removed this stub now that people have had time to adjust
[bioperl-db.git] / model / bioperl-maps.dia
blobf8e009e026bd054a94553d12700f165b0858f595
1 <?xml version="1.0"?>
2 <diagram xmlns:dia="http://www.lysator.liu.se/~alla/dia/">
3 <diagramdata>
4 <attribute name="background">
5 <color val="#ffffff"/>
6 </attribute>
7 <attribute name="paper">
8 <composite type="paper">
9 <attribute name="name">
10 <string>#A4#</string>
11 </attribute>
12 <attribute name="tmargin">
13 <real val="2.82"/>
14 </attribute>
15 <attribute name="bmargin">
16 <real val="2.82"/>
17 </attribute>
18 <attribute name="lmargin">
19 <real val="2.82"/>
20 </attribute>
21 <attribute name="rmargin">
22 <real val="2.82"/>
23 </attribute>
24 <attribute name="is_portrait">
25 <boolean val="false"/>
26 </attribute>
27 <attribute name="scaling">
28 <real val="0.750123"/>
29 </attribute>
30 <attribute name="fitto">
31 <boolean val="true"/>
32 </attribute>
33 <attribute name="fitwidth">
34 <int val="1"/>
35 </attribute>
36 <attribute name="fitheight">
37 <int val="1"/>
38 </attribute>
39 </composite>
40 </attribute>
41 <attribute name="grid">
42 <composite type="grid">
43 <attribute name="width_x">
44 <real val="2"/>
45 </attribute>
46 <attribute name="width_y">
47 <real val="2"/>
48 </attribute>
49 <attribute name="visible_x">
50 <int val="1"/>
51 </attribute>
52 <attribute name="visible_y">
53 <int val="1"/>
54 </attribute>
55 </composite>
56 </attribute>
57 <attribute name="guides">
58 <composite type="guides">
59 <attribute name="hguides"/>
60 <attribute name="vguides"/>
61 </composite>
62 </attribute>
63 </diagramdata>
64 <layer name="Background" visible="true">
65 <object type="UML - Class" version="0" id="O0">
66 <attribute name="obj_pos">
67 <point val="1.10345,0.324769"/>
68 </attribute>
69 <attribute name="obj_bb">
70 <rectangle val="1.05345,0.274769;13.5886,8.37477"/>
71 </attribute>
72 <attribute name="elem_corner">
73 <point val="1.10345,0.324769"/>
74 </attribute>
75 <attribute name="elem_width">
76 <real val="12.4352"/>
77 </attribute>
78 <attribute name="elem_height">
79 <real val="8"/>
80 </attribute>
81 <attribute name="name">
82 <string>#Marker#</string>
83 </attribute>
84 <attribute name="stereotype">
85 <string/>
86 </attribute>
87 <attribute name="abstract">
88 <boolean val="false"/>
89 </attribute>
90 <attribute name="suppress_attributes">
91 <boolean val="false"/>
92 </attribute>
93 <attribute name="suppress_operations">
94 <boolean val="false"/>
95 </attribute>
96 <attribute name="visible_attributes">
97 <boolean val="true"/>
98 </attribute>
99 <attribute name="visible_operations">
100 <boolean val="false"/>
101 </attribute>
102 <attribute name="attributes">
103 <composite type="umlattribute">
104 <attribute name="name">
105 <string>#markerid#</string>
106 </attribute>
107 <attribute name="type">
108 <string>#integer#</string>
109 </attribute>
110 <attribute name="value">
111 <string/>
112 </attribute>
113 <attribute name="visibility">
114 <enum val="0"/>
115 </attribute>
116 <attribute name="abstract">
117 <boolean val="false"/>
118 </attribute>
119 <attribute name="class_scope">
120 <boolean val="false"/>
121 </attribute>
122 </composite>
123 <composite type="umlattribute">
124 <attribute name="name">
125 <string>#locus#</string>
126 </attribute>
127 <attribute name="type">
128 <string>#varchar(64)#</string>
129 </attribute>
130 <attribute name="value">
131 <string/>
132 </attribute>
133 <attribute name="visibility">
134 <enum val="0"/>
135 </attribute>
136 <attribute name="abstract">
137 <boolean val="false"/>
138 </attribute>
139 <attribute name="class_scope">
140 <boolean val="false"/>
141 </attribute>
142 </composite>
143 <composite type="umlattribute">
144 <attribute name="name">
145 <string>#probe#</string>
146 </attribute>
147 <attribute name="type">
148 <string>#varchar(64)#</string>
149 </attribute>
150 <attribute name="value">
151 <string/>
152 </attribute>
153 <attribute name="visibility">
154 <enum val="0"/>
