tmtools/PKGBUILD

   1 # Maintainer: Athemis <alexander.minges[at]googlemail[dot]com>
   2 pkgname=tmtools
   3 _pkgname=TMtools
   4 pkgver=20111012
   5 pkgrel=1
   6 pkgdesc="TM-align is a computer algorithm for protein structure alignment using dynamic programming and TM-score rotation matrix"
   7 url="http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/"
   8 arch=('x86_64' 'i686')
   9 license=('custom')
  10 makedepends=('gcc-fortran')
  11 source=("http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/${_pkgname}${pkgver}.tar.gz"
  12         "LICENSE")
  13
  14 md5sums=('28c8566f334be52d44b62af3ad63e7ef'
  15          '9a0b46c94ef5214583c81be5bc44ca9b')
  16
  17 build() {
  18   cd "${srcdir}"
  19   rm TMalign
  20   rm TMscore
  21   gfortran -static -march=native -O3 -pipe -ffast-math -lm -o TMalign TMalign.f
  22   gfortran -static -march=native -O3 -pipe -ffast-math -lm -o TMscore TMscore.f
  23 }
  24
  25 package() {
  26   cd "${srcdir}"
  27   install -d ${pkgdir}/usr/bin
  28   install -d ${pkgdir}/usr/share/licenses/${pkgname}
  29   install -Dm755 TMalign ${pkgdir}/usr/bin
  30   install -Dm755 TMalign ${pkgdir}/usr/bin
  31   install -Dm644 LICENSE ${pkgdir}/usr/share/licenses/${pkgname}
  32 }
  33
  34 # vim:set ts=2 sw=2 et: