=\box26
 140 \strutbox@=\box27
 141 \big@size=\dimen109
 142 LaTeX Font Info:    Redeclaring font encoding OML on input line 567.
 143 LaTeX Font Info:    Redeclaring font encoding OMS on input line 568.
 144 \macc@depth=\count94
 145 \c@MaxMatrixCols=\count95
 146 \dotsspace@=\muskip10
 147 \c@parentequation=\count96
 148 \dspbrk@lvl=\count97
 149 \tag@help=\toks16
 150 \row@=\count98
 151 \column@=\count99
 152 \maxfields@=\count100
 153 \andhelp@=\toks17
 154 \eqnshift@=\dimen110
 155 \alignsep@=\dimen111
 156 \tagshift@=\dimen112
 157 \tagwidth@=\dimen113
 158 \totwidth@=\dimen114
 159 \lineht@=\dimen115
 160 \@envbody=\toks18
 161 \multlinegap=\skip56
 162 \multlinetaggap=\skip57
 163 \mathdisplay@stack=\toks19
 164 LaTeX Info: Redefining \[ on input line 2666.
 165 LaTeX Info: Redefining \] on input line 2667.
 166 )
 167 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/amssymb.sty
 168 Package: amssymb 2002/01/22 v2.2d
 169
 170 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/amsfonts.sty
 171 Package: amsfonts 2001/10/25 v2.2f
 172 \symAMSa=\mathgroup4
 173 \symAMSb=\mathgroup5
 174 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathfrak' in version `bold'
 175 (Font)                  U/euf/m/n --> U/euf/b/n on input line 132.
 176 ))
 177 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/subfigure/subfigure.sty
 178 Package: subfigure 2002/03/15 v2.1.5 subfigure package
 179 \subfigtopskip=\skip58
 180 \subfigcapskip=\skip59
 181 \subfigcaptopadj=\dimen116
 182 \subfigbottomskip=\skip60
 183 \subfigcapmargin=\dimen117
 184 \subfiglabelskip=\skip61
 185 \c@subfigure=\count101
 186 \c@lofdepth=\count102
 187 \c@subtable=\count103
 188 \c@lotdepth=\count104
 189
 190 ****************************************
 191 * Local config file subfigure.cfg used *
 192 ****************************************
 193 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/subfigure/subfigure.cfg)
 194 \subfig@top=\skip62
 195 \subfig@bottom=\skip63
 196 )
 197 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/float/float.sty
 198 Package: float 2001/11/08 v1.3d Float enhancements (AL)
 199 \c@float@type=\count105
 200 \float@exts=\toks20
 201 \float@box=\box28
 202 \@float@everytoks=\toks21
 203 \@floatcapt=\box29
 204 )
 205 (./Stylefiles/here.sty)
 206 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/harvard/harvard.sty
 207 Package: harvard
 208
 209 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/ifthen.sty
 210 Package: ifthen 2001/05/26 v1.1c Standard LaTeX ifthen package (DPC)
 211 ))
 212 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/rotating/rotating.sty
 213 Package: rotating 2008/10/05 v2.15c rotated objects in LaTeX
 214 \c@r@tfl@t=\count106
 215 \rotFPtop=\skip64
 216 \rotFPbot=\skip65
 217 \rot@float@box=\box30
 218 \rot@mess@toks=\toks22
 219 )
 220 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/multirow/multirow.sty
 221 \bigstrutjot=\dimen118
 222 )
 223 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/comment/comment.sty
 224 \CommentStream=\write4
 225
 226 Excluding comment 'comment') (./Stylefiles/captionhack.sty)
 227 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/epigraph/epigraph.sty
 228 Package: epigraph 2002/10/22 v1.5a typesetting epigraphs
 229 \beforeepigraphskip=\skip66
 230 \afterepigraphskip=\skip67
 231 \epigraphwidth=\skip68
 232 \epigraphrule=\skip69
 233 )
 234 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/hyperref/hyperref.sty
 235 Package: hyperref 2008/12/26 v6.78n Hypertext links for LaTeX
 236
 237 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/ifpdf.sty
 238 Package: ifpdf 2007/12/12 v1.6 Provides the ifpdf switch (HO)
 239 Package ifpdf Info: pdfTeX in pdf mode detected.
 240 )
