bioinfo.asd

   1 (defpackage #:bioinfo-system
   2   (:use :cl :asdf))
   3
   4 (in-package #:bioinfo-system)
   5
   6 (defsystem :bioinfo
   7   :description "A (hope so) complete system for bioinformatics analysis."
   8   :version "0.1"
   9   :author "Leonardo Varuzza <varuzza@gmail.com>"
  10   :licence "GPL"
  11   :depends-on (:cl-ppcre :cl-fad :cl-utilities :lambda-utils :lispbuilder-regex :lispbuilder-lexer :yacc :clsql)
  12   :serial t
  13   :components ((:file "packages")
  14                (:file "os")
  15                (:file "dataset")
  16                (:file "bioinfo")
  17                (:module "sage"
  18                         :components ((:file "sage")))
  19                (:file "feature")
  20
  21 ;;             (:module "sql"
  22 ;;                      :components
  23 ;;                      ((:file "sql")
  24 ;;                       (:file "ucsc-compiler")
  25 ;;                       (:file "ucsc-gen")
  26 ;;                       (:file "ucsc-sql")))
  27
  28 ;;             (:module "graphics"
  29 ;;                      :components ((:file "packages")
  30 ;;                                   (:file "util")
  31 ;;                                   (:file "panel")))
  32 ;;             (:module "cluster"
  33 ;;                      :components ((:file "packages")
  34 ;;                                   (:file "distance")))))