sodium/LICENSE

   1 Software License Agreement
   2 University of Illinois
   3 NAMD Molecular Dynamics Software
   4 Non-Exclusive, Non-Commercial Use License
   5
   6 Upon execution of this Agreement by the party identified below ("Licensee"),
   7 The Board of Trustees of the University of Illinois  ("Illinois"), on behalf
   8 of The Theoretical Biophysics Group ("TBG") in the Beckman Institute, will
   9 provide the NAMD molecular dynamics software ("NAMD") in Executable Code
  10 and/or Source Code form ("Software") to Licensee, subject to the following
  11 terms and conditions. For purposes of this Agreement, Executable Code is the
  12 compiled code, which is ready to run on Licensee's computer. Source code
  13 consists of a set of files which contain the actual program commands that are
  14 compiled to form the Executable Code.
  15
  16 1. The Software is intellectual property owned by Illinois, and all right,
  17 title and interest, including copyright, remain with Illinois.  Illinois
  18 grants, and Licensee hereby accepts, a restricted, non-exclusive,
  19 non-transferable license to use the Software for academic, research and
  20 internal business purposes only, e.g. not for commercial use (see Clause 7
  21 below), without a fee.
  22
  23 2. Licensee may, at its own expense, create and freely distribute
  24 complimentary works that interoperate with the Software, directing others to
  25 the TBG server to license and obtain the Software itself. Licensee may, at
  26 its own expense, modify the Software to make derivative works.  Except as
  27 explicitly provided below, this License shall apply to any derivative work
  28 as it does to the original Software distributed by Illinois.  Any derivative
  29 work should be clearly marked and renamed to notify users that it is a
  30 modified version and not the original Software distributed by Illinois.
  31 Licensee agrees to reproduce the copyright notice and other proprietary
  32 markings on any derivative work and to include in the documentation of such
  33 work the acknowledgement:
  34
  35 "This software includes code developed by the Theoretical Biophysics Group
  36  in the Beckman Institute for Advanced Science and Technology at the
  37  University of Illinois at Urbana-Champaign."
  38
  39 Licensee may redistribute without restriction works with up to 1/2 of their
  40 non-comment source code derived from at most 1/10 of the non-comment source
  41 code developed by Illinois and contained in the Software, provided that the
  42 above directions for notice and acknowledgement are observed.  Any other
  43 distribution of the Software or any derivative work requires a separate
  44 license with Illinois.  Licensee may contact Illinois (namd@ks.uiuc.edu) to
  45 negotiate an appropriate license for such distribution.
