A test to ensure Bio::PrimarySeqI->trunc() doesn't use clone() for a Bio::Seq::RichSe...
[bioperl-live.git] / t / data / ay007676.gb
blob37eb34128480afe4ba4da92ddafa5ff2a1dbe7c0
1 LOCUS       AY007676                1389 bp    DNA     linear   BCT 29-OCT-2001
2 DEFINITION  Unknown marine gamma proteobacterium NOR5 16S ribosomal RNA,
3             partial sequence.
4 ACCESSION   AY007676
5 VERSION     AY007676.1  GI:12000362
6 KEYWORDS    .
7 SOURCE      unknown marine gamma proteobacterium NOR5
8   ORGANISM  unknown marine gamma proteobacterium NOR5
9             Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria.
10 REFERENCE   1  (bases 1 to 1389)
11   AUTHORS   Eilers,H., Pernthaler,J., Peplies,J., Glockner,F.O., Gerdts,G. and
12             Amann,R.
13   TITLE     Isolation of novel pelagic bacteria from the German bight and their
14             seasonal contributions to surface picoplankton
15   JOURNAL   Appl. Environ. Microbiol. 67 (11), 5134-5142 (2001)
16    PUBMED   11679337
17 REFERENCE   2  (bases 1 to 1389)
18   AUTHORS   Eilers,H., Pernthaler,J., Peplies,J., Gloeckner,F.O., Gerdts,G.,
19             Schuett,C. and Amann,R.
20   TITLE     Identification and seasonal dominance of culturable marine bacteria
21   JOURNAL   Unpublished
22 REFERENCE   3  (bases 1 to 1389)
23   AUTHORS   Eilers,H., Pernthaler,J., Peplies,J., Gloeckner,F.O., Gerdts,G.,
24             Schuett,C. and Amann,R.
25   TITLE     Direct Submission
26   JOURNAL   Submitted (29-AUG-2000) Molecular Ecology, Max-Planck-Institute,
27             Celsiusstrasse 1, Bremen 28359, Germany
28 FEATURES             Location/Qualifiers
29      source          1..1389
30                      /organism="unknown marine gamma proteobacterium NOR5"
31                      /mol_type="genomic DNA"
32                      /db_xref="taxon:145658"
33      rRNA            <1..>1389
34                      /product="16S ribosomal RNA"
35 ORIGIN      
36         1 cgcgaaagta cttcggtatg agtagagcgg cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctat
37        61 ccagtagtgg gggacaactc ggggaaactc gagctaatac cgcatacgtc ctaagggaga
38       121 aagcggggga tcttcggacc tcgcgctatt ggaggagcct gcgttggatt agctagttgg
39       181 tggggtaaag gcctaccaag gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca
40       241 ccgggactga gacacggccc ggactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcgcaat
41       301 gggcgaaagc ctgacgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca
42       361 ctttcaattg ggaagaaagg ttagtagtta ataactgcta gctgtgacat tacctttaga
43       421 agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggtgcg agcgttaatc
44       481 ggaattactg ggcgtaaagc gcgcgtaggc ggtctgttaa gtcggatgtg aaagccccgg
45       541 gctcaacctg ggaattgcac ccgatactgg ccgactggag tgcgagagag ggaggtagaa
46       601 ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tgtggaggaa taccggtggc gaaggcggcc
47       661 tcctggctcg acactgacgc tgaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc
48       721 ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtctac tagccgttgg gagacttgat ttcttggtgg
49       781 cgaagttaac gcgataagta gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat
50       841 gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag
51       901 aaccttacca ggccttgaca tcctaggaat cctgtagaga tacgggagtg ccttcgggaa
52       961 tctagtgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc
53      1021 ccgtaacgag cgcaaccctt gtccttagtt gccagcgcgt aatggcggga actctaagga
54      1081 gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttacg
55      1141 gcctgggcta cacacgtgct acaatggaac gcacagaggg cagcaaaccc gcgaggggga
56      1201 gcgaatccca caaaacgttt cgtagtccgg atcggagtct gcaactcgac tccgtgaagt
57      1261 cggaatcgct agtaatcgtg aatcagaatg tcacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac
58      1321 acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gctccagaag tggttagcct aaccttcggg
59      1381 agggcgatc