1 ********************************************************************************
2 MAST
- Motif Alignment
and Search Tool
3 ********************************************************************************
4 MAST version
3.5.3 (Release date
: 2006-04-30 01:41:24 -0700 (Sun
, 30 Apr
2006))
6 For further information on how
to interpret these results
or to get
7 a copy of the MAST software please access http
://meme.nbcr.net.
8 ********************************************************************************
11 ********************************************************************************
13 ********************************************************************************
14 If you use this program
in your research
, please cite
:
16 Timothy L. Bailey
and Michael Gribskov
,
17 "Combining evidence using p-values: application to sequence homology
18 searches", Bioinformatics
, 14(48-54), 1998.
19 ********************************************************************************
22 ********************************************************************************
24 ********************************************************************************
25 DATABASE
/home
/struckma
/XXXXX
/xxxxx.seq.fasta
(nucleotide
)
26 Last updated on Tue Jul
11 18:30:00 2006
27 Database contains
4390 sequences
, 173499994 residues
29 Scores for positive
and reverse complement strands are combined.
31 MOTIFS test2.fasta.meme.out
(peptide
)
32 MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
33 ----- ----- -------------------
39 PAIRWISE MOTIF CORRELATIONS
:
41 ----- ----- ----- -----
45 No overly similar pairs
(correlation
> 0.60) found.
47 Random
model letter frequencies
(from non
-redundant database
):
48 A
0.070 C
0.024 D
0.040 E
0.052 F
0.040 G
0.074 H
0.029 I
0.041 K
0.052
49 L
0.096 M
0.017 N
0.032 P
0.065 Q
0.042 R
0.067 S
0.084 T
0.052 V
0.059
51 ********************************************************************************
54 ********************************************************************************
55 SECTION I
: HIGH
-SCORING SEQUENCES
56 ********************************************************************************
57 SEQUENCE NAME DESCRIPTION FRAME E
-VALUE LENGTH
58 ------------- ----------- ----- -------- ------
59 chr04q c
3.3e-26 6776397
60 chr02q b
9.1e-20 8059593
62 ********************************************************************************
66 ********************************************************************************
67 SECTION II
: MOTIF DIAGRAMS
68 ********************************************************************************
69 SEQUENCE NAME E
-VALUE MOTIF DIAGRAM
70 ------------- -------- -------------
71 chr04q
3.3e-26 170163_
[-3a
]_45546_
[+4a
]_316730_
72 [+2c
]_6917_
[-1b
]_46576_
[+2c
]_
73 112087_
[-4a
]_106122_
[-3a
]_54413_
74 [-3c
]_2646_
[-3c
]_55292_
[-1b
]_
75 229973_
[-1a
]_168811_
[+1b
]_320302_
76 [+3c
]_36_
[+1c
]_192_
[+4c
]_879_
77 [+2c
]_15041_
[+4b
]_12578_
[+2a
]_
78 15085_
[-2b
]_34466_
[-2a
]_3572_
79 [-3c
]_106732_
[-4a
]_100884_
[-1a
]_
80 150814_
[+2b
]_50394_
[-2b
]_2709_
81 [+1b
]_80737_
[-2c
]_9981_
[+4c
]_
82 134258_
[+2b
]_5742_
[+2b
]_9723_
83 [-1b
]_120512_
[-2a
]_180_
[+2a
]_
84 53270_
[-4c
]_17749_
[-2a
]_105178_
85 [-1b
]_47045_
[-2a
]_86702_
[+2c
]_
86 6448_
[-4a
]_10586_
[-2c
]_30988_
87 [-2a
]_125990_
[-2c
]_69247_
[-4a
]_
88 250534_
[-2b
]_143429_
[-2a
]_41053_
89 [-4b
]_167542_
[-1c
]_126920_
[-2b
]_
90 79648_
[-2c
]_41344_
[-1a
]_34611_
91 [-1a
]_32643_
[-2a
]_69929_
[+1c
]_
92 20774_
[+1b
]_62113_
[+2c
]_23189_
93 [-4b
]_9299_
[-4a
]_39496_
[+1b
]_
94 43277_
[-2a
]_116690_
[+4c
]_6861_
95 [+4c
]_71133_
[+2c
]_143200_
[-2a
]_
96 382714_
[+1b
]_15009_
[+3b
]_167995_
97 [-3c
]_11445_
[+3c
]_85905_
[-2c
]_
98 116003_
[+2b
]_62888_
[-3a
]_64899_
99 [+2a
]_49005_
[+2a
]_56736_
[+3a
]_
100 14883_
[+2a
]_6123_
[-2a
]_24729_
101 [-2a
]_75491_
[-2c
]_33025_
[+2a
]_
102 223953_
[+2a
]_3536_
[+2c
]_57658_
103 [+1a
]_321010_
[-2b
]_99474_
[+4b
]_
104 14568_
[+4b
]_14260_
[-2c
]_151646_
105 [-4b
]_91790_
[-2a
]_60756
106 chr02q
9.1e-20 181586_
[+1c
]_84138_
[-3c
]_15167_
107 [-2b
]_135571_
[-4c
]_325471_
[+4a
]_
108 12798_
[-4a
]_4700_
[-2c
]_182142_
109 [-1c
]_7912_
[-1a
]_80644_
[-2b
]_
110 143591_
[-2a
]_5286_
[-1a
]_17554_
111 [-4b
]_104512_
[+2c
]_75992_
[-2b
]_
112 1994_
[+2a
]_7759_
[-2b
]_11678_
[+4a
]_
113 544_
[+2b
]_15348_
[+2b
]_53558_
[+2a
]_
114 756_
[-2a
]_132170_
[-3c
]_6820_
[+1a
]_
115 226852_
[+2b
]_107962_
[+1c
]_5949_
116 [-2c
]_138458_
[-4b
]_133762_
[+1c
]_
117 126753_
[-2c
]_69234_
[+1c
]_33_
[+1c
]_
118 72_
[+1c
]_150_
[+1c
]_33_
[+1c
]_72_
119 [+1c
]_267_
[+1c
]_33_
[+1c
]_15489_
120 [-1c
]_21704_
[+1b
]_72_
[+1b
]_346_
121 [+1c
]_96059_
[-4b
]_36498_
[-2b
]_
122 335_
[-4a
]_
[-1a
]_155_
[-3c
]_18189_
123 [-1c
]_174870_
[-2c
]_38785_
[+1a
]_
124 40123_
[+2b
]_147684_
[-1b
]_122397_
125 [+2b
]_45479_
[+4a
]_74846_
[+1c
]_
126 23231_
[+3b
]_38245_
[-4c
]_152196_
127 [-2c
]_304660_
[+2a
]_165655_
[-4b
]_
128 38440_
[-4c
]_21816_
[+1c
]_25500_
129 [-2c
]_336004_
[+3a
]_323232_
[-4a
]_
130 7268_
[+2c
]_47044_
[+4a
]_41451_
131 [-2a
]_66303_
[+2a
]_30342_
[+1a
]_
132 40657_
[-4b
]_180301_
[-2c
]_35205_
133 [-2c
]_59610_
[-2c
]_2222_
[+1b
]_
134 1400_
[-2a
]_53171_
[-2c
]_175866_
135 [-2c
]_162426_
[-2c
]_70915_
[+2a
]_
136 33010_
[-1b
]_139023_
[+1b
]_248403_
137 [-2b
]_102258_
[+2b
]_13294_
[-4c
]_
138 85097_
[+2b
]_13395_
[-4b
]_217923_
139 [-2b
]_252830_
[-2a
]_40346_
[-3c
]_
140 9779_
[+1b
]_15798_
[-1b
]_16835_
141 [+1a
]_31854_
[-2a
]_3867_
[+2a
]_
142 28000_
[+1b
]_14934_
[+2b
]_18632_
143 [+4a
]_54520_
[+2b
]_53902_
[+1c
]_
144 198948_
[-2c
]_10079_
[+1b
]_162971_
145 [-2a
]_106411_
[+2b
]_74994_
[-4b
]_
146 11202_
[-4b
]_165552_
[+2b
]_7010_
147 [-2a
]_12481_
[-2b
]_23349_
[+1b
]_
148 102412_
[+2c
]_100606_
[-4a
]_31326
150 ********************************************************************************
154 ********************************************************************************
155 SECTION III
: ANNOTATED SEQUENCES
156 ********************************************************************************
161 LENGTH
= 6776397 COMBINED P
-VALUE
= 7.48e-30 E
-VALUE
= 3.3e-26
162 DIAGRAM
: 170163_
[-3a
]_45546_
[+4a
]_316730_
[+2c
]_6917_
[-1b
]_46576_
[+2c
]_112087_
163 [-4a
]_106122_
[-3a
]_54413_
[-3c
]_2646_
[-3c
]_55292_
[-1b
]_229973_
[-1a
]_
164 168811_
[+1b
]_320302_
[+3c
]_36_
[+1c
]_192_
[+4c
]_879_
[+2c
]_15041_
[+4b
]_
165 12578_
[+2a
]_15085_
[-2b
]_34466_
[-2a
]_3572_
[-3c
]_106732_
[-4a
]_100884_
166 [-1a
]_150814_
[+2b
]_50394_
[-2b
]_2709_
[+1b
]_80737_
[-2c
]_9981_
[+4c
]_
167 134258_
[+2b
]_5742_
[+2b
]_9723_
[-1b
]_120512_
[-2a
]_180_
[+2a
]_53270_
168 [-4c
]_17749_
[-2a
]_105178_
[-1b
]_47045_
[-2a
]_86702_
[+2c
]_6448_
[-4a
]_
169 10586_
[-2c
]_30988_
[-2a
]_125990_
[-2c
]_69247_
[-4a
]_250534_
[-2b
]_143429_
170 [-2a
]_41053_
[-4b
]_167542_
[-1c
]_126920_
[-2b
]_79648_
[-2c
]_41344_
[-1a
]_
171 34611_
[-1a
]_32643_
[-2a
]_69929_
[+1c
]_20774_
[+1b
]_62113_
[+2c
]_23189_
172 [-4b
]_9299_
[-4a
]_39496_
[+1b
]_43277_
[-2a
]_116690_
[+4c
]_6861_
[+4c
]_
173 71133_
[+2c
]_143200_
[-2a
]_382714_
[+1b
]_15009_
[+3b
]_167995_
[-3c
]_
174 11445_
[+3c
]_85905_
[-2c
]_116003_
[+2b
]_62888_
[-3a
]_64899_
[+2a
]_49005_
175 [+2a
]_56736_
[+3a
]_14883_
[+2a
]_6123_
[-2a
]_24729_
[-2a
]_75491_
[-2c
]_
176 33025_
[+2a
]_223953_
[+2a
]_3536_
[+2c
]_57658_
[+1a
]_321010_
[-2b
]_99474_
177 [+4b
]_14568_
[+4b
]_14260_
[-2c
]_151646_
[-4b
]_91790_
[-2a
]_60756
182 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
184 ..T..D..T..Q..T..V..N..L..
