Sync with main trunk
[bioperl-live.git] / Bio / Variation / README
blob805980c3c512b29a6cc2eaa50518f8d588357ff4
2                        README for Bio::Variation classes
5 These classes are part of "Computational Mutation Expression Toolkit"
6 project at European Bioinformatics Institute
7 <http://www.ebi.ac.uk/mutations/toolkit/>, but they are written to be
8 as general as possinble.
10 Bio::Variation name space contains modules to store sequence variation
11 information as differences between the reference sequence and changes
12 sequences. Also included are classes to write out and recrete objects
13 from EMBL-like flat files and XML. Lastly, there are simple classes to
14 calculate values for sequence change objects.
16 See "Computational Mutation Expression Toolkit" web pages for more
17 information:
19         http://www.ebi.ac.uk/mutations/toolkit/
22 Send bug reports using the bioperl bug-tracking system at
23   http://bugzilla.open-bio.org/.
25 Send general comments, questions, and feature requests to the bioperl
26 mailing list:
28         bioperl-l@bioperl.org
30 Heikki Lehväslaiho <heikki-at-bioperl-dot-org>