blat/PKGBUILD

   1 # Maintainer: Brendan Long <korin43@gmail.com>
   2
   3 pkgname=blat
   4 pkgver=34
   5 pkgrel=1
   6 pkgdesc="The BLAST-like Alignment Tool: fast sequence search command line tool"
   7 arch=('i686' 'x86_64')
   8 url="http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQblat.html"
   9 license=('custom')
  10 depends=()
  11 source=('http://users.soe.ucsc.edu/~kent/src/blatSrc34.zip'
  12         'common.mk.patch')
  13 md5sums=('c8637145ea70acf1ced1a670d37d7b98'
  14          'b47409d3c8bcb6886b2b37100a4005cd')
  15
  16 build() {
  17   mkdir -p ${pkgdir}/usr/bin
  18   mkdir -p ${pkgdir}/usr/share/licenses/{$pkgname}
  19   cp ${srcdir}/blatSrc/README ${pkgdir}/usr/share/licenses/{$pkgname}
  20   patch -p0 -i ${srcdir}/common.mk.patch
  21   cd "$srcdir/blatSrc"
  22   if [ $MACHTYPE = "i686-pc-linux-gnu" ]; then
  23     MACHTYPE=i386 make INSTALL_ROOT=${pkgdir}
  24   else
  25     MACHTYPE=x86_64 make INSTALL_ROOT=${pkgdir}
  26   fi
  27 }