*..I..P..R..A..Q..F
185 170137 CAGAAAAATCGAAGACGAGTATAAAATTGTGTCAGTCTGAGTAACATTCAGCTAAATAGGTCTAGCTTGAAA
189 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..
191 N..
*..L..I..T..L..K..S..I..L..
192 215713 TGTGTGAAAGGATATGGCCTATGGCATCAATAGGACTGAATCAACTAGCTAATCACATTAAAAAGTATTCTA
199 215785 AATTAAACAGTACACAACACTGACAAATGCAAGCGAATTTATAGAATGTGTGAGCACTGAGCAGGATGTATA
203 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
205 V..H..K..K..V..V..K..C..W..F..S..N..R..N..N..
206 532513 AATCCTATTTATCGCATGTCCACAAAAAAGTTGTAAAATGTTGGTTTAGTAATAGAAACAACAAAGCTCTTT
213 539425 TTTATTTTCTTTCAACTTGAGACGCTAATAGGAACACCGAGTGCTTATTGAAGAAACGTTCGAGTATGTATG
217 S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
219 T..I..K..T..S..S..F..N..S..I..A..T..Y..S
220 539497 TTATTTTAGTTGATGAGAAATTACTGATTGCAGTATATGACCTACTTCACATGTTATGCACCTATTATGTCA
224 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R
226 R..K..K..K..V..V..R..R..D..F..C..G..R..E
227 586081 ACACACAAAGATATACGTCATAATCGTGAGAACGTAAGAAAAAGGTAGTAAGACGCGATTTCTGTGGTCGCG
234 586153 AACGTTTAGTTTCTATTCCATTTTGGCAGAAGTTTAGAATTGTGATCTTACTAAGTATAACGGCAATCTTGT
241 698185 AGACGGAATGTCTCAGAATGCATCTTCGCACTAGTGCATACTTTTATATATATATATAGAGTTAGTCAGTTT
245 ..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
247 ..Q..L..I..V..M..L..K..I..A..Q..K
248 698257 TTGTAGTATCACCATCAGCTTTATGGCTTGTTTTTATTGTATGTACATTATACATGATATTTTATTGTAATG
252 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
254 ..L..N..T..Q..K..V..G..
*..K..G..R..R..L..K..G
255 804385 AATAAAATTATTAAATTACAACAAAAATAAATTTGTTTGTTTTACACCTCACTTACCTCTGCGTAACTTTCC
262 858817 CAACACACCTAAAAAAGTTATTTCTAGACATCTAGTGGTTTGTATAACCTATGTACCTGTCCTACAGTATAT
266 .G..L..K..I..R..R..Q..K..F
268 .G..S..T..L..R..Y..L..
*..F
269 858889 CCACTGGTAAGCCTGTATAACTAAAATAGAATGCGGAACAATTTTCATGGATGTACTTACTACATAGCTACC
273 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
275 ..Y..N..P..Q..Q..Y..G..F..T..I..R..K..R..H..F
276 861553 GTAAGGGTATAGTTTGGTTGCTGATAGCCGAAAGTAATTCTTTTGCGGTGGAAGTCGTAGTTTAGAAGCAAC
280 ..F..S..L..Q..L..A..E..
282 ..L..S..L..D..L..A..E..
283 916849 ATTCCCATTGGCAGGAGCCAAGTATATCGAGTGTGTCGAGTTTAGATGATAAACTAAGGTCAAGTGCTTCTG
287 F..R..C..I..T..T..Q..S
289 A..S..S..S..N..T..R..S
290 916921 CTGAAGAAGAATTAGTGCGTGATGTGTTATATTCTACAAGGCAAAATATCAACATTGTCCATGAGATGTTTC
294 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
296 ..P..S..I..K..R..T..E..F..S..P..I..
*..T..R..S
297 1146889 CTTAATGAGCTTTGAATGACCGAAACTAGGAGATATTTTGCGGGTTTCGAAACTCGGAATTCACGTGCGTGA
301 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A.
303 S..F..T..S..I..V..R..F..T..N.
304 1315729 GAACGATTAAACTAGATAAACAACAGCTGACGTGAAATTCTGTTCTTTCACTTCGATCGTAAGATTCACTAA
311 1315801 CTATGACGCAACTTTCTTCTTCGGTTTTGATTGGCTTGATTTCATGAAACGGAAATTACATCAAAAAATGGC
318 1636057 TTGATGTGGCTTTTTAGGAAGAAGCAAAGCAGTTGGAGCAGCTGGAACTTTTCGCGAAGGATTTCAAGCAGA
322 ..R..I..K..L..G..F..T..Q..A..D..V.. S
323 + + + + + + + + + + +
324 ..R..I..K..M..G..F..T..Q..G..D..V.. S
325 1636129 AGCGAATTAAGATGGGGTTTACTCAGGGTGATGTTGGACAAGCAATGGGTTGTCTGTATGGCAATGATTTCA
329 ..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
330 + + + + + + + + + + + + +
331 ..Q..T..T..I..S..R..F..E..A..L..N..L..R..F..
332 1636201 GTCAAACCACCATTTCAAGATTTGAAGCACTGAACTTGAGGTTTGTTTGTTCAGTTGGAGTCTTAGTTTTGT
336 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
337 + + + + + + + + + + + + +
338 K..N..M..I..K..L..K..P..M..L..E..R..W..L..L..
339 1636417 ATTGATCATTACACAGCTTTAAAAATATGATCAAGCTGAAGCCCATGCTAGAAAGATGGTTGCTGGATGCTA
343 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
344 + + + + + + + + + + + + + + +
345 M..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
346 1637353 AATGTAAAATGGAGAAGGAGGTAGTTCGTGTTTGGTTTTGCAACCGACGGCAAAAGCAAAAGAGAATATCGC
350 K..N..M..C..K..L..K..P..L.
352 N..S..A..
*..K..I..I..C..L.
353 1652401 TATAAATGGCACATTTTAAAAGTTAACAGATTATCATAAAAAATAGAATTCTGCTTGAAAAATAATATGTTT
360 1652473 GACATCAAAGTGGGTTGAGTTTTTAGGCACACTTTTGTTTGTATTAGAGGATTAACTTAATGATATTTAAAC
367 1665001 CAATTCGCCCCGCACCCTATATATAAATATAACGCATTAACTTACGTGCATGAAATAAATTTCTTATGCTAT
371 E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
373 *..R..L..V..I..A..V..C..F..F..N..R..A..V..
374 1665073 TGAAGGCTCGTTATAGCAGTATGTTTTTTCAATCGAGCTGTGGCGGTTTTCGACAAAACTATATATACTGCA
378 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
380 ..N..S..S..N..Y..F..W..V..R..V..V..E..M..F..R
381 1680193 AAAGAACATTCGAAGAATTATAAAACCATACCCTCACGACTTCCATAAACCGTTGTTTATTGTTTAAAACTT
385 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E
387 ..N..S..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..E..M..F
388 1714681 TCACGTTCCATTTGGTAGTAAACAAAGAACATTCGAAGAATTATAAAACCATATCCTCACGACTTCCATAAA
395 1714753 CCGTTGTTTATTGTTTAAAACTTGATTAGGATATTTGAATATTAGGTTTCCCATCTTCCCCCACAGTACTAT
399 ..V..D..A..Q..T..F..G..L.
401 ..I..D..R..Q..T..V..N..L.
402 1718281 GATGACCTTGAAAATGAAACCTTGACGTGACAGATTTATTCTTATTGTATGTCTCGTTGTGTAACATTAAGT
409 1718353 TTTATTTATTTAACCCTAATTTTAGCATTGTTGTACTCAAGGATTTTTACATTTTATTATTACTTAGTTGCG
413 ..E..L..W..K..Q..L..L..P
415 ..R..V..R..K..S..L..V..P
416 1825057 AGACGTACAATGGGAAGCTTATAGAAACATTTAATTGGATGACCGTGTTCTCACACGTTTGCTTAAGACGGG
420 ..K..L..K..C..M..N..K
422 ..D..L..T..V..M..R..N
423 1825129 ATCTAAGGTTACCATTCTATTCGAACGAAATTATTTATCAATTGAATCAGCCCTCGGAACTAAACAAACTGA
427 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T
429 ..S..S..L..N..Q..K..E..F..L..C..I..N..S
430 1926001 ACACTGCGTGTATGTCAAACAGATCTAAGTTTATGAACTCAAATTTTGTTTTTCAAATAGGCAAATATTTGA
437 1926073 TAACCAAAATTTCTCTTTTTAGGGTGGCAAAGGAGAGAAAGACAAAGGAAAAAAGAAGATTGGTGGAAGAGA
444 2076841 TTGAGCACAACATAATATTAAATTATCCTGATTGTGCTTAAACCATTAATAACGGTCTATGGGAGTCGTGAG
448 .V..W..F..C..N..R..R..Q..
450 .I..W..F..Y..N..S..L..N..
451 2076913 AATATGGTTTTATAATTCATTAAATGTTTTTTGTTTACTACCAAATGGGACGAAAAAATAGGATGAAAAGGT
455 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
457 ..F..L..S..N..Y..F..
*..V..R..V..V..G..M..S..L
458 2127313 TTAGTAGTATACAAAGAACAAACAAAGAATTATAAAACTATACCCTCACTACTCCCATAGACAGTAGTTAAT
462 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q.
464 F..F..T..F..I..S..C..F..T..S..L..T.
465 2130049 TACAGCTTCAACTTTGATCTCCGGTTGATTTTCTTCTTTTTTCACCTTTATCTCTTGTTTTACTTCTTTAAC
472 2130121 TTTATCTTTGGTTTGTTCATTTTCCACTTTTTTGGCAGTTTCTATATCAGGTTTACTTGTTTGTTGTTCTTC
476 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E.
478 ..T..L..R..N..K..K..W..N..R..V..L..V.
479 2210833 AGAAGAGCGCAAGAAATTGCAAGATCTCAAACTAAAGTAAGCCGATTTTTTTTCCAATTCCGTACTAGAACC
486 2210905 TTCTTGTAGATATAGCTATTGCTGTCGAAATATGTACAAAACTCTTATTTAAACGGTACATTTTCCAGCAGA
493 2220841 ATTATGTTTCTTTCCCTTTAAACTTCTTCAATATACAGTGTACGATACGCACGAATGACACAATAACACTGC
497 ..P..L..L..Q..K..W..L..E..
499 ..L..L..L..A..H..W..S..K..
