t/data/27-contig_Newbler.ace

   1 AS 1 27
   2
   3 CO contig00001 203 27 38 U
   4 gTAGGACttga*CGTC*GgAGCt**GgATTt*AGCTC*C*CTG*AaTGTT
   5 *cGg*ATGGAAATGT*GCT*GA*CcTGg***TtGGGGA*t*Acc**a*Gg
   6 *TCGAa**GAATCtgTT*Attt**CGTGCag*ACg*AA*TTttCCcTTCg
   7 Aa*ct*GGAtGa*G*cA*Ca*TGgA*G*ATGAGg**TtCCCcATt*TTC*
   8 gTG
   9
  10 BQ
  11 8 64 64 64 64 64 64 29 5 29 29 64 64 64 64 64 10 64 64 64 22 64 8 64 64 64 11 64 64 64 64 64 64 64 64 64 64 19 64 64 64 64 0 64 19 64 64 64 64 64
  12 64 64 64 64 64 64 64 64 64 64 64 14 47 64 16 64 21 64 64 64 64 64 25 47 25 20 25 64 25 64 64 64 64 14 41 64 64 64 64 16 25 64 64 64 39 16 5 64 64 64
  13 64 64 12 12 64 64 17 64 64 64 58 23 5 64 49 7 64 64 64 21 64 8 21 21 64 64 64 29 64 29 64 35 55 64 20 64 64 19 55 64 64 64 64 64 64 9 64 11 64 64
  14 64 10 64 64 20 64 64 64 25 64 64
  15
  16 AF species2703|6185 U 102
  17 AF species2004|3290 U -18
  18 AF species2702|8138 U -3
  19 AF species2788|6026 U 122
  20 AF species3098|4869 U 117
  21 AF species1827|9888 U 171
  22 AF species2742|48 U 28
  23 AF species2011|1996 U -28
  24 AF species3089|7597 U 149
  25 AF species1961|5108 U 84
  26 AF species2011|4145 U 150
  27 AF species1667|4956 U -3
  28 AF species980|9980 U 143
  29 AF species2907|6509 U 170
  30 AF species1973|7670 U 77
  31 AF species2779|6708 U -9
  32 AF species2024|3244 U 101
  33 AF species2216|7882 U 112
  34 AF species1037|7115 U 27
  35 AF species2742|9239 U 23
  36 AF species1961|9433 U 27
  37 AF species158|7890 U 8
  38 AF species2703|5769 U 182
  39 AF species2119|1909 U 113
  40 AF species2739|2104 U 57
  41 AF species1635|5973 U 8
  42 AF species2066|9064 U 25
  43
  44 BS 1 7 species2702|8138
  45 BS 8 24 species1635|5973
  46 BS 25 25 species2702|8138
  47 BS 26 26 species1635|5973
  48 BS 27 27 species2702|8138
  49 BS 28 75 species1635|5973
  50 BS 76 76 species2739|2104
  51 BS 77 78 species1635|5973
  52 BS 79 79 species2739|2104
  53 BS 80 80 species1635|5973
  54 BS 81 81 species2739|2104
  55 BS 82 82 species1635|5973
  56 BS 83 83 species2739|2104
  57 BS 84 89 species1635|5973
  58 BS 90 91 species2739|2104
  59 BS 92 107 species1635|5973
  60 BS 108 109 species2739|2104
  61 BS 110 121 species1635|5973
  62 BS 122 122 species2742|9239
  63 BS 123 129 species1635|5973
  64 BS 130 130 species2739|2104
  65 BS 131 131 species1635|5973
  66 BS 132 132 species2739|2104
  67 BS 133 137 species1635|5973
  68 BS 138 142 species2739|2104
  69 BS 143 143 species3098|4869
  70 BS 144 159 species2739|2104
  71 BS 160 160 species2119|1909
  72 BS 161 164 species1973|7670
  73 BS 165 166 species2119|1909
  74 BS 167 175 species1973|7670
  75 BS 176 181 species2119|1909
  76 BS 182 184 species2703|5769
  77 BS 185 185 species2119|1909
  78 BS 186 191 species2703|5769
  79 BS 192 192 species2119|1909
  80 BS 193 198 species2703|5769
