INSTALL

   1 bioperl-network Installation
   2
   3 REQUIREMENTS
   4
   5 Perl 5.6.1 is required, but 5.8 or greater is recommended.
   6
   7 The bioperl-network package depends on the core BioPerl package. See
   8 the BioPerl INSTALL file (http://bioperl.org/INSTALL.html) for instructions
   9 for downloading and installing BioPerl. You should install at least the
  10 corresponding version of Bioperl: since this is bioperl-network 1.6, bioperl
  11 1.6 or greater is recommended.
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  13 bioperl-network also requires Perl's Graph package, https://metacpan.org/pod/Graph
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  15 Reading PSI XML files using bioperl-network requires the XML::Twig
  16 module. See https://metacpan.org/pod/XML::Twig.
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  18 INSTALLING BIOPERL-NETWORK (UNIX, MAC OS X AND CYGWIN)
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  20 Using CPAN:
  21
  22     cpan>install C/CJ/CJFIELDS/BioPerl-network-1.6.0.tar.gz
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  24 Manual installation:
  25
  26     >gunzip bioperl-network-<release-version>.tar.gz
  27     >tar xvf bioperl-network-<release-version>.tar
  28     >cd bioperl-network
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  30 where <release-version> is the current release.
  31
  32     >perl Build.PL
  33
  34 You can run regression tests and install bioperl-network using the
  35 following commands:
  36
  37     >./Build test
  38     >./Build install
  39
  40 You may have to have root privileges in order to run './Build install'
  41 successfully on Unix. See the BioPerl INSTALL file for alternative approaches
  42 if you don't have root or administrative privileges.