t/data/SPAN_Family4nl.nex

   1 #NEXUS
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   5         Chlamydomonas_reinhardtii_AAB04944.1    Trypanosoma_cruzi_AAB39949.1    Caenorhabditis_elegans_AAB53822.1       Mus_musculus_AAB60902.1 Saccharomyces_cerevisiae_AAB68939.1     Babesia_bovis_AAB69755.1        Candida_albicans_AAB86583.1     Pneumocystis_carinii_AAC24764.1 Penicillium_chrysogenum_AAC36585.1      Tritrichomonas_foetus_AAC47734.1        Tritrichomonas_foetus_AAC47735.1        Trichomonas_vaginalis_AAC48291.1        Toxoplasma_gondii_AAC63943.1    Neurospora_crassa_AAD28503.1    Arabidopsis_thaliana_AAF01529.1 Schizosaccharomyces_pombe_AAF19051.1    Drosophila_melanogaster_AAF57955.1      Oryza_sativa_BAA92737.1 Arabidopsis_thaliana_BAA97372.1 Arabidopsis_thaliana_BAB11186.1 Escherichia_coli_CAA27580.1     Rattus_norvegicus_CAA39937.1    Entamoeba_histolytica_CAA50204.1        Onchocerca_volvulus_CAA57658.1  Candida_sp_CAA72335.1   Caenorhabditis_elegans_CAB02913.1       Arabidopsis_thaliana_CAB87434.1;
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  12 Chlamydomonas_reinhardtii_AAB04944.1    ???atggccctcgcgatgaaggctcaggcttccagcctggtggctggc---------------------------cagcgccgcgctgtgcgccccgcttcgggccgtcgcgctgtgatcactcgc------------------------gctgctctggagctgaagtctcccccctacgctctggatgctctggagccccac---atgagcaagcagaccctggagttccactggggcaagcaccaccgcgcctacgtggataacatgaacaagcaggtcgctggcactccc---ctggac---------------------------ggcaagtcgctggaggagatcgtcctggccagctggaacaatggccag------cccaccccggtgttcaacaacgccgctcaggtctggaaccacactttcttctgggagagcatgaagccc---------aacggtggcggtgcccccaccggc---------gcgctggctgaggccatcacccgcgacttcggcagcctggacaagttcaaggaggagttcaagcaggctggcatgacccagttcggctctggctgggcctggctgaacgccgacaag------------------------------------------------acc------ggcaagctgtcgatcagcaagtcgcccaacgccgtgaaccccgtggtggag------------------ggcaagacccccatcctgactgtcgatgtgtgggagcacgcctactacattgacgtgcagaaccgccgccccgactacatcaccaccttcatggagaagctgatcaactgggacgccgttgctcagcgctacgcccgtgccaccaag??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  13 Trypanosoma_cruzi_AAB39949.1    ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atggtcttcagcattcctccgctcccatggggctacgatgggcttgcggcaaaaggcctctcaaagcagcaggtgacgctccactacgacaaacaccatcaggggtatgtgacgaaactcaacgccgcggcgcagacaaactccgcgcttgca---------------------------acgaaaagcatcgaggaaatcatcaggacggag---aaaggc------------------cccatattcaaccttgcggcgcagatttttaaccacacgttctactgggagagcatgtgtcct---------aatggcggtggcgagccgacggga---------aaagttgccgacgagatcaacgcttcatttggcagttttgcgaagttcaaggaggagtttacaaacgtggctgtgggccactttggctcgggtttggcgtggcttgtgaaggacacc---------------------------------------------aattcc------ggcaaactgaaagtctaccagacgcatgacgcgggatgtccactgacagagccc---------------aacttgaagcctctccttacatgcgatgtatgggagcatgcgtactacgtggactacaagaacgaccgtgcggcatatgtgcagaccttttggaac---gttgtcaactgg------------aagaacgtggaacggcaactt?