  46
  47 3. Except as expressly set forth in this Agreement, THIS SOFTWARE IS PROVIDED
  48 "AS IS" AND ILLINOIS MAKES NO REPRESENTATIONS AND EXTENDS NO WARRANTIES OF
  49 ANY KIND, EITHER EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO WARRANTIES
  50 OR MERCHANTABILITY OR FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE, OR THAT THE USE OF
  51 THE SOFTWARE WILL NOT INFRINGE ANY PATENT, TRADEMARK, OR OTHER RIGHTS.
  52 LICENSEE ASSUMES THE ENTIRE RISK AS TO THE RESULTS AND PERFORMANCE OF THE
  53 SOFTWARE AND/OR ASSOCIATED MATERIALS.  LICENSEE AGREES THAT UNIVERSITY SHALL
  54 NOT BE HELD LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, CONSEQUENTIAL, OR INCIDENTAL
  55 DAMAGES WITH RESPECT TO ANY CLAIM BY LICENSEE OR ANY THIRD PARTY ON ACCOUNT
  56 OF OR ARISING FROM THIS AGREEMENT OR USE OF THE SOFTWARE AND/OR ASSOCIATED
  57 MATERIALS.
  58
  59 4. Licensee understands the Software is proprietary to Illinois. Licensee
  60 agrees to take all reasonable steps to insure that the Software is
  61 protected and secured from unauthorized disclosure, use, or release and
  62 will treat it with at least the same level of care as Licensee would use to
  63 protect and secure its own proprietary computer programs and/or information,
  64 but using no less than a reasonable standard of care.  Licensee agrees to
  65 provide the Software only to any other person or entity who has registered
  66 with Illinois. If licensee is not registering as an individual but as an
  67 institution or corporation each member of the institution or corporation
  68 who has access to or uses Software must agree to and abide by the terms
  69 of this license. If Licensee becomes aware of any unauthorized licensing,
  70 copying or use of the Software, Licensee shall promptly notify Illinois
  71 in writing. Licensee expressly agrees to use the Software only in the
  72 manner and for the specific uses authorized in this Agreement.
  73
  74 5. By using or copying this Software, Licensee agrees to abide by the
  75 copyright law and all other applicable laws of the U.S. including, but not
  76 limited to, export control laws and the terms of this license. Illinois
  77 shall have the right to terminate this license immediately by written
  78 notice upon Licensee's breach of, or non-compliance with, any
  79 terms of the license. Licensee may be held legally responsible for any
  80 copyright infringement that is caused or encouraged by its failure to
  81 abide by the terms of this license. Upon termination, Licensee agrees to
  82 destroy all copies of the Software in its possession and to verify such
  83 destruction in writing.
  84
  85 6. The user agrees that any reports or published results obtained with
  86 the Software will acknowledge its use by the appropriate citation as
  87 follows:
  88
  89 "NAMD was developed by the Theoretical Biophysics Group in the Beckman
  90  Institute for Advanced Science and Technology at the University of
  91  Illinois at Urbana-Champaign."
  92
  93 Any published work which utilizes NAMD shall include the following reference:
  94
  95 "Laxmikant Kale, Robert Skeel, Milind Bhandarkar, Robert Brunner,
  96  Attila Gursoy, Neal Krawetz, James Phillips, Aritomo Shinozaki,
  97  Krishnan Varadarajan, and Klaus Schulten. NAMD2: Greater scalability
  98  for parallel molecular dynamics.  J. Comp. Phys., 151:283-312, 1999."
  99
 100 Electronic documents will include a direct link to the official NAMD page
 101 at http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/
 102
 103 7. Commercial use of the Software, or derivative works based thereon,
 104 REQUIRES A COMMERCIAL LICENSE.  Should Licensee wish to make commercial
 105 use of the Software, Licensee will contact Illinois (namd@ks.uiuc.edu) to
 106 negotiate an appropriate license for such use. Commercial use includes:
 107 (1) integration of all or part of the Software into a product for sale,
 108 lease or license by or on behalf of Licensee to third parties, or
 109 (2) distribution of the Software to third parties that need it to
 110 commercialize product sold or licensed by or on behalf of Licensee.
 111
 112 8. Government Rights. Because substantial governmental funds have been
 113 used in the development of NAMD, any possession, use or sublicense of the
 114 Software by or to the United States government shall be subject to such
 115 required restrictions.
 116
 117 9. NAMD is being distributed as a research and teaching tool and as
 118 such, TBG encourages contributions from users of the code that might, at
 119 Illinois' sole discretion, be used or incorporated to make the basic
 120 operating framework of the Software a more stable, flexible, and/or useful
 121 product.  Licensees who contribute their code to become an internal
 122 portion of the Software agree that such code may be distributed by
 123 Illinois under the terms of this License and may be required to sign an
 124 "Agreement Regarding Contributory Code for NAMD Software" before Illinois
 125 can accept it (contact namd@ks.uiuc.edu for a copy).
 126
 127 UNDERSTOOD AND AGREED.
 128
 129
 130 Contact Information:
 131
 132 The best contact path for licensing issues is by e-mail to
 133 namd@ks.uiuc.edu or send correspondence to:
 134                              NAMD Team
 135                              Theoretical Biophysics Group
 136                              Beckman Institute
 137                              University of Illinois
 138                              405 North Mathews MC-251
 139                              Urbana, Illinois 61801 USA
 140                              FAX: (217) 244-6078