500 2220913 GACTATTATTGGCTCACTGGTCAAAATATTTTAGAATCTAAAACTTACATACAGAAACAATACAATAGCAGC
504 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
506 R..S..K..E..V..V..R..I..R..F..C..N..S..L..Y..
507 2355193 ACAACGGTCTAAGGAAGTCGTGAGGATACGATTTTGTAATTCTTTGTATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGG
511 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R.
513 L..K..G..E..V..L..S..V..W..F..A..R..S..I.
514 2360953 ACCAAAACCGCAAGCGGAATTCGCCTTCGGCTTGAAAGGGGAGGTTTTGTCGGTTTGGTTCGCAAGATCTAT
521 2361025 TAGCGCGCTTTTAGGCTTTAGTTAATTCGATCAGCAGTTTTAATAAAATAAGCCCATTGCGAATTATACGCC
525 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
527 ..H..T..Q..E..L..S..N..F..V..C..I..A..S..S..A
528 2370745 CAACGTCGTGTGTTTGCTCAAGGGAATTGAATACGCATATCGCAGACGAAGCTAAACAATGTCTGCCCTATA
532 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E
534 ..N..S..S..N..Y..F..W..V..R..V..V..
*
535 2491273 CTATTTTTTCGCTCCATTTGGTAGTAAACAGAGAGCATTCGAAGAATTATAAAACCATACTCTCACGACTCA
542 2491345 TCCCACAGACCGTTGTTAATTGTTTAAAACACAATCAGGATATTTCAACACTATGTGCTATAAAGGCGTCTC
546 L..E..K..E..V..V..R..V..W..
548 S..V..G..
*..V..V..R..V..W..
549 2491489 ATAGTGTTGAAATATCCTGATTGTGTTTTAAACAATTAACAACGGTCTGTGGGATGAGTCGTGAGAGTATGG
556 2491561 TTTTATAATTCTTCGAATGCTCTCTGTTTACTACCAAATGGAGCGAAAAAATAGAATAAAGGGGTGTCCGAT
560 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
562 ..E..M..K..K..
*..L..I..S..V..I..K..N..M..N..
*
563 2544841 AATTGCAATTCCATCTTCTTTTACAAAATTGACACGATTTTGTTCATGTTTTAGACATGAAAACTTTAATAT
567 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
569 ..N..S..I..S..I..F..W..V..Y..V..V..K..D..K..L
570 2562625 ACAGCTATACAAAAGATGGTTGCTTATTGATATAAACCATACATAAACAACTTTGTCTTTCAAATTAAAGCG
574 ..F..S..L..Q..L..A..E..
576 ..Y..S..T..Q..L..C..E..
577 2667817 ACTTCAAATGTGGGCGATTTATTGCCTGTTTAGTCTTGTGTTGGATAACATACGAAGTCTGCAAGCACTCAA
581 F..R..C..I..T..T..Q..S
583 F..R..H..F..C..T..M..N
584 2667889 AGCGATGGAAACAAGTCATATTTTCATGGCAGTGGAAAATAACTGGTCTGGCTTTCGCCATAACTACGCTGA
588 ..Q..R..R..N..C..F..W
590 ..L..S..S..N..C..F..G
591 2714905 CACCTTTTTCTTTTAATTTCTAGTCACATTTAGAAGTAAACAGAGAACATTCAATGAAGAATTACAAAACCC
595 ..V..R..V..V..E..K..E..L
597 ..I..R..V..V..G..M..P..L
598 2714977 TATCCTCACGACTCCCATAGGCAGTTGTTAATTGTTTAAAACACGATCAGGATATTTCGATATTATGTGTTA
602 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N
604 R..S..M..E..V..V..R..V..R..F..Y..N
605 2801665 TATTCAAATATCATGATCGTGTTTTAATCAATTACCAACGGTCTATGGAAGTCGTAAGGGTTCGGTTTTATA
612 2801737 ATTCTTTGAACGTTTTTTGTTTACTAGCAAATGGGACGAGAAAATGTAACGAAAATGTGTCCCATCTTTACT
616 ..E..L..W..K..Q..L..L
618 ..L..S..W..L..S..L..V
619 2808145 GAAGATCAAATGCGAACTGCTTTGCTTTATGGTGAAATCTACAACGCTTGTTAAACTCCACAAACTTAACAC
623 ..P..K..L..K..C..M..N..K
625 ..P..K..L..S..S..A..L..K
626 2808217 CGGCTTGAGCGAGCTTGCTAACTTTGGTGCCGCAGTTGTAATAGTCTCGATGTGACGGGCGCCACGGCTGCA
630 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
632 ..N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..G..L..S..R
633 2818801 CCAATTTGTTCGTGAACAAAAAAAACATTCAAAGAATTATAAAACCATATTCTCACAACTCCCAAAGACCGT
637 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
639 ..N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..E..M..Y..F
640 2849833 CATGTTATTTGGTAGTAAACAAAGAACATTCAAAGAATTATAAAACCATATCCTCACGACTTCCATATAGAA
647 2975833 TCCAGCACAACACACATGCCCAGGACAAGTTATTCACCAGAATTGCTGATAGTTACATTGCTCTCTTCTTTA
651 .N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
653 .T..C..M..W..V..Y..S..V..F..K..E..L
654 2975905 GTGCACATCCAGACATAAGAGACAAATTTTTCAAGGTAAATTTTTGGCTTGAAACTGTCAAATAAAAGTACA
658 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
660 ..V..V..W..K..R..L..I..A..R..T..S..C..C..E..N
661 3045169 TTCTATTCTTACACAACCTACCACCCATTTTCTTAATATAGCCCGAGTAGAACAACATTCGTTCTGTTGTTG
665 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..
667 ..N..S..Y..N..Y..F..W..I..R..V..L..
668 3295729 TTCCTTTTCTTGTCCCAATGGGTAGTAAACAAAGAGCATTCGAATAATTATAAAACCATATCCTCACGAGTC
675 3295801 CCATATACAGTTGTTAATTGTTTATATCATGATCAGCATATTTGGATATTATGTACTAAAGGTGTCCCATCT
679 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
681 ..C..G..
*..C..C..F..W..V..R..V..C..Q..S..D..Y
682 3439225 TTGTTTTAGCCAAAAACAACCTTAACAACAAAACCATACCCTAACACACTGTGAATCATACATAATAATGCA
686 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
688 ..K..L..W..L..Q..G..V..A..G..V..T..C..M..S..N
689 3480337 TTTTAAGCCACAGTTGACCTACTGCCCCCACTGTACACATGCTATTTATGGCGGATAGTTATTTGAGCCATT
693 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R.
695 ..H..T..N..L..L..K..A..F..G.
696 3647881 CGCCACCGTTAGATTCCGATCTATATACCTAGGATTTGCCATAAATGTGTGTTTAGAAGTTTCGCGAAACCG
703 3647953 CAAATCGTGTGTGTAGATGCGTATCCCAATCCCCTGCTCTTTATCTCAAGATCCAGCGCTCGCTTGTCAATC
707 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
709 ..N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..E..M..F..R
710 3774889 CATTTAAAGAATTATAAAACCATATCCTTACGACTTCCATAAACCGTTGTTTATTGTTTAAAACTTGATCAG
717 3854521 GGGAGAAGATGGGACACATTTTCATTCCATTTTCTTTGTACGTTTTGTTGTAAACAAAAGACATTCAAAGAA
721 .N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
723 .N..Y..F..Q..I..R..V..V..E..R..S..R
724 3854593 TTATAAAACTGTATCCTCACGACTTCCCTAGACCGTTGTTAATTGTTTAGAAACCAATCAGGAAGTTTAAAT
728 ..F..S..L..Q..L..A..E
730 ..S..S..I..K..L..D..E
731 3895921 TACGGTATGGCTGACAACTTAAACAATCCATATGGAAGGCTACTGTGTTGGAGAACTTATTTTTAAGTCTTC
735 ..F..R..C..I..T..T..Q..S
737 ..F..R..T..I..C..I..
*..S
738 3895993 AAATCTTGTAATGCAGATCTACGACACCGAACTTGAGAATGCGAACGAGTTTTCAGGTTTTAACGACCTTTT
742 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
744 ..V..S..L..N..L..N..G..F..R..C..V..T..N..
*..
*
745 3930625 ACGAACCGATAAGTTCAAGTTTCCGAAACGACAAACGGTATTTTATCAACAATAGATAAACGACTAAAAACA
749 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
751 ..I..L..A..N..C..F..N..G..S..Y..V..Q..K..E..L
752 3963313 ACTGATTAATGCATTGCAGAAATTTCCAGAGTATACCTGTTTCTCTAAAATGAGGACTTGTGATTGTCATAA
759 4033225 AAACCCAAAAAGAAATGCACTTGTAGTACTGTGGGGTAAGATGGATGTCGATATAGCACATTTTATCCCATT
763 ..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
765 ..S..
*..S..R..F..N..N..
*..Q..L..S..F..
766 4033297 CTTCATAATCGCGTTTTAACAATTAACAACTCTCTTTTACAATCGTGAGGTAACGGTTATATAATTCTGTAA
770 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
772 S..H..S..S..
*..S..R..F..N..N..
*..Q..L..S..F..
773 4054105 TTTATCCCATTCTTCATAATCGCGTTTTAACAATTAACAACTCTCTTTTACAATCGTGAGGTAACGGTTATA
777 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
779 L..Y..R..S..L..V..K..I..W..F..Y..N..S..L..V..
780 4116241 TTATGTTTTAAACAATTAACAACGGTCTATATAGGAGTCTCGTGAAAATATGGTTTTATAATTCTTTGGTTG
784 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
786 ..L..L..G..L..S..L..V..L..K..L..K..I..A..T..K
787 4139497 TGGACAATAATCCCAGACTGAGGACTAACTTCAATTTGATTGCGGTTTTCATCTTTCTAATAAGAACAAAGA
794 4148785 TTTGGTTATTAGGAGAATGAAGGTATAATAAAAATAGTATTCAAAACTAAAAAAATGATATTCACGCCATGC
798 ..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
800 ..
*..L..
*..A..Q..
*..K..N..I..N..K
801 4148857 TTATAACTATGCTTGTCATTTATTGATGTTTTTTATTTGTATTAGGTAAATGAACAAAATCCTCAAGTGTTT
805 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
807 S..
*..P..G..I..S..T..F..Q..
*..L..D..I..S..H..
