Merge pull request #231 from bioperl/pir-no-desc-line
[bioperl-live.git] / t / data / assembly_with_singlets.ace
bloba05a6c218d324957ed1a358bd7ea05e1dd2b6307
1 AS 36 39
3 CO Contig1| 131 1 1 U
4 gctagaaaaaaaaggactcccagtagaaatacgtacaataaagtaggttc
5 ctctagttaactgttacaaaataagtttcccattggtaatataatagatt
6 tataactgttatatccagagcaacctagggg
8 BQ
9  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
10  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
11  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
13 AF 5765593 U 1
14 BS 1 131 5765593
16 RD 5765593 131 0 6
17 gctagaaaaaaaaggactcccagtagaaatacgtacaataaagtaggttc
18 ctctagttaactgttacaaaataagtttcccattggtaatataatagatt
19 tataactgttatatccagagcaacctagggg
21 QA 1 131 1 131
23 RT{
24 5765593 matchElsewhereHighQual phrap 108 131 080215:162048
27 RT{
28 5765593 matchElsewhereHighQual phrap 98 118 080215:162048
31 RT{
32 5765593 matchElsewhereHighQual phrap 36 57 080215:162048
35 RT{
36 5765593 matchElsewhereHighQual phrap 15 34 080215:162048
39 RT{
40 5765593 matchElsewhereHighQual phrap 8 27 080215:162048
43 RT{
44 5765593 matchElsewhereHighQual phrap 6 25 080215:162048
47 CO Contig2 139 1 1 U
48 gtgggggcatggcggcccttggccgcccccagtaagtcaattgtcccgcg
49 aaggagcgggacgaagggtcccgcagggacccgagaaccgatcgggggct
50 cttaacacaaaatgtccttccggcgggggggccccgtac
53  0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
54  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
55  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
57 AF 5740343 U 1
58 BS 1 139 5740343
60 RD 5740343 139 0 4
61 gtgggggcatggcggcccttggccgcccccagtaagtcaattgtcccgcg
62 aaggagcgggacgaagggtcccgcagggacccgagaaccgatcgggggct
63 cttaacacaaaatgtccttccggcgggggggccccgtac
65 QA 4 139 1 139
67 RT{
68 5740343 matchElsewhereHighQual phrap 102 135 080215:162048
71 RT{
72 5740343 matchElsewhereHighQual phrap 89 129 080215:162048
75 RT{
76 5740343 matchElsewhereHighQual phrap 40 90 080215:162048
79 RT{
80 5740343 matchElsewhereHighQual phrap 4 45 080215:162048
83 CO Contig3 118 1 1 U
84 cctacgcgaggatacgaatgtttcttcgacaataataagctttttattat
85 tattattattattattattatttctattattattattattattattatta
86 ttattattattattatta
89  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15
90  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
91  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
93 AF 5685889 U 1
94 BS 1 118 5685889
96 RD 5685889 118 0 2
97 cctacgcgaggatacgaatgtttcttcgacaataataagctttttattat
98 tattattattattattattatttctattattattattattattattatta
99 ttattattattattatta
101 QA 44 118 1 118
104 5685889 matchElsewhereHighQual phrap 75 118 080215:162048
108 5685889 matchElsewhereHighQual phrap 44 72 080215:162048
111 CO Contig4 81 1 1 U
112 gctctggctcactcgctctgagcaggcaatctttcagtcttacacagtct
113 acattcatactggacagcagtgtagacttaa
116  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
117  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
119 AF 5695780 U 1
120 BS 1 81 5695780
122 RD 5695780 81 0 2
123 gctctggctcactcgctctgagcaggcaatctttcagtcttacacagtct
124 acattcatactggacagcagtgtagacttaa
126 QA 1 81 1 81
129 5695780 matchElsewhereHighQual phrap 23 81 080215:162048
133 5695780 matchElsewhereHighQual phrap 1 67 080215:162048
136 CO Contig5 86 1 1 U
137 gtgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
138 gtgtgtgtgtcgtccgtccgtcgtagtagtagtgtg
141  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
142  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
144 AF 5659765 U 1
145 BS 1 86 5659765
147 RD 5659765 86 0 1
148 gtgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
149 gtgtgtgtgtcgtccgtccgtcgtagtagtagtgtg
151 QA 1 86 1 86
154 5659765 matchElsewhereHighQual phrap 10 60 080215:162048
157 CO Contig6 83 1 1 U
158 gaggaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
159 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
162  0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
163  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
165 AF 5772270 U 1
166 BS 1 83 5772270
168 RD 5772270 83 0 2
169 gaggaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
170 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
172 QA 7 83 1 83
175 5772270 matchElsewhereHighQual phrap 7 83 080215:162048
179 5772270 matchElsewhereHighQual phrap 6 81 080215:162048
182 CO Contig7 82 1 1 U
183 cttccttcagcaactgtgtgtgtgtgtntgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
