t/data/multiresult_blastn+.bls

   1 BLASTN 2.2.25+
   2
   3
   4 Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
   5 Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
   6 Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
   7 protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
   8
   9
  10
  11 Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS,
  12 GSS,environmental samples or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences)
  13            14,049,258 sequences; 36,075,095,184 total letters
  14
  15
  16
  17 Query= GFAVMM201BADC0
  18
  19 Length=477
  20                                                                       Score     E
  21 Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value
  22
  23 gi|194750627|ref|XM_001957596.1|  Drosophila ananassae GF23929 (D...  42.8    2.1
  24 gi|118568029|gb|CP000325.1|  Mycobacterium ulcerans Agy99, comple...  42.8    2.1
  25 gi|24395301|emb|AL928579.6|  Mouse DNA sequence from clone RP23-3...  42.8    2.1
  26 gi|326411376|gb|CP002568.1|  Polymorphum gilvum SL003B-26A1, comp...  41.0    7.4
  27 gi|317165637|gb|CP002447.1|  Mesorhizobium ciceri biovar biserrul...  41.0    7.4
  28 gi|312283773|gb|AC243242.1|  Panicum virgatum clone PV_ABa051-K05...  41.0    7.4
  29 gi|303315262|ref|XM_003067593.1|  Coccidioides posadasii C735 del...  41.0    7.4
  30 gi|297153409|gb|CP002047.1|  Streptomyces bingchenggensis BCW-1, ...  41.0    7.4
  31 gi|295434944|gb|CP002013.1|  Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome...  41.0    7.4
  32 gi|283945692|gb|CP001854.1|  Conexibacter woesei DSM 14684, compl...  41.0    7.4
  33 gi|194346582|gb|CP001111.1|  Stenotrophomonas maltophilia R551-3,...  41.0    7.4
  34 gi|166857509|gb|CP000926.1|  Pseudomonas putida GB-1, complete ge...  41.0    7.4
  35 gi|148498119|gb|CP000699.1|  Sphingomonas wittichii RW1, complete...  41.0    7.4
  36
  37
  38 >gi|194750627|ref|XM_001957596.1| Drosophila ananassae GF23929 (Dana\GF23929), mRNA
  39 Length=1641
  40
  41  Score = 42.8 bits (46),  Expect = 2.1
  42  Identities = 37/45 (83%), Gaps = 1/45 (2%)
  43  Strand=Plus/Plus
  44
  45 Query  236  ACGCCGACGACAAGCGGCGAGTCCCTTGTGGACGATCTCGGCCAC  280
  46             |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||  ||||  ||||
  47 Sbjct  137  ACGCCGACGACAAG-GGCGAGTCCATTTGGGACTTTCTCACCCAC  180
  48
  49
  50 >gi|118568029|gb|CP000325.1| Mycobacterium ulcerans Agy99, complete genome
  51 Length=5631606
  52
  53  Score = 42.8 bits (46),  Expect = 2.1
  54  Identities = 36/43 (84%), Gaps = 1/43 (2%)
  55  Strand=Plus/Minus
  56
  57 Query  69      CCATGACTGCCGGCAGAACATCGACCGGCCAG-TATGTCGGCC  110
  58                ||||| ||||||||||||| |||| || || | |||| |||||
  59 Sbjct  890715  CCATGTCTGCCGGCAGAACTTCGAGCGACCCGATATGGCGGCC  890673
  60
  61
  62 >gi|24395301|emb|AL928579.6| Mouse DNA sequence from clone RP23-302M15 on chromosome 4, complete
  63 sequence
  64 Length=184057
  65
  66  Score = 42.8 bits (46),  Expect = 2.1
  67  Identities = 31/35 (89%), Gaps = 1/35 (2%)
  68  Strand=Plus/Plus
  69
  70 Query  437     AGCTGCAACATGAATGTGCTCGCAGATCTTCAGGA  471
  71                |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||
