empty directory
[bioperl-live.git] / t / data / mini-AE001405.gb
blob8271dbcdb058216e5a0742fbde0a32b30121d033
1 LOCUS       AE001405               11389 bp    DNA     linear   INV 04-OCT-2002
2 DEFINITION  Plasmodium falciparum 3D7 chromosome 2 section 42 of 73 of the
3             complete sequence.
4 ACCESSION   AE001405 AE001362
5 VERSION     AE001405.2  GI:23503395
6 KEYWORDS    .
7 SOURCE      Plasmodium falciparum 3D7
8   ORGANISM  Plasmodium falciparum 3D7
9             Eukaryota; Alveolata; Apicomplexa; Haemosporida; Plasmodium.
10 REFERENCE   1  (bases 1 to 11389)
11   AUTHORS   Gardner,M.J., Tettelin,H., Carucci,D.J., Cummings,L.M., Aravind,L.,
12             Koonin,E.V., Shallom,S., Mason,T., Yu,K., Fujii,C., Pederson,J.,
13             Shen,K., Jing,J., Aston,C., Lai,Z., Schwartz,D.C., Pertea,M.,
14             Salzberg,S., Zhou,L., Sutton,G.G., Clayton,R., White,O.,
15             Smith,H.O., Fraser,C.M., Adams,M.D., Venter,J.C. and Hoffman,S.L.
16   TITLE     Chromosome 2 sequence of the human malaria parasite Plasmodium
17             falciparum
18   JOURNAL   Science 282 (5391), 1126-1132 (1998)
19    PUBMED   9804551
20 REFERENCE   2  (bases 1 to 11389)
21   AUTHORS   Gardner,M.J., Hall,N., Fung,E., White,O., Berriman,M., Hyman,R.W.,
22             Carlton,J.M., Pain,A., Nelson,K.E., Bowman,S., Paulsen,I.T.,
23             James,K., Eisen,J.A., Rutherford,K., Salzberg,S.L., Craig,A.,
24             Kyes,S., Chan,M.S., Nene,V., Shallom,S.J., Suh,B., Peterson,J.,
25             Angiuoli,S., Pertea,M., Allen,J., Selengut,J., Haft,D.,
26             Mather,M.W., Vaidya,A.B., Martin,D.M., Fairlamb,A.H.,
27             Fraunholz,M.J., Roos,D.S., Ralph,S.A., McFadden,G.I.,
28             Cummings,L.M., Subramanian,G.M., Mungall,C., Venter,J.C.,
29             Carucci,D.J., Hoffman,S.L., Newbold,C., Davis,R.W., Fraser,C.M. and
30             Barrell,B.
31   TITLE     Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum
32   JOURNAL   Nature 419 (6906), 498-511 (2002)
33    PUBMED   12368864
34 REFERENCE   3  (bases 1 to 11389)
35   AUTHORS   Gardner,M.J.
36   TITLE     Direct Submission
37   JOURNAL   Submitted (02-OCT-2002) The Institute for Genomic Research, 9712
38             Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
39 COMMENT     On Oct 4, 2002 this sequence version replaced gi:3845224.
40 FEATURES             Location/Qualifiers
41      source          1..180
42                      /organism="Plasmodium falciparum 3D7"
43                      /mol_type="genomic DNA"
44                      /isolate="3D7"
45                      /db_xref="taxon:36329"
46                      /chromosome="2"
47      repeat_region   complement(<1..55)
48                      /rpt_type=tandem
49                      /rpt_unit=(TG)10;A;(TG)7
50      repeat_region   112..117
51                      /rpt_type=tandem
52                      /rpt_unit_seq="(TAAAA)n"
53      repeat_region   complement(116..119)
54                      /rpt_type=tandem
55                      /rpt_unit_seq="(TA)n"
56 ORIGIN      
57         1 tattatattt ttattaaatg caaatatgtt gatatgtaca tatatatata tatatgatca
58        61 taatatattt catttttatc atttttaaag tgtttgttta tttatattta ttatttttaa
59       121 tttttttatt ttatttaatt attttttttt attttttaaa tttttgtgac aagtttatat