A test to ensure Bio::PrimarySeqI->trunc() doesn't use clone() for a Bio::Seq::RichSe...
[bioperl-live.git] / t / data / NC_006346.gb
blobfb7352796c472e7d3fe34b684dc0f178eeb518bd
1 LOCUS       NC_006346              21657 bp    DNA     circular VRT 12-JAN-2005
2 DEFINITION  Bolitoglossa n. sp. RLM-2004 mitochondrion, complete genome.
3 ACCESSION   NC_006346
4 VERSION     NC_006346.1  GI:53686544
5 KEYWORDS    .
6 SOURCE      mitochondrion Bolitoglossa n. sp. RLM-2004 (mushroomtongue
7             salamander)
8   ORGANISM  Bolitoglossa n. sp. RLM-2004
9             Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
10             Amphibia; Batrachia; Caudata; Salamandroidea; Plethodontidae;
11             Plethodontinae; Bolitoglossini; Bolitoglossa.
12 REFERENCE   1  (bases 1 to 21657)
13   AUTHORS   Mueller,R.L., Macey,J.R., Jaekel,M., Wake,D.B. and Boore,J.L.
14   TITLE     Morphological homoplasy, life history evolution, and historical
15             biogeography of plethodontid salamanders inferred from complete
16             mitochondrial genomes
17   JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (38), 13820-13825 (2004)
18    PUBMED   15365171
19 REFERENCE   2  (bases 1 to 21657)
20   AUTHORS   .
21   CONSRTM   NCBI Genome Project
22   TITLE     Direct Submission
23   JOURNAL   Submitted (01-OCT-2004) National Center for Biotechnology
24             Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
25 REFERENCE   3  (bases 1 to 21657)
26   AUTHORS   Mueller,R.L., Macey,J.R., Jaekel,M., Wake,D.B. and Boore,J.L.
27   TITLE     Direct Submission
28   JOURNAL   Submitted (18-AUG-2004) Museum of Vertebrate Zoology and
29             Evolutionary Genomics, University of California at Berkeley and DOE
30             Joint Genome Institute, 3101 Valley Life Sciences Bldg., Berkeley,
31             CA 94720-3160, USA
32 COMMENT     REVIEWED REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff. The
33             reference sequence was derived from AY728235.
34 FEATURES             Location/Qualifiers
35      source          1..21657
36                      /organism="Bolitoglossa n. sp. RLM-2004"
37                      /organelle="mitochondrion"
38                      /mol_type="genomic DNA"
39                      /db_xref="taxon:291262"
40                      /common="mushroomtongue salamander"
41      tRNA            1..64
42                      /product="tRNA-Phe"
43      rRNA            65..96
44                      /product="s-rRNA"
45      D-loop          152..216
46                      /note="putative control region"
47 ORIGIN      
48         1 gcaagtgtag tttataaaaa catagcactg aaaatgctaa aataaatatt atatttcact
49        61 agcaatagat ttggtcctaa tctttttatt aattataact ataattatac atgcaagttt
50       121 caccacccca gtgagtaagc cccacatccc cgcttagtga tgaaggagct ggtatcaggc
51       181 atacacaccc aaaacaccac gcttagccac acctacacag gaactcagca gtaattaaca
52       241 ttaaaccata agtgaaaact tgatttagta atagtattta aagttggtaa atctcgtgcc
53       301 agccaccgcg gttacacgaa agacttaaat taatatatgc ggcccaaagg acagtttaag
54       361 gttttatagg aacttaagag cctttaaggc cgttatacgt ttaaaaggtc aaaaacacaa
55       421 atcaccccac caacttgaat ctgttaaagc cgggggacac actgggatta gataccccac