  72 Sbjct  146437  AGCTGCAACATGGATGTGCTAGCAGA-CTTCTGGA  146470
  73
  74
  75 >gi|326411376|gb|CP002568.1| Polymorphum gilvum SL003B-26A1, complete genome
  76 Length=4649365
  77
  78  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
  79  Identities = 33/40 (83%), Gaps = 0/40 (0%)
  80  Strand=Plus/Plus
  81
  82 Query  238      GCCGACGACAAGCGGCGAGTCCCTTGTGGACGATCTCGGC  277
  83                 |||||||||  ||||||||||| | |||  |||| |||||
  84 Sbjct  2023755  GCCGACGACGCGCGGCGAGTCCGTGGTGCTCGATGTCGGC  2023794
  85
  86
  87 >gi|317165637|gb|CP002447.1| Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271, complete genome
  88 Length=6264489
  89
  90  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
  91  Identities = 22/22 (100%), Gaps = 0/22 (0%)
  92  Strand=Plus/Plus
  93
  94 Query  300      TTGATGCCGAGGCGGATGCCAT  321
  95                 ||||||||||||||||||||||
  96 Sbjct  4510008  TTGATGCCGAGGCGGATGCCAT  4510029
  97
  98
  99 >gi|312283773|gb|AC243242.1| Panicum virgatum clone PV_ABa051-K05, complete sequence
 100 Length=161398
 101
 102  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 103  Identities = 28/32 (88%), Gaps = 0/32 (0%)
 104  Strand=Plus/Plus
 105
 106 Query  271     TCTCGGCCACCTGTTTGAGTGGTATTCTTTTG  302
 107                ||| |||||||||||||||| ||||| || ||
 108 Sbjct  137850  TCTTGGCCACCTGTTTGAGTTGTATTTTTCTG  137881
 109
 110
 111 >gi|303315262|ref|XM_003067593.1| Coccidioides posadasii C735 delta SOWgp Sugar transporter family
 112 protein, mRNA
 113 Length=1947
 114
 115  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 116  Identities = 31/37 (84%), Gaps = 0/37 (0%)
 117  Strand=Plus/Minus
 118
 119 Query  289  GTGGTATTCTTTTGATGCCGAGGCGGATGCCATTGCA  325
 120             ||||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||
 121 Sbjct  84   GTGGTCTTCATATGATGCCGAGGCGTAAGCCTTTGCA  48
 122
 123
 124 >gi|297153409|gb|CP002047.1| Streptomyces bingchenggensis BCW-1, complete genome
 125 Length=11936683
 126
 127  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 128  Identities = 27/30 (90%), Gaps = 0/30 (0%)
 129  Strand=Plus/Plus
 130
 131 Query  38       GTCGGCAGCGGATCTCCGAAAACCATCAAG  67
 132                 |||||||||||| |||||||  ||||||||
 133 Sbjct  3073377  GTCGGCAGCGGAACTCCGAATTCCATCAAG  3073406
 134
 135
 136 >gi|295434944|gb|CP002013.1| Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 1, complete sequence
 137 Length=3518940
 138
 139  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 140  Identities = 33/40 (83%), Gaps = 0/40 (0%)
 141  Strand=Plus/Minus
 142
 143 Query  212      ATGGGCGAATCGATCACCTTCAACACGCCGACGACAAGCG  251
 144                 || |||||||||||| | |||||||||| | |||  ||||
 145 Sbjct  2243828  ATCGGCGAATCGATCGCGTTCAACACGCTGGCGATGAGCG  2243789
 146
 147
 148 >gi|283945692|gb|CP001854.1| Conexibacter woesei DSM 14684, complete genome
 149 Length=6359369
 150
 151  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 152  Identities = 35/43 (82%), Gaps = 3/43 (6%)
 153  Strand=Plus/Minus
 154
 155 Query  101      TATGTCGGCCATGGCTTCTACAGTCCGGACATGATCGACGGCG  143
 156                 ||||||||||| | |||||||   ||| || || |||||||||
 157 Sbjct  2039361  TATGTCGGCCACGACTTCTAC---CCGAACCTGGTCGACGGCG  2039322
 158
 159