155 </attribute>
156 <attribute name="abstract">
157 <boolean val="false"/>
158 </attribute>
159 <attribute name="class_scope">
160 <boolean val="false"/>
161 </attribute>
162 </composite>
163 <composite type="umlattribute">
164 <attribute name="name">
165 <string>#type#</string>
166 </attribute>
167 <attribute name="type">
168 <string>#varchar(5)#</string>
169 </attribute>
170 <attribute name="value">
171 <string/>
172 </attribute>
173 <attribute name="visibility">
174 <enum val="0"/>
175 </attribute>
176 <attribute name="abstract">
177 <boolean val="false"/>
178 </attribute>
179 <attribute name="class_scope">
180 <boolean val="false"/>
181 </attribute>
182 </composite>
183 <composite type="umlattribute">
184 <attribute name="name">
185 <string>#chrom#</string>
186 </attribute>
187 <attribute name="type">
188 <string>#char(2)#</string>
189 </attribute>
190 <attribute name="value">
191 <string/>
192 </attribute>
193 <attribute name="visibility">
194 <enum val="0"/>
195 </attribute>
196 <attribute name="abstract">
197 <boolean val="false"/>
198 </attribute>
199 <attribute name="class_scope">
200 <boolean val="false"/>
201 </attribute>
202 </composite>
203 <composite type="umlattribute">
204 <attribute name="name">
205 <string>#fwdprimer#</string>
206 </attribute>
207 <attribute name="type">
208 <string>#varchar(128)#</string>
209 </attribute>
210 <attribute name="value">
211 <string/>
212 </attribute>
213 <attribute name="visibility">
214 <enum val="0"/>
215 </attribute>
216 <attribute name="abstract">
217 <boolean val="false"/>
218 </attribute>
219 <attribute name="class_scope">
220 <boolean val="false"/>
221 </attribute>
222 </composite>
223 <composite type="umlattribute">
224 <attribute name="name">
225 <string>#revprimer#</string>
226 </attribute>
227 <attribute name="type">
228 <string>#varchar(128)#</string>
229 </attribute>
230 <attribute name="value">
231 <string/>
232 </attribute>
233 <attribute name="visibility">
234 <enum val="0"/>
235 </attribute>
236 <attribute name="abstract">
237 <boolean val="false"/>
238 </attribute>
239 <attribute name="class_scope">
240 <boolean val="false"/>
241 </attribute>
242 </composite>
243 <composite type="umlattribute">
244 <attribute name="name">
245 <string>#length#</string>
246 </attribute>
247 <attribute name="type">
248 <string>#integer#</string>
249 </attribute>
250 <attribute name="value">
251 <string/>
252 </attribute>
253 <attribute name="visibility">
254 <enum val="0"/>
255 </attribute>
256 <attribute name="abstract">
257 <boolean val="false"/>
258 </attribute>
259 <attribute name="class_scope">
260 <boolean val="false"/>
261 </attribute>
262 </composite>
263 </attribute>
264 <attribute name="operations"/>
265 <attribute name="template">
266 <boolean val="false"/>
267 </attribute>
268 <attribute name="templates"/>
269 </object>
270 <object type="UML - Class" version="0" id="O1">
271 <attribute name="obj_pos">
272 <point val="-0.227922,15.5861"/>
273 </attribute>
274 <attribute name="obj_bb">
275 <rectangle val="-0.277922,15.5361;10.3181,19.6361"/>
276 </attribute>
277 <attribute name="elem_corner">
278 <point val="-0.227922,15.5861"/>
279 </attribute>
280 <attribute name="elem_width">
281 <real val="10.496"/>
282 </attribute>
283 <attribute name="elem_height">
284 <real val="4"/>
285 </attribute>
286 <attribute name="name">
287 <string>#Marker_alias#</string>
288 </attribute>
289 <attribute name="stereotype">
290 <string/>
291 </attribute>
292 <attribute name="abstract">
293 <boolean val="false"/>
294 </attribute>
295 <attribute name="suppress_attributes">
296 <boolean val="false"/>
297 </attribute>
298 <attribute name="suppress_operations">
299 <boolean val="false"/>
300 </attribute>
301 <attribute name="visible_attributes">
302 <boolean val="true"/>
303 </attribute>
304 <attribute name="visible_operations">
305 <boolean val="false"/>
306 </attribute>
307 <attribute name="attributes">
308 <composite type="umlattribute">
309 <attribute name="name">
