.travis.yml

   1 language: perl
   2 perl:
   3   - "5.18"
   4   - "5.16"
   5   - "5.14"
   6   - "5.12"
   7   - "5.10"
   8
   9 env: PERL_CPANM_OPT="--notest --force --skip-satisfied"
  10
  11 before_script:
  12
  13 install:
  14     #This should solve problem installing Perl's DB_File & GraphViz
  15     - "sudo apt-get install libdb-dev graphviz libgd2-xpm-dev libxml2-dev 2>&1 | tail -n 4"
  16     #These are recommended or required Perl libraries:
  17     - "cpanm GD 2>&1 | tail -n 1"
  18     - "cpanm HTML::TableExtract DBI Data::Stag DB_File 2>&1 | tail -n 1"
  19     - "cpanm DBD::mysql DBD::Pg DBD::SQLite 2>&1 | tail -n 1"
  20     - "cpanm Algorithm::Munkres Array::Compare Convert::Binary::C Error 2>&1 | tail -n 1"
  21     - "cpanm Graph SVG SVG::Graph GraphViz 2>&1 | tail -n 1"
  22     - "cpanm XML::DOM::XPath XML::Parser XML::Parser::PerlSAX 2>&1 | tail -n 1"
  23     - "cpanm XML::SAX XML::SAX::Writer XML::Simple XML::LibXML XML::Twig XML::Writer 2>&1 | tail -n 1"
  24     - "cpanm PostScript::TextBlock Set::Scalar Sort::Naturally YAML | tail -n 1"
  25     - "cpanm Math::Random SOAP::Lite Spreadsheet::ParseExcel | tail -n 1"
  26     - "cpanm Bio::Phylo | tail -n 1"
  27     #for some reason tests and deps aren't skipped here.  Will have to look into it more...
  28     - "cpanm -f -n Bio::ASN1::EntrezGene | tail -n 1"
  29     #git repos, seems to only work for simple checkouts, so pure perl only (TODO: look into before_script for more detail)
  30     - "git clone https://github.com/bioperl/Bio-Root.git; export PERL5LIB=$( pwd )/Bio-Root/lib:$PERL5LIB"
  31     #This installs BioPerl itself:
  32     - "perl ./Build.PL --accept"
  33
  34 script:
  35     - "./Build test"
  36
  37 #TODO - send emails to bioperl-guts-l
  38 notifications:
  39   email: false
  40
  41 # whitelist branches
  42 branches:
  43   only:
  44     - master
  45     - v1
  46     - v1_cherry