 160 >gi|194346582|gb|CP001111.1| Stenotrophomonas maltophilia R551-3, complete genome
 161 Length=4573969
 162
 163  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 164  Identities = 32/36 (89%), Gaps = 2/36 (5%)
 165  Strand=Plus/Minus
 166
 167 Query  102      ATGTCGGCCATGGC-TTCTACAGTCCGGACATGATC  136
 168                 |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||
 169 Sbjct  3897524  ATGTCGGCCATGGCGTTGCACAG-CCGGACATGATC  3897490
 170
 171
 172 >gi|166857509|gb|CP000926.1| Pseudomonas putida GB-1, complete genome
 173 Length=6078430
 174
 175  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 176  Identities = 35/41 (86%), Gaps = 2/41 (4%)
 177  Strand=Plus/Minus
 178
 179 Query  222      CGATCACCTTCAACACG-CCGACGACAAGCGGCGAGTCCCT  261
 180                 ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| ||
 181 Sbjct  5087565  CGATCACCTTCGACACGTCCGACGA-AAGCGCCAAGTCGCT  5087526
 182
 183
 184 >gi|148498119|gb|CP000699.1| Sphingomonas wittichii RW1, complete genome
 185 Length=5382261
 186
 187  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 7.4
 188  Identities = 32/38 (85%), Gaps = 3/38 (7%)
 189  Strand=Plus/Plus
 190
 191 Query  208      GACGATG---GGCGAATCGATCACCTTCAACACGCCGA  242
 192                 |||||||   ||||  |||||||||||||| |||||||
 193 Sbjct  4265124  GACGATGTGGGGCGGCTCGATCACCTTCAAGACGCCGA  4265161
 194
 195
 196
 197 Lambda     K      H
 198    0.634    0.408    0.912
 199
 200 Gapped
 201 Lambda     K      H
 202    0.625    0.410    0.780
 203
 204 Effective search space used: 15727850050068
 205
 206
 207 Query= GFAVMM201A1JOH
 208
 209 Length=57
 210                                                                       Score     E
 211 Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value
 212
 213 gi|22416007|emb|AL772315.4|  Mouse DNA sequence from clone RP23-5...  41.0    0.42
 214 gi|117168385|gb|AC190175.4|  Pan troglodytes BAC clone CH251-542A...  39.2    1.5
 215 gi|45238691|gb|AC145377.2|  Pan troglodytes BAC clone RP43-11P19 ...  39.2    1.5
 216 gi|4926907|gb|AC004936.2|  Homo sapiens PAC clone RP5-959C21 from...  39.2    1.5
 217 gi|31414500|emb|AL831797.4|  Oryza sativa chromosome 12, . BAC OS...  39.2    1.5
 218 gi|158967071|gb|CP000033.3|  Lactobacillus acidophilus NCFM, comp...  37.4    5.1
 219
 220
 221 >gi|22416007|emb|AL772315.4| Mouse DNA sequence from clone RP23-54A13 on chromosome 4, complete
 222 sequence
 223 Length=200266
 224
 225  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 0.42
 226  Identities = 28/31 (91%), Gaps = 2/31 (6%)
 227  Strand=Plus/Minus
 228
 229 Query  6      CGTTCCAGTCACGATACATACCAATAACGAC  36
 230               ||||||||| |  ||||||||||||||||||
 231 Sbjct  26821  CGTTCCAGTGA--ATACATACCAATAACGAC  26793
 232
 233
 234 >gi|117168385|gb|AC190175.4| Pan troglodytes BAC clone CH251-542A7 from chromosome 7, complete
 235 sequence
 236 Length=214222
 237
 238  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 1.5
 239  Identities = 26/29 (90%), Gaps = 0/29 (0%)
 240  Strand=Plus/Minus
 241
 242 Query  19      ATACATACCAATAACGACTTCTATATGTA  47
 243                ||||||||||||||  | |||||||||||
 244 Sbjct  166678  ATACATACCAATAAATATTTCTATATGTA  166650
 245
 246
 247 >gi|45238691|gb|AC145377.2| Pan troglodytes BAC clone RP43-11P19 from chromosome 7, complete