310 <string>#markerid#</string>
311 </attribute>
312 <attribute name="type">
313 <string>#integer#</string>
314 </attribute>
315 <attribute name="value">
316 <string/>
317 </attribute>
318 <attribute name="visibility">
319 <enum val="0"/>
320 </attribute>
321 <attribute name="abstract">
322 <boolean val="false"/>
323 </attribute>
324 <attribute name="class_scope">
325 <boolean val="false"/>
326 </attribute>
327 </composite>
328 <composite type="umlattribute">
329 <attribute name="name">
330 <string>#alias#</string>
331 </attribute>
332 <attribute name="type">
333 <string>#varchar(32)#</string>
334 </attribute>
335 <attribute name="value">
336 <string/>
337 </attribute>
338 <attribute name="visibility">
339 <enum val="0"/>
340 </attribute>
341 <attribute name="abstract">
342 <boolean val="false"/>
343 </attribute>
344 <attribute name="class_scope">
345 <boolean val="false"/>
346 </attribute>
347 </composite>
348 <composite type="umlattribute">
349 <attribute name="name">
350 <string>#source#</string>
351 </attribute>
352 <attribute name="type">
353 <string>#varchar(32)#</string>
354 </attribute>
355 <attribute name="value">
356 <string/>
357 </attribute>
358 <attribute name="visibility">
359 <enum val="0"/>
360 </attribute>
361 <attribute name="abstract">
362 <boolean val="false"/>
363 </attribute>
364 <attribute name="class_scope">
365 <boolean val="false"/>
366 </attribute>
367 </composite>
368 </attribute>
369 <attribute name="operations"/>
370 <attribute name="template">
371 <boolean val="false"/>
372 </attribute>
373 <attribute name="templates"/>
374 </object>
375 <object type="UML - Class" version="0" id="O2">
376 <attribute name="obj_pos">
377 <point val="16.8876,1.58543"/>
378 </attribute>
379 <attribute name="obj_bb">
380 <rectangle val="16.8376,1.53543;31.7968,6.43543"/>
381 </attribute>
382 <attribute name="elem_corner">
383 <point val="16.8876,1.58543"/>
384 </attribute>
385 <attribute name="elem_width">
386 <real val="14.8592"/>
387 </attribute>
388 <attribute name="elem_height">
389 <real val="4.8"/>
390 </attribute>
391 <attribute name="name">
392 <string>#Map#</string>
393 </attribute>
394 <attribute name="stereotype">
395 <string/>
396 </attribute>
397 <attribute name="abstract">
398 <boolean val="false"/>
399 </attribute>
400 <attribute name="suppress_attributes">
401 <boolean val="false"/>
402 </attribute>
403 <attribute name="suppress_operations">
404 <boolean val="false"/>
405 </attribute>
406 <attribute name="visible_attributes">
407 <boolean val="true"/>
408 </attribute>
409 <attribute name="visible_operations">
410 <boolean val="false"/>
411 </attribute>
412 <attribute name="attributes">
413 <composite type="umlattribute">
414 <attribute name="name">
415 <string>#mapid#</string>
416 </attribute>
417 <attribute name="type">
418 <string>#integer#</string>
419 </attribute>
420 <attribute name="value">
421 <string/>
422 </attribute>
423 <attribute name="visibility">
424 <enum val="0"/>
425 </attribute>
426 <attribute name="abstract">
427 <boolean val="false"/>
428 </attribute>
429 <attribute name="class_scope">
430 <boolean val="false"/>
431 </attribute>
432 </composite>
433 <composite type="umlattribute">
434 <attribute name="name">
435 <string>#name#</string>
436 </attribute>
437 <attribute name="type">
438 <string>#varchar(32)#</string>
439 </attribute>
440 <attribute name="value">
441 <string/>
442 </attribute>
443 <attribute name="visibility">
444 <enum val="0"/>
445 </attribute>
446 <attribute name="abstract">
447 <boolean val="false"/>
448 </attribute>
449 <attribute name="class_scope">
450 <boolean val="false"/>
451 </attribute>
452 </composite>
453 <composite type="umlattribute">
454 <attribute name="name">
455 <string>#units#</string>
456 </attribute>
457 <attribute name="type">
458 <string>#char(5)#</string>
459 </attribute>
460 <attribute name="value">
461 <string/>
462 </attribute>
463 <attribute name="visibility">
464 <enum val="0"/>
465 </attribute>
