t/data/bl2seq.out

   1 >ALEU_HORVU
   2           Length = 362
   3
   4  Score =  191 bits (481), Expect = 2e-53
   5  Identities = 111/322 (34%), Positives = 167/322 (51%), Gaps = 27/322 (8%)
   6
   7 Query: 28  QFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
   8            +F  F  ++ K Y S  E   RF IF  +L ++   N   + ++     G+N+F+D+S +
   9 Sbjct: 60  RFARFAVRYGKSYESAAEVRRRFRIFSESLEEVRSTNRKGLPYR----LGINRFSDMSWE 115
  10
  11 Query: 87  EFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
  12            EF+   L    A  T    +A         ++P   DWR  G V+PVKNQ  CGSCW+FS
  13 Sbjct: 116 EFQATRLG---AAQTCSATLAGNHLMRDAAALPETKDWREDGIVSPVKNQAHCGSCWTFS 172
  14
  15 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
  16            TTG +E  +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI  NG
  17 Sbjct: 173 TTGALEAAYTQATGKNISLSEQQLVDCAGGFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIKYNG 224
  18
  19 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADAV 265
  20            GI TE SYPY    G  C++ + N   ++ +   I  N E  +   +    P+++A   +
  21 Sbjct: 225 GIDTEESYPYKGVNGV-CHYKAENAAVQVLDSVNITLNAEDELKNAVGLVRPVSVAFQVI 283
  22
  23 Query: 266 E-WQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQG 321
  24            + ++ Y  GV+        P+ ++H +L VGY  +N      +PYW++KNSWGADWG+ G
  25 Sbjct: 284 DGFRQYKSGVYTSDHCGTTPDDVNHAVLAVGYGVEN-----GVPYWLIKNSWGADWGDNG 338
  26
  27 Query: 322 YIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
  28            Y  +  GKN C ++   S  ++
  29 Sbjct: 339 YFKMEMGKNMCAIATCASYPVV 360
  30
  31
  32 Lambda     K      H
  33    0.316    0.135    0.414
  34
  35 Gapped
  36 Lambda     K      H
  37    0.270   0.0470    0.230
  38
  39
  40 Matrix: BLOSUM62
  41 Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
  42 Number of Hits to DB: 368
  43 Number of Sequences: 0
  44 Number of extensions: 19
  45 Number of successful extensions: 6
  46 Number of sequences better than 10.0: 1
  47 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
  48 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
  49 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
  50 Number of HSP's gapped (non-prelim): 1
  51 length of query: 343
  52 length of database: 362
  53 effective HSP length: 23
  54 effective length of query: 320
  55 effective length of database: 339
  56 effective search space:   108480
  57 effective search space used:   108480
  58 T: 11
  59 A: 40
  60 X1: 16 ( 7.3 bits)
  61 X2: 38 (14.8 bits)
  62 X3: 64 (24.9 bits)
  63 S1: 24 (13.8 bits)
  64 S2: 24 (13.8 bits)