 248 sequence
 249 Length=194463
 250
 251  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 1.5
 252  Identities = 26/29 (90%), Gaps = 0/29 (0%)
 253  Strand=Plus/Plus
 254
 255 Query  19      ATACATACCAATAACGACTTCTATATGTA  47
 256                ||||||||||||||  | |||||||||||
 257 Sbjct  192749  ATACATACCAATAAATATTTCTATATGTA  192777
 258
 259
 260 >gi|4926907|gb|AC004936.2| Homo sapiens PAC clone RP5-959C21 from 7, complete sequence
 261 Length=139949
 262
 263  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 1.5
 264  Identities = 26/29 (90%), Gaps = 0/29 (0%)
 265  Strand=Plus/Minus
 266
 267 Query  19     ATACATACCAATAACGACTTCTATATGTA  47
 268               ||||||||||||||  | |||||||||||
 269 Sbjct  12654  ATACATACCAATAAATATTTCTATATGTA  12626
 270
 271
 272 >gi|31414500|emb|AL831797.4| Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0010M16 of library OSJNBa
 273 from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica
 274 of Oryza sativa (rice), complete sequence
 275 Length=132741
 276
 277  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 1.5
 278  Identities = 23/24 (96%), Gaps = 0/24 (0%)
 279  Strand=Plus/Plus
 280
 281 Query  18      GATACATACCAATAACGACTTCTA  41
 282                ||||||||||||||| ||||||||
 283 Sbjct  126346  GATACATACCAATAAAGACTTCTA  126369
 284
 285
 286 >gi|158967071|gb|CP000033.3| Lactobacillus acidophilus NCFM, complete genome
 287 Length=1993560
 288
 289  Score = 37.4 bits (40),  Expect = 5.1
 290  Identities = 20/20 (100%), Gaps = 0/20 (0%)
 291  Strand=Plus/Minus
 292
 293 Query  14      TCACGATACATACCAATAAC  33
 294                ||||||||||||||||||||
 295 Sbjct  756012  TCACGATACATACCAATAAC  755993
 296
 297
 298
 299 Lambda     K      H
 300    0.634    0.408    0.912
 301
 302 Gapped
 303 Lambda     K      H
 304    0.625    0.410    0.780
 305
 306 Effective search space used: 890637973200
 307
 308
 309 Query= GFAVMM201D933Z
 310
 311 Length=119
 312                                                                       Score     E
 313 Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value
 314
 315 gi|332189094|gb|CP002684.1|  Arabidopsis thaliana chromosome 1, c...  41.0    1.4
 316 gi|313747610|gb|AC237431.3|  Macaca mulatta Y Chr BAC RMAEX-106G5...  41.0    1.4
 317 gi|168693784|gb|AC213321.3|  MACACA MULATTA BAC clone CH250-541A1...  41.0    1.4
 318 gi|8778954|gb|AC007932.3|F11A17  Arabidopsis thaliana chromosome ...  41.0    1.4
 319 gi|256052438|ref|XM_002569731.1|  Schistosoma mansoni GTP-binding...  39.2    5.0
 320 gi|238867551|gb|CP001600.1|  Edwardsiella ictaluri 93-146, comple...  39.2    5.0
 321 gi|224465197|ref|NG_009929.1|  Homo sapiens like-glycosyltransfer...  39.2    5.0
 322 gi|147784643|emb|AM469007.2|  Vitis vinifera contig VV78X098884.1...  39.2    5.0
 323 gi|123663234|emb|AM455601.1|  Vitis vinifera, whole genome shotgu...  39.2    5.0
 324 gi|118344518|gb|AC192748.2|  Gallus gallus BAC clone CH261-166H21...  39.2    5.0
 325 gi|90309320|gb|AY607844.2|  Edwardsiella ictaluri transposase-lik...  39.2    5.0
 326 gi|55908997|gb|AC102414.8|  Mus musculus chromosome 15, clone RP2...  39.2    5.0
 327 gi|72096292|gb|AC162857.5|  Mus musculus chromosome 15, clone RP2...  39.2    5.0
