.travis.yml

   1 language: perl
   2 perl:
   3   - "5.20"
   4   - "5.18"
   5   - "5.16"
   6   - "5.14"
   7   - "5.12"
   8   - "5.10"
   9
  10 sudo: false
  11 env: PERL_CPANM_OPT="--notest --force --skip-satisfied"
  12
  13 addons:
  14   apt:
  15     packages:
  16       - libdb-dev
  17       - graphviz
  18       - libgd2-xpm-dev
  19       - libxml2-dev
  20
  21 install:
  22     #These are recommended or required Perl libraries:
  23     - "cpanm GD 2>&1 | tail -n 1"
  24     - "cpanm HTML::TableExtract DBI Data::Stag DB_File 2>&1 | tail -n 1"
  25     - "cpanm DBD::mysql DBD::Pg DBD::SQLite 2>&1 | tail -n 1"
  26     - "cpanm Algorithm::Munkres Array::Compare Convert::Binary::C Error 2>&1 | tail -n 1"
  27     - "cpanm Graph SVG SVG::Graph GraphViz 2>&1 | tail -n 1"
  28     - "cpanm XML::DOM::XPath XML::Parser XML::Parser::PerlSAX 2>&1 | tail -n 1"
  29     - "cpanm XML::SAX XML::SAX::Writer XML::Simple XML::LibXML XML::Twig XML::Writer 2>&1 | tail -n 1"
  30     - "cpanm PostScript::TextBlock Set::Scalar Sort::Naturally YAML | tail -n 1"
  31     - "cpanm Math::Random SOAP::Lite Spreadsheet::ParseExcel | tail -n 1"
  32     - "cpanm Bio::ASN1::EntrezGene | tail -n 1"
  33     - "cpanm Bio::Phylo | tail -n 1"
  34     - "cpanm Test::Weaken | tail -n 1"
  35     - "cpanm Test::Memory::Cycle | tail -n 1"
  36     #Test coverage from Coveralls
  37     #- cpanm --quiet --notest Devel::Cover::Report::Coveralls
  38     #for some reason tests and deps aren't skipped here.  Will have to look into it more...
  39     #git repos, seems to only work for simple checkouts, so pure perl only (TODO: look into before_script for more detail)
  40     #- "git clone https://github.com/bioperl/Bio-Root.git; export PERL5LIB=$( pwd )/Bio-Root/lib:$PERL5LIB"
  41     #This installs BioPerl itself:
  42     - "perl ./Build.PL --accept"
  43
  44 script:
  45     - "./Build test"
  46     #Devel::Cover coverage options are: statement, branch, condition, path, subroutine, pod, time, all and none
  47     #- "./Build build && cover -test -report coveralls" #complete version coverage test
  48     #- PERL5OPT=-MDevel::Cover=+ignore,prove,-coverage,statement,subroutine prove -lr t #limited version coverage test
  49     #- cover -report coveralls
  50
  51 #TODO - send emails to bioperl-guts-l
  52 notifications:
  53   email:
  54     recipients:
  55       - bioperl-guts-l@lists.open-bio.org
  56       - cjfields1@gmail.com
  57     on_success: change
  58     on_failure: change
  59
  60 # whitelist branches
  61 branches:
  62   only:
  63     - master
  64