184 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
187  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
188  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
190 AF 5717803 U 1
191 BS 1 82 5717803
193 RD 5717803 82 0 1
194 cttccttcagcaactgtgtgtgtgtgtntgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
195 tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
197 QA 15 82 1 82
200 5717803 matchElsewhereHighQual phrap 29 82 080215:162048
203 CO Contig8 139 1 1 U
204 attattattattattattattattattattattattattattattattat
205 tattattattattattatttattcaatttcgactttaattgttgtttttt
206 ttattaagtaaatactttaattttttttactttaaatac
209  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
210  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
211  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
213 AF 5671215 U 1
214 BS 1 139 5671215
216 RD 5671215 139 0 0
217 attattattattattattattattattattattattattattattattat
218 tattattattattattatttattcaatttcgactttaattgttgtttttt
219 ttattaagtaaatactttaattttttttactttaaatac
221 QA 70 139 1 139
223 CO Contig9 81 1 1 U
224 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
225 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
228  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
229  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
231 AF 5726177 U 1
232 BS 1 81 5726177
234 RD 5726177 81 0 2
235 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
236 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
238 QA 1 81 1 81
241 5726177 matchElsewhereHighQual phrap 3 81 080215:162048
245 5726177 matchElsewhereHighQual phrap 1 77 080215:162048
248 CO Contig10 83 1 1 U
249 gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
250 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtactac
253  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
254  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
256 AF 5741972 U 1
257 BS 1 83 5741972
259 RD 5741972 83 0 1
260 gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
261 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtactac
263 QA 1 83 1 83
266 5741972 matchElsewhereHighQual phrap 11 78 080215:162048
269 CO Contig11 177 1 1 U
270 ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
271 ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
272 tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
273 tatttattttatttatttatttattta
276  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
277  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
278  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
279  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
281 AF 5695538 U 1
282 BS 1 177 5695538
284 RD 5695538 177 0 2
285 ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
286 ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
287 tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
288 tatttattttatttatttatttattta
290 QA 1 177 1 177
293 5695538 matchElsewhereHighQual phrap 161 177 080215:162048
297 5695538 matchElsewhereHighQual phrap 1 167 080215:162048
300 CO Contig12 121 1 1 U
301 atctcttgatagttgcacgctacattgaacgaaccaaatcccttttttaa
302 ggtgagtttggtaagattggggtaatatattcatttgataggtctcccta
303 aaaatggcctantttttttac
306  0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
307  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
308  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
310 AF 5732765 U 1
311 BS 1 121 5732765
313 RD 5732765 121 0 4
314 atctcttgatagttgcacgctacattgaacgaaccaaatcccttttttaa
315 ggtgagtttggtaagattggggtaatatattcatttgataggtctcccta
316 aaaatggcctantttttttac
318 QA 2 121 1 121
321 5732765 matchElsewhereHighQual phrap 81 110 080215:162048
325 5732765 matchElsewhereHighQual phrap 54 103 080215:162048
329 5732765 matchElsewhereHighQual phrap 53 98 080215:162048
333 5732765 matchElsewhereHighQual phrap 2 55 080215:162048
336 CO Contig13 119 1 1 U
337 tattattattattattattattattattattattattattattattatta
338 ttattattattattattattattattattattattattattattattatt
339 attattattattattatta
342  0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
343  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
344  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
346 AF 5685756 U 1
347 BS 1 119 5685756
349 RD 5685756 119 0 1
350 tattattattattattattattattattattattattattattattatta
351 ttattattattattattattattattattattattattattattattatt