 328 gi|22415845|emb|AL139016.8|  Human DNA sequence from clone RP4-65...  39.2    5.0
 329 gi|6572307|emb|Z82173.2|  Human DNA sequence from clone SC22CB-1D...  39.2    5.0
 330 gi|56410822|gb|AC140454.4|  Mus musculus BAC clone RP24-163I14 fr...  39.2    5.0
 331 gi|38707373|emb|BX255930.3|  Zebrafish DNA sequence from clone DK...  39.2    5.0
 332
 333
 334 >gi|332189094|gb|CP002684.1| Arabidopsis thaliana chromosome 1, complete sequence
 335 Length=30427671
 336
 337  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 1.4
 338  Identities = 25/27 (93%), Gaps = 0/27 (0%)
 339  Strand=Plus/Minus
 340
 341 Query  70        AACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAA  96
 342                  |||||||||  ||||||||||||||||
 343 Sbjct  17871124  AACAGAAACTTCTACGAAAGGAAAGAA  17871098
 344
 345
 346 >gi|313747610|gb|AC237431.3| Macaca mulatta Y Chr BAC RMAEX-106G5 complete sequence
 347 Length=169910
 348
 349  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 1.4
 350  Identities = 28/31 (91%), Gaps = 2/31 (6%)
 351  Strand=Plus/Minus
 352
 353 Query  75     AAACCACTACGAAAGGAAAGAAATGCCTCTA  105
 354               ||||||  ||||||||||| |||||||||||
 355 Sbjct  60448  AAACCA--ACGAAAGGAAATAAATGCCTCTA  60420
 356
 357
 358 >gi|168693784|gb|AC213321.3| MACACA MULATTA BAC clone CH250-541A11 from chromosome y, complete
 359 sequence
 360 Length=156689
 361
 362  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 1.4
 363  Identities = 28/31 (91%), Gaps = 2/31 (6%)
 364  Strand=Plus/Plus
 365
 366 Query  75     AAACCACTACGAAAGGAAAGAAATGCCTCTA  105
 367               ||||||  ||||||||||| |||||||||||
 368 Sbjct  62327  AAACCA--ACGAAAGGAAATAAATGCCTCTA  62355
 369
 370
 371 >gi|8778954|gb|AC007932.3|F11A17 Arabidopsis thaliana chromosome 1 BAC F11A17 sequence, complete
 372 sequence
 373 Length=102078
 374
 375  Score = 41.0 bits (44),  Expect = 1.4
 376  Identities = 25/27 (93%), Gaps = 0/27 (0%)
 377  Strand=Plus/Plus
 378
 379 Query  70     AACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAA  96
 380               |||||||||  ||||||||||||||||
 381 Sbjct  32940  AACAGAAACTTCTACGAAAGGAAAGAA  32966
 382
 383
 384 >gi|256052438|ref|XM_002569731.1| Schistosoma mansoni GTP-binding protein era, putative (Smp_164220)
 385 mRNA, complete cds
 386 Length=1341
 387
 388  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 389  Identities = 21/21 (100%), Gaps = 0/21 (0%)
 390  Strand=Plus/Minus
 391
 392 Query  40   TTCTCTTTTCGTATTTGGAAC  60
 393             |||||||||||||||||||||
 394 Sbjct  159  TTCTCTTTTCGTATTTGGAAC  139
 395
 396
 397 >gi|238867551|gb|CP001600.1| Edwardsiella ictaluri 93-146, complete genome
 398 Length=3812315
 399
 400  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 401  Identities = 31/37 (84%), Gaps = 3/37 (8%)
 402  Strand=Plus/Plus
 403
 404 Query  58       AACAGCTGTTATA---ACAGAAACCACTACGAAAGGA  91
 405                 |||||| ||||||   ||| ||||||||||| |||||
 406 Sbjct  1978968  AACAGCCGTTATATCCACATAAACCACTACGCAAGGA  1979004
 407
 408
 409 >gi|224465197|ref|NG_009929.1| Homo sapiens like-glycosyltransferase (LARGE), RefSeqGene on
 410 chromosome 22
 411 Length=654355
 412
 413  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 414  Identities = 30/36 (84%), Gaps = 0/36 (0%)