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  14 Caenorhabditis_elegans_AAB53822.1       ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgctgcaatctactgctcgcactgcttcaaagcttgttcaaccggttgcgggagttctcgccgtccgc------tccaagcacactctcccagatctcccattcgactatgcagatttggaacctgta---atcagccatgaaatcatgcagcttcatcatcaaaagcatcatgccacctacgtgaacaatctcaatcagatcgaggagaaacttcacgaggctgtttcg---------------------aaagggaatctaaaagaagcaattgctctccaacca---------------------------gcgctgaaattcaatggtggtggacacatcaatcattctatcttctggaccaacttggct------------aaggatggtggagaaccttcaaag---------gagctgatggacactattaagcgcgacttcggttccctggataacttgcaaaaacgtctttctgacatcactattgcggttcaaggctctggctggggatggttgggatattgcaag---------------------------------------------aaagac------aaaatcttgaagatcgccacctgtgcaaaccaggat---cctttggaagga---------------------atggtcccactttttggaattgacgtttgggagcacgcctactacttgcagtacaaaaatgtccgcccagactatgtccatgctatttggaag---attgccaactggaagaatatcagcgagagatttgccaatgctcgacaa??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  15 Mus_musculus_AAB60902.1 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgttgtgtcgggcggcgtgcagcacgggcaggaggctgggccctgtggccggtgccgcgggctcccgg------cacaagcacagcctcccagacctgccttacgactatggcgcgctggagccacac---attaacgcgcagatcatgcagctgcaccacagcaagcaccatgcggcctacgtgaacaacctcaacgccaccgaggagaagtaccacgaggctctggcc---------------------aagggagatgttacaactcaggtcgctcttcagcct---------------------------gcactgaagttcaatggtgggggacatattaatcacaccattttctggacaaacctgagccct---------aagggtggtggagaacctaaagga---------gagttgctggaggctatcaagcgtgactttgggtcttttgagaagtttaaggagaagctgacagccatgtctgtgggagtccaaggttcaggctggggctggcttggcttcaataag---------------------------------------------gagcaa------ggtcgcttacagattgctgcctgctctaatcaggac---ccattgcaaggaacaacaggc------------cttattccgctgctggggattgacgtgtgggagcacgcttactaccttcagtataaaaacgtcagacctgactatctgaaagctatttggaat---gtaatcaactgggagaatgttactgaaagatacacagcttgcaagaag??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  16 Saccharomyces_cerevisiae_AAB68939.1     ?????????????????????????????????????????????atgttc---------------------gcgaaaacagcagctgctaatttaaccaagaagggtggtttgtcattgctctccacc---acagcaaggaga------accaaagtcaccttgccagacttgaagtgggacttcggtgcattggaaccttat---atctccggtcaaatcaacgaattgcattacaccaagcaccatcaaacttatgtgaacggattcaacactgctgttgaccaattccaagaactctcagatcttctggccaaggagccctctcccgcaaacgcaagaaaaatgattgctatccaacaa---------------------------aacatcaagttccatggcggtggtttcacaaaccactgtctattctgggaaaacctggctccagagtcg---cagggcggtggtgaaccacccaccggc------gctttggcaaaggcaatcgacgagcagtttggcagtctggacgagctgattaagttgaccaacacaaagctagcaggcgtgcagggctccggatgggccttcattgtgaaaaacctc---------------------------------------------tctaat---ggaggcaagctggacgttgttcaaacctacaaccaggat---accgtcacaggccca------------------ctagttcctctagttgccattgacgcctgggaacacgcctactacttgcagtaccaaaacaagaaagccgactacttcaaagccatttggaat---gtggtcaactggaaagaagcatccagaagattcgatgctggcaagatc??