Merge pull request #254 from bioperl/hyphaltip-bug253-patch-1
[bioperl-live.git] / t / AlignIO / prodom.t
blob5721aed3edd531b2a5ffa60bd7955c3cef1e4dce
1 # -*-Perl-*- Test Harness script for Bioperl
2 # $Id: prodom.t 14971 2008-10-28 16:08:52Z cjfields $
4 use strict;
6 BEGIN {
7         use lib '.';
8     use Bio::Root::Test;
9     
10     test_begin(-tests => 3);
11         
12         use_ok('Bio::AlignIO::prodom');
15 my $DEBUG = test_debug();
17 my ($str,$aln,$strout,$status);
19 # PRODOM
20 $str = Bio::AlignIO->new(
21    '-file' => test_input_file("testaln.prodom"),
22                            '-format' => 'prodom');
23 $aln = $str->next_aln();
24 isa_ok($aln,'Bio::Align::AlignI');
25 is $aln->get_seq_by_pos(1)->get_nse, 'P04777/1-33', "prodom input test ";