 415  Strand=Plus/Plus
 416
 417 Query  66      TTATAACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAAATGCC  101
 418                ||| |||||||||||  || |||||||| ||| |||
 419 Sbjct  603836  TTAAAACAGAAACCAAAACCAAAGGAAAAAAAAGCC  603871
 420
 421
 422 >gi|147784643|emb|AM469007.2| Vitis vinifera contig VV78X098884.11, whole genome shotgun sequence
 423 Length=7756
 424
 425  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 426  Identities = 24/26 (93%), Gaps = 0/26 (0%)
 427  Strand=Plus/Minus
 428
 429 Query  71    ACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAA  96
 430              ||| |||||||||| |||||||||||
 431 Sbjct  6827  ACAAAAACCACTACAAAAGGAAAGAA  6802
 432
 433
 434 >gi|123663234|emb|AM455601.1| Vitis vinifera, whole genome shotgun sequence, contig VV78X123660.5,
 435 clone ENTAV 115
 436 Length=34741
 437
 438  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 439  Identities = 24/26 (93%), Gaps = 0/26 (0%)
 440  Strand=Plus/Plus
 441
 442 Query  71     ACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAA  96
 443               ||| |||||||||| |||||||||||
 444 Sbjct  34120  ACAAAAACCACTACAAAAGGAAAGAA  34145
 445
 446
 447 >gi|118344518|gb|AC192748.2| Gallus gallus BAC clone CH261-166H21 from chromosome z, complete
 448 sequence
 449 Length=226699
 450
 451  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 452  Identities = 27/31 (88%), Gaps = 0/31 (0%)
 453  Strand=Plus/Plus
 454
 455 Query  58      AACAGCTGTTATAACAGAAACCACTACGAAA  88
 456                ||||||||| ||||||||||||  || ||||
 457 Sbjct  178051  AACAGCTGTCATAACAGAAACCCATATGAAA  178081
 458
 459
 460 >gi|90309320|gb|AY607844.2| Edwardsiella ictaluri transposase-like protein gene, complete
 461 cds; urease operon, complete sequence; and ammonium transporter
 462 (amtB) and TnpA (tnpA) genes, complete cds
 463 Length=11426
 464
 465  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 466  Identities = 31/37 (84%), Gaps = 3/37 (8%)
 467  Strand=Plus/Minus
 468
 469 Query  58    AACAGCTGTTATA---ACAGAAACCACTACGAAAGGA  91
 470              |||||| ||||||   ||| ||||||||||| |||||
 471 Sbjct  8030  AACAGCCGTTATATCCACATAAACCACTACGCAAGGA  7994
 472
 473
 474 >gi|55908997|gb|AC102414.8| Mus musculus chromosome 15, clone RP24-474D5, complete sequence
 475 Length=159739
 476
 477  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 478  Identities = 24/26 (93%), Gaps = 0/26 (0%)
 479  Strand=Plus/Plus
 480
 481 Query  70     AACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGA  95
 482               ||||||||||||||| |||||| |||
 483 Sbjct  71851  AACAGAAACCACTACAAAAGGAGAGA  71876
 484
 485
 486 >gi|72096292|gb|AC162857.5| Mus musculus chromosome 15, clone RP23-333C11, complete sequence
 487 Length=224913
 488
 489  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 490  Identities = 24/26 (93%), Gaps = 0/26 (0%)
 491  Strand=Plus/Minus
 492
 493 Query  70    AACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGA  95
 494              ||||||||||||||| |||||| |||
 495 Sbjct  3370  AACAGAAACCACTACAAAAGGAGAGA  3345
 496
 497
 498 >gi|22415845|emb|AL139016.8| Human DNA sequence from clone RP4-658C17 on chromosome 1p11.1-13.3,
 499 complete sequence