808 4188385 ATCCTGACCTGGAATCTCAACTTTTCAATAACTTGACATCAGCCATACAATTACTACAAGGTAAGATAATGT
812 ..Q..R..R..N..C..F..W
814 ..H..L..F..N..C..F..W
815 4231657 GGACATCATTTCATTTTATTTACTCGTCTCACTTGGTAGTAAAAAAAGAAAATGCAAAAAATTACAAAACCA
819 ..V..R..V..V..E..K..E..L
821 ..I..R..V..V..G..T..S..R
822 4231729 TATCCTCACAACTCCCGTAGACCGTTGTTAATTGTTCAAATCACAATCAAGATGTTTGGAGATTATGAGCTA
826 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
828 N..L..L..K..K..I..K..P..I..L..Q..K..F..V..H..
829 4348441 AAAACCTTCTTAAAAAGATCAAACCAATCTTGCAGAAGTTTGTCCACGATGACACCAACTTACAACTACATG
836 4355281 TAAATTTTGAACGTATATATACTGTGTTTTGTAAATTTTGAACATATTCAGTTTTTAAACATCTACAAAATT
840 ..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
842 ..Q..N..A..I..K..P..I..L..I..K..Y..
*..L..
843 4355353 CCCAAAATGCAATTAAACCCATACTTATAAAATATTAATTACAAGTCGCATTAATTAATTTGGCAAATACAC
847 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N
849 R..S..M..G..V..V..R..V..W..F..Y..N
850 4426489 AATCCAAATATTCTGATCATGTTTTAAACAATTCACAACGGTCTATGGGAGTTGTAAGGGTATGGTTTTATA
857 4426561 ATACTTTGAATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGGGACAAAAATAATTAAAGGGTGTCCCATCTTTCCCTACC
861 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
863 ..M..R..
*..V..Y..F..F..I..S..V..V..S..R..K..L
864 4569769 TCCCATTCGCTAAACATAAAAGAAAATTGAAACTACGCTGCGTTTTAATAGTGTATATACGGCCATAGATAC
868 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
870 S..L..T..S..L..S..P..F..E..L..G..T..I..S..L..
871 4952521 TAGCGATCAAAGTTTGACGAGCCTCTCTCCTTTTGAACTTGGCACAATTTCTCTTACTTGTTGGTTTAATAT
875 F..K..Q..R..R..I..K..L..G..F..T..Q..A..D..V..
877 E..R..I..R..N..C..K..L..S..K..T..Q..G..N..V..
878 4967569 GGAAATTGTGGTTTCTGAAAGGATAAGAAACTGCAAATTATCTAAAACTCAGGGAAACGTTTAAAATCATGT
882 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
884 ..V..S..A..T..T..V..G..I..I..I..N..R..R..R..F
885 5135617 CAGATGGTTACAGAAGCAGTGGTAACACCAATGATAATGTTGCGCCTTCTAAACAGAGCAAAGAATCTTGTA
889 F..K..Q..R..R..I..K..L
891 F..I..Q..C..R..E..S..L
892 5147065 ACTTAATTGCCCCCCAAAAAATAATTAATTACATTTTCCGAAATGGTTGCTTTATACAGTGTAGAGAAAGTC
896 ..G..F..T..Q..A..D..V..
898 ..G..L..S..L..A..Y..V..
899 5147137 TTGGCCTAAGTTTAGCTTATGTGTCACAATTTGACATTACAATTATCATTATAATACAATTTAAATAGTTTG
903 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K.
905 ..F..R..I..N..Y..F..F..V..Q..V..C..Q..K.
906 5233033 ATTATATGATGCAAAAATTATATGATGCTTAAAAACCTAATGTTGTAGAAAAATACCTGAACACATTGTTTT
913 5233105 CTATAGAGTTTGTGAGTTCAGTAAGACTGAGTGCTTTTGCGCATGATTTGACTACAAATTTCACGGCTTCAA
917 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
919 L..F..K..E..V..V..R..P..L..F..D..N..L..I..I..
920 5349097 GGAACCTGTAAGACCTTTGTTTAAGGAAGTTGTAAGACCTTTGTTTGATAACTTAATAATAGTTGTCACATG
924 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
926 ..R..N..T..Q..W..F..S..L..S..I..R..R..L..K..G
927 5412025 TATGCTTTGCTAAATCAACTGTCTGTTTGTTTGCCAAAACGACAAACTAATGCGGCGCAATTTACCCTGCGA
931 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
933 L..Q..R..N..V..C..S..V..S..R..
*..N..R..T..Q..
934 5476969 TTTATATCAACTTGTATTTTTTTACAAAGAAATGTGTGTTCTGTAAGTCGTTAAAACCGAACACAAAACGTG
938 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..
940 Q..S..M..E..V..V..R..I..Q..F..C..
941 5526001 GACACTATCTTGATCGTTGTTTTTAAAAACAATTAGCATCAGTCTATGGAAGTTGTAAGGATACAGTTTTGC
948 5526073 AATTCTTTGAATGTCTTTGTTTACCACCAAATACGACGAGAAAATAGAATGAAAAGGTGTCCTATCTTTCCC
952 F..K..Q..R..R..I..K..L..G..F..T..Q..A..D..V..
954 L..K..E..S..R..N..K..R..G..V..T..F..T..T..V..
955 5582809 AGGAAGTACTCGCTAAAAGAGTCGCGAAATAAACGTGGTGTCACATTTACTACCGTTGCGCGGGTGGTAAAG
959 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..
961 L..S..M..G..V..V..R..I..W..F..Y..N..
962 5597713 TACAAATATCCTGATCTTGTTTTAAACAGTTAACAACTGTCTATGGGAGTCGTGAGGATATGGTTTTATAAT
969 5597785 TCTTTAAATGTTCTTTATTTACTACCAAGTGGGACAAGAAAATAGAACTAAAAGGTGTCCCATCTTCTCGCA
973 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
975 ..Y..K..K..N..C..F..S..V..S..V..K..D..K..T..S
976 5603905 AGTATAATTTCTATACTTTTTATTGCAGAAAGAAACAGAAACTTTATCTTTTGTTGAAAAACTTCTGACACA
980 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
982 ..I..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..G..I..S..R
983 5628673 TTTTAGTAAACAAAGAACAATCAAAGAATTATAAAACCATATCCTCACGACTCCTATAGACCTTTGTTGATT
987 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
989 ..P..Y..R..T..A..F..W..L..R..V..K..G..K..E..R
990 5704201 GTTCCAGTCTATTATGGTGTGGTGTATGGATAGCGAGTAGCGAACCAGAGTCTCACTTTCCCTTTTTCTCGC
994 L..E..K..E..V..V..R..V..
996 Y..Q..V..N..V..K..R..I..
997 5737249 CGACAAGAGAATGTTCGGAACTTGTGGTTGAGGCCACTTACAAGACGATACCAAGTTAATGTGAAACGAATT
1001 W..F..C..N..R..R..Q..
1003 R..F..R..N..R..A..Q..
1004 5737321 CGTTTTCGAAACCGAGCACAGAACTTTACTAATGACCAAACACAGGTTAATACAGTTTAAATATTTCGTTTT
1011 5961241 NNCCTTTAACAGATAGTTTTCAAATAGCCTGATCGTGTTTTAAAGAATTAACAACGGTTTGTGGAAGTCGTA
1015 R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1017 R..I..W..F..H..N..S..L..D..
1018 5961313 AGGATATGGTTTCATAATTCTTTGGATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGGAAAGAGAAAACTAAATGAAAAG
1022 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R
1024 R..S..V..E..V..V..R..I..W..F..H..N..S
1025 5964841 CCAAATAGCCTGATCGTGTTTTAAAGAATTAACAACGGTCTGTGGAAGTCGTAAGGATATGGTTTCATAACT
1032 5964913 CTTTGGATGTTCTTTGTTTACTTCCAAATGGAAAGAGAAAACAAAATGAAAAGGTGTCCCATCTTCCCCCAT
1039 6022513 ATCCAAAATAACACTTTTGCAAATTGAAAGAACTTTTTTTTTCAAATTTAAACATTTTTAAAATTGCACCTT
1043 T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1045 F..
*..I..C..T..F..L..S..L..N..L..S..F..
1046 6022585 TTTTAAATTTGCACCTTTTTAAGTTTAAACCTGTCTTTTAATGCTGGCTATTTTTAGTCACCACTGTGGCCT
1050 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1052 ..N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..G..L..S..Q
1053 6343633 CATTCAAAGAATTATAAAACCATATCCTTACGACTCCCAAAGACTGTTGTTAATTGTTTAAAACATGATCAG
1057 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
1059 N..N..A..C..K..Y..S..L..F..T..N..K..W..V..E..
1060 6443137 TCGTGTTTCAACAATTAACAACGCTTGTAAATATTCTTTGTTTACTAATAAATGGGTCGAATAAAAAATTGG
1064 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
1066 N..S..A..V..K..I..V..K..I..L..N..M..K..L..E..
1067 6457753 CTCGCGACTCTGAAATAGCGCTGTTAAAATTGTTAAAATCTTGAATATGAAACTCGAGTATTATCTGTAACC
1074 6472009 GAGTGGGTTAAAGATGCGACGAAGTCACATTCATTCTATTTTCTTGTCCAATTTGGTAGTAAACAAAGAACA
1078 .N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1080 .N..F..F..Q..V..R..V..V..G..K..S..W
1081 6472081 TTAAAAAACTGTACCCTCACGACTCCCTTAGACCATTGTTAATTGTTTAAACACAATCAGGATATTTTGGAT
1085 ..E..L..W..K..Q..L..L..
1087 ..K..L..E..R..H..L..L..
1088 6623713 GGAGCAGAATAATGCTTTGATTGTGAAAGAAATGACTTTCCAGGTCGCTTTTTAGTTCTCGGTGTAAAAGGT
1092 P..K..L..K..C..M..N..K
1094 N..R..L..K..I..S..D..K
1095 6623785 TTCTCAGTTTTATTGAATCTTTCTTCATGTCTTTCCAGATAATCCCCGTTATAAGTTACATCCATAACTTGT
1099 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1101 ..L..
