t/data/bl2seq.blastn.rev

   1 Query=
   2          (180 letters)
   3
   4 >human
   5           Length = 179
   6
   7  Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-12
   8  Identities = 83/94 (88%), Gaps = 7/94 (7%)
   9  Strand = Plus / Minus
  10
  11
  12 Query: 94  gtggctgggctc-tgaagcatttggg--tgagcccagggg-ctcagggcagggcacct-g 148
  13            |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| | || |||||||||||| |
  14 Sbjct: 94  gtggctgggctcgtgaagcatgtgggggtgagcccaggggccccaaggcagggcacctgg 35
  15
  16
  17 Query: 149 ccttcag-cggcctcag-cctgcctgtctcccag 180
  18            ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||
  19 Sbjct: 34  ccttcagcctgcctcagccctgcctgtctcccag 1
  20
  21
  22 Lambda     K      H
  23     1.37    0.711     1.31
  24
  25 Gapped
  26 Lambda     K      H
  27     1.37    0.711     1.31
  28
  29
  30 Matrix: blastn matrix:1 -3
  31 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
  32 Number of Hits to DB: 6
  33 Number of Sequences: 0
  34 Number of extensions: 6
  35 Number of successful extensions: 6
  36 Number of sequences better than 10.0: 1
  37 length of query: 180
  38 length of database: 179
  39 effective HSP length: 6
  40 effective length of query: 174
  41 effective length of database: 173
  42 effective search space:    30102
  43 effective search space used:    30102
  44 T: 0
  45 A: 30
  46 X1: 6 (11.9 bits)
  47 X2: 15 (29.7 bits)
  48 S1: 12 (24.3 bits)
  49 S2: 6 (12.4 bits)