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  17 Babesia_bovis_AAB69755.1        ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atggccttcaaactaccagcgctcccttacggcatgagggaactcatccctcac---atcagcgaggaaaccttgagcttccactacggcaaacaccatgcaggctacgtcaacaaactaaacagtctcatcaagggc---acacctatggaa---------------------------tcatgcactatcgaagagttgatactcggacaa---accggt------------------gccgtattcaacaacgcagcacaaatatggaaccacaccttctactggaactccatgggacct---------aactgtggaggcgagcccaccggt---------cccatccgcaagaagatcgaggaaaagttcggttctttcagcgcattcaagaccgatttctctaaccttctcgcagggcatttcggatccggttggggatggttggtgctaaaggat---------------------------------------------gatggc---------acagctgatattgtccaaacacatgatgcaggatcaccattaaaagagaat---------------ctagggcgcccactactttgctgtgatgtctgggagcatgcttactacattgactacaagaatgaccgtttgagctacattaacagctggtggaat---cttgtcaactgggacttcgccaataagaacctcgaagctcccttcaagtggtct????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  18 Candida_albicans_AAB86583.1     ?????????????????????????????????????????????atgttttctatcagatcatcatctcgtgttttattaaaggcttcttccgcaaccacccgtgctactttgaacgccgctgcttccaagactttcactaga------tctaaatatagtttaccagaattggactatgaattctccgctactgaaccatac---atttctggtcaaataaacgaaattcactacactaaacatcaccaaacttatgttaacaaccttaatgcttcaattgaacaagccgttgaagccaaatct---------------------aaaggtgaagttaaaaaattggttgccttagaaaaa---------------------------gccatcaatttcaacggtggtggttacctcaatcattgtttgtggtggaaaaacttggctcctgtctct---caaggtggtggtcaaccaccaagtgaagattccaaattaggtaaacaaatcgtcaaacaatttggttctttggataaattgattgaaatcaccaatggcaaattggctggtattcaaggttctggatgggcttttattgttaaaaacaaa---------------------------------------------gccaat---ggtgatactattgatgtcatcaccactgctaaccaagat---actgttactgatccaaac---------------ttggttccattgattgctattgatgcttgggaacatgcttattatttgcaataccaaaatgttaaagctgattacttcaagaacctttggcat---gttatcaactggaaggaagctgaaagaagatttgaattt???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  19 Pneumocystis_carinii_AAC24764.1 ????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgttaaagtcatttagagatttggttttcaaaaaaactattaaaaactctcgtttt------ttttctcat------tcaaaacatgttttaccaagtcttccttatgattatcaggcattagaaccatat---ctttcagcagatttaattgagcttcattataatcaacatcatcgggcatatgttacaaatttaaataagacgatagagaaatattatgagggaaatgaa---------------tcatcattagattcgtttattaaccggttaaatcttttaaca---------------------------tctataaaattttttgcaggtggtcatattaatcattcattatattgggaaaatcttcttcctaataaa---caaggaggcggggaaataattaatgga------cctttagtagaagctattaagaaagaatggaaaagtgtcgatgaatttattcgtatatttaatatgcaattggcaggaattcaaggaagtggatgggcatggcttgtaaaatcg------------------------------------------------cctttt---agtcaacgtctaagtattcaaataacaatgaatcaagat---gttgtgacacagggt---------------------aaagttattcttggaatcgatgcatgggaacattcatattatgttcaatatttaaataataaaacaaaatattttgaaaatatatggaat---gtgatcaattggaaagttatgaatcaacgatttgagcaa???