*..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..K..K..S..R
1102 6715585 TTAGTAAACGAAAAGCTAAGAATTATAAAACCATATCCTCACGACTTTCTTAGACCGTTTAATAATTGTTTA
1107 LENGTH
= 8059593 COMBINED P
-VALUE
= 2.06e-23 E
-VALUE
= 9.1e-20
1108 DIAGRAM
: 181586_
[+1c
]_84138_
[-3c
]_15167_
[-2b
]_135571_
[-4c
]_325471_
[+4a
]_
1109 12798_
[-4a
]_4700_
[-2c
]_182142_
[-1c
]_7912_
[-1a
]_80644_
[-2b
]_143591_
1110 [-2a
]_5286_
[-1a
]_17554_
[-4b
]_104512_
[+2c
]_75992_
[-2b
]_1994_
[+2a
]_
1111 7759_
[-2b
]_11678_
[+4a
]_544_
[+2b
]_15348_
[+2b
]_53558_
[+2a
]_756_
[-2a
]_
1112 132170_
[-3c
]_6820_
[+1a
]_226852_
[+2b
]_107962_
[+1c
]_5949_
[-2c
]_138458_
1113 [-4b
]_133762_
[+1c
]_126753_
[-2c
]_69234_
[+1c
]_33_
[+1c
]_72_
[+1c
]_150_
1114 [+1c
]_33_
[+1c
]_72_
[+1c
]_267_
[+1c
]_33_
[+1c
]_15489_
[-1c
]_21704_
[+1b
]_
1115 72_
[+1b
]_346_
[+1c
]_96059_
[-4b
]_36498_
[-2b
]_335_
[-4a
]_
[-1a
]_155_
1116 [-3c
]_18189_
[-1c
]_174870_
[-2c
]_38785_
[+1a
]_40123_
[+2b
]_147684_
[-1b
]_
1117 122397_
[+2b
]_45479_
[+4a
]_74846_
[+1c
]_23231_
[+3b
]_38245_
[-4c
]_152196_
1118 [-2c
]_304660_
[+2a
]_165655_
[-4b
]_38440_
[-4c
]_21816_
[+1c
]_25500_
[-2c
]_
1119 336004_
[+3a
]_323232_
[-4a
]_7268_
[+2c
]_47044_
[+4a
]_41451_
[-2a
]_66303_
1120 [+2a
]_30342_
[+1a
]_40657_
[-4b
]_180301_
[-2c
]_35205_
[-2c
]_59610_
[-2c
]_
1121 2222_
[+1b
]_1400_
[-2a
]_53171_
[-2c
]_175866_
[-2c
]_162426_
[-2c
]_70915_
1122 [+2a
]_33010_
[-1b
]_139023_
[+1b
]_248403_
[-2b
]_102258_
[+2b
]_13294_
1123 [-4c
]_85097_
[+2b
]_13395_
[-4b
]_217923_
[-2b
]_252830_
[-2a
]_40346_
[-3c
]_
1124 9779_
[+1b
]_15798_
[-1b
]_16835_
[+1a
]_31854_
[-2a
]_3867_
[+2a
]_28000_
1125 [+1b
]_14934_
[+2b
]_18632_
[+4a
]_54520_
[+2b
]_53902_
[+1c
]_198948_
[-2c
]_
1126 10079_
[+1b
]_162971_
[-2a
]_106411_
[+2b
]_74994_
[-4b
]_11202_
[-4b
]_165552_
1127 [+2b
]_7010_
[-2a
]_12481_
[-2b
]_23349_
[+1b
]_102412_
[+2c
]_100606_
[-4a
]_
1133 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1135 S..S..P..S..L..S..R..N..E..S..L..R..I..T..F..
1136 181585 CATCAAGTCCGTCATTATCGAGAAACGAATCGTTGAGAATTACCTTCTTCTCTTCTTCTCTCAAGCGAGTTT
1140 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
1142 ..V..L..S..Q..T..V..G..L..L..I..N..V..F..K..L
1143 265753 AGCCAAATAAAACACAGGACCAAACTCTGGGTAACACCTAAAAGTATGTTAACAAACTTCAAGGGGAAATTG
1147 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..
1149 ..Y..
*..N..N..Y..F..W..Q..
*..I..F..
1150 280945 AAAAAAACATGACATATACAGTGTGTTAAGGCTGGTAATACTAGTTGTTGTAAAACCATTGCTAAATAAACT
1157 281017 CTTTCATTAAAACTAGAACTAAAATAATGTGACAGAAAATATACTTACTGCATTGATAATATATGATGAATA
1161 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
1163 ..N..L..W..S..Q..L..V..P..K..G..I..A..E..S..N
1164 416593 ATGGAATTTAGCCAAGATTGCAGAACAGGTTTGCCTATTGCTTCAGAATTATGATTGTTACGCCTAGATGAA
1168 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
1170 N..S..F..Y..K..L..V..
*..L..L..I..S..W..L..
*..
1171 742105 TGGCAAAGTAACAGTTTTTATAAATTAGTTTAGCTTCTTATATCTTGGCTATAAACTTAAAAATTCATTATA
1175 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C
1177 ..I..G..Q..K..F..L..
*..P..K..I..K..V
1178 754921 TTCACTGTGAGTTAACCAAAAACTCCAGACATGCAGTATACCTTGTTTAAATAGTTACGGCTTTATTTTGAC
1185 754993 AGCATTGTTTTATCGTTAAACCCATATGTTTGCCAACAAATTACTTTTATTTGTTTAACTTTTTGCACTTTT
1189 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E.
1191 ..Q..W..V..N..G..F..D..F..Y..I..V..N..K..Q.
1192 759673 TGGGGGAAGATGGGACACTTAAACATATATTGCCAAACATTTCCAAAATCAAAATAGATGACGTTTTTTTGG
1199 759745 TAATACCACGAAGTAGTACTACTATTCCTTTATTAATTGACAACGATTTAATAATATAAATATAATAAAACA
1206 941833 TATGTTTAATATTCAAAATTGATTAGCAACAAGTTAGGGTATCTGTTTGCGATTTTGAGGCTTAAAGAATAT
1210 .A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
1212 .K..E..F..R..N..I..S..K..H..T
1213 941905 TTTTCAAATCTATTTATTGATTTGTGTGTTTGAGGGAAATATTAGTTCTCTGTTTTGAATTAAAATATATTA
1217 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
1219 ..L..S..L..S..Y..K..E..F..R..N..I..S..K..H..T
1220 949825 AGGGTATCCATTTGCGATTTTGAGGCTTAAAGAATATTTTTCAAATCTATTTATTGATTTGTGTGTTTGAGG
1227 1030465 GTATTGCATTGGTGCGATGTATAGTAGAGTGGGGGAATTTTCTCGACTCATTTGATAGTAAATATAAAACAT
1231 Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1233 N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..E..M..S..R
1234 1030537 TCAAAGAATTATAAAACCATATCCTCACGACTTCCATAGACCGTTGGTAAATATTTAAAACACGATCAGAGT
1241 1174105 TTGGTGGGGGAAGATGGGACACCTTTTTATTCTATTTTCTTGTGTCATTCGGTAGTAAACAAAGAACACTCA
1245 ..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1247 ..F..N..Y..F..R..V..R..V..V..G..A..T..L
1248 1174177 AAAATTATAAAACCGTACCCTCACGACTCCCGCCGTTAGTAGTTGTTAAAAACAAGATCAAGATGTTTGGAC
1255 1179433 TATCAATTTATTATACAATCATATACTGTGGGTAACATGTTAAAAACCATAGCAGTAGGGCAGGACAAAAAA
1259 ..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
1261 ..T..L..I..L..N..E..F..R..K..I..N..N..Q..
*
1262 1179505 TGTTAAAATTAGATTTTCAAACCGTTTAATATTATTTTGTTAAGTTTACGTGTATTTCTAATAATAAATTCA
1266 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..
1268 ..N..K..V..K..K..L..V..S..F..L..Y..C..M..N..
1269 1197073 TGTCGCAAATCAACCGCTTCTAATTCTAATTTTTGACTTTTTTTAACACAGAAAACAAATAACACATGTTTT
1276 1197145 TTACATTTTTCAACCTTTAAATTTGTTTTTAGGCCCAAGTTTTTCTGTAATTTACCGAAAAACATACATTTT
1280 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C
1282 R..S..M..
*..V..V..R..V..W..F..Y
1283 1301617 TAATATCCAAATATCCTGATCGTGTTTTATACAGCCACCAACGGTCTATGTGAGTCGTGAGGGTGTGGTTTT
1290 1301689 ATAATTCCTCGAATGCTCTTTGTTTACTACCAAATTGGACGAGAAAATAGAATGAAAAGATGTCCCATCTTC
1294 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..
1296 ..Q..L..I..N..
*..F..R..L..
1297 1377649 ATTATTCTATCGTTGAGTGGAGTTAGAGGGGACATTTATGCACATATTGAAGAATATTTTAAAATCTTAAAT
1304 1377721 CTATAACGCTTCGTTCGAGCATCTCTAGCTACAAAATATTTTGAATTCCTGTTAACTTTTAATGCTAAATAT
1311 1379665 TTTCGTACTGTAGGACACCTTTAGCACATAATATCGAAATATTCTGATCGTATTTTAAACAATTAACAGCAG
1315 E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1317 S..M..A..V..V..R..V..W..F..Y..N..F..L..N..
1318 1379737 TCTATGGCAGTCGTCAGGGTGTGGTTTTATAATTTTTTGAATGTTCTTTGTTTACTAATAAATAGGACGAGA
1322 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1324 ..H..L..S..N..Y..F..R..I..R..V..V..E..R..P..R
1325 1387513 CCCAATTTGGTAGTAAACAAATAAAATGCAAAGAATTATAAAAGCGTATCCTAACGACTTCCCTAGGCCGTT
1329 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
1331 N..N..A..C..C..I..K..A..I..L..G..T..F..M..I..
1332 1399249 CGGGTAAACAATAATAACGCGTGCTGTATCAAAGCTATTCTTGGAACATTCATGATCCATCTATTTCTAAGT
1336 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1338 L..E..K..N..L..V..F..I..S..F..K..
*..N..R..
*..
1339 1399825 CTGGTAAGCATATGCAAGATTCCTCTTGGAAAAAAATCTTGTGTTTATCTCATTTAAGTGAAACCGATAATG
1343 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1345 V..S..M..E..V..V..R..I..W..F..Y..N..S..S..N..
1346 1415233 AAATTAACAAGTGTCTATGGAAGTCGTGAGAATATGGTTTTATAATTCTTCGAATTTTCTTTGTTTACTACT
1350 L..E..K..E..V..V..R..V..W..
1352 L..S..M..E..V..V..R..I..L..
1353 1468801 GCACATAATTTCCAAATATCCTGATCGTCTTTTAAACAATTAAAACTGTCTATGGAAGTCGTAAGGATACTG
1360 1468873 TTTTATAATTCCTTGAATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGCAATGAAAAAGTAGAATAAAAGGGTGTCCCAT
1367 1469593 ACTTTGCATCATGTTGAGGCTCTGGTGCTTGGAAATTAACCTCTTCCACTAACAAACGCTGTTGTTCGTAAA
1371 ..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1373 ..S..V..I..
*..V..E..K..S..L
1374 1469665 ACTAACAATTCACACTTCTTTGCTTAAGCATGGGCAGGAAATGTCAGAATGTCATTTTGAGATCGCTCTCAC
1378 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
1380 ..C..K..A..T..T..A..G..L..K..I..R..K..N..K..L
1381 1601857 GTAAAACATTTCGCCGTAGTGGCACCGAGTTTAATGCGCTTGTTTTTTAACCAGAGAACATGTGGTGTAAAT
1385 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..