 241 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/ifvtex.sty
 242 Package: ifvtex 2008/11/04 v1.4 Switches for detecting VTeX and its modes (HO)
 243 Package ifvtex Info: VTeX not detected.
 244 )
 245 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/ifxetex/ifxetex.sty
 246 Package: ifxetex 2008/09/18 v0.4 Provides ifxetex conditional
 247 )
 248 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/oberdiek/hycolor.sty
 249 Package: hycolor 2008/09/08 v1.4 Code for color options of hyperref/bookmark (H
 250 O)
 251
 252 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/oberdiek/xcolor-patch.sty
 253 Package: xcolor-patch 2008/09/08 xcolor patch
 254 ))
 255 \@linkdim=\dimen119
 256 \Hy@linkcounter=\count107
 257 \Hy@pagecounter=\count108
 258
 259 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/hyperref/pd1enc.def
 260 File: pd1enc.def 2008/12/26 v6.78n Hyperref: PDFDocEncoding definition (HO)
 261 )
 262 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/etexcmds.sty
 263 Package: etexcmds 2007/12/12 v1.2 Prefix for e-TeX command names (HO)
 264
 265 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/infwarerr.sty
 266 Package: infwarerr 2007/09/09 v1.2 Providing info/warning/message (HO)
 267 )
 268 Package etexcmds Info: Could not find \expanded.
 269 (etexcmds)             That can mean that you are not using pdfTeX 1.50 or
 270 (etexcmds)             that some package has redefined \expanded.
 271 (etexcmds)             In the latter case, load this package earlier.
 272 )
 273 (/usr/local/texlive/2008/texmf/tex/latex/config/hyperref.cfg
 274 File: hyperref.cfg 2002/06/06 v1.2 hyperref configuration of TeXLive
 275 )
 276 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/oberdiek/kvoptions.sty
 277 Package: kvoptions 2007/10/18 v3.0 Keyval support for LaTeX options (HO)
 278 )
 279 Package hyperref Info: Option `colorlinks' set `true' on input line 2796.
 280 Package hyperref Info: Hyper figures OFF on input line 2907.
 281 Package hyperref Info: Link nesting OFF on input line 2912.
 282 Package hyperref Info: Hyper index ON on input line 2915.
 283 Package hyperref Info: Plain pages OFF on input line 2922.
 284 Package hyperref Info: Backreferencing OFF on input line 2927.
 285
 286 Implicit mode ON; LaTeX internals redefined
 287 Package hyperref Info: Bookmarks ON on input line 3117.
 288 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/ltxmisc/url.sty
 289 \Urlmuskip=\muskip11
 290 Package: url 2006/04/12  ver 3.3  Verb mode for urls, etc.
 291 )
 292 LaTeX Info: Redefining \url on input line 3354.
 293
 294 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/bitset.sty
 295 Package: bitset 2007/09/28 v1.0 Data type bit set (HO)
 296
 297 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/intcalc.sty
 298 Package: intcalc 2007/09/27 v1.1 Expandable integer calculations (HO)
 299 )
 300 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/bigintcalc.sty
 301 Package: bigintcalc 2007/11/11 v1.1 Expandable big integer calculations (HO)
 302
 303 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/pdftexcmds.sty
 304 Package: pdftexcmds 2007/12/12 v0.3 LuaTeX support for pdfTeX utility functions
 305  (HO)
 306 Package pdftexcmds Info: LuaTeX not detected on input line 139.
 307 )))
 308 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/kvsetkeys.sty
 309 Package: kvsetkeys 2007/09/29 v1.3 Key value parser with default handler suppor
 310 t (HO)
 311 )
 312 \Fld@menulength=\count109
 313 \Field@Width=\dimen120
 314 \Fld@charsize=\dimen121
 315 \Field@toks=\toks23
 316 Package hyperref Info: Hyper figures OFF on input line 4271.
 317 Package hyperref Info: Link nesting OFF on input line 4276.
 318 Package hyperref Info: Hyper index ON on input line 4279.
 319 Package hyperref Info: backreferencing OFF on input line 4286.
 320 Package hyperref Info: Link coloring ON on input line 4289.
 321 Package hyperref Info: Link coloring with OCG OFF on input line 4296.
 322 Package hyperref Info: PDF/A mode OFF on input line 4301.
 323
 324 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/generic/oberdiek/atbegshi.sty
 325 Package: atbegshi 2008/07/31 v1.9 At begin shipout hook (HO)
 326 )
 327 \Hy@abspage=\count110
 328 \c@Item=\count111
 329 \c@Hfootnote=\count112
 330 )
 331
 332 Package hyperref Warning: Wrong driver `hdvips.def';
 333 (hyperref)                pdfTeX is running in PDF mode.
