fix deprecated usage warnings for perl 5.16
[bioperl-live.git] / t / data / AF305198.gb
blob3b140f08fcb1384f38b7eac958e429204e61a338
1 LOCUS       AF305198                1744 bp    DNA     linear   BCT 18-DEC-2000
2 DEFINITION  Virginia creeper phytoplasma 16S ribosomal RNA gene, partial
3             sequence; and tRNA-Ile gene, complete sequence.
4 ACCESSION   AF305198
5 VERSION     AF305198.1  GI:11878216
6 KEYWORDS    .
7 SOURCE      Virginia creeper phytoplasma
8   ORGANISM  Virginia creeper phytoplasma
9             Bacteria; Firmicutes; Mollicutes; Acholeplasmatales;
10             Acholeplasmataceae; Candidatus Phytoplasma; 16SrV (Elm yellows
11             group).
12 REFERENCE   1  (bases 1 to 1744)
13   AUTHORS   Harrison,N.A., Griffiths,H.M., Carpio,M.L. and Richardson,P.A.
14   TITLE     Detection of an Elm yellows group (16SrV) phytoplasma associated
15             with Virginia creeper plants in southern Florida
16   JOURNAL   Unpublished
17 REFERENCE   2  (bases 1 to 1744)
18   AUTHORS   Griffiths,H.M., Harrison,N.A., Carpio,M.L. and Richardson,P.A.
19   TITLE     Direct Submission
20   JOURNAL   Submitted (13-SEP-2000) Research and Education Center, University
21             of Florida, 3205 College Avenue, Fort Lauderdale, FL 33314-7799,
22             USA
23 FEATURES             Location/Qualifiers
24      source          1..1744
25                      /organism="Virginia creeper phytoplasma"
26                      /mol_type="genomic DNA"
27                      /strain="VC-Fl"
28                      /db_xref="taxon:145578"
29      rRNA            <1..1491
30                      /product="16S ribosomal RNA"
31      tRNA            1599..1675
32                      /product="tRNA-Ile"
33 ORIGIN      
34         1 gcctaataca tgcaagtcga acggagaccc ttcaaaaggt cttagtggcg aacgggtgag
35        61 taacacgtaa gtaacctacc tttaagacga ggataacaat cggaaacggt tgctaagact
36       121 ggataggaaa cagaaaggca tctttttgtt tttaaaagac cttcttcgga gggtatgctt
37       181 aaagaggggc ttgcgccaca ttagttagtt ggtgaggtaa aggcttacca agattatgat
38       241 gtgtagctgg actgagaggt tgaacagcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct
39       301 acgggaggca gcagtaggga attttcggca atggaggaaa ctctgaccga gcgacgccgc
40       361 gtgaacgatg aagtatttcg gtatgtaaag ttcttttatt gaagaagaaa aaatagtgga
41       421 aaaactatct tgacgttatt caatgaataa gccccggcta actatgtgcc agcagccgcg
42       481 gtaagacata gggggcgagc gttatccgga attattgggc gtaaagggtg cgtaggcggt
43       541 tagataagtc tataatttaa tttcagtgct taacgctgtc ttgttataga aactgtcttg
44       601 actagagtga gatagaggca agcggaattc catgtgtagc ggtaaaatgt gtaaatatat
45       661 ggaggaacac cagaagcgta ggcggcttgc tgggtcttta ctgacgctga ggcacgaaag
46       721 cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga tgagtactaa
47       781 gtgtcggggg taactcggta ctgaagttaa cacattaagt actccgcctg agtagtacgt
48       841 acgcaagtat gaaacttaaa ggaattgacg ggactccgca caagcggtgg atcatgttgt
49       901 ttaattcgaa gatacacgaa aaaccttacc aggtcttgac atactctgca aagctataga
50       961 aatatagtgg aggttatcag ggatacaggt ggtgcatggt tgtcgtcagt tcgtgtcgtg
51      1021 agatgttagg ttaagtccta aaacgaacgc aacccctgtc gctagttgcc agcacgtaat
52      1081 ggtggggact ttagcgagac tgccaattaa acattggagg aaggtgggga taacgtcaaa
53      1141 tcatcatgcc ccttatgatc tgggctacaa acgtgataca atggctatta caaagagtag
54      1201 ctgaaacgcg agtttttagc caatctcaaa aaggtagtct cagtacggat tgaagtctgc
55      1261 aactcgactt tatgaagctg gaatcgctag taatcgcgaa tcagcatgtc gcggtgaata
56      1321 cgttctcggg gtttgtacac accgcccgtc aaaccacgaa agttagcaat acccgaaagc
57      1381 agtggcttaa cttcgcaaga agagggagct gtctaaggta gggttgatga ttggggttaa
58      1441 gtcgtaacaa ggtatcctta ccggaaggtg aggatggatc acctcctttc taaggacata
59      1501 catataaaaa tcatcatctt cagttttgaa agacttaggt taaaatataa gtttttcttt
60      1561 ttataaaaaa aagtgtttct cttatataaa agaccaaagg gcctatagct cagttggtta
61      1621 gagcacacgc ctgataagcg tgaggtcggt ggttcgagtc cacttaggcc caccaatttt
62      1681 atatcaggaa aatatttact tcgaagaaag ttctttgaaa agtagataaa catgatttgc
63      1741 ttaa