t/data/bl2seq.blastn

   1 Query=
   2          (180 letters)
   3
   4 >human
   5           Length = 179
   6
   7  Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-12
   8  Identities = 83/94 (88%), Gaps = 7/94 (7%)
   9  Strand = Plus / Plus
  10
  11
  12 Query: 94  gtggctgggctc-tgaagcatttggg--tgagcccagggg-ctcagggcagggcacct-g 148
  13            |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| | || |||||||||||| |
  14 Sbjct: 86  gtggctgggctcgtgaagcatgtgggggtgagcccaggggccccaaggcagggcacctgg 145
  15
  16
  17 Query: 149 ccttcag-cggcctcag-cctgcctgtctcccag 180
  18            ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||
  19 Sbjct: 146 ccttcagcctgcctcagccctgcctgtctcccag 179
  20
  21
  22
  23  Score = 36.2 bits (18), Expect = 4e-07
  24  Identities = 18/18 (100%)
  25  Strand = Plus / Plus
  26
  27
  28 Query: 1  gtctgttccaagggcctt 18
  29           ||||||||||||||||||
  30 Sbjct: 1  gtctgttccaagggcctt 18
  31
  32
  33 Lambda     K      H
  34     1.37    0.711     1.31
  35
  36 Gapped
  37 Lambda     K      H
  38     1.37    0.711     1.31
  39
  40
  41 Matrix: blastn matrix:1 -3
  42 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
  43 Number of Hits to DB: 7
  44 Number of Sequences: 0
  45 Number of extensions: 7
  46 Number of successful extensions: 7
  47 Number of sequences better than 10.0: 1
  48 length of query: 180
  49 length of database: 179
  50 effective HSP length: 6
  51 effective length of query: 174
  52 effective length of database: 173
  53 effective search space:    30102
  54 effective search space used:    30102
  55 T: 0
  56 A: 30
  57 X1: 6 (11.9 bits)
  58 X2: 15 (29.7 bits)
  59 S1: 12 (24.3 bits)
  60 S2: 6 (12.4 bits)