1387 S..R..L..T..P..S..V..F..E..K..L..H..L..S..
1388 1608697 TTAATCCGAATTAACAAGAATTTATAACTGTCTCGACTTACCCCGTCTGTTTTCGAAAAATTACACCTGTCA
1395 1608769 AGCGAACCGCTAAATAACTCGTGTGTTTTATTATATTTTTTGACCAATAGAGTTATCAACTAATAAAGGTAT
1402 1835569 AGGGAACGCGGAAGTTGGTGGGGCATGTTTTGCTTGGGAGGAGTTCCCATACAAAGATCGTAAAGGCCACAT
1406 .R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1408 .Q..V..W..F..R..N..R..R..G..
1409 1835641 TCAAGTGTGGTTTCGAAACAGACGCGGTGAAGGCGTCATTTTCTCCTGCGTATATCGTCAGGATTGTATGAA
1416 1943569 GTACGACCTGGGACCAAACCGGCCACTTCAAACCTTTAACCCTGATCATATGAGTGTAGAAAAAGCTTACGT
1420 ..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1422 ..I..C..R..S..E..A..L..W..L..T..Q..
1423 1943641 CAATCTGCAGAAGCGAGGCTCTATGGTTAACCCAGCAGATGAACCCAAACTTGGATATGCCGCACATCCCCA
1427 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1429 ..N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..G..M..S..R
1430 1949617 CAAAGAGTGTTCAAAGAATTATAAAACCATATCCTCACGACTCCCATAGACCGTTGTTAATTGTTTAAAACA
1437 2088073 CTGGTGGCTGACTCTGATGAAGACGGAACAATATCTTTTCGTGAATTTCTGGACATAATAGTTCTTTTTACA
1441 L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
1443 L..L..H..K..L..K..K..N..N..K
1444 2088145 AAAGGTGCTTCAACTTTTTGTTATTTTTTTTTCCTATTTAATTATTTTTACAATTTGTGACATATTGCAATT
1448 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1450 S..T..A..N..I..C..A..Q..E..V..L..
*..L..S..L..
1451 2221921 TATAATGGCGTCTTTCCACAGCGAACATATGCGCACAGGAGGTCTTATAATTAAGCTTAATTGAGCTTTTGT
1455 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1457 ..N..L..S..I..Y..F..W..I..R..I..V..E..V..S..L
1458 2348713 TTTGGCAGTAAACAAAGGATATTCAAAGAAATATAAAACCATATTCTTATAACTTCCACTGACAGCTGTTAG
1462 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L
1464 S..L..D..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V
1465 2417977 TAGATGCAGCATCCTCTTTTGGATTATTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAG
1469 ..S..F.. S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L
1471 ..S..L.. S..L..D..A..A..S..S..F..E..S..L
1472 2418049 TTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGGATCGTTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGC
1479 2418121 TTCCAGTTTCACTAGACGCAGCATCCTCTTTTGGATTATTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCCCCTCTG
1483 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1485 S..L..D..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V..S..L..
1486 2418193 AATCGTTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCT
1493 2418337 CATCCCCCTCTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGGATTATTTCTAGTTTCACTAG
1497 ..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F.. S
1499 ..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V..S..L.. S
1500 2418409 ATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTATACGCAGCATCCTCTTTTGGATTATTTCCAGTTT
1504 ..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1506 ..L..D..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V..S..L..
1507 2418481 CACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGGATTATTTC
1511 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A
1513 S..L..D..A..A..S..S..F..E..S
1514 2418553 CAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGTTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAAT
1521 2418625 CGCTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGTTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTT
1528 2418841 CAGCATCCTCTTTTGAATTATTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCCCCTCTGAATCGCTTCCAGTTTCAC
1532 ..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1534 ..D..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V..S..L..
1535 2418913 TAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCCCCTCTGAATCGTTTCCAG
1539 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1541 S..L..D..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V..S..L..
1542 2418985 TTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGC
1549 2434465 AGTTTTAGATGTAAAGTTGATTTTTACGATAATAGTTTTTACCACATCCATGTTAAATGGCTTAATTGCATT
1553 .A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
1555 .S..I..F..R..F..I..T..V..T..Y
1556 2434537 GAAATAAATCTGAAAATTGTAACTGTATATTATTAAATACAGTATTAGAAACCATATTCTGTATAATTTAGA
1563 2456209 TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTAGTTTCACTAGATGC
1567 .I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1569 .A..S..S..F..E..S..L..P..V..S..L..
1570 2456281 AGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAGACGCAGCATCCTCTTTTGGATTATTTCCAGTTTCACT
1574 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L.
1576 S..L..D..A..A..S..S..F..E..S..L..P..V.
1577 2456353 AGATGCAGCATCCCCCTCTGAATCGTTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGT
1584 2456425 TTCACTAGATGCAGCATTCTCTCTTGGATTATTTCCAGTTTCACTAGATGCAGCATTCTCTTTTGAATTATT
1591 2456713 ATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGATTTCACTAGATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTCCAGTTTCACTAG
1595 ..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1597 ..A..A..S..S..F..E..S..L..S..L..S..L..
1598 2456785 ATGCAGCATCCTCTTTTGAATCGCTTTCACTTTCACTAGTTGCAGCATCCCCTTTTGAATCGTTTCCAGTTT
1602 ..E..L..W..K..Q..L..L..
1604 ..D..P..I..K..I..L..I..
1605 2552833 ATTTTTATTAAGAATTAATTTGTTTTGGATAATAAAATTAAAATTGTTAGTCTGGAATCTTAATCAATATAC
1609 P..K..L..K..C..M..N..K
1611 G..K..L..K..W..F..N..K
1612 2552905 CTTTCAACTTCCAAAAGTTTTTTTTCTAAATTCTCTTTTTCTGCAGAAATCGCCTACAATGTAAAATAATGT
1616 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1617 + + + + + + + + + + + + + + +
1618 ..Q..R..Q..N..C..F..W..V..R..V..V..N..K..K..L
1619 2589409 TCATTCTCTTTTGTTTCTGCCTTTGATTGCAAAACCACACACGCACGACGTTTTTCTTTAAGTCGAGCTTTT
1623 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C
1625 ..E..L..W..T..I..L..I..P..K..L..A..V
1626 2589769 ATTCTCCATCTTCCTCCTGTGCTCTTCCTCCGCTTTTTCTAACCACGTGATCAAGATTGGTTTCAAGGCGAC
1630 ..M..N..K..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
1631 + + + + + + + + + + + + +
1632 ..M..N..N..H..S..L..T..L..S..E..F..R..H..V..C..S..
*..I
1633 2589841 CATGTTGTTGTGACTGAGTGTCAAGGACTCAAACCTGTGCACACAACTTTATATTAAGCACATTATACTTCA
1640 2589985 CTGCAAATTGTGCTTTGGCTCAGCGATCCAACACCCGGTAGCTTGAGGTTGGCAAGAGCTTGCCCAACATCA
1644 .A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
1645 + + + + + + + + + + + +
1646 .N..Q..T..V..G..L..K..I..R..R..Q..K..F
1647 2590057 TTCTGCGTCACTCCAAGTTTAATGCGTCGCTGCTTGAATCTGAAACAATATTGATCCTGGGTAAGTGGCTGT
1651 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
1653 ..Y..T..L..
*..L..A..V..F..R..S..I..P..I..T..S
1654 2608273 AATCAACCACAGTACGTTAACTACAAAGCCACAAACCTCGAAATCGGAATCGTTGATAAGGTCAGTGATACC
1658 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V.
1660 ..R..R..K..P..T..F..R..V..R..I..P.
1661 2783161 TCTGTCTCTTCATGCTCACTGGAAGAGTATGTCCTCACTCTCCTCTTTGGAGTAAATCTCACTCTTATAGGC
1668 2783233 ATCTTTTTTAACCGTTCTTTCTTGATTGAAGAAACATCTGTAGAACCTCCAGCAGAGACATTTAAACTGGCC
1675 2821969 CGTAATATTTGATAAGCCCTGAGGTACAAATTATTGAATTAAAATCAGACCCTTTTTTTTTCAAACACATAT
1679 I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1681 I..S..L..F..F..S..Q..N..L..S..S..
1682 2822041 ATATCTCTGTTTTTTTCACAAAACTTAAGCTCATTTCATCAGAAAAAATCCAACTCTGCGAAATGTTTCAAC
1686 L..E..K..E..V..V..R.
1688 M..
*..R..F..F..I..R.
1689 2862145 CCTAAATCGAGCTGTCTGAACGTTACAGCAACAGACACAATGTCTTAAAGGCATGTGACGTTTCTTTATACG
1693 .V..W..F..C..N..R..R..Q..
1695 .L..S..F..C..N..N..K..Q..
1696 2862217 GTTGTCTTTCTGCAACAACAAGCAAGTCGAGCGTGGTGCCGGTGTTAGCTGGGATGTCCTACACCAAATATG
1700 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..
1702 ..F..S..L..N..Y..Y..E..F..R..
*..R..
1703 3009889 TATTCATTGCTGTATGACCTATGCACCTATGGAATTTAAAAGAAAGGTTGTAATATTCAAACCTTCATCTTG
1710 3009961 AGGTCTGCAACATCGGCCATAAATTCTCCAGCGACAGTCTCAAGTGCCATTGCATTTGCGAGTCCATTCATT
1714 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1716 M..V..Q..G..V..L..R..I..W..F..Y..N..S..L..N..
1717 3132361 ATTAACAATGGTTCAGGGAGTTCTGAGGATTTGGTTTTATAATTCTTTGAATGTTCTCTGTTTACTATCGAA
1721 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
1723 K..V..M..I..N..I..K..I..L..L..M..K..I..L..N..
1724 3177865 AATTGAAAACCTTAAGGTGTTAACATAAAGGTCATGATAAACATAAAAATCCTATTAATGAAAATATTAAAT
1728 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q
1730 V..L..T..T..I..C..R..F..D..D..I..
*
1731 3252745 TTATAGCAACACTATAGCAACGTTGTTATTGCTTTGTTGTGCTGACTACTATATGTCGTTTTGATGACATTT
1738 3252817 AATTGGAATTTTGTAAATTCTAAGAAATCGCGTAATCTGTAAAGTGTTTTGATAAATCAGTTTTGCACCCGT
1745 3276001 CCTGAACGCGAAACTACAGTTTCGTATTTTGTCTGGCTTTTGAACACGTCCACGAGGTTTTAAACAACGTAA
1749 .I..K..L..G..F..T..Q..A..D..V..