352 attattattattattatta
354 QA 3 119 1 119
357 5685756 matchElsewhereHighQual phrap 7 86 080215:162048
360 CO Contig14 178 1 1 U
361 ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
362 ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
363 tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
364 tatttattttatttattttatttattta
367  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
368  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
369  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
370  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
372 AF 5693041 U 1
373 BS 1 178 5693041
375 RD 5693041 178 0 1
376 ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
377 ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
378 tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
379 tatttattttatttattttatttattta
381 QA 1 178 1 178
384 5693041 matchElsewhereHighQual phrap 1 168 080215:162048
387 CO Contig15 115 1 1 U
388 ttgaaggatggtagccatcctactctttttctataagttatgttccgcca
389 ggaagagcagccgccgttagatagggactcacaacccttcaaaatcgccc
390 taagacttctcaacc
393  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
394  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
395  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
397 AF 5651991 U 1
398 BS 1 115 5651991
400 RD 5651991 115 0 2
401 ttgaaggatggtagccatcctactctttttctataagttatgttccgcca
402 ggaagagcagccgccgttagatagggactcacaacccttcaaaatcgccc
403 taagacttctcaacc
405 QA 1 115 1 115
408 5651991 matchElsewhereHighQual phrap 47 115 080215:162048
412 5651991 matchElsewhereHighQual phrap 1 46 080215:162048
415 CO Contig16 83 1 1 U
416 cacacacaaacacacacacacacccacacacacacacacacacacacaca
417 cacacacacacacacacacacacacacacacac
420  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
421  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
423 AF 5756120 U 1
424 BS 1 83 5756120
426 RD 5756120 83 0 2
427 cacacacaaacacacacacacacccacacacacacacacacacacacaca
428 cacacacacacacacacacacacacacacacac
430 QA 1 83 1 83
433 5756120 matchElsewhereHighQual phrap 25 83 080215:162048
437 5756120 matchElsewhereHighQual phrap 9 23 080215:162048
440 CO Contig17 120 1 1 U
441 ttcaattttaatattattattattattattattattattattattattat
442 tattattattattattattattattattattattattattactactacta
443 ctactactactactactgtc
446  0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
447  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
448  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
450 AF 5766191 U 1
451 BS 1 120 5766191
453 RD 5766191 120 0 1
454 ttcaattttaatattattattattattattattattattattattattat
455 tattattattattattattattattattattattattattactactacta
456 ctactactactactactgtc
458 QA 8 120 1 120
461 5766191 matchElsewhereHighQual phrap 12 91 080215:162048
464 CO Contig18 81 1 1 U
465 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
466 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtnt
469  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
470  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0
472 AF 5701563 U 1
473 BS 1 81 5701563
475 RD 5701563 81 0 1
476 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
477 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtnt
479 QA 1 81 1 81
482 5701563 matchElsewhereHighQual phrap 1 76 080215:162048
485 CO Contig19 85 1 1 U
486 gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
487 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtcgtactac
490  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
491  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
493 AF 5710086 U 1
494 BS 1 85 5710086
496 RD 5710086 85 0 1
497 gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
498 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtcgtactac
500 QA 1 85 1 85
503 5710086 matchElsewhereHighQual phrap 11 74 080215:162048
506 CO Contig20 175 1 1 U
507 ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
508 ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
509 tattttatttattttatttattttatttattttattattttatttatttt
510 atttatttatttatttatttattta
513  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
514  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
515  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
516  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
518 AF 5692289 U 1
519 BS 1 175 5692289
521 RD 5692289 175 0 3
