get basic tests, num_taxa test passing
[bioperl-live.git] / ide / bioperl.komodo
blobf6fa4f27304dfd8a9d2fc1f5195c71eb9d444be4
1 # $Id: [[%f]],v 0.01 2007-03-27 12:43:27 heikki Exp $
3 # BioPerl module for [[%ask1:Perl class name]]
5 # Cared for by [[%ask2:Caretaker name]] [[%ask3:Caretaker email]]
7 # Copyright [[%ask2]]
9 # You may distribute this module under the same terms as perl itself
11 # POD documentation - main docs before the code
13 =head1 NAME
15 [[%ask1]] - DESCRIPTION of Object
17 =head1 SYNOPSIS
19 Give standard usage here
21 =head1 DESCRIPTION
23 Describe the object here
25 =head1 FEEDBACK
27 =head2 Mailing Lists
29 User feedback is an integral part of the evolution of this and other
30 Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to
31 the Bioperl mailing list.  Your participation is much appreciated.
33   bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
34   http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
35   
36 =head2 Reporting Bugs
38 Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
39 of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via
40 the web:
42   https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
43   
44 =head1 AUTHOR - [[%ask2]]
46   Email [[%ask3]]
48 Describe contact details here
50 =head1 CONTRIBUTORS
52 Additional contributors names and emails here
54 =head1 APPENDIX
56 The rest of the documentation details each of the object methods.
57 Internal methods are usually preceded with a _
59 =cut
61 # Let the code begin...
63 package [[%ask1]];
65 use strict;
67 # Object preamble - inherits from Bio::Root::Root
69 use base qw(Bio::Root::Root);
71 =head2 new
73  Title   : new
74  Usage   : my $obj = new
75  Function: Builds a new [[%ask1]] object 
76  Returns : an instance of [[%ask1]]
77  Args    : 
79 =cut
81 sub new {
82         my($class,@args) = @_;
83         my $self = $class->SUPER::new(@args);
84         return $self;