 500 Length=100643
 501
 502  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 503  Identities = 22/23 (96%), Gaps = 0/23 (0%)
 504  Strand=Plus/Plus
 505
 506 Query  87     AAGGAAAGAAATGCCTCTANAAG  109
 507               ||||||||||||||||||| |||
 508 Sbjct  22086  AAGGAAAGAAATGCCTCTAGAAG  22108
 509
 510
 511 >gi|6572307|emb|Z82173.2| Human DNA sequence from clone SC22CB-1D7 on chromosome 22 Contains
 512 a novel gene and part of the LARGE gene for like-glycosyltransferase,
 513 complete sequence
 514 Length=37731
 515
 516  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 517  Identities = 30/36 (84%), Gaps = 0/36 (0%)
 518  Strand=Plus/Minus
 519
 520 Query  66     TTATAACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAAATGCC  101
 521               ||| |||||||||||  || |||||||| ||| |||
 522 Sbjct  15530  TTAAAACAGAAACCAAAACCAAAGGAAAAAAAAGCC  15495
 523
 524
 525 >gi|56410822|gb|AC140454.4| Mus musculus BAC clone RP24-163I14 from 1, complete sequence
 526 Length=171533
 527
 528  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 529  Identities = 28/32 (88%), Gaps = 4/32 (12%)
 530  Strand=Plus/Plus
 531
 532 Query  66      TTATAACAGAAACCACTACGAAAGGAAAGAAA  97
 533                ||||||||||||||||    ||||||||||||
 534 Sbjct  140248  TTATAACAGAAACCAC----AAAGGAAAGAAA  140275
 535
 536
 537 >gi|38707373|emb|BX255930.3| Zebrafish DNA sequence from clone DKEY-101K6 in linkage group
 538 9 Contains the 3' end of the mcm3ap gene for MCM3 minichromosome
 539 maintenance deficient 3 (S. cerevisiae) associated protein,
 540 the gene for a novel protein similar to vertebrate lanosterol
 541 synthase (2,3-oxidosqualene-lanosterol cyclase) (LSS),
 542 the gene for a novel protein similar to human and mouse leishmanolysin-like
 543 (metallopeptidase M8 family) (LMLN), the
 544 gene for a novel protein similar to vertebrate oxysterol binding
 545 protein-like 10 (OSBPL10), the gene for a novel protein
 546 similar to vertebrate transforming growth factor, beta receptor
 547 II (70/80kDa) (TGFBR2), the snx4 gene for sorting nexin
 548 4, the gene for a novel protein similar to vertebrate zinc
 549 finger protein 148 (ZNF148) and the 5' end of the gene for a
 550 novel protein similar to vertebrate solute carrier family 12
 551 (potassium/chloride transporters), member 8 (SLC12A8), complete
 552 sequence
 553 Length=185559
 554
 555  Score = 39.2 bits (42),  Expect = 5.0
 556  Identities = 21/21 (100%), Gaps = 0/21 (0%)
 557  Strand=Plus/Plus
 558
 559 Query  62      GCTGTTATAACAGAAACCACT  82
 560                |||||||||||||||||||||
 561 Sbjct  124003  GCTGTTATAACAGAAACCACT  124023
 562
 563
 564
 565 Lambda     K      H
 566    0.634    0.408    0.912
 567
 568 Gapped
 569 Lambda     K      H
 570    0.625    0.410    0.780
 571
 572 Effective search space used: 3062586391620
 573
 574
 575   Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS,
 576 GSS,environmental samples or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences)
 577     Posted date:  May 21, 2011  4:39 PM
 578   Number of letters in database: 36,075,095,184
 579   Number of sequences in database:  14,049,258
 580
 581
 582
 583 Matrix: blastn matrix 2 -3
 584 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2