bamtools-git/PKGBUILD

   1 # Maintainer: Ben Booth <benwbooth@gmail.com>
   2 pkgname=bamtools-git
   3 pkgver=20110606
   4 pkgrel=1
   5 pkgdesc="API and toolkit for reading, writing, and manipulating BAM (genome alignment) files."
   6 arch=('i686' 'x86_64')
   7 url="https://github.com/pezmaster31/bamtools"
   8 license=('MIT')
   9 groups=()
  10 depends=()
  11 makedepends=('git' 'cmake')
  12 provides=('bamtools')
  13 conflicts=()
  14 replaces=()
  15 backup=()
  16 options=()
  17 install=
  18 source=()
  19 noextract=()
  20 md5sums=() #generate with 'makepkg -g'
  21
  22 _gitroot="https://github.com/pezmaster31/bamtools.git"
  23 _gitname="bamtools"
  24
  25 build() {
  26   cd "$srcdir"
  27   msg "Connecting to GIT server...."
  28
  29   if [ -d $_gitname ] ; then
  30     cd $_gitname && git pull origin
  31     msg "The local files are updated."
  32   else
  33     git clone $_gitroot $_gitname
  34   fi
  35
  36   msg "GIT checkout done or server timeout"
  37   msg "Starting make..."
  38
  39   rm -rf "$srcdir/$_gitname-build"
  40   git clone "$srcdir/$_gitname" "$srcdir/$_gitname-build"
  41   cd "$srcdir/$_gitname-build"
  42
  43   mkdir build
  44   pushd build
  45   cmake ..
  46   make
  47   popd
  48 }
  49
  50 package() {
  51   cd "$srcdir/$_gitname-build"
  52   mkdir "$pkgdir/usr"
  53   cp -r bin lib "$pkgdir/usr"
  54
  55   mkdir -p "$pkgdir/usr/include/bamtools"
  56   cp -r include/* "$pkgdir/usr/include/bamtools"
  57 }