maint: remove Travis stuff which has been replaced with Github actions (#325)
[bioperl-live.git] / t / data / map_hem / HEM14-HEM15.fa
blobf7017c3914c1b237435da349664e9731e04a2059
1 >SGD_Scer_YER014W HEM14 "Protoporphyrinogen oxidase, a mitochondrial enzyme that catalyzes the seventh step in the heme biosynthetic pathway, converting protoporphyrinogen IX to protoporphyrin IX"
2 TATACAAGCTCTTTTTGGCGTTCTCAATTGCACTTTACTCGATATGTTTGAATTGGTGTT
3 CTTCGCGAATATCTCTATTGTTCTCTCTATTATACTATTTCTTTTTTTGAATACTCCGCG
4 ACTCCGAAGCAACAAAGTGTCGAAGGCAAGTTCAAAGGCGTTTTGTAACTAAACGAGCAA
5 TGGCAGCTTTCAATTAAAGAAAGGTTAGCGTTACTCTGTGATTTTTTTCATGTAAAAATT
6 CTCAAGAGAGATAAAGTTGTTAAAAAATTAAATATAGGTCTATAAAACTCGATAATTATA
7 ATGCATAAAAAGCTAACAATGT
8 >MIT_Spar_c425_6072 YER014W 5' untranslated region, Contig c425 34016 - 36015, 2000 bp (revcom)
9 TATTCGAGCCCTTTCCCGCGTTCCCAATTGTACCTTCCTCGATAGGATTGAATTGGTATC
10 CTTCGCGGATCTCTCTATTGTTCTCTCTATTATTCTTTTTCTTTTTTAAATACTCCGCGA
11 CTCCGAAGCAACAAAATGTCGAAGGCAAGATGAAAGGCGTTTTGCAACTAAACGAGTAAT
12 GGCAGCTTTTAATTAAATAACGGTCAGCATTACTCTATAACTTTTCACATAAAATCCTCG
13 AAGAAGGAAAAATTGATAATCAATTTACCGAAGAATGAATATAGGTCTATAAAAATTCAA
14 TAATTATAGATGCATAAAAAGC
15 >MIT_Smik_c283_5928 YER014W 5' untranslated region, Contig c283 42606 - 44605, 2000 bp (revcom)
16 TATTGAAGCTCTCTCCACTATTTCTTTAATCGCGCTATACTAGATATGGTTAAACTGCTA
17 TCTTTTGCAAATCCCTCTATTGTTCTTTCCATTACTCTTTTCTTTTTTAAATACGGACTC
18 CGAAGCAACAAGGTCGAAGGCAAGCTGAAAGGCATTTTACAACTAAACGAGCAATGGTAG
19 CTTTTGATTGAATAAATTATTATCATTATTTTGTTATTTGTCCCACGAAATTCTCGTTGA
20 AAGCAAGGTTCGTAAGGATTTATCAAATGTTAAATATAGATCTATAAAAATTGAATAGTA
21 ATAATAACAAGGGATGGTGTTA
22 >MIT_Sbay_c84_6418 YER014W 5' untranslated region, Contig c84 10802 - 12801(revcom), 2000 bp (revcom)
23 TGTCGAAGTTCTCCTTTATTCCGCTGTTTCTTACGGAATCCAGCGAGACTGTTGTCCTTT
24 CGCATCCTTCTATTGTTCTTCCTTATTGTTCTCGTTTTTTTTATACTCTGCGACTCCGAA
25 ACAACAAAATCTCGAAGGCAAGCTAAGGTAAAAATATTCACCACTAAACGAGCAATGACA
26 GTTATATTCAAACGTCATTCTACTTTTTTGCCAGAGAAGTCCTCACTGGAGACGAAGTTG
27 GTAAATGCTTTATTTATATTAAACGTAGATCTATAAAGTTTAAATAGTTTATAATGCTTA
28 ACAAGGGACGATGTTATCTCTT
29 >SGD_Scer_YOR176W HEM15 "Ferrochelatase, a mitochondrial inner membrane protein, catalyzes the insertion of ferrous iron into protoporphyrin IX, the eighth and final step in the heme biosynthetic pathway; Yfh1p mediates the use of iron by Hem15p"
30 TCTTTAAACGTTCTTTTTTTTACTGCTAAATTTGTCCAAATAGCAGGTATGTGTTAAATA
31 TTTCTGTACTTCTTGTAAACCGACTCAAGTGGAACACGAGAATTTACGCTTGTTTGGTGT
32 CAAGCCAAGAGTGACCTTGACCGACCAAAAGTATTCCTTCGCGTCCTCCTTCTTCAATCC
33 CATATCCCCTACGAAAAAAAGCAGCATGAGAAAACGAAGGGCAGCAACTCCTTCGTCATA
34 TAAGGCTTACGGTGACCATTGAAGATTGGGCATGTCTAACGGCTATTGCCAGCGGAGATG
35 TTTCAAGGCATCCTACACATGCTACATATTTGTAATTATTTTACTGAGTTTGTGTATATA
36 AAAAACTTTTTTAAAAAAAAAAAATGGCCAGCATCCTCTTTCATGTAAAGCTGTTGAACC
37 TTCCTGAAATTTACTTCTAAAATTGTTCAGTAAAACTGCTTGTTAAAAGTGCGAAGAGTT
38 CTTTTTTAGCTTTTTTTGTCCTGCTGTTGAGCTGTTTTGCTTTACTGTTCAACAAAACAT
39 TGAAGATCTTTCACATTGCGCGTCGAAACCACAAACCGTCGAAAACAATGGTCATCTAAA
40 TAAAGGGTTCTTATTAAACAGATTTAAAGCCAAGGACAAAATACAGGCACAGGTCAAGCA
41 AGAAGACAAACCGCATACGCCAAGACAAACCGTGGTGATTTAATTCTGCTGCTGATCGCT
42 TCCAACA
43 >MIT_Spar_c278_20970 YOR176W 5' untranslated region, Contig c278 32746 - 34745, 2000 bp (revcom)
44 TCTTCAAACGTTCTTTTCCTACTACTAAGCTTTTCAATAAATAGCGGGTATATGCTAAAT
45 ACTTCTTTGCTTCTTGTACGACCTACTTAATTGAAATACGGATATTTTTGCTTGCTTGGT
46 GCCAAACCAAGAGTGACCTTGACCGACTAAAAGTATTCCTTCGCGTCCTCCTTCTTCAAT
47 CCCATATCCCCTACTGAAAAAAGCAGCGTGCGAAAATGAAGGGCAGCAACTCCTTCGTCA
48 TATAAGGCTTAGGTAATCTTTCAAGGTCAGGTATATCCAGCTGTCGTTACGAGTAGAGAT
49 ATTTCAAGCTGTCCTGCACATGCTACATATTTGTGATTATTTTTATTGAGTTGCGTATAT
50 AAAAAAACAATCTAAAAAAAAAAAAAATGGCCAGCATCTTCTTCCATGTAAAGCTGTTGA
51 ACCTTGCTAAAATCTATTACTATAATTGTTCAGTAAAGTTGCTTGTTAAAAATGCGAAGA
52 GTCTTTTTTAGCTTTTTTTGCCCTGCTGTTGAGCTGTTTTGCTTCACTGTTCAACAAAAC
53 AGTGAAGATCTTTCGAATTGCGCGTCGAAACCACAAACCGTCGAAAATAATGGTCATCTA
54 AATAAAGGGTTCTTATTTGAACAGATTTAAAGCTCAAAGACACGATACAGGCACAGGTCC
55 AGAAAGAATACAAAACGCAAACGCCAAGACAAATTGTGGTAATTTCATTCTGCTGCTGAT
56 CACTGCC
57 >MIT_Smik_c935_20455 YOR176W 5' untranslated region, Contig c935 1803 - 3802(revcom), 2000 bp (revcom)
58 TCTTGAATTGCAATTTTCTACTACTGAAGTTACCAACAATTAGCAAATATGTGATGAGTC
59 CTTTTTACGTTCTTGTATAACCTAAGTTAAATACAAAGGTTTATGCTCCTTTAATGATCA
60 GACCAACAGTGATCTTGGCCGACCAAAAGACTCCTTCGCGTCCTCCTTCTTCAAGTCTCA
61 TATCCCCTACCAGAAAAAGTAGCAGGCGAAAATAAAGAGCAACTGCTCCCCCCCATATAG
62 AGCTTACCATAATTTCTCAAGGAAAGGTATCTCCAGTTGTCGTAAAGAATAAAGAAGTTT