 334 (hyperref)                Forcing driver `hpdftex.def'.
 335
 336 *hyperref using driver hpdftex*
 337 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/hyperref/hpdftex.def
 338 File: hpdftex.def 2008/12/26 v6.78n Hyperref driver for pdfTeX
 339 \Fld@listcount=\count113
 340 )
 341 Package hyperref Info: Option `bookmarksnumbered' set `true' on input line 64.
 342
 343 Dissertation
 344
 345 LaTeX Warning: Unused global option(s):
 346     [makeidx].
 347
 348 (./thesis.aux (./Thesis.Cover/cover.aux)
 349 (./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.aux))
 350 \openout1 = `thesis.aux'.
 351
 352 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OML/cmm/m/it on input line 97.
 353 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 354 LaTeX Font Info:    Checking defaults for T1/cmr/m/n on input line 97.
 355 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 356 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OT1/cmr/m/n on input line 97.
 357 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 358 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OMS/cmsy/m/n on input line 97.
 359 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 360 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OMX/cmex/m/n on input line 97.
 361 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 362 LaTeX Font Info:    Checking defaults for U/cmr/m/n on input line 97.
 363 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 364 LaTeX Font Info:    Checking defaults for PD1/pdf/m/n on input line 97.
 365 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 97.
 366 LaTeX Font Info:    Try loading font information for OT1+ppl on input line 97.
 367
 368 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/psnfss/ot1ppl.fd
 369 File: ot1ppl.fd 2001/06/04 font definitions for OT1/ppl.
 370 )
 371 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/context/base/supp-pdf.tex
 372 [Loading MPS to PDF converter (version 2006.09.02).]
 373 \scratchcounter=\count114
 374 \scratchdimen=\dimen122
 375 \scratchbox=\box31
 376 \nofMPsegments=\count115
 377 \nofMParguments=\count116
 378 \everyMPshowfont=\toks24
 379 \MPscratchCnt=\count117
 380 \MPscratchDim=\dimen123
 381 \MPnumerator=\count118
 382 \everyMPtoPDFconversion=\toks25
 383 ) (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/color.sty
 384 Package: color 2005/11/14 v1.0j Standard LaTeX Color (DPC)
 385
 386 (/usr/local/texlive/2008/texmf/tex/latex/config/color.cfg
 387 File: color.cfg 2007/01/18 v1.5 color configuration of teTeX/TeXLive
 388 )
 389 Package color Info: Driver file: pdftex.def on input line 130.
 390 )
 391 Package hyperref Info: Link coloring ON on input line 97.
 392
 393 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/hyperref/nameref.sty
 394 Package: nameref 2007/05/29 v2.31 Cross-referencing by name of section
 395
 396 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/oberdiek/refcount.sty
 397 Package: refcount 2008/08/11 v3.1 Data extraction from references (HO)
 398 )
 399 \c@section@level=\count119
 400 )
 401 LaTeX Info: Redefining \ref on input line 97.
 402 LaTeX Info: Redefining \pageref on input line 97.
 403
 404 (./thesis.out) (./thesis.out)
 405 \@outlinefile=\write5
 406 \openout5 = `thesis.out'.
 407
 408 \AtBeginShipoutBox=\box32
 409 Package hyperref Info: *** compatibility with harvard ****  on input line 97.
 410 \openout2 = `./Thesis.Cover/cover.aux'.
 411
 412  (./Thesis.Cover/cover.tex
 413 \centeroffset=\skip70
 414 LaTeX Font Info:    Font shape `OT1/ppl/bx/n' in size <12> not available
 415 (Font)              Font shape `OT1/ppl/b/n' tried instead on input line 17.
 416
 417 <./Thesis.Cover/logo.jpg, id=22, 298.86656pt x 361.35pt>
 418 File: ./Thesis.Cover/logo.jpg Graphic file (type jpg)
 419
 420 <use ./Thesis.Cover/logo.jpg>
 421 Underfull \hbox (badness 10000) in paragraph at lines 43--43
 422
 423  []
 424
 425 LaTeX Font Info:    Try loading font information for U+msa on input line 43.
 426 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/umsa.fd
 427 File: umsa.fd 2002/01/19 v2.2g AMS font definitions
 428 )
 429 LaTeX Font Info:    Try loading font information for U+msb on input line 43.
 430
 431 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/umsb.fd
 432 File: umsb.fd 2002/01/19 v2.2g AMS font definitions
 433 )) [1
 434
 435
 436 {/usr/local/texlive/2008/texmf-var/fonts/map/pdftex/updmap/pdftex.map} <./Thesi
 437 s.Cover/logo.jpg>] [2
 438
 439
 440 ]
 441 \openout2 = `./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.aux'.