  81 BS 199 203 species2119|1909
  82
  83 RD species2703|6185 108 0 0
  84 TGGGGATACCAAGTCGAAGAATCGCTGATTCTTGCACTGGTATTTTCCCT
  85 CGAACTGGATAAG*CA*C*GTGGA*G*ATGAGGG*TTCCC*ATT*TTGGT
  86 GTAGTTCT
  87
  88 QA 61 97 61 97
  89 DS CHROMAT_FILE: species2703|6185 PHD_FILE: species2703|6185.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
  90
  91 RD species2004|3290 122 0 0
  92 TGTCTCCGTCCTTCTCCAGATAGGACTT*AACGTCTG*AGCTT*G*ATTT
  93 *AGCTC*C*CTG*AATGTT*CGG*ATGGAAATGT*GCT*GA*CCTGG***
  94 TTGGGGAC**ACC**A*GG*TC
  95
  96 QA 21 122 21 122
  97 DS CHROMAT_FILE: species2004|3290 PHD_FILE: species2004|3290.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
  98
  99 RD species2702|8138 125 0 0
 100 CCAGGTAGGACTTGA*CGTC*GGAGCT**GGATTT*AGCTC*C*CTG*AA
 101 TGTT*CGG*ATGGAAATGT*GCT*GA*CCTGG***TTGGGGA**GACC**
 102 A*GG*TCGAA**GAATCTGTT*ATT
 103
 104 QA 5 125 5 125
 105 DS CHROMAT_FILE: species2702|8138 PHD_FILE: species2702|8138.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 106
 107 RD species2788|6026 114 0 0
 108 TTATTTGTGCATTGGAA*TTTTCC*TTC*AAA*TTGGATGA*G*CA*C*G
 109 TGGA**TATGAGG**TTCCCCATT*TTCA*TGAAGCTCTCTACACACTCT
 110 AATGAATAATTTAG
 111
 112 QA 14 82 14 82
 113 DS CHROMAT_FILE: species2788|6026 PHD_FILE: species2788|6026.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 114
 115 RD species3098|4869 110 0 0
 116 ATCTGTTATTTTTGCACTGGAA*TTTTCC*TTC*AAA*TTGGATGA*G**
 117 AACA*TGGA**TATGCGGAGACCCATCTTCGTGAAGCTCTCTGCAGATTT
 118 TTATGAATTT
 119
 120 QA 19 65 19 65
 121 DS CHROMAT_FILE: species3098|4869 PHD_FILE: species3098|4869.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 122
 123 RD species1827|9888 104 0 0
 124 ACGTGGATATGAGGGCT*CCC*AT*CTTC*GTGAAGCTCTCTGCAGATTT
 125 TGATGTATTTTTTGTTGGTTGGGGTTTCTAGGTTTTGAAGTTGGGAGAGT
 126 GCTT
 127
 128 QA 9 33 9 33
 129 DS CHROMAT_FILE: species1827|9888 PHD_FILE: species1827|9888.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 130
 131 RD species2742|48 120 0 0
 132 CTTTTAGCTC*C*CTG*AATGTTT*GG*ATGGAAATGT*GCT*GA*CCTG
 133 G***TTGGGGA*T*A**TGA*G*ATCGAA**GAATCT*TTGATTTTTACA
 134 CTGGAATTTCCCTTCGAATT
 135
 136 QA 2 97 2 97
 137 DS CHROMAT_FILE: species2742|48 PHD_FILE: species2742|48.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 138
 139 RD species2011|1996 116 0 0
 140 CATTCCAGTGTGTCTCCGTCCTTGGTAATGTATGTTTTGA*CGTC*GGAG
 141 CT**GGATTT*AGCTC*C*CTGTA*TGTT*CGG*ATGGAAATGT*GCT*G
 142 A*CCTGG***TTGGGG
 143
 144 QA 37 116 37 116
 145 DS CHROMAT_FILE: species2011|1996 PHD_FILE: species2011|1996.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 146
 147 RD species3089|7597 112 0 0
 148 CGAA*CT*GGATGA*G*CA*CA*TGGA*G*ATGAGGGCT*CCC*AT*CTT
 149 C*GTGCAGTTCTCTGCAGATCTTGATGAATTTTTTATTTGTTGGTGTTTC
 150 TAGGTTTTGTAA
 151
 152 QA 1 55 1 55
 153 DS CHROMAT_FILE: species3089|7597 PHD_FILE: species3089|7597.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 154