63 CAACGTGTCCTGCATGTTCTACAAATTTGCAATTGACTTTACTAAGTTGCATATATAAAA
64 CTTGTATTAGATAAGTTAGCCAGCATTTTCATTCAAGCTAAGATGTTGAATATGCCAAAG
65 CACATTGCTGAAATTAATCAGTAAAGCTGCTTGCTGAAAGTGGAAATATTTTCAGCTTTT
66 TTTGCTCTGCTGTTGAGCTGTTTTACTTCATTGTTCAACAAAACAATAGAGTTCTCTCCA
67 ATTGCGCGTCAAAACCACAAACCGTCGAAAATAATGATCATCTAAATAAAAGAGTTCACG
68 TTTTCACATATTTAAAGTTGAAATACTCCATACAGGCACAGGTCTAACAAGAAGACAACG
69 CATTCGATAAAACTAATCGTGGTAATTTTTATATCGCTGCTAGCCACTACCAACAATGTA
70 CAATTTT
71 >WashU_Skud_Contig2050.4 YOR176W 5' untranslated region, Contig c2050 12271 - 14270(revcom), 2000 bp (revcom)
72 TCTTAGTTTATAGCTTTTCTACTACTCTGGTCATAAACGAACAGAAGATAAGCAAGAAAT
73 CTTTTTTTCCTTCTTTTACGGTCTATTCAAGTGAAGCACGGGGATTCCCGCTTGTTTAAT
74 AATCAGACCAACAATGATATTGACCGACCAAAAGAAGTATTCCTTCGCGTGCTTCTCCTT
75 TCTGTGTCAAATCCCCTACTGAAAAAGCAGCATTGGGAAAGGAACAGCAGCTTCTCCTTC
76 GTCGCAGAGAGCTCGCGGTAGCATTTCATTGTCAGGTATTTATGATATTTGCTAAGAATA
77 ATTAAAATGTCTTCAGGTCTTGCACATACTCCTACATATTTGTAAGTATTTTACTGATTT
78 GAGTATATAAAAGCCGTACTAAAACTAACCAGCACCTGTAGCAAGGTGCAAAATGTTGAA
79 CCTTTCCGAAATTTATTGCCAGAAACCAAGAGCTAAAAGTGCTTGGTAAAAGTGAAAAGA
80 CTCTTTTTCAGCTGTTTTTTGTTCTGCTGTTGAGCTGTTTTGTTCCATCTGTTCAACAAA
81 ACAGCTTCACTGGATCTTTCAAAGTGCGCGTCGAAACCACAAACCGTCGAAAATATTGAT
82 CATCTAAATAAAGGGTTCTTATTTGCACAGTTTCGCATTGAAATATTCCATTCAGGCACA
83 GATCAACAAGAAGACAAAAAGGTATTCGAGAAGACTAATTGTGGTATTTTTACTTTGCTG
84 CTGACCA
85 >WashU_Sbay_Contig480.2 YOR176W 5' untranslated region, Contig c480 3444 - 5443(revcom), 2000 bp (revcom)
86 TTTCAGGGAAGCACCATGTGCACGAATTGTTCTAGAAAGCATTTTTGGTTCGTAAATTCT
87 CTACAACTGAACTTATTAACAAATAGCAAACAGAGAAGAAAATTTTTTTTTTCCTTCTTG
88 TATGGTCAGTTAGTTGAAAACACGGAGATTTTCACTTGTTTAGTAAGCAGAGCCATAATG
89 CTCTTGACCGACCAAAAGAAGTATTCCTACGCGAGCTCCCTCTTCAAGTGCCAAATCCCC
90 TACTGAAAAAAGCAACATGAGAAGCAAAGAGATGCCTCTCGCCATGCAGGGCTTGCGGTC
91 ATGTTTTCTACGTTCAATTGATTTTGTTACAGCTGAAAGATGTTTATAAAACTGTCTTGC
92 ATATGCTCTATTTACTTGTAAACAATTTTATTAAGTTGCGTATATATGATCGTACTAAAA
93 ATTGGCTGGCGCGTTCTCCAGGCAGAGTTGGTTGAACCTTGCTCGAATTGATAGCTCAAA
94 GTGGAGAGACTCTTTTTTAGCTGTTTTTTGTTCTGCTGTTGAGCTGTTTTGCTCCACCTG
95 TTCAACAAAATGGCAGAGATCTTTCGAAGTGCGCGTCGAAACCACAAACCATCAAAAATA
96 TCGACCATCTAAATAAAGGGTTCTTGTTTGAATAAATATCAGGCGAAGCTCTTCATACAG
97 GCACAGGTCAGATAAGAAGACAATTCGAATTCGAGAAGGATATTCGTGGTATCTTTAATC
98 TGCTGCT