1751 .I..K..R..F..F..
*..Q..
*..D..S..
1752 3276073 GATTAAAAGATTTTTTTAACAGTAGGATTCTGCAACTTGCAGTTAATTATCTACCGAAATTAATCGACTGTG
1756 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K.
1758 ..N..
*..W..T..E..L..V..I..T.
1759 3314305 TTAAGTAAACTATATATGCCACATACACATACAACAACATATTTATTCTACCATGTTTCTAACACAATAGTT
1766 3314377 AACTTATACATGTTATCAACTAACAACCTATAATATACCTTAACCTATCATATCCAGGTCAAAAAGTAGGAT
1770 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1772 ..W..K..R..N..C..V..L..V..R..V..F..E..K..C..H
1773 3466585 AGCTCCCACTTACGGTTACAAACTAAAACACGAACGAATTCCTTACAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAT
1777 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1779 R..P..I..G..V..V..R..I..W..F..C..N..S..L..I..
1780 3771289 TAACAACGGCCTATAGGAGTTGTAAGGATATGGTTTTGTAATTCTTTGATTTTTTGTTTACCACAAAATGGG
1784 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..
1786 ..N..V..W..S..S..L..L..N..S..L..K..I..
1787 3936961 TGACAACGCCGACGAGCTGCACAAAATTAAACGAATTCACCCAACTGGAAAGTAAATTACTCAGTTTAATTT
1794 3937033 CTTGCTTCCGTCATTTTGAAATGAATTCTTTGTATGTGGCAGGTTACTCCTGCGATTACGGGTAGAATACTG
1801 3975409 TTAATACAATATCTAGTTAACCACTTGTATGTGTTTCATTATTGTCACCTAGTTTTCTTATTTCACTCCCCC
1805 .E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
1807 .V..L..P..S..A..L..L..P..K..L..T..Q..S..G..S
1808 3975481 ACCAGTGGCGAAGCCAGAAGGGGCTTTAAGGTTTGCGACCCACTTTAAAAAAAAGTTGTTGTTTTTTTGTAA
1812 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A
1814 S..V..K..A..I..C..E..F..T..S
1815 3997297 AATGGGCATGGTAACTAATTTGGACAATAATATAGAACAAGGGTTCTGTAAAAGCAATATGTGAATTCACCT
1822 3997369 CATTAAATCGAGCATTCAAACGACTTCTTGACCCACCTGAAACATTCGTTCCTTTTTGTACTTCTTGCCTGT
1826 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E.
1828 ..R..K..F..N..S..F..W..I..R..V..V..G..I..S.
1829 4022857 TTTTCGTCCCATTTGATAGTAAGCAAAAAACGTTTAAAATTAGAAAACCATATCCTCACGACTCCAATAGAC
1836 4022929 CGCTAATAACTGTTTACAACACGATCAGAATATTTGGATATCATGTTCCAAAGGTGTTCCGTCTCCCCCCAT
1843 4358881 TCAGTCATGCCAAAAAAGACGCAAAACAAACAATCACCATCAAAGTTCCATGAGTAACTTATAAAAAAGATG
1847 K..L..G..F..T..Q..A..D..V..
1849 K..L..C..F..T..T..T..D..V..
1850 4358953 AAATTGTGTTTTACAACTACTGACGTTGCCCAGTAACCCAAGGTTATATAAATGTCATTCATTTATGCAATC
1854 ..E..L..W..K..Q..L..L
1856 ..E..K..W..K..A..R..L
1857 4682161 CATTTGAAAAAAGTCTACTTTAAACCGCTTGTAATGTTTTCATTCTCTTTCCTCTTTCCATTTGGCCCGGAG
1861 ..P..K..L..K..C..M..N..K
1863 ..G..F..L..T..I..L..N..N
1864 4682233 TCCAAAAAGCGTTATTAAATTGTTTAAAACATGATCAGCAGGAAATAGCAGATTTAGGTGCTAAGGGAATAT
1868 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1870 L..N..M..E..V..V..R..I..R..F..Y..N..S..L..N..
1871 4689505 TATCTAAATATCTTCGAATTTTAAACATGGAGGTTGTGAGGATCCGGTTTTACAACTCTTTGAATGTTCTTT
1875 K..N..M..C..K..L..K..P..L..L..Q..K..W..L..E..
1877 N..S..T..V..A..M..N..Q..L..L..K..R..W..L..H..
1878 4736593 CACTAGAAGCTTTGGTGCGTCAACTCAACTGTTGCCATGAACCAACTCTTAAAGCGATGGTTACACAGCTCA
1882 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R
1884 ..S..Y..R..N..C..F..W..I..S
1885 4778065 AAAGCTAACAGGCAAACATATCATTGCCTACATAGTTTTATAAATGGAGTAACGATTACAGAACCAGATGCT
1892 4778137 GCTAACATCGATATAATGTAGATGTTTTTGGGTCCAAACACTTCAACGGCTCCAAATGAAATTAGATAAGCA
1896 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
1898 Y..Q..K..N..V..K..N..I..K..F..C..S..K..R..K..
1899 4844449 ATATGAAAATACCAAAAAAATGTGAAAAATATAAAATTCTGTTCTAAACGAAAATACAAAAAAATATTAAAA
1903 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1905 S..L..F..S..I..S..F..F..L..A..E..N..I..S..F..
1906 4874833 TATCTCAAAATCTCTCTCTTTAGCATTAGCTTTTTCCTTGCTGAAAATATCTCATTTTCTTTTGCAGGTTAA
1910 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..
1912 ..D..L..W..L..E..L..A..Q..A..L..A..D..
1913 4915513 GTGACTTCTGGTTTAAAAGTTGGGGTGACATGCGATCAAGCCAGAGCTCTAAAGCTTGTGCCAGAGCGTCTG
1920 4915585 CATTTTTGACTCCTGTCATTTGGCGTAAAGTAAAGACAGCGTCGAGTCATATGCAATTGCTATAATGTTGCA
1924 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1926 ..M..R..S..N..Y..F..W..I..R..I..V..R..N..I..T
1927 5095873 TGGTAGTAAACAATAAAGAACATACGAGAATTGTAAAACCATATCCTAATGACCCTGTTAATTGTTTAAAAC
1934 5131081 TAGGGTGGGGGAAGGTGGGACACATTTTCCTTCTATATTATCTCCACCCATTCGGTAGTAAACAAAGAAGAA
1938 .N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1940 .N..Y..F..W..S..R..V..V..K..M..S..L
1941 5131153 TTATAAAACCATGATCTCACGACTTTCATAGACAGTTGTTAATGATTTAAAACACGATCAGGATATTTAGAC
1945 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E.
1947 ..N..L..S..N..C..F..W..I..R..V..A..E..M..S.
1948 5190769 TCATTTGGTGAACACAGTCAAAACAGAACATTCAAAGAATTGCAAAACCATATCCTCACGGCTTCCATAGAC
1955 5190841 CGTTGTACTACAATCAGGATATTTGCATATTATTTGCTAAAGGTGCTTGTTTTACCTCAACCTACTGTATAT
1962 5193001 TGGATGTTGTGTTGACTGCTTGCATGATAACTGTGTTTGTAACCCGACACAACACTGAGCAAAATACAATAC
1966 .T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
1968 .T..I..S..L..F..E..N..L..L..K..I..F..
1969 5193073 AACAATCTCATTATTTGAAAATCTATTAAAAATATTTTTTGTTAATTCTTTCCAAGTACACTGACTGAAAAC
1976 5194441 TTTGTGAAGTATTGCTGTAATTTTTTATCAGTCACGTTTCTGTACTAGTCAAAGTTTAGGAATAGGAATTGT
1980 ..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1982 ..E..P..N..T..F..I..I..R..V..T..K..K..Q..M
1983 5194513 TTCTGGGTTTGTAAAAATAATTCTGACTGTTTTTTTTTGCATTTGATGGTGCAGCTATTATTAGGTTTGCAT
1987 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1989 ..N..F..Y..E..Y..F..W..V..R..V..V..E..T..T..L
1990 5247721 AGAACATTAAAATATTCATAAAACCACACCCTTACGACTTCGGTTGTTAACTTTTTTAAACACGACTAGGCT
1994 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
1996 ..N..L..S..N..Y..F..W..I..R..V..V..G..M..S..R
1997 5423617 TTTTGTAGTAAACAAAGAACATTCAACGAATTATAAAACCATATTCTCACGACTCCCATAGACCGTTGTTAA
2004 5586049 AGGGCGGGGGAAGATGGGACACCTTTTTATTCTATTCCATTTGGCCGTACACAAAGAATGTACAAAGAATTA
2008 .C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
2010 .Y..F..W..V..R..V..V..R..M..P..R
2011 5586121 TAAAACCAAACCCTCACAACTCTCATAGGCCGTTGTCAATTGTTTAAAACATGATCAGGGTATGTGAACTTT
2015 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2017 L..E..L..
*..L..V..R..I..W..F..Y..N..S..L..N..
2018 5657041 GTGTTTTAAACAAATAACAACAGTCTATTAGAGTTGTGACTTGTGAGGATATGGTTTTATAATTCTTTGAAT
2022 ..F..S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..
2024 ..F..S..I..D..A..N..E..T..R..C..I..S..
2025 5690089 AAATAATCCACAAAAACAAGTTGAACTTTAGCACGAATGAAATATCCGCGTTTTCAGTTCGACATATACTAC
2032 5690161 GTGGACAGCGGTGACAAATACATTTTGCTAATTTGTTGCGTAAACAAAAATATCTCTATAGTAGATATCGGT
2039 5829121 CCTATATATACCCTTTAATTCAATAAGTGTAGTCAATATAAAATATATAAAAACTTTGTAATTTGAACAGAT
2043 .Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2045 .A..T..A..I..S..S..F..S..S..L..N..P..S..F..
2046 5829193 CGCGACGGCAATTTCGTCATTTAGTTCCCTGAATCCATCGTTTCGAAAAATTAAAAATCAAAGGAAACTACC
2050 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..
2052 ..K..Q..S..N..Y..F..W..I..
2053 6077593 AAAATGTGACACCTTTTTGTTCGATTTTCTTGTCCCGTTTTTAATTTTTTTGTGAATTATAAAACCATATTC
2060 6077665 TAACGACTCCTATGGAGTAGTATTAATTGTTTGAAACACGATTAATACATTTGAATATTATACAATAAATGT
2064 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N.
2066 *..E..K..L..V..V..R..L..
*..F..T..N.
