raxml/PKGBUILD

   1 # Maintainer: Stephen A Smith <blackrim at gmail dot com>
   2 # Contributor: Mick Elliot <micke at sfu dot ca>
   3
   4 pkgname=raxml
   5 pkgver=7.2.6
   6 origver=7.2.6
   7 pkgrel=1
   8 pkgdesc="Randomized Axelerated Maximum Likelihood for sequential and parallel inference of large phylogenetic trees"
   9 arch=('i686' 'x86_64')
  10 url="http://wwwkramer.in.tum.de/exelixis/software.html"
  11 license=('GPL')
  12 depends=('glibc')
  13 conflicts=('raxml-mpi')
  14 source=(http://wwwkramer.in.tum.de/exelixis/countSource726.php http://icwww.epfl.ch/~stamatak/index-Dateien/countManual7.0.4.php)
  15 md5sums=('252b690a163c0569cccf219a03b10f64' 'f366e3092b238e2ce89580393f2cb71e')
  16 makedepends=('gcc')
  17 build() {
  18   cd $startdir/src/RAxML-$pkgver
  19   make -f Makefile.SSE3.gcc clean
  20   make -f Makefile.SSE3.gcc || return 1
  21   make -f Makefile.SSE3.PTHREADS.gcc clean
  22   make -f Makefile.SSE3.PTHREADS.gcc || return 1
  23   install -D -m755 raxmlHPC-SSE3 $startdir/pkg/usr/bin/raxmlHPC-SSE3
  24   install -D -m755 raxmlHPC-PTHREADS-SSE3 $startdir/pkg/usr/bin/raxmlHPC-PTHREADS-SSE3
  25   mv ../countManual7.0.4.php ../RAxML-Manual.7.0.4.pdf
  26   install -D -m644 ../RAxML-Manual.7.0.4.pdf $startdir/pkg/usr/share/doc/$pkgname/RAxML-Manual.7.0.4.pdf
  27   echo "Manual is located at /usr/share/doc/$pkgname/RAxML-Manual.7.0.4.pdf"
  28 }