466 <attribute name="abstract">
467 <boolean val="false"/>
468 </attribute>
469 <attribute name="class_scope">
470 <boolean val="false"/>
471 </attribute>
472 </composite>
473 <composite type="umlattribute">
474 <attribute name="name">
475 <string>#version (to be added)#</string>
476 </attribute>
477 <attribute name="type">
478 <string>#float#</string>
479 </attribute>
480 <attribute name="value">
481 <string/>
482 </attribute>
483 <attribute name="visibility">
484 <enum val="0"/>
485 </attribute>
486 <attribute name="abstract">
487 <boolean val="false"/>
488 </attribute>
489 <attribute name="class_scope">
490 <boolean val="false"/>
491 </attribute>
492 </composite>
493 </attribute>
494 <attribute name="operations"/>
495 <attribute name="template">
496 <boolean val="false"/>
497 </attribute>
498 <attribute name="templates"/>
499 </object>
500 <object type="UML - Class" version="0" id="O3">
501 <attribute name="obj_pos">
502 <point val="11.2201,15.424"/>
503 </attribute>
504 <attribute name="obj_bb">
505 <rectangle val="11.1701,15.374;20.7965,19.474"/>
506 </attribute>
507 <attribute name="elem_corner">
508 <point val="11.2201,15.424"/>
509 </attribute>
510 <attribute name="elem_width">
511 <real val="9.5264"/>
512 </attribute>
513 <attribute name="elem_height">
514 <real val="4"/>
515 </attribute>
516 <attribute name="name">
517 <string>#Map_position#</string>
518 </attribute>
519 <attribute name="stereotype">
520 <string/>
521 </attribute>
522 <attribute name="abstract">
523 <boolean val="false"/>
524 </attribute>
525 <attribute name="suppress_attributes">
526 <boolean val="false"/>
527 </attribute>
528 <attribute name="suppress_operations">
529 <boolean val="false"/>
530 </attribute>
531 <attribute name="visible_attributes">
532 <boolean val="true"/>
533 </attribute>
534 <attribute name="visible_operations">
535 <boolean val="false"/>
536 </attribute>
537 <attribute name="attributes">
538 <composite type="umlattribute">
539 <attribute name="name">
540 <string>#markerid#</string>
541 </attribute>
542 <attribute name="type">
543 <string>#integer#</string>
544 </attribute>
545 <attribute name="value">
546 <string/>
547 </attribute>
548 <attribute name="visibility">
549 <enum val="0"/>
550 </attribute>
551 <attribute name="abstract">
552 <boolean val="false"/>
553 </attribute>
554 <attribute name="class_scope">
555 <boolean val="false"/>
556 </attribute>
557 </composite>
558 <composite type="umlattribute">
559 <attribute name="name">
560 <string>#mapid#</string>
561 </attribute>
562 <attribute name="type">
563 <string>#integer#</string>
564 </attribute>
565 <attribute name="value">
566 <string/>
567 </attribute>
568 <attribute name="visibility">
569 <enum val="0"/>
570 </attribute>
571 <attribute name="abstract">
572 <boolean val="false"/>
573 </attribute>
574 <attribute name="class_scope">
575 <boolean val="false"/>
576 </attribute>
577 </composite>
578 <composite type="umlattribute">
579 <attribute name="name">
580 <string>#position#</string>
581 </attribute>
582 <attribute name="type">
583 <string>#float#</string>
584 </attribute>
585 <attribute name="value">
586 <string/>
587 </attribute>
588 <attribute name="visibility">
589 <enum val="0"/>
590 </attribute>
591 <attribute name="abstract">
592 <boolean val="false"/>
593 </attribute>
594 <attribute name="class_scope">
595 <boolean val="false"/>
596 </attribute>
597 </composite>
598 </attribute>
599 <attribute name="operations"/>
600 <attribute name="template">
601 <boolean val="false"/>
602 </attribute>
603 <attribute name="templates"/>
604 </object>
605 <object type="UML - Association" version="0" id="O4">
606 <attribute name="obj_pos">
607 <point val="10.75,8.25"/>
608 </attribute>
609 <attribute name="obj_bb">
610 <rectangle val="9.3,6.8;17.4333,16.874"/>
611 </attribute>
612 <attribute name="orth_points">
613 <point val="10.75,8.25"/>
614 <point val="10.75,9.57574"/>
615 <point val="15.9833,9.57574"/>
616 <point val="15.9833,15.424"/>
617 </attribute>