2067 6179905 AACAAATATATCAAACCTTTTTGCAACAACTTAATATTAAGAAAAATTAGTAGTAAGGCTTTAGTTTACCAA
2074 6179977 CAAAAACTTATTATTTTAAAGTTGAAATAAGATTACTTACTGTAAACAATTTAAAAAAAGGAACGAATAATT
2081 6193225 CAGTATATGGTTAAACTTGAACAAACATAAATGGCTCGTTGTTTGTCTTCTAGGTGTAGCAACCACGCTTCT
2085 .L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
2087 .K..K..L..K..L..Q..F..M..N..K
2088 6193297 TTTTTTAACTTTAATTGAAACATGTTTTTACCTGTAAGCGCTTTAACAACCGTTATTTTAGTGCTACATTCT
2092 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2094 L..T..R..N..F..A..T..V..W..F..T..T..Q..R..H..
2095 6278401 AATTAATGCGCACGTATTTGCTTTGACAAGAAATTTCGCAACCGTGTGGTTCACTACCCAGCGTCACTTCCC
2102 6291793 ATAATTGTTTTCCAGGCTGCTTGCAAACTTGTGAAAACTGTAGACACCAAATCTTTGACATCAATCTTCTAT
2106 E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
2108 H..Q..W..
*..E..L..L..S..G..L..K..C..L..S..H
2109 6291865 GCTGCCACTACTCAAGCAGAGATCCCAGCTTGCAAAGTGAGTGCCTTTTTCTTGAGTCACTTAATCCCCACA
2113 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
2115 ..N..V..S..N..
*..L..W..I..R..I..A..N..R..K..L
2116 6509809 TATTCGGTAGTGGACATAGAACATTTACAGAGTTTTACAACCATATCCTTATGGCATTTCTTTTCAAATCAC
2120 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K
2122 ..Q..R..F..N..C..F..F..L..
*..Y..
*..N..K
2123 6762673 AACAAAAAGAAAAAAAAGAGGGAACACTAACTACTGTCTAAAGTTACAAAAAAACAACTAATATTAATTTTT
2130 6762745 TTTAAAAGGAAACACTTTCCGCTTGACCACACACTGAGGTAATATGATATCCCATTGTGATGGAATAAACCT
2134 ..V..D..A..Q..T..F..G..L..K..I..R..R..Q.
2136 ..V..R..
*..Q..T..V..I..L..K..F..L..K..L.
2137 6803065 AGTATTTTGATTAACCCTTAGAAGTTGTGCTTAACTCTTCACTGTGTAACAATCAATTTAAATAATTTAAGT
2144 6803137 TTTAGACCTCTTTGTCAATCGCTTAAATAATGCTATTTGTTTATTTATAATGTAATATATATAATATGTTAT
2151 6812857 GGTCAAATCCTGATAGTGATACATTATAAAGTAAGTTTCCTGTTTCTTTCATTAATATTTATGGTATCAATT
2155 .T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2157 .
*..I..N..R..F..D..K..L..Q..I..
*..F..
2158 6812929 ATGAATAAATCGATTTGATAAGCTTCAAATATAATTCAACTATGGCAGATAAATTTAATTATGTACTTGTGA
2165 6828697 CTAAGGATGCATTATTACTTTAATTTCAATTATGTCTTACTTAAAGCTATAACACGTCGTATACCCTAAAAA
2169 S..L..Q..L..A..E..F..R..C..I..T..T..Q..S
2171 F..C..N..
*..A..L..F..R..C..I..Q..T..N..N
2172 6828769 AACAATTCTACGCCAAAAATCGACATATCTGCGTGTTATTTTATCCAATGCTTATTTGTAAACAAAACTATC
2176 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2178 N..L..A..R..I..C..N..F..C..S..Q..Q..L..S..F..
2179 6845617 TGCACGCATGGCCTGTAATGTAAACCAAATTTAGCTCGAATTTGTAATTTTTGTTCACAACAGCTTAGTTTT
2183 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E
2185 ..N..L..F..N..Y..F..Q..I..R..V..V..E..V..F
2186 6877513 TCTAGTCCCATTTGGTGGTACACAAACAACATTCAAAAAATTATAAAACTGTATTCTCACGACTTCAACAAA
2193 6877585 CAGTTGTTAATTGTTTAAAACTTGATCACAATATTTGAATATGATGTGCTAACGGTGTCCCATCTTACCCCA
2200 6881401 ATTAAAAAAAATTCTTGCCAAAGAGCCAAAATGCATCCTGATAACATTTACCAAAGGTCTATGGGAGTAGTA
2204 R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2206 R..I..W..F..Y..N..S..L..N..
2207 6881473 AGGATATGGTTTTATAATTCTTTAAATATTCTTTGTTTACTTCCAAATGGGAGGAGAAAATACAATGAAAAG
2211 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2213 S..
*..S..T..D..C..R..F..V..K..L..
*..Y..T..V..
2214 6909481 AACTAGATATTAGATTAGGTCATGAAGTACTGACTGTAGATTTGTGAAGCTGTGATACACGGTGAAAGTTGT
2218 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2220 M..A..M..E..L..V..R..I..R..F..Y..N..S..L..K..
2221 6924457 ACATCGTTTTTTACAATTAACAATGGCTATGGAACTCGTGAGGATACGGTTTTATAATTCTTTGAAGTTTCT
2225 K..N..M..C..K..L..K..
2227 K..L..A..S..
*..L..A..
2228 6943105 TTTTTTTAATTAGTACCCTTTTTTTACTTTTTAAAACTGTTTTATTCCTAAAAACTAGCTTCCTAGCTGGCA
2232 P..L..L..Q..K..W..L..E..
2234 S..L..L..H..I..W..L..E..
2235 6943177 TCACTGCTACATATCTGGTTGGAAACACTGTATTTTTCCTTTTTAATCTTCCTAGGAACAACATGTTTTTCA
2239 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C.
2241 L..
*..M..N..I..V..S..V..W..V..Y.
2242 6997681 AACTTCTAAACCAGTGAGGAAAACAGTTGAAAGGATTAAATTATAGATGAATATTGTGTCTGTTTGGGTATA
2249 6997753 TAATCGAAGAAAAGCAATGTTTTACGGTTTATTATTGTATATTTTTACAAAGAGAGCGTTTTTTACTAAGAC
2256 7051609 TTTTAACGTATCAACTTCAATGCAACCCCAAAGGATCGTTTATTCAATAAAACTAGTTCAGCGCGGCCGCCA
2260 ..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2262 ..C..S..F..
*..K..L..Q..F..T..M..
2263 7051681 TATGTTCGTTTTAAAAACTTCAATTTACAATGAAATGGTTTTCCCTTCATTACCACAATACCCTTGTGCCAA
2267 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R.
2269 ..N..L..S..N..
*..F..W..V..S.
2270 7250617 TTTTTATTCTGTTTTCTCGTCCTATTTAATAGTAAACAAAGAACATTCAAAGAATTTTAAAACCATACGCTC
2277 7250689 ACGACTTCCATAGACCGTTGTTAATTGTTTAAACACGATCAGATTATTCAGATATTATGTGCCAAAAGTGTC
2281 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2283 D..
*..A..
*..I..C..R..F..T..S..T..N..D..S..H..
2284 7260769 GGAAACTGAAACCGCAGATTAGGCTTAAATTTGTCGTTTTACTTCAACAAACGACTCGCATGGCGATAAAAA
2288 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
2290 ..N..L..S..N..C..F..R..I..R..V..V..E..M..S..R
2291 7423777 CCCATTTGGTGGTAAACACGAAACATTCAAAGAATTACAAAACCGTATCCTCACGACTTCCATAGACCGTTG
2298 7530193 AAGAAGTCCTTGCCAACTCCCTCCATTGCTCAGTCTCCGGAACAAAATGAAAACGAAAATCCGATATCAAAA
2302 .E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2304 .K..M..I..R..
*..W..F..S..K..Q..R..K..
2305 7530265 GAAGATGATCAGATGATGGTTCTCGAAACAAAGAAAGCTGTTCAGAAAAGTCCAAGGCCCAACATCAAGGCT
2309 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
2311 ..Y..L..T..
*..K..L..V..P..K..Y..A..I..L..N..N
2312 7605289 CACCACTGTATAGTGTTTATTTTAAGACAGGTTTGTAAGCTATTAAATTGTTTTTATTTATACTGAGTAGTT
2316 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
2318 ..Y..L..T..
*..K..L..V..P..K..Y..A..I..L..N..N
2319 7616521 TGATCCTTGCACTATCACCACTGTATAGTGTTTATTTTAAGACAGGTTTGTAAGCTATTAAATTGTTTTCAT
2323 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2325 R..S..M..G..V..V..R..I..W..F..Y..N..S..X..X..
2326 7782121 TGTTTTAAACAATTAACAACGGTCTATGGGGGTCGTGAGGATATGGTTTTATAATTCTNNNNNNNNNNNNNN
2330 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
2332 ..N..L..Y..N..Y..F..W..I..R..V..V..G..I..S..R
2333 7789177 TGGTAGTAAACAAAGAACATTCAAATAATTATAAAACCATATCCTCACGACGCCTATAGACCGTTGTTAATT
2337 ..Q..R..R..N..C..F..W..V..R..V..V..E..K..E..L
2339 ..N..
*..L..N..Y..F..W..I..R..V..V..E..M..S..Q
2340 7801705 GTAGTAAGCAAAGAACATTTTATAAATTATAAAACCATATCCTCACGACTTCCATAGACTGTTGTTAATTAT
2344 S..Q..T..T..I..C..R..F..E..A..L..Q..L..S..F..
2346 S..L..A..T..I..Y..Y..F..E..S..H..Q..L..S..A..
2347 7825105 GGGGGATTCTTCACTAGCAACCATATATTATTTTGAATCACACCAATTGTCTGCAATATTCTAGCAAAAACA
2351 L..E..K..E..V..V..R..V..W..F..C..N..R..R..Q..
2353 R..S..I..G..V..V..R..I..W..F..Y..N..S..L..I..
2354 7927561 ACAATTGACAACGGTCTATAGGAGTCGTGAGGATATGGTTTTATAATTCTTTAATTGTCCTTTTTTTACTCT
2358 ..E..L..W..K..Q..L..L..P..K..L..K..C..M..N..K
2360 ..H..K..F..K..N..L..F..L..N..L..K..S..A..N..K
2361 8028217 CGTTTTGTGTTTAAACTTGTTTAAAAATAAATTTAATTTTGATGCATTTTTTAGTTTCTTTTTTTATATAAA
2363 ********************************************************************************
2367 Time
470.725418 secs.
2369 mast.bin test2.fasta.meme.out
-nostatus
-mt
1e-06 -ev
2e-02 -dna
-brief
-d
/home
/struckma
/XXXXX
/xxxxx.seq.fasta
-text
-stdout