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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  22 Tritrichomonas_foetus_AAC47735.1        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgttcagcatcgaaccagtttcattcttagagtcaggacttccaaacttc---ctcacaccacacgctgtccagatccacgttacaaagcaccaccaaggctacgtcgacatggccaacaaaattgtcccagaaagcgaa---ttcaag---------------------------ggcaaatccgttgaagaaatcattcaaaatgcttcaggt---------------------ccagtcttcaataacgtcgcccagcacttcaatcacagctttttctggaaatgtttgacagca---------acaacacaagaagttcca---gcc---------gccgttgcctcgttcctttcaaagcatttcgaaagcgtcgataacttcaaggcccagttcgtccaaaaggcatcaacagttttcggaagcggatggtgctatcttgccgtcaacaag------------------------------------------------gat------ggctcagtttcaatcaaccaatactcaaacgctctcaatccagtaaaggat------------------ggcggtgttccactcctttgcgttgacacatgggagcacgcctggtatatcgattatgaaaaccgcaaggccgaatacttcaacaaattctggggt---gttgtcaactggaactttgttgaagaaaaccttaagaaagccaaattaatc???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  23 Trichomonas_vaginalis_AAC48291.1        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgttcacaatggagcatcctgcctacttgaagactggtcttccaggcttc---ctcacacagcacgctgtcgaggtccatgttacaaagcaccatcagtcctacattgatacagctaacaagcttatcgttggctctggc---ttcgaa---------------------------ggcaagccaattgaagaaatcatccaaaaggctcagggc---------------------ccactcttcaacaacgttgcccagcacttcaaccactccttcttctggaagtccctctccgct---------gagaaggttgctgttcca---gct---------catgttgctgagctcctcaagaagaacttcggctctgtcgagaagttccaggaaacattcacagctaaggcttcaacagtcttcggctctggctgggcttacctttacaagacaaag------------------------------------------------gac------ggcaagcttgagatcggccagtactccaacgctgctaacccagtcaaggat------------------ggccttacaccaattctcacagtcgatacatgggaacatgcttggtacatcgactacgagaacagaaaggctgagtacttcaagaactactggaac---cacgtcaactggaactttgttgagcagaacttaaaggctgctggtttg??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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  27 Schizosaccharomyces_pombe_AAF19051.1    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????atgcttcgctttttgtct------aagaactctgtagccgctattaggaacgtctcaattgccaggggagttcat------actaaggctactcttccccctttaccttatgcttacaatgcacttgaacctgct---ttgtcggaaacgattatgaagttacatcatgacaagcatcaccaaacatatgttaacaacttgaatgccgctcaggagaagctggccgatcccaac---------------------------ctcgatttggagggagaggttgcccttcaagct---------------------------gctattaaattcaatggcggtggtcacatcaatcattctctcttttggaagattttagcacctcaaaag---gaaggtggtggcaaacccgtcacc---tctggatctttacataaggctataacctctaaatggggttctttggaggatttccagaaggaaatgaatgccgccttagctagcatccaaggtagtggttgggcatggctaatcgtggataaa---------------------------------------------gacggt------agt---ctccgtattactactactgctaaccaagac---acgattgtcaagtccaag---------------------cccattattggaattgatgcttgggaacatgcctactatcctcaatacgagaatcgtaaggccgaatactttaaagctatttggaat---gtgattaattggaaagaggccgagtctcgttattccaaccgt????