 155 RD species1961|5108 110 0 0
 156 GG**A*TG***TGA*GG*TC*AAA*GAATCTGTTGTTTTGGCATTTGAAT
 157 TTTCCTTCGAACTGGATGAGAACATGCAAGTGAGGAGTCCCATTTTCATG
 158 AAGCTCTCTG
 159
 160 QA 1 31 1 31
 161 DS CHROMAT_FILE: species1961|5108 PHD_FILE: species1961|5108.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 162
 163 RD species2011|4145 109 0 0
 164 TTCGAATTGGACAAG*CA*C*GTGGA*G*ATGAGG**TTCCCCATT*TTC
 165 A*TGCAACTCTCTGCAGATCTTGATGAATTTCTTGTCTACTGGTGTGTTT
 166 AGGTTTTGT
 167
 168 QA 13 54 13 54
 169 DS CHROMAT_FILE: species2011|4145 PHD_FILE: species2011|4145.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 170
 171 RD species1667|4956 120 0 0
 172 TTTTTCCATGTATGTTTTAACATCTGTTGAGCTTTTAGCTC*C*CTG*AA
 173 TGTT*CGG*ATGGAAATGT*GCT*GATC**GGG**TTGGGGA*TG***TG
 174 A*G*ATCGAA**GAATCT*T
 175
 176 QA 33 120 33 120
 177 DS CHROMAT_FILE: species1667|4956 PHD_FILE: species1667|4956.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 178
 179 RD species980|9980 109 0 0
 180 ATTTCCCTTCGAATTGTATAAG*CA*CA*TGGA*G*ATGAGG**TTCCCC
 181 ATT*TTC*GTGTAGCTCTCTAGCTACTTTTATGTATTTTTTATTTGTTGG
 182 TGTTTGTAG
 183
 184 QA 20 61 20 61
 185 DS CHROMAT_FILE: species980|9980 PHD_FILE: species980|9980.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 186
 187 RD species2907|6509 107 0 0
 188 A*TGGA*G*ATGAGGGCT*CCC*AT*CTTC*GTGCAGCTCTCTACAGATT
 189 TTGATATATTTTTTATTTGTTGGGGTTTGTAGAGGTTTTAATTGGGAAAG
 190 TGCTTCT
 191
 192 QA 1 34 1 34
 193 DS CHROMAT_FILE: species2907|6509 PHD_FILE: species2907|6509.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 194
 195 RD species1973|7670 104 0 0
 196 CGGATGGAAATATGCTGACTGGGAAGGGGACACCAGGTCGAAGAATCTGT
 197 AATTTGTGCATTGGTATTTGCCTTCGAACTGAATGA*GT*A*CA*TGGAT
 198 ATGA
 199
 200 QA 85 99 85 99
 201 DS CHROMAT_FILE: species1973|7670 PHD_FILE: species1973|7670.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 202
 203 RD species2779|6708 124 0 0
 204 CTTTCTCGACGTAGGACTTGA*CGTC*GGAGCT**GGATTT*AGCTC*C*
 205 CTG*AATGTT*CGG*ATGGAAATGTA**TTGA*CCTGG***TTGGGGAC*
 206 *ACC**A*G*ATCGAA**GAATCT
 207
 208 QA 11 124 11 124
 209 DS CHROMAT_FILE: species2779|6708 PHD_FILE: species2779|6708.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 210
 211 RD species2024|3244 112 0 0
 212 GGGATACGAGGTCGAAGAATCTGTTATTTTTGCACTTGTATTTCCCTTCG
 213 AA*CT*GGATGA*G*CA*C*GTG*AAG*ATGAGG**TTCCCCATT*TTCA
 214 *TGAAACTCTCT
 215
 216 QA 49 103 49 103
 217 DS CHROMAT_FILE: species2024|3244 PHD_FILE: species2024|3244.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 218
 219 RD species2216|7882 110 0 0
 220 TCTGTT*ATT***CGTGCAG*ACG*AACTT**CCCTTCGAA*CT*GGATA
 221 AGAACGTGGATATGCGGAGACCCATCTTCGTGCAACTCTCTACAAATTTT
 222 GATAAATTTC
 223
 224 QA 1 49 1 49
 225 DS CHROMAT_FILE: species2216|7882 PHD_FILE: species2216|7882.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 226
 227 RD species1037|7115 119 0 0