522 ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
523 ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
524 tattttatttattttatttattttatttattttattattttatttatttt
525 atttatttatttatttatttattta
527 QA 1 175 1 175
530 5692289 matchElsewhereHighQual phrap 159 175 080215:162048
534 5692289 matchElsewhereHighQual phrap 137 157 080215:162048
538 5692289 matchElsewhereHighQual phrap 1 135 080215:162048
541 CO Contig21 122 1 1 U
542 agtgttattactattattattattattattattattattattattattat
543 tattattattattattatttccactaacaaaatatatatataatataatt
544 tattctaaatttttttaatcta
547  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
548  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
549  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
551 AF 5731835 U 1
552 BS 1 122 5731835
554 RD 5731835 122 0 0
555 agtgttattactattattattattattattattattattattattattat
556 tattattattattattatttccactaacaaaatatatatataatataatt
557 tattctaaatttttttaatcta
559 QA 77 122 1 122
561 CO Contig22 79 1 1 U
562 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
563 cacacacacacacacacacacacacacac
566  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
567  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
569 AF 5734795 U 1
570 BS 1 79 5734795
572 RD 5734795 79 0 1
573 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
574 cacacacacacacacacacacacacacac
576 QA 1 79 1 79
579 5734795 matchElsewhereHighQual phrap 1 79 080215:162048
582 CO Contig23 72 1 1 U
583 atatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
584 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
587  0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
588  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
590 AF 5769497 U 1
591 BS 1 72 5769497
593 RD 5769497 72 0 1
594 atatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
595 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
597 QA 10 72 1 72
600 5769497 matchElsewhereHighQual phrap 10 72 080215:162048
603 CO Contig24 71 1 1 U
604 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
605 gtgtgtgtgtgtgtgtgtagt
608  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
609  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
611 AF 5685312 U 1
612 BS 1 71 5685312
614 RD 5685312 71 0 1
615 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
616 gtgtgtgtgtgtgtgtgtagt
618 QA 1 71 1 71
621 5685312 matchElsewhereHighQual phrap 1 68 080215:162048
624 CO Contig25 79 1 1 U
625 catacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
626 cacacacacacacacacacacacacacac
629  0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
630  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
632 AF 5654419 U 1
633 BS 1 79 5654419
635 RD 5654419 79 0 1
636 catacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
637 cacacacacacacacacacacacacacac
639 QA 3 79 1 79
642 5654419 matchElsewhereHighQual phrap 31 79 080215:162048
645 CO Contig26 85 1 1 U
646 cgaagacccggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
647 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
650  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
651  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
653 AF 5722605 U 1
654 BS 1 85 5722605
656 RD 5722605 85 0 1
657 cgaagacccggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
658 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
660 QA 11 85 1 85
663 5722605 matchElsewhereHighQual phrap 10 85 080215:162048
666 CO Contig27 83 1 1 U
667 attnatattaatacanaacacacacacacacacacacacacacacacaca
668 cacacacacacacacacacacacacacacacac
671  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
672  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
674 AF 5667144 U 1
675 BS 1 83 5667144
677 RD 5667144 83 0 2
678 attnatattaatacanaacacacacacacacacacacacacacacacaca
679 cacacacacacacacacacacacacacacacac
681 QA 12 83 1 83
684 5667144 matchElsewhereHighQual phrap 18 83 080215:162048
688 5667144 matchElsewhereHighQual phrap 17 31 080215:162048
691 CO Contig28 103 1 1 U
692 atcatttaggattgctatattttggattttggattgggaaatgcctggct
693 agacaaccgttctggaaattgaaatcatgcagatgtaaacaaaaatggga
697  0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
698  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
699  15 15 15
701 AF 5754151 U 1
702 BS 1 103 5754151
704 RD 5754151 103 0 0
705 atcatttaggattgctatattttggattttggattgggaaatgcctggct