618 <attribute name="orth_orient">
619 <enum val="1"/>
620 <enum val="0"/>
621 <enum val="1"/>
622 </attribute>
623 <attribute name="name">
624 <string/>
625 </attribute>
626 <attribute name="direction">
627 <enum val="0"/>
628 </attribute>
629 <attribute name="ends">
630 <composite>
631 <attribute name="role">
632 <string/>
633 </attribute>
634 <attribute name="multiplicity">
635 <string>#1#</string>
636 </attribute>
637 <attribute name="arrow">
638 <boolean val="false"/>
639 </attribute>
640 <attribute name="aggregate">
641 <enum val="0"/>
642 </attribute>
643 </composite>
644 <composite>
645 <attribute name="role">
646 <string/>
647 </attribute>
648 <attribute name="multiplicity">
649 <string>#n#</string>
650 </attribute>
651 <attribute name="arrow">
652 <boolean val="false"/>
653 </attribute>
654 <attribute name="aggregate">
655 <enum val="0"/>
656 </attribute>
657 </composite>
658 </attribute>
659 <connections>
660 <connection handle="1" to="O3" connection="1"/>
661 </connections>
662 </object>
663 <object type="UML - Association" version="0" id="O5">
664 <attribute name="obj_pos">
665 <point val="7.32105,8.32477"/>
666 </attribute>
667 <attribute name="obj_bb">
668 <rectangle val="3.57008,6.87477;8.77105,17.0361"/>
669 </attribute>
670 <attribute name="orth_points">
671 <point val="7.32105,8.32477"/>
672 <point val="7.32105,9.57574"/>
673 <point val="5.02008,9.57574"/>
674 <point val="5.02008,15.5861"/>
675 </attribute>
676 <attribute name="orth_orient">
677 <enum val="1"/>
678 <enum val="0"/>
679 <enum val="1"/>
680 </attribute>
681 <attribute name="name">
682 <string/>
683 </attribute>
684 <attribute name="direction">
685 <enum val="0"/>
686 </attribute>
687 <attribute name="ends">
688 <composite>
689 <attribute name="role">
690 <string/>
691 </attribute>
692 <attribute name="multiplicity">
693 <string>#1#</string>
694 </attribute>
695 <attribute name="arrow">
696 <boolean val="false"/>
697 </attribute>
698 <attribute name="aggregate">
699 <enum val="0"/>
700 </attribute>
701 </composite>
702 <composite>
703 <attribute name="role">
704 <string/>
705 </attribute>
706 <attribute name="multiplicity">
707 <string>#n#</string>
708 </attribute>
709 <attribute name="arrow">
710 <boolean val="false"/>
711 </attribute>
712 <attribute name="aggregate">
713 <enum val="0"/>
714 </attribute>
715 </composite>
716 </attribute>
717 <connections>
718 <connection handle="0" to="O0" connection="6"/>
719 <connection handle="1" to="O1" connection="1"/>
720 </connections>
721 </object>
722 <object type="UML - Association" version="0" id="O6">
723 <attribute name="obj_pos">
724 <point val="24.3172,6.38543"/>
725 </attribute>
726 <attribute name="obj_bb">
727 <rectangle val="16.65,4.93543;25.7672,16.8"/>
728 </attribute>
729 <attribute name="orth_points">
730 <point val="24.3172,6.38543"/>
731 <point val="24.3172,11.0607"/>
732 <point val="18.1,11.0607"/>
733 <point val="18.1,15.35"/>
734 </attribute>
735 <attribute name="orth_orient">
736 <enum val="1"/>
737 <enum val="0"/>
738 <enum val="1"/>
739 </attribute>
740 <attribute name="name">
741 <string/>
742 </attribute>
743 <attribute name="direction">
744 <enum val="0"/>
745 </attribute>
746 <attribute name="ends">
747 <composite>
748 <attribute name="role">
749 <string/>
750 </attribute>
751 <attribute name="multiplicity">
752 <string>#1#</string>
753 </attribute>
754 <attribute name="arrow">
755 <boolean val="false"/>
756 </attribute>
757 <attribute name="aggregate">
758 <enum val="0"/>
759 </attribute>
760 </composite>
761 <composite>
762 <attribute name="role">
763 <string/>
764 </attribute>
765 <attribute name="multiplicity">
766 <string>#n#</string>
767 </attribute>
768 <attribute name="arrow">
769 <boolean val="false"/>
770 </attribute>
771 <attribute name="aggregate">
772 <enum val="0"/>
773 </attribute>
774 </composite>
775 </attribute>
776 <connections>
777 <connection handle="0" to="O2" connection="6"/>
778 </connections>
779 </object>
780 </layer>
781 </diagram>