 228 GCTTTTAGCTC*C*CTG*AATGTTT*GG*ATGGAAATGT*GCT*GATC*T
 229 GG***TTGGGGA*T*ACC**AA**ATCGAA**GAATCGTTGATTGTGGCA
 230 TTTGAATTTGCCTTCGAAC
 231
 232 QA 3 87 3 87
 233 DS CHROMAT_FILE: species1037|7115 PHD_FILE: species1037|7115.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 234
 235 RD species2742|9239 120 0 0
 236 ATGAGCTTTTAGCTC*C*CTG*AATGTTT*GG*ATGGAAATGT*GCT*GA
 237 *CCTGG***TTGGGGA*T*A**TGA*G*ATCGAA**GAATCT*TTGATTT
 238 TTACACTGGAATTTCCCTTC
 239
 240 QA 7 102 7 102
 241 DS CHROMAT_FILE: species2742|9239 PHD_FILE: species2742|9239.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 242
 243 RD species1961|9433 119 0 0
 244 GCTTTTAGCTC*C*CTG*AATGTTT*GG*ATGGAAATGT*GCT*GA*CCT
 245 G**C*TTGGGGA*TG***TGA*GG*TC*AAA*GAATCTGTTGTTTTGGCA
 246 TTTGAATTTTCCTTCGAAC
 247
 248 QA 3 88 3 88
 249 DS CHROMAT_FILE: species1961|9433 PHD_FILE: species1961|9433.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 250
 251 RD species158|7890 125 0 0
 252 T*GA*CGTC*GGAGCT**GGATTT*AGCTC**TCTG*AATGTTT*GG*AT
 253 GGAAATGT*GCT*GA*CCTGG***TTGGGGA*T*ACC**A*GG*TCGAA*
 254 T*AATCTGATATTTGTGATCTGAAC
 255
 256 QA 1 108 1 108
 257 DS CHROMAT_FILE: species158|7890 PHD_FILE: species158|7890.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 258
 259 RD species2703|5769 103 0 0
 260 AGGG*TTCCC*ATT*TTGGTGTAGTTCTCGACAGATTTTGATGTATTTTT
 261 TGTTTGTTGGTGTATCTAGGGCTTTTATTTTTTCAAGGGTTTCTTCTTTG
 262 GCG
 263
 264 QA 1 17 1 17
 265 DS CHROMAT_FILE: species2703|5769 PHD_FILE: species2703|5769.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 266
 267 RD species2119|1909 110 0 0
 268 AATTAATGGCATTTGCGTATGAATCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTTGA
 269 *G*CA*CA*TGGA*G*ATGAGG**TTCCCCAT*CTTC*GTGTAATTCTCT
 270 GGAAACCCTA
 271
 272 QA 48 91 48 91
 273 DS CHROMAT_FILE: species2119|1909 PHD_FILE: species2119|1909.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 274
 275 RD species2739|2104 124 0 0
 276 TGGAAATGT*GCT*GA*CCTGG***TTGGGGA*T*ACC**A*GG*TCGAA
 277 **GAATCTGTT*ATT***CGTGCAG*ACG*AA*TTT*CCCTTCGAA*CT*
 278 GGAGTAACACGTGGAGATGAGGGC
 279
 280 QA 1 103 1 103
 281 DS CHROMAT_FILE: species2739|2104 PHD_FILE: species2739|2104.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 282
 283 RD species1635|5973 130 0 0
 284 TTGA*CGTC*GGAGCT*CG*ATTT*AGCTC*C*CTG*AATGTT*CGG*AT
 285 GGAAATGT*GCT*GA*CC*GGG*AT*GGGGA**GACC**A*GG*TCGAA*
 286 T*AATCTGTT*ATT***CGTGC*GGACG*A
 287
 288 QA 1 130 1 130
 289 DS CHROMAT_FILE: species1635|5973 PHD_FILE: species1635|5973.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000
 290
 291 RD species2066|9064 119 0 0
 292 GAGCTTTTAGC*CGC*CTG*AATGTT**GGGATGGAAATGT*GCT*GA*C
 293 CTG**C*TTGGGGA*T*AC*T*A*GG*TCGAA**GAATCGTTGATTTGTG
 294 CAGTTGTATTTCCCCTCGA
 295
 296 QA 5 89 5 89
 297 DS CHROMAT_FILE: species2066|9064 PHD_FILE: species2066|9064.phd.1 TIME: Thu Jul 27 12:33:48 2000