706 agacaaccgttctggaaattgaaatcatgcagatgtaaacaaaaatggga
709 QA 3 103 1 103
711 CO Contig29 79 1 1 U
712 natacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
713 cacacacacacacacacacacacacacac
716  0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
717  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
719 AF 5764329 U 1
720 BS 1 79 5764329
722 RD 5764329 79 0 1
723 natacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
724 cacacacacacacacacacacacacacac
726 QA 4 79 2 79
729 5764329 matchElsewhereHighQual phrap 31 79 080215:162048
732 CO Contig30 112 1 1 U
733 attttcagattcatttgtattttgatttggattattatcattgttgttat
734 tgttgttattattattattattattattattattattattattattatta
735 ttattattatta
738  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
739  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
740  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
742 AF 5725479 U 1
743 BS 1 112 5725479
745 RD 5725479 112 0 1
746 attttcagattcatttgtattttgatttggattattatcattgttgttat
747 tgttgttattattattattattattattattattattattattattatta
748 ttattattatta
750 QA 33 112 1 112
753 5725479 matchElsewhereHighQual phrap 56 112 080215:162048
756 CO Contig31 78 1 1 U
757 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
758 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
761  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
762  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
764 AF 5762369 U 1
765 BS 1 78 5762369
767 RD 5762369 78 0 1
768 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
769 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
771 QA 1 78 1 78
774 5762369 matchElsewhereHighQual phrap 1 78 080215:162048
777 CO Contig32 82 1 1 U
778 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
779 acacacacacacacacacacacacgacgacnc
782  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
783  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0
785 AF 5679898 U 1
786 BS 1 82 5679898
788 RD 5679898 82 0 1
789 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
790 acacacacacacacacacacacacgacgacnc
792 QA 1 82 1 82
795 5679898 matchElsewhereHighQual phrap 1 74 080215:162048
798 CO Contig33 62 1 1 U
799 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
800 gtgtgtgtgtgt
803  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
804  15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
806 AF 5697733 U 1
807 BS 1 62 5697733
809 RD 5697733 62 0 1
810 gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
811 gtgtgtgtgtgt
813 QA 1 62 1 62
816 5697733 matchElsewhereHighQual phrap 1 62 080215:162048
819 CO Contig34 98 2 54 U
820 aagggaCTCGTCTAAGTGAAAGGCAGTAGATGTATGTAAGTCATGATGAC
821 ATCATCGCtaatcAAGCCtaacaGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta
824  0 0 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
825  25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15
827 AF 5704073 U 2
828 AF 5762101 U 1
829 BS 1 3 5762101
830 BS 4 4 5704073
831 BS 5 5 5762101
832 BS 6 6 5704073
833 BS 7 7 5762101
834 BS 8 8 5704073
835 BS 9 9 5762101
836 BS 10 14 5704073
837 BS 15 15 5762101
838 BS 16 18 5704073
839 BS 19 20 5762101
840 BS 21 21 5704073
841 BS 22 24 5762101
842 BS 25 25 5704073
843 BS 26 26 5762101
844 BS 27 27 5704073
845 BS 28 28 5762101
846 BS 29 29 5704073
847 BS 30 30 5762101
848 BS 31 32 5704073
849 BS 33 38 5762101
850 BS 39 39 5704073
851 BS 40 46 5762101
852 BS 47 47 5704073
853 BS 48 50 5762101
854 BS 51 52 5704073
855 BS 53 54 5762101
856 BS 55 55 5704073
857 BS 56 56 5762101
858 BS 57 61 5704073
859 BS 62 63 5762101
860 BS 64 65 5704073
861 BS 66 66 5762101
862 BS 67 68 5704073
863 BS 69 69 5762101
864 BS 70 72 5704073
865 BS 73 74 5762101
866 BS 75 75 5704073
867 BS 76 77 5762101
868 BS 78 78 5704073
869 BS 79 80 5762101
870 BS 81 81 5704073
871 BS 82 82 5762101
872 BS 83 83 5704073
873 BS 84 84 5762101
874 BS 85 85 5704073
875 BS 86 88 5762101
876 BS 89 90 5704073
877 BS 91 92 5762101
878 BS 93 93 5704073
879 BS 94 94 5762101
880 BS 95 96 5704073
881 BS 97 97 5762101
882 BS 98 98 5704073
884 RD 5704073 97 0 0
885 aaggaCTCGTCTAAGTGAAAGGCAGTAGATGTATGTAAGTCATGATGACA
886 TCATCGCtaatcAAGCCtaacaGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta
888 QA 3 97 3 97
890 RD 5762101 98 0 0
891 aagggaCTCGTCTAAGTGAAAGGCAGTAGATGTATGTAAGTCATGATGAC
892 ATCATCGCta*tcAAGCCta*caGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta
894 QA 4 98 1 98
896 CO Contig35 108 2 62 U
897 atTTTCAATCctttacaCACGTTTCTGTACTCCGATGCATGATTCCGATC
898 CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
899 TAAATTta
902  15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
903  25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
904  25 25 25 25 25 25 15 15
906 AF 5748846 U 1
907 AF 5729853 U 1
908 BS 1 6 5748846
909 BS 7 8 5729853
910 BS 9 9 5748846
911 BS 10 11 5729853
912 BS 12 12 5748846
913 BS 13 13 5729853
914 BS 14 16 5748846
915 BS 17 19 5729853
916 BS 20 21 5748846
917 BS 22 22 5729853
918 BS 23 23 5748846
919 BS 24 24 5729853
920 BS 25 25 5748846
921 BS 26 26 5729853
922 BS 27 28 5748846
923 BS 29 30 5729853
924 BS 31 33 5748846
925 BS 34 35 5729853
926 BS 36 36 5748846
927 BS 37 37 5729853
928 BS 38 38 5748846
929 BS 39 39 5729853
930 BS 40 40 5748846
931 BS 41 41 5729853
932 BS 42 43 5748846
933 BS 44 44 5729853
934 BS 45 45 5748846
935 BS 46 48 5729853
936 BS 49 49 5748846
937 BS 50 51 5729853
938 BS 52 52 5748846
939 BS 53 55 5729853
940 BS 56 57 5748846
941 BS 58 58 5729853
942 BS 59 60 5748846
943 BS 61 63 5729853
944 BS 64 68 5748846
945 BS 69 72 5729853
946 BS 73 74 5748846
947 BS 75 75 5729853
948 BS 76 76 5748846
949 BS 77 77 5729853
950 BS 78 78 5748846
951 BS 79 79 5729853
952 BS 80 80 5748846
953 BS 81 81 5729853
954 BS 82 84 5748846
955 BS 85 86 5729853
956 BS 87 89 5748846
957 BS 90 90 5729853
958 BS 91 92 5748846
959 BS 93 93 5729853
960 BS 94 94 5748846
961 BS 95 95 5729853
962 BS 96 96 5748846
963 BS 97 97 5729853
964 BS 98 99 5748846
965 BS 100 101 5729853
966 BS 102 104 5748846
967 BS 105 106 5729853
968 BS 107 107 5748846
969 BS 108 108 5729853
971 RD 5748846 108 0 0
972 atTTTCAATCctttacaCACGTTTCTGTACTCCGATGCATGATTCCGATC
973 CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
974 TAAATTta
976 QA 1 108 1 108
978 RD 5729853 108 0 0
979 atTTTCAATCcttt*caCACGTTTCTGTACTCCGATGCATGATTCCGATC
980 CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
981 TAAATTta
983 QA 1 108 1 108
985 CO Contig36 111 2 63 U
986 taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
987 ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgccttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
988 TGCtccaatcg
991  15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
992  25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
993  25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15
995 AF 5648323 U 1
996 AF 5703145 U 1
997 BS 1 1 5648323
998 BS 2 2 5703145
999 BS 3 4 5648323
1000 BS 5 5 5703145
1001 BS 6 6 5648323
1002 BS 7 8 5703145
1003 BS 9 12 5648323
1004 BS 13 13 5703145
1005 BS 14 15 5648323
1006 BS 16 16 5703145
1007 BS 17 17 5648323
1008 BS 18 18 5703145
1009 BS 19 19 5648323
1010 BS 20 20 5703145
1011 BS 21 21 5648323
1012 BS 22 22 5703145
1013 BS 23 24 5648323
1014 BS 25 25 5703145
1015 BS 26 27 5648323
1016 BS 28 29 5703145
1017 BS 30 32 5648323
1018 BS 33 34 5703145
1019 BS 35 35 5648323
1020 BS 36 36 5703145
1021 BS 37 37 5648323
1022 BS 38 38 5703145
1023 BS 39 39 5648323
1024 BS 40 40 5703145
1025 BS 41 42 5648323
1026 BS 43 43 5703145
1027 BS 44 44 5648323
1028 BS 45 45 5703145
1029 BS 46 46 5648323
1030 BS 47 50 5703145
1031 BS 51 51 5648323
1032 BS 52 55 5703145
1033 BS 56 57 5648323
1034 BS 58 60 5703145
1035 BS 61 63 5648323
1036 BS 64 65 5703145
1037 BS 66 66 5648323
1038 BS 67 67 5703145
1039 BS 68 68 5648323
1040 BS 69 69 5703145
1041 BS 70 70 5648323
1042 BS 71 72 5703145
1043 BS 73 76 5648323
1044 BS 77 78 5703145
1045 BS 79 79 5648323
1046 BS 80 82 5703145
1047 BS 83 84 5648323
1048 BS 85 86 5703145
1049 BS 87 87 5648323
1050 BS 88 90 5703145
1051 BS 91 92 5648323
1052 BS 93 93 5703145
1053 BS 94 95 5648323
1054 BS 96 96 5703145
1055 BS 97 97 5648323
1056 BS 98 99 5703145
1057 BS 100 102 5648323
1058 BS 103 104 5703145
1059 BS 105 111 5648323
1061 RD 5648323 111 0 0
1062 taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
1063 ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgccttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
1064 TGCtccaatcg
1066 QA 1 111 1 111
1068 RD 5703145 109 0 1
1069 taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
1070 ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgc*ttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
1071 TGCtcatcg
1073 QA 1 109 1 105
1076 5703145 compression phrap 74 76 080215:162048