 442
 443  (./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.tex
 444 Chapter 1.
 445 LaTeX Font Info:    Font shape `OT1/ppl/bx/n' in size <14.4> not available
 446 (Font)              Font shape `OT1/ppl/b/n' tried instead on input line 7.
 447 LaTeX Font Info:    Font shape `OT1/ppl/bx/n' in size <17.28> not available
 448 (Font)              Font shape `OT1/ppl/b/n' tried instead on input line 7.
 449 LaTeX Font Info:    Font shape `OT1/ppl/bx/n' in size <10> not available
 450 (Font)              Font shape `OT1/ppl/b/n' tried instead on input line 23.
 451
 452 Overfull \hbox (0.71962pt too wide) in paragraph at lines 24--25
 453 []\OT1/ppl/m/it/9 Fast scan-ning tun-nel-ing mi-croscopy re-veals an un-usual s
 454 truc-ture and mo-bil-ity of smaller
 455  []
 456
 457
 458 LaTeX Warning: Citation 'Hubel62' on page 1 undefined on input line 42.
 459
 460
 461 LaTeX Warning: Citation 'Hubel74' on page 1 undefined on input line 42.
 462
 463 [1
 464
 465
 466
 467
 468 ]
 469
 470 LaTeX Warning: Citation 'Daugman80' on page 2 undefined on input line 50.
 471
 472
 473 LaTeX Warning: Citation 'Daugman85' on page 2 undefined on input line 50.
 474
 475
 476 <./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png, id=39, 125.5089pt x 115.3
 477 911pt>
 478 File: ./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png Graphic file (type pn
 479 g)
 480  <use ./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png>
 481 LaTeX Font Info:    Font shape `OT1/ppl/bx/n' in size <9> not available
 482 (Font)              Font shape `OT1/ppl/b/n' tried instead on input line 61.
 483 LaTeX Font Info:    Font shape `OT1/ppl/bx/n' in size <8> not available
 484 (Font)              Font shape `OT1/ppl/b/n' tried instead on input line 73.
 485
 486
 487 LaTeX Warning: Reference `Fig:Images' on page 2 undefined on input line 95.
 488
 489
 490 LaTeX Warning: Reference `Fig:Images' on page 2 undefined on input line 95.
 491
 492 ) [2 <./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png (PNG copy)>] [3]
 493 [4
 494
 495
 496 ]
 497 No file thesis.bbl.
 498 (./thesis.aux (./Thesis.Cover/cover.aux)
 499 (./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.aux))
 500
 501 LaTeX Warning: There were undefined references.
 502
 503  )
 504 Here is how much of TeX's memory you used:
 505  5872 strings out of 493876
 506  82946 string characters out of 1150567
 507  155432 words of memory out of 3000000
 508  8962 multiletter control sequences out of 10000+50000
 509  25068 words of font info for 69 fonts, out of 3000000 for 5000
 510  714 hyphenation exceptions out of 8191
 511  39i,12n,45p,1304b,333s stack positions out of 5000i,500n,10000p,200000b,50000s
 512 {/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/fonts/enc/dvips/base/8r.enc}</usr/local/t
 513 exlive/2008/texmf-dist/fonts/type1/bluesky/cm/cmmi8.pfb></usr/local/texlive/200
 514 8/texmf-dist/fonts/type1/bluesky/cm/cmr8.pfb></usr/local/texlive/2008/texmf-dis
 515 t/fonts/type1/urw/palatino/uplb8a.pfb></usr/local/texlive/2008/texmf-dist/fonts
 516 /type1/urw/palatino/uplr8a.pfb></usr/local/texlive/2008/texmf-dist/fonts/type1/
 517 urw/palatino/uplri8a.pfb>
 518 Output written on thesis.pdf (6 pages, 114965 bytes).
 519 PDF statistics:
 520  79 PDF objects out of 1000 (max. 8388607)
 521  13 named destinations out of 1000 (max. 131072)
 522  55 words of extra memory for PDF output out of 10000 (max. 10000000)
 523