Makefile.PL

   1 ## --Makefile.PL for Bioperl core module distribution--##
   2 ## ----------------------------------------------------##
   3 ## $Id$
   4 ##----------------------------------------------------
   5
   6 # Basically this is a standard Makefile with a hash of
   7 # needed packages which are tested at the start
   8 #
   9 # If you want help with this Makefile get in touch with
  10 # the developers by sending a message to bioperl-l@bioperl.org.
  11
  12 # All Bioperl-db dependencies on external modules are defined here
  13 %packages =(
  14     'DBI' => '0.0/Database Access/this entire package/',
  15     'Bio::Root::Version' => '0.0/Bioperl//',
  16 );
  17
  18 sub check_package {
  19     my ($name,$str) = @_;
  20     my($ver,$desc,$expl,@modules);
  21
  22     ($ver,$desc,$expl,$module) = split( /\// , $str);
  23     if( !eval "require $name") {
  24         if ($name eq 'Bio::Root::Version') {
  25           print "Bioperl-db absolutely needs Bioperl to work - It makes no sense without it\n";
  26           exit(0);
  27         }
  28         print "External Module $name, $desc,\n is not installed on this computer.\n  The $module in Bioperl-db needs it for $expl\n\n";
  29         return 1;
  30     }
  31
  32     return 0;
  33 }
  34
  35
  36 # Generate sub testing package system
  37 #
  38 #
  39
  40 # make mini test targets for playing around with
  41 # in testing...
  42
  43 opendir(DIR,"t") || warn "No test directory. Weird!";
  44 @files = readdir(DIR);
  45 shift @files;
  46 shift @files;
  47 foreach my $file (@files) {
  48     $file =~ /(\w+)\.t/ || next;
  49     $file = $1;
  50     $line = "test_$file :: pure_all\n\tPERL_DL_NONLAZY=1 \$(FULLPERL) -I\$(INST_ARCHLIB) -I\$(INST_LIB) -I\$(PERL_ARCHLIB) -I\$(PERL_LIB) -e \'use Test::Harness qw(&runtests \$\$verbose); \$\$verbose=\$(TEST_VERBOSE); runtests \@ARGV;\' t/$file.t\n";
  51     push(@tline,$line);
  52     push(@targets,$file);
  53     $tset  .= "$file \\\n";
  54 }
  55
  56 $tline = join('',@tline);
  57 $tline = "show_tests :\n\t\@echo \'type make test_<subtest> to run\'\n\t\@echo '$tset'\n$tline\n";
  58
  59 print STDERR "Generated sub tests. go make show_tests to see available subtests\n";
  60
  61 sub MY::postamble {
  62              $tline;
  63            }
  64
  65
  66
  67 use ExtUtils::MakeMaker;
  68 require 5.004;
  69 $NAME     = 'Bio';
  70 $DISTNAME = "bioperl-db";
  71 $VERSION  = "0.01";
  72
  73 $error = 0;
  74 foreach $name ( keys %packages ) {
  75     if( &check_package($name,$packages{$name}) == 1 ) {
  76         $error = 1;
  77     }
  78 }
  79
  80 if( $error == 1 ) {
  81     print <<QQ_ERROR_QQ;
  82
  83 Warning:
  84
  85    There are some external packages, listed above, which bioperl
  86    uses. This only effects the functionality which is listed above:
  87    the rest of bioperl will work fine.
  88
  89    The installation of these external packages is very simple. You
  90    can read more about the external packages at
  91
  92    http://bio.perl.org/Core/external.shtml
  93
  94    The ftp site
  95
  96    ftp://bio.perl.org/pub/external/
  97
  98    has all the external packages for easy retrieval, or you can use CPAN
  99
 100    Enjoy the rest of bioperl, which you can use after going 'make install'
 101
 102 QQ_ERROR_QQ
 103 }
 104
 105 @BACKUP_FILES = ();
 106
 107 # generate hash for prerequisites
 108 # for use in WriteMakefile
 109 my %prereq;
 110 while (my ($key, $value) = each %packages) {
 111   my ($version,$desc,$expl,$module) = split( /\// , $value);
 112   $prereq{$key} = $version;
 113 }
 114
 115 WriteMakefile(
 116   NAME         => $NAME,
 117   DISTNAME     => $DISTNAME,
 118   VERSION      => $VERSION,
 119   dist         => { COMPRESS     => 'gzip -9f',
 120                     SUFFIX       => '.gz',
 121                     DIST_DEFAULT => 'all tardist',
 122   },
 123   ($] ge '5.005') ? (
 124     'AUTHOR'   => 'Bioperl Team (bioperl-l@bioperl.org)',
 125     'ABSTRACT' => 'Bioperl DB',
 126   ) : (),
 127   realclean   => { FILES => join(' ', @BACKUP_FILES) },
 128   DIR         => [  ], # directories with other Makefile.PL's in them
 129   PREREQ_PM   => \%prereq,
 130 );
 131