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  28 Drosophila_melanogaster_AAF57955.1      ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgttcgtggcccgtaaaatttcgcaaactgcaagc------ctggcggtgcgt------ggcaagcacaccctaccgaagctgccctacgactatgccgccctggagcctatc---atctgccgggagatcatggagctgcatcaccagaagcaccaccagacctacgtcaacaatctaaatgccgccgaggagcagctggaggaggccaagtcg---------------------aagagcgacaccaccaagctgattcagctggctcct---------------------------gccctgcgtttcaatggcggtggccacatcaaccacaccatcttctggcagaacctctcg------------cccaacaagacccagcccagcgat---------gatctgaagaaggccatcgagtcgcagtggaagagcctcgaggagttcaaaaaggagctgaccacgctgaccgtggcggtccagggctccggctggggctggctgggcttcaacaag---------------------------------------------aagtcg------ggcaaactgcaactggccgccctgcccaaccaggat---cccctggaggcctccaccggc------------ctgatcccgctcttcggcatcgatgtctgggagcacgcctactatctgcagtacaagaacgtgcgtccctcctacgtggaggccatctgggac---atcgccaactgggatgacatctcgtgccgcttccaggaggccaagaagctcggttgc?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  29 Oryza_sativa_BAA92737.1 ???atggatgaggatgctgaagcaaatggt------------------------------------------------------gatgagtcgtcaggcactgatgaagatgcttctgtctcc------------------------------tggatagagcagcagcctcttccttatccttcagatgccctagagccatac---atcagcaaggagacggtggaacagcactggggagttcatcagaacattcacgtcgagaggctcaatggcatgattggtggcagtgag---tgggag---------------------------gggatgtcgctggggcagatgatgctatcctccttcaatgagggcagggaggcaccccatccccccttcttccatgctgcacagatatggaaccatgatttctattggcgatctatgcaacct---------ggtggcgggggaaaacccccagaa---------cgccttttgaaatttatcaacagggactttggatcctatgatggcatgattcgacaatttatggatgctgcatcaactcaatttggttctggatgggtttggctttgttacaaaacaagcaagttgcctcatgtgaaatcaagaagcccaatcccatctgataattat------ggtagactggtcatctcaaagtctccgaatgccatcaatcctcttgtctgg------------------ggtcactct---------------------------catgcatactacctggattatgaggatcggagatctgactatgtctccacatttctagagaagcttgtgtcatgggaaactgttgagtccaggcttaagaaggccgtacaacgggcagtagaaagagatgaatatgttagcacaaagcatataaggaagcaacttttagctcgggcaaagagccaaatcagagctatgcctcagcaggtcaatggggatgcaagagagcagaccagcggtcaagagaagtccctaggggtg
  30 Arabidopsis_thaliana_BAA97372.1 atgatgaatgttgcagtgacagccactccctcgtctctcttgtactctcctctgcttcttccttctcaagggccaaaccggcgaatgcaatggaaaagaaacggaaagagacggttagggacaaaggtggctgtttccggtgttatcacagctggatttgagctgaagccacctccatatcctcttgatgctctggaaccgcat---atgagccgggaaaccttggattatcactggggcaaacatcacaaaacttatgtagagaacctgaacaagcaaatcttaggcacggat---ctagat---------------------------gcattatccttggaagaagttgtgcttctttcatacaacaaaggcaat------atgcttcctgctttcaacaacgctgcacaggcttggaaccacgagttcttctgggagtctatccaacct---------ggaggtggaggaaagccaactgga---------gagctcctcagattaatagaaagagattttgggtctttcgaagagtttttggaaaggttcaagtcggctgcagcttcgaattttggttcgggttggacatggcttgcatataaggcgaatagacttgacgttgcaaatgccgttaatcctctcccaaaggaggaagac------aagaaacttgttatagtgaagacgcccaatgcagtaaatccgctcgtatgg------------------gattattctccacttctcaccattgatacctgggagcacgcttactatctggattttgagaaccgaagagctgaatacataaatacattcatggaaaagcttgtgtcatgggaaactgtaagcacaaggttggaatccgcaattgctcgagcagtgcaaagagaacaagaaggaacagagacagaagat------------------------gaagagaatccagatgatgaagtaccagaggtctatttagatagtgacatcgatgtatctgaggttgac???????????????
  31 Arabidopsis_thaliana_BAB11186.1 ???atgagttcttgtgttgtgacgacaagctgtttctatacaatttcagattctagtatacgtttgaaatcccccaagctcctcaatctgagtaaccagcagagaagacgctctcttaggtctcgaggtggtttaaag------gttgaagcttactacggtctaaagacacctccttatccacttgatgctttggagccgtat---atgagtagaagaacactagaagtgcattggggaaaacaccatcgaggttatgtagataatctgaataaacagttagggaaagatgatagactctat---------------------------ggatacaccatggaagagcttatcaaggctacatacaacaacgggaat------cctttacccgagttcaacaacgctgcacaggtctataaccatgatttcttctgggagtcgatgcaacct---------ggtggtggagacacgcctcaaaag---------ggtgttcttgagcagattgataaggattttggttctttcacaaattttagagaaaagttcactaatgcagctcttactcagtttggttctggatgggtctggcttgtcttaaagagg---------------------------------------------gaagag------agaaggcttgaggtggtcaaaacctcaaacgccattaacccactcgtgtgg------------------gacgatattccaatcatctgcgtggatgtgtgggagcactcttattatctggactacaagaacgacagggctaagtatataaacacatttctgaaccacttggtgtcgtggaacgctgccatgagtcggatggcccgtgcagaagcgtttgtgaatcttggtgaa------------------------------------------------------------------------------------------cccaacatcccaatcgct????????????????????????
  32 Escherichia_coli_CAA27580.1     ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgagctataccctgccatccctgccgtatgcttacgatgccctggaaccgcac---ttcgataagcagaccatggaaatccaccacaccaaacaccatcagacctacgtaaacaacgccaacgcggcgctggaaagcctgccagaatttgccaacctgccggttgaagagctgattaccaaactggaccagctgccagcagacaagaaaacc---------------------------gtactgcgcaacaacgctggcggtcacgctaaccacagcctgttctggaaaggtctgaaa---------------aaaggcaccaccctgcagggt---------gacctgaaagcggctatcgaacgtgacttcggctccgttgataacttcaaagcagaatttgaaaaagcggcagcttcccgctttggttccggctgggcatggctggtgctgaaaggc---------------------------------------------gataaa------------ctggcggtggtttctactgctaaccaggattctccgctgatgggtgaagctatttctggcgcttccggcttcccgattatgggcctggatgtgtgggaacatgcttactacctgaaattccagaaccgccgtccggactacattaaagagttctggaac---gtggtgaactgggacgaagcagcggcacgttttgcggcgaaaaaa?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  33 Rattus_norvegicus_CAA39937.1    ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgttgtgtcgggcggcgtgcagcgcgggcagaagactgggccccgcggccagtaccgcgggctcccgg------cacaagcacagcctccctgacctgccttacgactatggcgcgctggagccgcac---attaacgcgcagatcatgcagctgcaccacagcaagcaccacgcgacctacgtgaacaatctgaacgtcaccgaggagaagtaccacgaggcgctggcc---------------------aagggagatgttacaactcaggttgctcttcagcct---------------------------gcactgaagttcaatggcgggggccatatcaatcacagcattttctggacaaacctgagccct---------aagggtggtggagaacccaaagga---------gagttgctggaggctatcaagcgtgactttgggtcttttgagaagtttaaggagaaactgacagctgtgtctgtgggagtccaaggttcaggctggggctggcttggcttcaataag---------------------------------------------gagcaa------ggtcgcttacagattgccgcctgctctaatcaggac---ccactgcaaggaaccacaggc------------cttattccactgctggggattgatgtgtgggagcacgcttactatcttcagtataaaaacgtcagacctgactatctgaaagccatttggaat---gtaatcaactgggagaatgttagccaaagatacatagtttgcaagaag??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  34 Entamoeba_histolytica_CAA50204.1        ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgtctttccaattaccacaattaccttatgcttataatgctcttgagcctcat---attagtaaagagactcttgaattccatcatgataagcatcacgctacttatgttaataagttaaatggtcttgtaaaagga---actgaacaagaa---------------------------cataaaactcttgaagaattaattaaacaaaagccaactcaa------------------gcaatttataataatgcagcccaagcatggaatcatgcattctattggaaatgtatgtgtgga------------tgtggagttaaaccatctgaa---------caattaattgctaaattaactgctgcttttggaggattagaagaatttaagaagaagtttactgagaaagctgttggacattttggaagtggatggtgttggttggttgaacatgat---------------------------------------------ggt------------aagttagagattattgatactcatgatgctgttaatccaatgaccaat------------------ggaatgaaaccattattaacttgtgatgtttgggaacatgcttattacattgacactagaaacaacagagctgcttacttagaacattggtggaat---gtagtcaactgg------------aagttcgttgaagaacaactc?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  35 Onchocerca_volvulus_CAA57658.1  ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgaatctgattattggcgtcgcaggtcgcttattggttggcaagaactattgtctgaatacacaacga------ctaaaacatgttcttcctgatttaccatacgattatggagccttggagccgata---ttgtcggccgaaattatgcaagttcatcacggtaaacatcatgctgcatatgtaaatgctcttaatcaagccgaagagaaagtaaaagaagcgctagca---------------------aaaggagatacacaggctgctgttgctggcacaaaa---------------------------ttaatgaatttcaacactggcggacacattaatcatacactgttctgggaaggattaactgccgta------aagaatagcggagaaccgaattct---------gaattaatgacggctataaagaaggatttcgggtctttggaaacgatgatagataagttaaatgctaaaacaattgcgatccaaggttccggatggggatggcttgcttatgacaag---------------------------------------------gaaatg------aaacgtttgcaacttgcttgttgtcccaaccaagat---cttcttgagccaacaacaggt------------ctaattccactattttgcatcgatgtctgggaacatgcttattatctgcagtataaaaatttacggccagatttcgtgaaagctatttggaaa---attgcgaattggaaaataatcagtgatcgctacattaaagctagagga??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  36 Candida_sp_CAA72335.1   ?????????????????????????????????????????????atgctt------------tcttctgctatcaagagatccgccgtcggtattgctagacgttccgtcgtgtcttcttccgttgga------gccgtcaga------accaaagtatcgttaccagacttggattgggacttcggagccttggagcctcac---atttcgggacagatcaacgaaatccactacaccaagcaccaccaaacttacgttaacggttacaaccaagccattgagcaagcagccaggccaagg------------------------caaggggaggtcaagaagaccattgaattgcaaaag---------------------------gccatcaacttccacggtggtggatacaccaaccactgtttgttctggaagaacttggctccagagaag---caaggaggtggtgagccacctgctgaagactctgagtttgccaagagaatcgttgagcaatacggctccctcgacaacttgaaggctatcaccaacggtaagttggccggtatccaaggttctggttgggctttcattgtcaagaacaag---------------------------------------------gaaaac---ggtggtgctttagatgttatcactactgcaaaccaagat---actgttcttggacca------------------tttgttccattggttgctattgatgcttgggaacatgcctactacttgcaataccagaacgtcaaggctgactacttcaaggccatctggaac---gttatcaactggaaggaagccgagaagagatacttgatcaac????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  37 Caenorhabditis_elegans_CAB02913.1       ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????atgcttcaaaacaccgttcgctgtgtctcaaagcttgttcaaccgatcacaggagtcgctgctgttcgc------tcgaagcactcgctgccagatttaccatacgactatgctgatttggagcctgta---atcagtcacgagattatgcaacttcatcatcaaaagcatcatgccacttatgtgaacaatctcaaccaaattgaggaaaagcttcacgaggcggtctcc---------------------aaaggaaacgtcaaagaagctatcgctcttcagcca---------------------------gctctcaagttcaatggaggaggacatatcaaccactccatcttctggactaatttggca------------aaggacggaggagaaccatcggcg---------gagttgctcaccgcaattaagagcgacttcggatctctggataatcttcaaaaacagctttcggcatcaactgtcgctgttcaaggatcaggatggggatggttgggatactgtcca---------------------------------------------aaggga------aagatcttgaaggttgccacatgtgccaatcaggat---ccacttgaggcaacaactgga------------cttgttccactgttcggaattgacgtctgggagcacgcttactacttgcagtacaagaatgttcgaccagattatgtcaatgctatttggaag---atcgccaactggaagaacgtcagcgagcgttttgcaaaggcacagcaa??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  38 Arabidopsis_thaliana_CAB87434.1 ???????????????????????????????????????????????????atgacgaccaccgttattatcattatcttcgttgccatcttcgctacgactcttcacgacgccagaggagcaaccatggaaccgtgtctcgaatcaatgaagactgcttcgcttcctgatcttccgtatgcttatgatgcgctagagccagca---atcagtgaggagatcatgcggctacaccatcagaaacaccaccagacttatgtcactcagtacaacaaagccctcaacagccttcgttctgccatggct---------------------gacggtgatcactcctccgtcgtcaaactccaaagc---------------------------ctcatcaagttcaacggcggagggcacgttaaccatgcaatcttctggaaaaacctagccccggttcat---gaaggaggtggcaaaccaccgcat------gatcctttggcttcggcgatcgatgctcatttcggatcactagaaggattgatccaaaaaatgaacgcggaaggcgctgctgtacagggatctggatgggtgtggtttggattagacaga---------------------------------------------gagctt------aagagacttgtcgttgaaaccacagccaaccaggat---ccattggtgactaagggatcacac---------ctagttcctctaattgggattgacgtgtgggagcatgcctactatccacagtacaagaatgcaagagcggagtacttgaagaacatatggact---gtaatcaactggaaatatgcagcggacgtcttcgagaagcacactcgtgatctt------gatattaac?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
  39 ;
  40 end;
  41
  42 begin trees;
  43         tree Mn_Fe_superoxide_dismutase = (((((Penicillium_chrysogenum_AAC36585.1:0.34051,Neurospora_crassa_AAD28503.1:0.27339)7:0.26409[1],(Schizosaccharomyces_pombe_AAF19051.1:0.36196,Pneumocystis_carinii_AAC24764.1:0.71151)8:0.12214[0.943])6:0.06412[0.513],(Candida_albicans_AAB86583.1:0.24934,(Candida_sp_CAA72335.1:0.18954,Saccharomyces_cerevisiae_AAB68939.1:0.32136)5:0.07268[0.61])4:0.25434[1])3:0.08564[0.791],((Arabidopsis_thaliana_CAB87434.1:0.31765,Arabidopsis_thaliana_AAF01529.1:0.21348)10:0.27524[1],(Drosophila_melanogaster_AAF57955.1:0.35616,((Onchocerca_volvulus_CAA57658.1:0.50902,(Caenorhabditis_elegans_CAB02913.1:0.15628,Caenorhabditis_elegans_AAB53822.1:0.11313)15:0.15295[1])14:0.11584[0.994],(Rattus_norvegicus_CAA39937.1:0.03387,Mus_musculus_AAB60902.1:0.02684)13:0.23219[1])12:0.08725[0.873])11:0.14599[1])9:0.10103[0.724])2:0.21049[1],(((Toxoplasma_gondii_AAC63943.1:0.21401,(Babesia_bovis_AAB69755.1:0.3377,Entamoeba_histolytica_CAA50204.1:0.47354)19:0.08578[0.743])18:0.09059[0.924],Trypanosoma_cruzi_AAB39949.1:0.35308)17:0.14755[1],((Trichomonas_vaginalis_AAC48291.1:0.12536,(Tritrichomonas_foetus_AAC47735.1:0.1604,Tritrichomonas_foetus_AAC47734.1:0.09764)22:0.20185[1])21:0.38885[1],(Chlamydomonas_reinhardtii_AAB04944.1:0.28584,((Arabidopsis_thaliana_BAA97372.1:0.29163,Oryza_sativa_BAA92737.1:0.56464)25:0.13153[0.967],Arabidopsis_thaliana_BAB11186.1:0.43387)24:0.21097[1])23:0.12537[0.998])20:0.09524[0.633])16:0.25459[1],Escherichia_coli_CAA27580.1:0.39688)1;
  44 end;
  45